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Definition Helicobacter hepaticus ATCC 51449 chromosome, complete genome.
Accession NC_004917
Length 1,799,146

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The map label for this gene is 32265670

Identifier: 32265670

GI number: 32265670

Start: 163418

End: 165418

Strand: Direct

Name: 32265670

Synonym: HH0171

Alternate gene names: NA

Gene position: 163418-165418 (Clockwise)

Preceding gene: 32265669

Following gene: 32265671

Centisome position: 9.08

GC content: 35.13

Gene sequence:

>2001_bases
ATGCACTTACATCTGTTTTCATCATTACATAATCTCATTTTTAAACGCTTTATTTATGTCTATGATGCAGGATTCTTTGG
ACTTATTTATGCCATTAAGGCAATGATTGCAATTTGTATTAGTGGAACGATATGCTACACTCTTCTTGGCGGACAAGTGC
TTATTTGGTCTGTAATGATGGGAATGTATGTATTTTTCCTCAACGGCTTTAGAAGCAATAAAGATATGGATTGGAAATAT
CTTGTGCTTTTTGTTGCCTTTGTATGCGCGCTTATACCTATTTTTGGCATATGGGAAGAAAGCCTTTGGCTTATAATCCC
TTCTATGATTCTTGCCTTTGGGATTGGGATAAGCGAAGTATATGATAGCGATTTGCCAAAAGTGCTTACTCTTGCACTCA
TTAGCGCGCTTGTAGCAAATATTTATGCGGGCTCTCACCCAGAAATCTCATTATGGCAGTGTGTAGTTGCGGCTTTTATC
GGCGGAAGTGTGAGTATAGGCATACGGCTTTTTATTTCTTTTGGACAATATGGTAAGTTTATTCAAACACAATTTGTTGC
TATGCTCTTTGAACTTTCAATGATGAGTGAGAATCTTGGCACAAAAGATTATGATACAATCAAAACTCAAACACTCAATC
ACATCTCTTTGCTTAAGTCTAAGCTTACCTCTGCCTCTGCTAAAATCAAAGATGCTCATCTTATCAAAAACCATAAACGC
GCACTTTTTTATCTCTATAAACTTGAAAGTGTATGCTATGTGCTTGATTTAATGAATTATTATTTTTTACATCATCGCTC
TACTTTACTTATTCAAGCACAAAAAGAAATGACAAGCAATCTTTATGAACTCTCACATATTTTTTATGGCAAAAAGCCCT
CTATTACAAAAAAATCCCTCCTCAATGCTATGGAAAATAATGCGGATTCAGAATGGATTAACGCTCTTAAAATATTTTAT
TCCAAAATAGAATCTTTTACGCGACTTTCTTCTTTACAATCTCAAGCTTTTGTTGAAAATACTACCCCAAAAACTCTAAA
GATTATGCGCGATGCTCTTGCGCATAATCCCTATCCACTGCTTTATGGTATCCGATATGCAGGAGCAATCGGACTTGCTA
TGTTTTTTGCACAATTTTTTCAGATTAATCACGGCGCGTGGATTGCACTTGGGGTAGTTACAATGATGCACCCAAACATC
GGCACTATTAAGACATTGGGCAAAGATTCTATACTTGGAAGCCTCATTGGGTTATTGCTTGGTGTGAGCTTAGTATTTAT
AGCTTGGGATTCTCCTTTATTGTATATCATCTTTGTGCTCAATCTTTTTTTAGTTATTTATTTTAAAACTTATCCTTTTG
TGCTATGGTCTTTGGTGCTTATGCTTGAATTTGTATTAATGTTTGCCCTTGTGGATAATAATTTCATTGAACTTATCGCC
TATCGCTTTAGTGATATTTTACTTGGATTCTTATTTGCCTTTTTTATCTCTAAAATACTCTATCCACGATATAGTGCTGA
TGATTTGCTACCCCAAATAAAGCTTTGTCTTGAACATTTTGCCACACTCACTTTAGACTTAGAACAATCTCAAAGTAAAG
TGCTTGAAGGGCAAAATAAACTTGTGCGAAGCCTTGATGAGCTCTCCTTGCTTATCACGCAAAGTCAAAATGACAAAAAA
CTTTACTCACCTCATACCTTAAAGCTTTTTGATGAACTTATGCGGGATTTTTATCAACTTAAAGAATCTCTTATTATGCT
TTGTGAAAGGGTAATAGATAGAGAAAAAAAGCTTGAGACACTTTTAAACAATGACTTAAAAGCCCTTCGTGTGCGTTATG
AAATGCTTTGTGCAATGATAGAATCTCAGCCTTATTATTTTAAAACAGATGAAGATGAGCGATTCTTGCTTAAAGATGAA
TCTATCTATCCTATTGTGCGTGAGATTTTTGAGCTACAAAATCGCGTTTATAACTTCTTGCACACCACACTTGGTAAATA
A

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTAATTTTCAAAGTGTAGAATGTCGCACGATTTGCAATAATAATCAATGCACACAGCAGTGTATTAGCGCAAGTGGAGAT
TATTATAAAAAATAATCTCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGTGTTTTGAGATTTAAGCAAACCTAATCTACAATACATTTTTTAATTTTTATATTAAAATAAAAGGTTAAGAATGAAAA
AAGCATTAATCACAGGTGTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 666; Mature: 666

Protein sequence:

>666_residues
MHLHLFSSLHNLIFKRFIYVYDAGFFGLIYAIKAMIAICISGTICYTLLGGQVLIWSVMMGMYVFFLNGFRSNKDMDWKY
LVLFVAFVCALIPIFGIWEESLWLIIPSMILAFGIGISEVYDSDLPKVLTLALISALVANIYAGSHPEISLWQCVVAAFI
GGSVSIGIRLFISFGQYGKFIQTQFVAMLFELSMMSENLGTKDYDTIKTQTLNHISLLKSKLTSASAKIKDAHLIKNHKR
ALFYLYKLESVCYVLDLMNYYFLHHRSTLLIQAQKEMTSNLYELSHIFYGKKPSITKKSLLNAMENNADSEWINALKIFY
SKIESFTRLSSLQSQAFVENTTPKTLKIMRDALAHNPYPLLYGIRYAGAIGLAMFFAQFFQINHGAWIALGVVTMMHPNI
GTIKTLGKDSILGSLIGLLLGVSLVFIAWDSPLLYIIFVLNLFLVIYFKTYPFVLWSLVLMLEFVLMFALVDNNFIELIA
YRFSDILLGFLFAFFISKILYPRYSADDLLPQIKLCLEHFATLTLDLEQSQSKVLEGQNKLVRSLDELSLLITQSQNDKK
LYSPHTLKLFDELMRDFYQLKESLIMLCERVIDREKKLETLLNNDLKALRVRYEMLCAMIESQPYYFKTDEDERFLLKDE
SIYPIVREIFELQNRVYNFLHTTLGK

Sequences:

>Translated_666_residues
MHLHLFSSLHNLIFKRFIYVYDAGFFGLIYAIKAMIAICISGTICYTLLGGQVLIWSVMMGMYVFFLNGFRSNKDMDWKY
LVLFVAFVCALIPIFGIWEESLWLIIPSMILAFGIGISEVYDSDLPKVLTLALISALVANIYAGSHPEISLWQCVVAAFI
GGSVSIGIRLFISFGQYGKFIQTQFVAMLFELSMMSENLGTKDYDTIKTQTLNHISLLKSKLTSASAKIKDAHLIKNHKR
ALFYLYKLESVCYVLDLMNYYFLHHRSTLLIQAQKEMTSNLYELSHIFYGKKPSITKKSLLNAMENNADSEWINALKIFY
SKIESFTRLSSLQSQAFVENTTPKTLKIMRDALAHNPYPLLYGIRYAGAIGLAMFFAQFFQINHGAWIALGVVTMMHPNI
GTIKTLGKDSILGSLIGLLLGVSLVFIAWDSPLLYIIFVLNLFLVIYFKTYPFVLWSLVLMLEFVLMFALVDNNFIELIA
YRFSDILLGFLFAFFISKILYPRYSADDLLPQIKLCLEHFATLTLDLEQSQSKVLEGQNKLVRSLDELSLLITQSQNDKK
LYSPHTLKLFDELMRDFYQLKESLIMLCERVIDREKKLETLLNNDLKALRVRYEMLCAMIESQPYYFKTDEDERFLLKDE
SIYPIVREIFELQNRVYNFLHTTLGK
>Mature_666_residues
MHLHLFSSLHNLIFKRFIYVYDAGFFGLIYAIKAMIAICISGTICYTLLGGQVLIWSVMMGMYVFFLNGFRSNKDMDWKY
LVLFVAFVCALIPIFGIWEESLWLIIPSMILAFGIGISEVYDSDLPKVLTLALISALVANIYAGSHPEISLWQCVVAAFI
GGSVSIGIRLFISFGQYGKFIQTQFVAMLFELSMMSENLGTKDYDTIKTQTLNHISLLKSKLTSASAKIKDAHLIKNHKR
ALFYLYKLESVCYVLDLMNYYFLHHRSTLLIQAQKEMTSNLYELSHIFYGKKPSITKKSLLNAMENNADSEWINALKIFY
SKIESFTRLSSLQSQAFVENTTPKTLKIMRDALAHNPYPLLYGIRYAGAIGLAMFFAQFFQINHGAWIALGVVTMMHPNI
GTIKTLGKDSILGSLIGLLLGVSLVFIAWDSPLLYIIFVLNLFLVIYFKTYPFVLWSLVLMLEFVLMFALVDNNFIELIA
YRFSDILLGFLFAFFISKILYPRYSADDLLPQIKLCLEHFATLTLDLEQSQSKVLEGQNKLVRSLDELSLLITQSQNDKK
LYSPHTLKLFDELMRDFYQLKESLIMLCERVIDREKKLETLLNNDLKALRVRYEMLCAMIESQPYYFKTDEDERFLLKDE
SIYPIVREIFELQNRVYNFLHTTLGK

Specific function: Unknown

COG id: COG1289

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 76670; Mature: 76670

Theoretical pI: Translated: 8.01; Mature: 8.01

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHCC
>Mature Secondary Structure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HHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA