Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is potE [H]

Identifier: 45358413

GI number: 45358413

Start: 841312

End: 842565

Strand: Direct

Name: potE [H]

Synonym: MMP0850

Alternate gene names: 45358413

Gene position: 841312-842565 (Clockwise)

Preceding gene: 45358412

Following gene: 45358416

Centisome position: 50.65

GC content: 32.46

Gene sequence:

>1254_bases
ATGAGTTCTAAAAAATTGGGGCCTTATACATTAAGTGGACTTATTGTGGGGCCGATACTTGGATCAGGAATTGTTATAAT
TCCCCCTATAGTTTACGATATCTTAAAAGATTACTCTATTTTTGCATGGGTAATCATGATGACTATTGGCGGGGTTTTTG
CGTATTTTGCAAGCAAATTATGTTTAAAATTTCCGGGAGATTCTGGTTTAACGGAAGTTGTAGGTCATTCTTTTGGAAAA
TCGTATAAAAATTTAAATGCATACTATCTACTAATTGCAATGGCAATGGCCCCGTTAGTTGTGATAATGGTTGCAGGGGA
GTATCTTTCAGTATTATTTTCAAATTACGCATTTGGCGCAGAATTTTATTCAGCAGTATTAATGCTAATTGGCGGAGTAA
TCCTTTCAAGAAATATTTCATCCGTAGGTAAAATTTCAATGCTTATCTCAACAGTAATTTCTACAATACTTGTAGTTGGT
GGGCTTTTTACAATTTTATTCTATAGAAAGGATGCGCTGTTTACGGGAACAGGAATAAGTACAATTGATGTAGGCTACTC
GTTTTTGATAATGTTCTGGTCAATTATCGGTTGGGAAATACTTGGAAATTACAGCCTTGAAGTTGAAAATCCTGAAAAAA
CAATTCCCAAAGCAGCTTTAGTAAGTGTAATTGCAATGTCTATAGTTTACTTGATAGTATCTGGAGCTCTGCAGGTGTTA
GATATTGGAAAACTTGGATTGATAGATCCAATTTCTGGAATTTCATTAATATTATATCCATTATTTGGGCAGTACTCCAG
TATTATATTATCACTTACTATAACAGGACTTTGTTTATGCAGTTTCTTGATGTTAATCGGTGGAGCATCAAGATTAGTTT
ATGCACAAGCTAAAGATGGCGTATTTCCAAAAATTTTTAAATACCGCTCAAATACAAATGCTCCGCTTTCGGCAGTATTG
CTGATGGTTTTTGCAAACTTTTTAACACTATTTGCAGTTTATTTTAATTTAATTTCATTTAACGAAATAATTGCGGCAGT
AAACGCATTTTTAATTACGAATATAATAATGGCGGCAGTAGCTTCGATAAAGGTTTTTGAAAACGTAATGGAAAAAGGAT
TTGCAGTATTTTTATTGGTTTCGTTCCTGTTAATGTTTTTATTTTCTTCAAAAATGGTAATACTAATCATTTTAGCAATG
CTTTTTGGAACTGTCGTGTATACTTTGAAAAATAATAATTATAACATAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTGCAATTGGGATTCAGCTGGCACTTTTGAGTAAATAATAAATTTAAATTAATTTAAAAATGAAAAACGTGAAAATTAAA
CGGAATATACAGGAATATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTATAAATTAAAAAAATAGCGGATTTATTTTTTTTATTTTTTTTATTCTTTATTTTTGAATAATTTTTCTTTATAATAG
CTATTTGACGTATAAATCGC

Product: amino acid transporter

Products: Proton [Cytoplasm]; putrescine [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 417; Mature: 416

Protein sequence:

>417_residues
MSSKKLGPYTLSGLIVGPILGSGIVIIPPIVYDILKDYSIFAWVIMMTIGGVFAYFASKLCLKFPGDSGLTEVVGHSFGK
SYKNLNAYYLLIAMAMAPLVVIMVAGEYLSVLFSNYAFGAEFYSAVLMLIGGVILSRNISSVGKISMLISTVISTILVVG
GLFTILFYRKDALFTGTGISTIDVGYSFLIMFWSIIGWEILGNYSLEVENPEKTIPKAALVSVIAMSIVYLIVSGALQVL
DIGKLGLIDPISGISLILYPLFGQYSSIILSLTITGLCLCSFLMLIGGASRLVYAQAKDGVFPKIFKYRSNTNAPLSAVL
LMVFANFLTLFAVYFNLISFNEIIAAVNAFLITNIIMAAVASIKVFENVMEKGFAVFLLVSFLLMFLFSSKMVILIILAM
LFGTVVYTLKNNNYNIK

Sequences:

>Translated_417_residues
MSSKKLGPYTLSGLIVGPILGSGIVIIPPIVYDILKDYSIFAWVIMMTIGGVFAYFASKLCLKFPGDSGLTEVVGHSFGK
SYKNLNAYYLLIAMAMAPLVVIMVAGEYLSVLFSNYAFGAEFYSAVLMLIGGVILSRNISSVGKISMLISTVISTILVVG
GLFTILFYRKDALFTGTGISTIDVGYSFLIMFWSIIGWEILGNYSLEVENPEKTIPKAALVSVIAMSIVYLIVSGALQVL
DIGKLGLIDPISGISLILYPLFGQYSSIILSLTITGLCLCSFLMLIGGASRLVYAQAKDGVFPKIFKYRSNTNAPLSAVL
LMVFANFLTLFAVYFNLISFNEIIAAVNAFLITNIIMAAVASIKVFENVMEKGFAVFLLVSFLLMFLFSSKMVILIILAM
LFGTVVYTLKNNNYNIK
>Mature_416_residues
SSKKLGPYTLSGLIVGPILGSGIVIIPPIVYDILKDYSIFAWVIMMTIGGVFAYFASKLCLKFPGDSGLTEVVGHSFGKS
YKNLNAYYLLIAMAMAPLVVIMVAGEYLSVLFSNYAFGAEFYSAVLMLIGGVILSRNISSVGKISMLISTVISTILVVGG
LFTILFYRKDALFTGTGISTIDVGYSFLIMFWSIIGWEILGNYSLEVENPEKTIPKAALVSVIAMSIVYLIVSGALQVLD
IGKLGLIDPISGISLILYPLFGQYSSIILSLTITGLCLCSFLMLIGGASRLVYAQAKDGVFPKIFKYRSNTNAPLSAVLL
MVFANFLTLFAVYFNLISFNEIIAAVNAFLITNIIMAAVASIKVFENVMEKGFAVFLLVSFLLMFLFSSKMVILIILAML
FGTVVYTLKNNNYNIK

Specific function: Probable Putrescine-Ornithine Antiporter. [C]

COG id: COG0531

COG function: function code E; Amino acid transporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the amino acid-polyamine-organocation (APC) superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004841
- InterPro:   IPR002293 [H]

Pfam domain/function: PF00324 AA_permease [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45346; Mature: 45215

Theoretical pI: Translated: 9.18; Mature: 9.18

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
4.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSSKKLGPYTLSGLIVGPILGSGIVIIPPIVYDILKDYSIFAWVIMMTIGGVFAYFASKL
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CLKFPGDSGLTEVVGHSFGKSYKNLNAYYLLIAMAMAPLVVIMVAGEYLSVLFSNYAFGA
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EFYSAVLMLIGGVILSRNISSVGKISMLISTVISTILVVGGLFTILFYRKDALFTGTGIS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCC
TIDVGYSFLIMFWSIIGWEILGNYSLEVENPEKTIPKAALVSVIAMSIVYLIVSGALQVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DIGKLGLIDPISGISLILYPLFGQYSSIILSLTITGLCLCSFLMLIGGASRLVYAQAKDG
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCC
VFPKIFKYRSNTNAPLSAVLLMVFANFLTLFAVYFNLISFNEIIAAVNAFLITNIIMAAV
CCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASIKVFENVMEKGFAVFLLVSFLLMFLFSSKMVILIILAMLFGTVVYTLKNNNYNIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SSKKLGPYTLSGLIVGPILGSGIVIIPPIVYDILKDYSIFAWVIMMTIGGVFAYFASKL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CLKFPGDSGLTEVVGHSFGKSYKNLNAYYLLIAMAMAPLVVIMVAGEYLSVLFSNYAFGA
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EFYSAVLMLIGGVILSRNISSVGKISMLISTVISTILVVGGLFTILFYRKDALFTGTGIS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCC
TIDVGYSFLIMFWSIIGWEILGNYSLEVENPEKTIPKAALVSVIAMSIVYLIVSGALQVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DIGKLGLIDPISGISLILYPLFGQYSSIILSLTITGLCLCSFLMLIGGASRLVYAQAKDG
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCC
VFPKIFKYRSNTNAPLSAVLLMVFANFLTLFAVYFNLISFNEIIAAVNAFLITNIIMAAV
CCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASIKVFENVMEKGFAVFLLVSFLLMFLFSSKMVILIILAMLFGTVVYTLKNNNYNIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; putrescine [Periplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + putrescine [Periplasm] = Proton [Cytoplasm] + putrescine [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969499; 9384377 [H]