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Definition Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome, complete genome.
Accession NC_004663
Length 6,260,361

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The map label for this gene is 29346764

Identifier: 29346764

GI number: 29346764

Start: 1679076

End: 1680617

Strand: Reverse

Name: 29346764

Synonym: BT_1354

Alternate gene names: NA

Gene position: 1680617-1679076 (Counterclockwise)

Preceding gene: 29346765

Following gene: 29346763

Centisome position: 26.85

GC content: 28.53

Gene sequence:

>1542_bases
ATGAACGGAAATACTCGAACGAAGAGAAGTTTAAAAAATATGCAAACAGCATTGCTGTTTTATATTATTAATTTAGTATT
AGCTTTCATTTCTAGAAAAGTTTTTATCGACCATTTAGGTATTGAGGTATTAGGACTTAATACAACAGCTACTAATATTT
TGGGTTTTTTAAATATAGCTGAATTAGGTATAGGTTCTGCAATATCTTATACTCTTTATCATCCTTTATTTGAAAAAGAC
AGACAAATGGTGAATGAAATTGTTTCTGTGCAGGGATGGCTTTATCGTAAAGTTGCTTATGTTATGATATTGGGTGCTTG
TATTTTAATCTTTTTTTTTCCTTTAATTTTTAAAAAGATGGAGTTACCTATGTGGTATGCATATGCTTCTTTTATTGTAC
TATTAGTAAGTTCTTTATTTGGCTATTTTATCAATTATCGCCAAATTGTGCTTATTGCTGATCAAAAAGAATATAAAGTA
ACATATTGTGTACAAGGTGGTAAAACTTTGAAATATATATTGCAAATTATCGCAATCATGTGGCTTATGCATGGTTATGT
TTATTGGTTAGTTATAGAGCTTTTGGTTTCATTCATTATAGCGTGTGCTCTCAATGTAATTATAAAAAAAGAATATTTTT
GGTTGAATACTTACCCATCAAAAGGGAAACTTTTGAGAAAGAAGTATCCAGAAATCATTACTAAAACTAAACAATTATTT
TTTCATCGAATTGCAGCATTTGTATTGAGTCAAACAAGTCCTTTAATTATATATGCATATGCTTCATTAACGTTGGTGGC
TATATATGGTAACTATATGTTGATAATTGGTGGGATTACATTATTTGTTAATTCATGTTTTAATGGAATGTCTGCGGGAA
TAGGTAATTTGGTAGCAGAGGGAAATAAAGCGAAAATAAAGTCTTTTTATTGGGAAATGGTTGCTGTGCGTTATTGGTTT
GCATCTATACTTTGTTTTAGTTTATTTATGTTAACTAATTCTTTTGTTTCTCTATGGGTGGGGGAGAAGTATATACTGCC
TCAAAGTACTTTTATATTGCTACTTATTTATGTTTTTATTGTTTGTACAAGGGTGCATGATCTTTTTATTGCTGCTTTTG
GAATGTATCAGGATATATGGGCACCAGCTTTGGAGGCTGGTATTAATATAGGTTGTTCTATTTTATTGGGTTATTATTGG
GGATTAAATGGGATTATAGGCGGAGTAATTTTAAGTTTATTGTTGATTATATTTTGTTGGAAGCCTTATTTTCTTTTTAG
ATATGGTTTTAGGGATTCTATAAAGGGATATATATTTGTGTGTTTGAAATATCTATTATTAATATTTTTAGCTTCATTTA
TCACCTATCAGATAATTAATGTTTTTATGTACATTGAGGTTGATAATATAATGCAATGGATGATGAAAGCATGTTTATGT
GTAGGTGTTTATTTTATTGTAAGTGTAGTATTATTTAGAACTTTTGATTCTACTTTTTTTAAATTTATTAATCGTATTGT
TACCTTGATATACAAAAGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGTCTGTATGTTATACTATTAGCTGGAATTTATTAGGCAAAAAAATTAGGTATATTTTGAAGGGTAGTAAGGAGAATCA
ACAATAATCTTTTGATATTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGATAGAGAATTGCCTTTAGTGAGTGTAATTGTTCCTGTTTATAATGTAGAAAAATATCTGAGACAATGTTTAGATTCA
TTGATCTCTCAAACGCTTCA

Product: putative flippase

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 513; Mature: 513

Protein sequence:

>513_residues
MNGNTRTKRSLKNMQTALLFYIINLVLAFISRKVFIDHLGIEVLGLNTTATNILGFLNIAELGIGSAISYTLYHPLFEKD
RQMVNEIVSVQGWLYRKVAYVMILGACILIFFFPLIFKKMELPMWYAYASFIVLLVSSLFGYFINYRQIVLIADQKEYKV
TYCVQGGKTLKYILQIIAIMWLMHGYVYWLVIELLVSFIIACALNVIIKKEYFWLNTYPSKGKLLRKKYPEIITKTKQLF
FHRIAAFVLSQTSPLIIYAYASLTLVAIYGNYMLIIGGITLFVNSCFNGMSAGIGNLVAEGNKAKIKSFYWEMVAVRYWF
ASILCFSLFMLTNSFVSLWVGEKYILPQSTFILLLIYVFIVCTRVHDLFIAAFGMYQDIWAPALEAGINIGCSILLGYYW
GLNGIIGGVILSLLLIIFCWKPYFLFRYGFRDSIKGYIFVCLKYLLLIFLASFITYQIINVFMYIEVDNIMQWMMKACLC
VGVYFIVSVVLFRTFDSTFFKFINRIVTLIYKR

Sequences:

>Translated_513_residues
MNGNTRTKRSLKNMQTALLFYIINLVLAFISRKVFIDHLGIEVLGLNTTATNILGFLNIAELGIGSAISYTLYHPLFEKD
RQMVNEIVSVQGWLYRKVAYVMILGACILIFFFPLIFKKMELPMWYAYASFIVLLVSSLFGYFINYRQIVLIADQKEYKV
TYCVQGGKTLKYILQIIAIMWLMHGYVYWLVIELLVSFIIACALNVIIKKEYFWLNTYPSKGKLLRKKYPEIITKTKQLF
FHRIAAFVLSQTSPLIIYAYASLTLVAIYGNYMLIIGGITLFVNSCFNGMSAGIGNLVAEGNKAKIKSFYWEMVAVRYWF
ASILCFSLFMLTNSFVSLWVGEKYILPQSTFILLLIYVFIVCTRVHDLFIAAFGMYQDIWAPALEAGINIGCSILLGYYW
GLNGIIGGVILSLLLIIFCWKPYFLFRYGFRDSIKGYIFVCLKYLLLIFLASFITYQIINVFMYIEVDNIMQWMMKACLC
VGVYFIVSVVLFRTFDSTFFKFINRIVTLIYKR
>Mature_513_residues
MNGNTRTKRSLKNMQTALLFYIINLVLAFISRKVFIDHLGIEVLGLNTTATNILGFLNIAELGIGSAISYTLYHPLFEKD
RQMVNEIVSVQGWLYRKVAYVMILGACILIFFFPLIFKKMELPMWYAYASFIVLLVSSLFGYFINYRQIVLIADQKEYKV
TYCVQGGKTLKYILQIIAIMWLMHGYVYWLVIELLVSFIIACALNVIIKKEYFWLNTYPSKGKLLRKKYPEIITKTKQLF
FHRIAAFVLSQTSPLIIYAYASLTLVAIYGNYMLIIGGITLFVNSCFNGMSAGIGNLVAEGNKAKIKSFYWEMVAVRYWF
ASILCFSLFMLTNSFVSLWVGEKYILPQSTFILLLIYVFIVCTRVHDLFIAAFGMYQDIWAPALEAGINIGCSILLGYYW
GLNGIIGGVILSLLLIIFCWKPYFLFRYGFRDSIKGYIFVCLKYLLLIFLASFITYQIINVFMYIEVDNIMQWMMKACLC
VGVYFIVSVVLFRTFDSTFFKFINRIVTLIYKR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59322; Mature: 59322

Theoretical pI: Translated: 9.62; Mature: 9.62

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.1 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
5.5 %Cys+Met (Translated Protein)
2.1 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
5.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNGNTRTKRSLKNMQTALLFYIINLVLAFISRKVFIDHLGIEVLGLNTTATNILGFLNIA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHH
ELGIGSAISYTLYHPLFEKDRQMVNEIVSVQGWLYRKVAYVMILGACILIFFFPLIFKKM
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELPMWYAYASFIVLLVSSLFGYFINYRQIVLIADQKEYKVTYCVQGGKTLKYILQIIAIM
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH
WLMHGYVYWLVIELLVSFIIACALNVIIKKEYFWLNTYPSKGKLLRKKYPEIITKTKQLF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FHRIAAFVLSQTSPLIIYAYASLTLVAIYGNYMLIIGGITLFVNSCFNGMSAGIGNLVAE
HHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCC
GNKAKIKSFYWEMVAVRYWFASILCFSLFMLTNSFVSLWVGEKYILPQSTFILLLIYVFI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHH
VCTRVHDLFIAAFGMYQDIWAPALEAGINIGCSILLGYYWGLNGIIGGVILSLLLIIFCW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KPYFLFRYGFRDSIKGYIFVCLKYLLLIFLASFITYQIINVFMYIEVDNIMQWMMKACLC
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHH
VGVYFIVSVVLFRTFDSTFFKFINRIVTLIYKR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNGNTRTKRSLKNMQTALLFYIINLVLAFISRKVFIDHLGIEVLGLNTTATNILGFLNIA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHH
ELGIGSAISYTLYHPLFEKDRQMVNEIVSVQGWLYRKVAYVMILGACILIFFFPLIFKKM
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELPMWYAYASFIVLLVSSLFGYFINYRQIVLIADQKEYKVTYCVQGGKTLKYILQIIAIM
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH
WLMHGYVYWLVIELLVSFIIACALNVIIKKEYFWLNTYPSKGKLLRKKYPEIITKTKQLF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FHRIAAFVLSQTSPLIIYAYASLTLVAIYGNYMLIIGGITLFVNSCFNGMSAGIGNLVAE
HHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCC
GNKAKIKSFYWEMVAVRYWFASILCFSLFMLTNSFVSLWVGEKYILPQSTFILLLIYVFI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHH
VCTRVHDLFIAAFGMYQDIWAPALEAGINIGCSILLGYYWGLNGIIGGVILSLLLIIFCW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KPYFLFRYGFRDSIKGYIFVCLKYLLLIFLASFITYQIINVFMYIEVDNIMQWMMKACLC
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHH
VGVYFIVSVVLFRTFDSTFFKFINRIVTLIYKR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA