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Definition Clostridium tetani E88 chromosome, complete genome.
Accession NC_004557
Length 2,799,251

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The map label for this gene is 28211611

Identifier: 28211611

GI number: 28211611

Start: 2112398

End: 2113471

Strand: Direct

Name: 28211611

Synonym: CTC01986

Alternate gene names: NA

Gene position: 2112398-2113471 (Clockwise)

Preceding gene: 28211610

Following gene: 28211612

Centisome position: 75.46

GC content: 24.39

Gene sequence:

>1074_bases
ATGAACACAATGAAAAAATTCTTGCATAATCCGCTATTTTATAAAGACTTTAAAAGTGCTAGGTGGATTTCTCTTATTTT
GTTACTATACCTAATTAAATTTAAGTTACTAATTTTTAGTCCAATTTTAAACACTATTAAGTCTAACATAACTAATTTTA
CTGATATTTCGCCAGGGAATATGACCCCTTTTAAGGCTGAAATGGCATATTGGTTTAAAAATAATTTATTATACTCAGAT
CAAGATATGATTGTAATAACTATTTTTGTTGTAATATTATTGATTGTACTTTTTAAAAACGAAAGAAATAACTCTACTTA
TTCTTTTACTGCATCTATGCCTTTTAAAAGAGAAGAAATAGTAAAAATAAAATGGATTGCAGGAATGTTCTCCATATCCA
TACCTTTTTTTATAACTTTTATATTAATAAGTATATTTTACTTTAAAAATACAAATTGGATTAACGATCCATATATTATA
GTTTTTCAATGGTTTATTATAAATATACTAACCTTCACAGCTATATTTTCTTTTATATTTTTTATACAGACTATTATGGG
ACAGAATATAACTGCTAGTATAATAGGTGCTCTTGTACTAGGAATTCCTGGTGCATGTATTGTTATGAGCATTGACTTTA
TATTATCACATTATAAAAATCCTATTTACCCTAAAGACATTCCCTATATACTTGAAAAAGTTATGATTTATTTTATGAGT
TTTCCAGATTATTCTATACAAAAGTTAGGTGAATATACAACTCGGGTTTCATATTACAAAAATTTTCAAATTAAAATTAT
AATTTTAATTTTAACTTGTATTGTAACTTATGCTCTTTCCATATACTTTTTTAAGCGAAATTCTCTTGAAAAAACTGGAT
TCTTAATTATGTTTAAACCCTTTGAATATATTCTTAAATTTATTGTAGCTATATTTTTAGGTCTTTTAATGGCCCTTATA
TTTGGTCAAAGCTATGCTGAAGATACTTTAGTAGTTATGTATGTATCTTTAACACTTGGATTTTTAGCTTCATATTTTAT
TACTGACAAATGTATTAAATATTATTCTAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTAAAGAATTGGAAGAAAAACTTAAATCTATGAGTGCCCTATTTATAGAAGAGCTAGATTTAAGTCTTGAGGATATGTT
TATTTATTCTGTAGAGGAGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTAATAAGGAGGCAATATGGATTATATATTAGAATGTAATGATTTAGTTAAAAAGTATGGAAATAAAATTGTCTTAAAT
AATTTAAATCTTAAAATCCC

Product: membrane spanning protein

Products: NA

Alternate protein names: Membrane Spanning Protein

Number of amino acids: Translated: 357; Mature: 357

Protein sequence:

>357_residues
MNTMKKFLHNPLFYKDFKSARWISLILLLYLIKFKLLIFSPILNTIKSNITNFTDISPGNMTPFKAEMAYWFKNNLLYSD
QDMIVITIFVVILLIVLFKNERNNSTYSFTASMPFKREEIVKIKWIAGMFSISIPFFITFILISIFYFKNTNWINDPYII
VFQWFIINILTFTAIFSFIFFIQTIMGQNITASIIGALVLGIPGACIVMSIDFILSHYKNPIYPKDIPYILEKVMIYFMS
FPDYSIQKLGEYTTRVSYYKNFQIKIIILILTCIVTYALSIYFFKRNSLEKTGFLIMFKPFEYILKFIVAIFLGLLMALI
FGQSYAEDTLVVMYVSLTLGFLASYFITDKCIKYYSK

Sequences:

>Translated_357_residues
MNTMKKFLHNPLFYKDFKSARWISLILLLYLIKFKLLIFSPILNTIKSNITNFTDISPGNMTPFKAEMAYWFKNNLLYSD
QDMIVITIFVVILLIVLFKNERNNSTYSFTASMPFKREEIVKIKWIAGMFSISIPFFITFILISIFYFKNTNWINDPYII
VFQWFIINILTFTAIFSFIFFIQTIMGQNITASIIGALVLGIPGACIVMSIDFILSHYKNPIYPKDIPYILEKVMIYFMS
FPDYSIQKLGEYTTRVSYYKNFQIKIIILILTCIVTYALSIYFFKRNSLEKTGFLIMFKPFEYILKFIVAIFLGLLMALI
FGQSYAEDTLVVMYVSLTLGFLASYFITDKCIKYYSK
>Mature_357_residues
MNTMKKFLHNPLFYKDFKSARWISLILLLYLIKFKLLIFSPILNTIKSNITNFTDISPGNMTPFKAEMAYWFKNNLLYSD
QDMIVITIFVVILLIVLFKNERNNSTYSFTASMPFKREEIVKIKWIAGMFSISIPFFITFILISIFYFKNTNWINDPYII
VFQWFIINILTFTAIFSFIFFIQTIMGQNITASIIGALVLGIPGACIVMSIDFILSHYKNPIYPKDIPYILEKVMIYFMS
FPDYSIQKLGEYTTRVSYYKNFQIKIIILILTCIVTYALSIYFFKRNSLEKTGFLIMFKPFEYILKFIVAIFLGLLMALI
FGQSYAEDTLVVMYVSLTLGFLASYFITDKCIKYYSK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 41893; Mature: 41893

Theoretical pI: Translated: 9.74; Mature: 9.74

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
4.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
4.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNTMKKFLHNPLFYKDFKSARWISLILLLYLIKFKLLIFSPILNTIKSNITNFTDISPGN
CCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
MTPFKAEMAYWFKNNLLYSDQDMIVITIFVVILLIVLFKNERNNSTYSFTASMPFKREEI
CCCHHHHHHHHHHCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHH
VKIKWIAGMFSISIPFFITFILISIFYFKNTNWINDPYIIVFQWFIINILTFTAIFSFIF
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIQTIMGQNITASIIGALVLGIPGACIVMSIDFILSHYKNPIYPKDIPYILEKVMIYFMS
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHC
FPDYSIQKLGEYTTRVSYYKNFQIKIIILILTCIVTYALSIYFFKRNSLEKTGFLIMFKP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECC
FEYILKFIVAIFLGLLMALIFGQSYAEDTLVVMYVSLTLGFLASYFITDKCIKYYSK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNTMKKFLHNPLFYKDFKSARWISLILLLYLIKFKLLIFSPILNTIKSNITNFTDISPGN
CCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
MTPFKAEMAYWFKNNLLYSDQDMIVITIFVVILLIVLFKNERNNSTYSFTASMPFKREEI
CCCHHHHHHHHHHCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHH
VKIKWIAGMFSISIPFFITFILISIFYFKNTNWINDPYIIVFQWFIINILTFTAIFSFIF
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIQTIMGQNITASIIGALVLGIPGACIVMSIDFILSHYKNPIYPKDIPYILEKVMIYFMS
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHC
FPDYSIQKLGEYTTRVSYYKNFQIKIIILILTCIVTYALSIYFFKRNSLEKTGFLIMFKP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECC
FEYILKFIVAIFLGLLMALIFGQSYAEDTLVVMYVSLTLGFLASYFITDKCIKYYSK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA