| Definition | Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004663 |
| Length | 6,260,361 |
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The map label for this gene is 29346764
Identifier: 29346764
GI number: 29346764
Start: 1679076
End: 1680617
Strand: Reverse
Name: 29346764
Synonym: BT_1354
Alternate gene names: NA
Gene position: 1680617-1679076 (Counterclockwise)
Preceding gene: 29346765
Following gene: 29346763
Centisome position: 26.85
GC content: 28.53
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGGATAGAGAATTGCCTTTAGTGAGTGTAATTGTTCCTGTTTATAATGTAGAAAAATATCTGAGACAATGTTTAGATTCA TTGATCTCTCAAACGCTTCA
Product: putative flippase
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 513; Mature: 513
Protein sequence:
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Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 59322; Mature: 59322
Theoretical pI: Translated: 9.62; Mature: 9.62
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.1 %Cys (Translated Protein) 3.3 %Met (Translated Protein) 5.5 %Cys+Met (Translated Protein) 2.1 %Cys (Mature Protein) 3.3 %Met (Mature Protein) 5.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNGNTRTKRSLKNMQTALLFYIINLVLAFISRKVFIDHLGIEVLGLNTTATNILGFLNIA CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHH ELGIGSAISYTLYHPLFEKDRQMVNEIVSVQGWLYRKVAYVMILGACILIFFFPLIFKKM HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELPMWYAYASFIVLLVSSLFGYFINYRQIVLIADQKEYKVTYCVQGGKTLKYILQIIAIM CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH WLMHGYVYWLVIELLVSFIIACALNVIIKKEYFWLNTYPSKGKLLRKKYPEIITKTKQLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH FHRIAAFVLSQTSPLIIYAYASLTLVAIYGNYMLIIGGITLFVNSCFNGMSAGIGNLVAE HHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCC GNKAKIKSFYWEMVAVRYWFASILCFSLFMLTNSFVSLWVGEKYILPQSTFILLLIYVFI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHH VCTRVHDLFIAAFGMYQDIWAPALEAGINIGCSILLGYYWGLNGIIGGVILSLLLIIFCW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KPYFLFRYGFRDSIKGYIFVCLKYLLLIFLASFITYQIINVFMYIEVDNIMQWMMKACLC HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHH VGVYFIVSVVLFRTFDSTFFKFINRIVTLIYKR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MNGNTRTKRSLKNMQTALLFYIINLVLAFISRKVFIDHLGIEVLGLNTTATNILGFLNIA CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHH ELGIGSAISYTLYHPLFEKDRQMVNEIVSVQGWLYRKVAYVMILGACILIFFFPLIFKKM HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELPMWYAYASFIVLLVSSLFGYFINYRQIVLIADQKEYKVTYCVQGGKTLKYILQIIAIM CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH WLMHGYVYWLVIELLVSFIIACALNVIIKKEYFWLNTYPSKGKLLRKKYPEIITKTKQLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH FHRIAAFVLSQTSPLIIYAYASLTLVAIYGNYMLIIGGITLFVNSCFNGMSAGIGNLVAE HHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCC GNKAKIKSFYWEMVAVRYWFASILCFSLFMLTNSFVSLWVGEKYILPQSTFILLLIYVFI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHH VCTRVHDLFIAAFGMYQDIWAPALEAGINIGCSILLGYYWGLNGIIGGVILSLLLIIFCW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KPYFLFRYGFRDSIKGYIFVCLKYLLLIFLASFITYQIINVFMYIEVDNIMQWMMKACLC HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHH VGVYFIVSVVLFRTFDSTFFKFINRIVTLIYKR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA