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The map label for this gene is 28377065

Identifier: 28377065

GI number: 28377065

Start: 101717

End: 102916

Strand: Direct

Name: 28377065

Synonym: lp_0116

Alternate gene names: NA

Gene position: 101717-102916 (Clockwise)

Preceding gene: 28377064

Following gene: 28377066

Centisome position: 3.07

GC content: 49.08

Gene sequence:

>1200_bases
ATGAAACATGACGGGATTTTTCGGAGCCAATTTTTATTGTGGCTCGGTGCGGCTATCTCAATTGCCGAAATCTTAACAGG
TACGCTGATGGCACCACTGGGGCTGACACGCGGATTGGCTGCGATTGTATTGGGGCACTTGATCGGCTGTGGCCTGTTCT
TGGTTCCAGCCGGCTATTTGGGGGCTAAATTACACCAGTCCGCGTTAGCGTCAGCCCAACTGGCTTTTGGTCGCGGCGGG
GTGTTACTAGCGTCAGGACTCAACGCCTTGCAACTCGTTGGCTGGACGGCGGTGATGATCGTCAATGCTCAGTTAGCCAT
GAACAGTATTAGTGGAAAGCTATTTGGCTTTCGAAGTCCGCTATTAATGGCAACCATCGTGGCGATTTTGATTATTGCGT
GGTTGCTCATGGGTAGTCAGTTACTGTTCAAAATCAACAATGCCGTTGTGGGCTTGTTGGTGCTCGGGACGGTGTTAATG
CTCGTAATGGTATTTATGGCACCGACAACTAGTCAGTCGGTATCACCGACTAGTATGACGTTTGGGCAAGCAGTGGAATT
GAACGTTACGATGGCACTCTCATGGTTGCCACTAATTGGTGATTATACCCAGCGTGTTGATCGTCCTTTACCAGTCGCAC
TAGTCAGCGCGGGTGGCTATATGTTAGGCAGTTTAGTGATGTTTGTGACGGGGCTATTAGTTGTGTTACGGACAGGGCAA
ACTGATATCACGGCATTGCTGACGCGGTCCGGTTTAGGATTGGTTGCATTGCTGATTATCGTTTTCTCAACGGTGACGAC
GACATTTTTAGATACTTATTCGGCCGCCACGAGTTTGGCTAATCTGACCGGTAGCCGCCATGTTAATCGATTAGCCGTTG
GTGTGACGGTAGTTGGGCTATTGATTGCGCTGACGGTTGCCATGACGTATTATCAGAACTTCCTGTATTTGATTGGTTCG
GTCTTCACACCGCTATATGCTATTATCTTCGTCACGTACTTTGTGCGGCACGCTACGTTACCATACTGGTTGAACTTTTG
CTGGTGGGTTGTGGGGATTGTCGCCTATTATCAGTTACAGGCCATTGATTTCATTGGTGGCACGACGCTATTAGTATTGG
TTGGGCTGAGCATCGCCGTCTGGTTGACGGGAATTATCGTCAAACCAACTGCACTCGGATATCGCGAGCTTAGTCATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTACTGGTGCGGCTGGCGCTGCGGTGATCTCAATGTTAACGCGTAGTCCCGATATGGCCGCCACGGTCAAGGCGATGCTA
ACGGCTACGGAGGGGCACTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAATTAGATGTAAAAAGTAAATGATAATCCCATTGGTAATGCGCATGTTACCGTGGGATTTTTTTGAGAGAGGGCGACAG
AATGGTTAAACCGATAATTG

Product: purine-cytosine transport protein

Products: NA

Alternate protein names: Permease For Cytosine/Purines Uracil Thiamine Allantoin; Cytosine Permease; Thiamine/Thiamine Cation Symporter; Permease; Purine-Cytosine Permease ; CytX-Like Hydroxymethylpyrimidine Transporter Protein; Cytosine/Purines/Uracil Permease; NCS1 Nucleoside Transporter; NCS1 Family Transporter; Purine-Cytosine Permease Related Protein; Permease For Cytosine/Purine Uracil Thiamine Allantoin

Number of amino acids: Translated: 399; Mature: 399

Protein sequence:

>399_residues
MKHDGIFRSQFLLWLGAAISIAEILTGTLMAPLGLTRGLAAIVLGHLIGCGLFLVPAGYLGAKLHQSALASAQLAFGRGG
VLLASGLNALQLVGWTAVMIVNAQLAMNSISGKLFGFRSPLLMATIVAILIIAWLLMGSQLLFKINNAVVGLLVLGTVLM
LVMVFMAPTTSQSVSPTSMTFGQAVELNVTMALSWLPLIGDYTQRVDRPLPVALVSAGGYMLGSLVMFVTGLLVVLRTGQ
TDITALLTRSGLGLVALLIIVFSTVTTTFLDTYSAATSLANLTGSRHVNRLAVGVTVVGLLIALTVAMTYYQNFLYLIGS
VFTPLYAIIFVTYFVRHATLPYWLNFCWWVVGIVAYYQLQAIDFIGGTTLLVLVGLSIAVWLTGIIVKPTALGYRELSH

Sequences:

>Translated_399_residues
MKHDGIFRSQFLLWLGAAISIAEILTGTLMAPLGLTRGLAAIVLGHLIGCGLFLVPAGYLGAKLHQSALASAQLAFGRGG
VLLASGLNALQLVGWTAVMIVNAQLAMNSISGKLFGFRSPLLMATIVAILIIAWLLMGSQLLFKINNAVVGLLVLGTVLM
LVMVFMAPTTSQSVSPTSMTFGQAVELNVTMALSWLPLIGDYTQRVDRPLPVALVSAGGYMLGSLVMFVTGLLVVLRTGQ
TDITALLTRSGLGLVALLIIVFSTVTTTFLDTYSAATSLANLTGSRHVNRLAVGVTVVGLLIALTVAMTYYQNFLYLIGS
VFTPLYAIIFVTYFVRHATLPYWLNFCWWVVGIVAYYQLQAIDFIGGTTLLVLVGLSIAVWLTGIIVKPTALGYRELSH
>Mature_399_residues
MKHDGIFRSQFLLWLGAAISIAEILTGTLMAPLGLTRGLAAIVLGHLIGCGLFLVPAGYLGAKLHQSALASAQLAFGRGG
VLLASGLNALQLVGWTAVMIVNAQLAMNSISGKLFGFRSPLLMATIVAILIIAWLLMGSQLLFKINNAVVGLLVLGTVLM
LVMVFMAPTTSQSVSPTSMTFGQAVELNVTMALSWLPLIGDYTQRVDRPLPVALVSAGGYMLGSLVMFVTGLLVVLRTGQ
TDITALLTRSGLGLVALLIIVFSTVTTTFLDTYSAATSLANLTGSRHVNRLAVGVTVVGLLIALTVAMTYYQNFLYLIGS
VFTPLYAIIFVTYFVRHATLPYWLNFCWWVVGIVAYYQLQAIDFIGGTTLLVLVGLSIAVWLTGIIVKPTALGYRELSH

Specific function: Unknown

COG id: COG1457

COG function: function code F; Purine-cytosine permease and related proteins

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 42575; Mature: 42575

Theoretical pI: Translated: 9.84; Mature: 9.84

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKHDGIFRSQFLLWLGAAISIAEILTGTLMAPLGLTRGLAAIVLGHLIGCGLFLVPAGYL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
GAKLHQSALASAQLAFGRGGVLLASGLNALQLVGWTAVMIVNAQLAMNSISGKLFGFRSP
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCH
LLMATIVAILIIAWLLMGSQLLFKINNAVVGLLVLGTVLMLVMVFMAPTTSQSVSPTSMT
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
FGQAVELNVTMALSWLPLIGDYTQRVDRPLPVALVSAGGYMLGSLVMFVTGLLVVLRTGQ
CCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
TDITALLTRSGLGLVALLIIVFSTVTTTFLDTYSAATSLANLTGSRHVNRLAVGVTVVGL
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH
LIALTVAMTYYQNFLYLIGSVFTPLYAIIFVTYFVRHATLPYWLNFCWWVVGIVAYYQLQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIDFIGGTTLLVLVGLSIAVWLTGIIVKPTALGYRELSH
HHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKHDGIFRSQFLLWLGAAISIAEILTGTLMAPLGLTRGLAAIVLGHLIGCGLFLVPAGYL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
GAKLHQSALASAQLAFGRGGVLLASGLNALQLVGWTAVMIVNAQLAMNSISGKLFGFRSP
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCH
LLMATIVAILIIAWLLMGSQLLFKINNAVVGLLVLGTVLMLVMVFMAPTTSQSVSPTSMT
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
FGQAVELNVTMALSWLPLIGDYTQRVDRPLPVALVSAGGYMLGSLVMFVTGLLVVLRTGQ
CCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
TDITALLTRSGLGLVALLIIVFSTVTTTFLDTYSAATSLANLTGSRHVNRLAVGVTVVGL
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH
LIALTVAMTYYQNFLYLIGSVFTPLYAIIFVTYFVRHATLPYWLNFCWWVVGIVAYYQLQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIDFIGGTTLLVLVGLSIAVWLTGIIVKPTALGYRELSH
HHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA