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The map label for this gene is yccS [H]

Identifier: 28198731

GI number: 28198731

Start: 1022066

End: 1024288

Strand: Reverse

Name: yccS [H]

Synonym: PD0826

Alternate gene names: 28198731

Gene position: 1024288-1022066 (Counterclockwise)

Preceding gene: 28198732

Following gene: 28198728

Centisome position: 40.65

GC content: 51.42

Gene sequence:

>2223_bases
TTGAGCAACTCCATTAGATCCTGGATAAGTAACCTTAAGTTCGGGTTCAATCATCTGTGGACACATGAGAAAACCAGCTA
CTTCCTGCGCGTGCTGATCGCACTGTCGGTCACAGTTGCTATGTGCTGGAAGACGAACCACCTGGATGCAGTCGGAAGCC
TTTTCTTGGGAATCATTGCCAGTGCTATCGCAGAGACTGACGATAACTGGTTAGGCCGTAGCAAGGCGGTGTTGCTATCG
CTTTTGTGTTTTGTTGGCGCCGGTGCCAGCGTGGTGTTTTTATTCCCGCATCCAGGATGGTTGGTGCTGAGTATGGCGAT
CTCAACGTTCACGTTGACTTTACTCGGTGCACTCGGCGAGCGTTATGCCTTGATCGCTCAAGCTACTGTGGCTTTAGCCA
TCTACGCAATGATCGACGTTGACCGTGGCGGGGATCAGCCGTGGCATGGTGTCACGTTATTGATGATCGGTGCTACTTGG
TATGGTGTGCTATCGATTCTATGGGTCCTGTTATTTGCCAACCGCCCAGTGCGCGAACGGCTGTCACGATTGTTTGAAGA
GTTAGGCCACTACCTACAACTTAAAGCCGATTTACTGGAACCAGTGCGGCAAAGCGATTTATATGCCATACGCTTGGCGC
TGTCTGAGCAAAACGCACGCGTAGTCACCGCACTGAACGATGTAAAAGACGTGATCATCTCTCGGTTCGGTCGCTCTGGT
CGGCCCGGCATGCGCTCTGGGGTGTACTTTCGACTGTATTACATGGCTCAGGAGTTTCACGAACGCGCTAGCTCCTCACA
CTATCCTTATGAAGCGCTGACCGAGGCATTTTTCCACAGCGACATCCTGTATCGCTGCCAACGCCTGCTCAGCCTTCAGG
GGATACTCTGCGCCGGATTGGGGAAAGCAATCCAGCTCGGTCGTCCGTTTATTTATGGTGATGATACGAGTCTGGCCAGC
GAAGATTTATACAAGTCGCTAAGCTTCTTAAAAACCCGCACCAAAGCAGCACAAAAGCGCTTACTGGGTGCGCTGGATCT
GTTAGTAAGCAATCTGCAAACAATCGAGCGACGTCTCTTTGAAGCTGCACAGTTGGATACCGCCACCGAGCAGATGGACA
TGCGCTTAAGCGATTCATCCCCACACAGTTTGAACGAAATGATGACACGCCTGGGGGAGCAACTCACCCCCAATTCGATA
CTGTTCCGACACGGTCTACGTATGGCCATCGCATTAAGTGTCGGCTATTTGGTGGTCCATTTGATGACTACCATCAATGG
CTACTGGATTCTATTAACGACTGCCTTCGTCTGCCGCCCCCACTACGACGCGACGCGGCTGCGCTTGATACAGAACATTC
TGGGTACGTTGCTTGGATTGCTGGTTGCCTGGGTGTTAATGCAATTGTTCTCCAGCATCACATTACATTTGCTGTTTGCT
CTGCTAAGTACGCTTGTCTTTATCCTCACCCGTACCGAACGTTATATGGTTGGCACGACTGCGGTTACAGCGATGGCGCT
GTTCTGTTTTAGCCTCATCGGCGATGGCTTTGTAATGATCTGGCCGCGTTTGTTGGATACCTTGATCGGCTGTGCGATTG
CTGCTGCTGCGGCATTCTTGATCCTTCCTGACTGGCAAGGCCGACGGCTGCATAAGATCTGCGCTCATGTGATTAACACT
TGCAAGAATTATCTGGAAAAAGTCCTCGAATATTATCGTGATCAGCCCGTTGATGACCTGGAGTACCGTATTGCACGTCG
CGATATGAATAATGCGGATGCGGCCTTATCAGCAGCGCTAGCACATATGCTGCGTGAGCCTGGGCGCTATCGCCGCAACC
TTGATACTGGATTCCGCTTCCTGGCACTTACCAACACGTTACTAGGTCATCTGTCGGCGCTAGGGGCACATCGCGCACCA
CTGGCAGACATATCAAACACAGCGCAGTTAGACGAAGCGAGTGCTTATGTAGGAGAAGGATTACAAGCCATAGCACGTGC
ATTGGAGAAACGCAAAGCCCCTTCTATTATGAAAGAAACACAGATCGAACAAGAGTTGATTGATGCACTGGAAGCCATCA
AGGAATCTGAAGACCGCACCCGTCACTTGCTCGCGATTCAGTTGGCGTTGCTATTGCGATTGTTACCGCAACTACGTGCC
GGAGTCACTGCACTGATGCAGCCGGCACCGACTGAAGACAATCCGGATCTGGCCACCACGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGTTTTCAGAGTCAAGAGATCAGGGAAACACGGGTTTTCTCCTTTCCGGTTTTCTTAGTCCCTCTATGCGATTTGAATCC
AAATTTCTGGAAAAACCGGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACCATCTGTTCAGCACCTGATGGAGGAATAATGCTCTGCATCACTGATCAAAAGCGACTGTATGGCTTTCCCACTCCAAG
GGTGCTGAGAAGATTGGAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 740; Mature: 739

Protein sequence:

>740_residues
MSNSIRSWISNLKFGFNHLWTHEKTSYFLRVLIALSVTVAMCWKTNHLDAVGSLFLGIIASAIAETDDNWLGRSKAVLLS
LLCFVGAGASVVFLFPHPGWLVLSMAISTFTLTLLGALGERYALIAQATVALAIYAMIDVDRGGDQPWHGVTLLMIGATW
YGVLSILWVLLFANRPVRERLSRLFEELGHYLQLKADLLEPVRQSDLYAIRLALSEQNARVVTALNDVKDVIISRFGRSG
RPGMRSGVYFRLYYMAQEFHERASSSHYPYEALTEAFFHSDILYRCQRLLSLQGILCAGLGKAIQLGRPFIYGDDTSLAS
EDLYKSLSFLKTRTKAAQKRLLGALDLLVSNLQTIERRLFEAAQLDTATEQMDMRLSDSSPHSLNEMMTRLGEQLTPNSI
LFRHGLRMAIALSVGYLVVHLMTTINGYWILLTTAFVCRPHYDATRLRLIQNILGTLLGLLVAWVLMQLFSSITLHLLFA
LLSTLVFILTRTERYMVGTTAVTAMALFCFSLIGDGFVMIWPRLLDTLIGCAIAAAAAFLILPDWQGRRLHKICAHVINT
CKNYLEKVLEYYRDQPVDDLEYRIARRDMNNADAALSAALAHMLREPGRYRRNLDTGFRFLALTNTLLGHLSALGAHRAP
LADISNTAQLDEASAYVGEGLQAIARALEKRKAPSIMKETQIEQELIDALEAIKESEDRTRHLLAIQLALLLRLLPQLRA
GVTALMQPAPTEDNPDLATT

Sequences:

>Translated_740_residues
MSNSIRSWISNLKFGFNHLWTHEKTSYFLRVLIALSVTVAMCWKTNHLDAVGSLFLGIIASAIAETDDNWLGRSKAVLLS
LLCFVGAGASVVFLFPHPGWLVLSMAISTFTLTLLGALGERYALIAQATVALAIYAMIDVDRGGDQPWHGVTLLMIGATW
YGVLSILWVLLFANRPVRERLSRLFEELGHYLQLKADLLEPVRQSDLYAIRLALSEQNARVVTALNDVKDVIISRFGRSG
RPGMRSGVYFRLYYMAQEFHERASSSHYPYEALTEAFFHSDILYRCQRLLSLQGILCAGLGKAIQLGRPFIYGDDTSLAS
EDLYKSLSFLKTRTKAAQKRLLGALDLLVSNLQTIERRLFEAAQLDTATEQMDMRLSDSSPHSLNEMMTRLGEQLTPNSI
LFRHGLRMAIALSVGYLVVHLMTTINGYWILLTTAFVCRPHYDATRLRLIQNILGTLLGLLVAWVLMQLFSSITLHLLFA
LLSTLVFILTRTERYMVGTTAVTAMALFCFSLIGDGFVMIWPRLLDTLIGCAIAAAAAFLILPDWQGRRLHKICAHVINT
CKNYLEKVLEYYRDQPVDDLEYRIARRDMNNADAALSAALAHMLREPGRYRRNLDTGFRFLALTNTLLGHLSALGAHRAP
LADISNTAQLDEASAYVGEGLQAIARALEKRKAPSIMKETQIEQELIDALEAIKESEDRTRHLLAIQLALLLRLLPQLRA
GVTALMQPAPTEDNPDLATT
>Mature_739_residues
SNSIRSWISNLKFGFNHLWTHEKTSYFLRVLIALSVTVAMCWKTNHLDAVGSLFLGIIASAIAETDDNWLGRSKAVLLSL
LCFVGAGASVVFLFPHPGWLVLSMAISTFTLTLLGALGERYALIAQATVALAIYAMIDVDRGGDQPWHGVTLLMIGATWY
GVLSILWVLLFANRPVRERLSRLFEELGHYLQLKADLLEPVRQSDLYAIRLALSEQNARVVTALNDVKDVIISRFGRSGR
PGMRSGVYFRLYYMAQEFHERASSSHYPYEALTEAFFHSDILYRCQRLLSLQGILCAGLGKAIQLGRPFIYGDDTSLASE
DLYKSLSFLKTRTKAAQKRLLGALDLLVSNLQTIERRLFEAAQLDTATEQMDMRLSDSSPHSLNEMMTRLGEQLTPNSIL
FRHGLRMAIALSVGYLVVHLMTTINGYWILLTTAFVCRPHYDATRLRLIQNILGTLLGLLVAWVLMQLFSSITLHLLFAL
LSTLVFILTRTERYMVGTTAVTAMALFCFSLIGDGFVMIWPRLLDTLIGCAIAAAAAFLILPDWQGRRLHKICAHVINTC
KNYLEKVLEYYRDQPVDDLEYRIARRDMNNADAALSAALAHMLREPGRYRRNLDTGFRFLALTNTLLGHLSALGAHRAPL
ADISNTAQLDEASAYVGEGLQAIARALEKRKAPSIMKETQIEQELIDALEAIKESEDRTRHLLAIQLALLLRLLPQLRAG
VTALMQPAPTEDNPDLATT

Specific function: Unknown

COG id: COG1289

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the yccS/yhfK family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081808, Length=733, Percent_Identity=35.8799454297408, Blast_Score=411, Evalue=1e-116,
Organism=Escherichia coli, GI87082248, Length=258, Percent_Identity=27.1317829457364, Blast_Score=77, Evalue=5e-15,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010019
- InterPro:   IPR010020 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 82737; Mature: 82605

Theoretical pI: Translated: 8.31; Mature: 8.31

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSNSIRSWISNLKFGFNHLWTHEKTSYFLRVLIALSVTVAMCWKTNHLDAVGSLFLGIIA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
SAIAETDDNWLGRSKAVLLSLLCFVGAGASVVFLFPHPGWLVLSMAISTFTLTLLGALGE
HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RYALIAQATVALAIYAMIDVDRGGDQPWHGVTLLMIGATWYGVLSILWVLLFANRPVRER
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
LSRLFEELGHYLQLKADLLEPVRQSDLYAIRLALSEQNARVVTALNDVKDVIISRFGRSG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
RPGMRSGVYFRLYYMAQEFHERASSSHYPYEALTEAFFHSDILYRCQRLLSLQGILCAGL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GKAIQLGRPFIYGDDTSLASEDLYKSLSFLKTRTKAAQKRLLGALDLLVSNLQTIERRLF
HHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EAAQLDTATEQMDMRLSDSSPHSLNEMMTRLGEQLTPNSILFRHGLRMAIALSVGYLVVH
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMTTINGYWILLTTAFVCRPHYDATRLRLIQNILGTLLGLLVAWVLMQLFSSITLHLLFA
HHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLSTLVFILTRTERYMVGTTAVTAMALFCFSLIGDGFVMIWPRLLDTLIGCAIAAAAAFL
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILPDWQGRRLHKICAHVINTCKNYLEKVLEYYRDQPVDDLEYRIARRDMNNADAALSAAL
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
AHMLREPGRYRRNLDTGFRFLALTNTLLGHLSALGAHRAPLADISNTAQLDEASAYVGEG
HHHHHCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
LQAIARALEKRKAPSIMKETQIEQELIDALEAIKESEDRTRHLLAIQLALLLRLLPQLRA
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVTALMQPAPTEDNPDLATT
HHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SNSIRSWISNLKFGFNHLWTHEKTSYFLRVLIALSVTVAMCWKTNHLDAVGSLFLGIIA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
SAIAETDDNWLGRSKAVLLSLLCFVGAGASVVFLFPHPGWLVLSMAISTFTLTLLGALGE
HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RYALIAQATVALAIYAMIDVDRGGDQPWHGVTLLMIGATWYGVLSILWVLLFANRPVRER
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
LSRLFEELGHYLQLKADLLEPVRQSDLYAIRLALSEQNARVVTALNDVKDVIISRFGRSG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
RPGMRSGVYFRLYYMAQEFHERASSSHYPYEALTEAFFHSDILYRCQRLLSLQGILCAGL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GKAIQLGRPFIYGDDTSLASEDLYKSLSFLKTRTKAAQKRLLGALDLLVSNLQTIERRLF
HHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EAAQLDTATEQMDMRLSDSSPHSLNEMMTRLGEQLTPNSILFRHGLRMAIALSVGYLVVH
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMTTINGYWILLTTAFVCRPHYDATRLRLIQNILGTLLGLLVAWVLMQLFSSITLHLLFA
HHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLSTLVFILTRTERYMVGTTAVTAMALFCFSLIGDGFVMIWPRLLDTLIGCAIAAAAAFL
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILPDWQGRRLHKICAHVINTCKNYLEKVLEYYRDQPVDDLEYRIARRDMNNADAALSAAL
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
AHMLREPGRYRRNLDTGFRFLALTNTLLGHLSALGAHRAPLADISNTAQLDEASAYVGEG
HHHHHCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
LQAIARALEKRKAPSIMKETQIEQELIDALEAIKESEDRTRHLLAIQLALLLRLLPQLRA
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVTALMQPAPTEDNPDLATT
HHHHHCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905232; 9278503 [H]