Definition Chlamydophila abortus S26/3, complete genome.
Accession NC_004552
Length 1,144,377

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The map label for this gene is 62184664

Identifier: 62184664

GI number: 62184664

Start: 26660

End: 29317

Strand: Direct

Name: 62184664

Synonym: CAB017

Alternate gene names: NA

Gene position: 26660-29317 (Clockwise)

Preceding gene: 62184662

Following gene: 62184665

Centisome position: 2.33

GC content: 38.98

Gene sequence:

>2658_bases
ATGTTAATTTTATTAAAAATAAAAGTTAACAAGACTGTTTTCCGTATGGATATCATCAATAGTTACTCTGTTTCAGCAAA
TTATAAAAAATTACCGATACTACCTTGCTCAGATTCAATACAAAAACGCCACCAGTTATTAGAAAGTGTTTTTCATTACG
AAAAGACTGAGTTTGAACGTTATGTAGTGCAGAGATTGATCTGTATTTTAGATCAAAAAGCTGATGAAAAGTACCGGCAG
TTAATAGATAAACTGCATAAGTTTGAAATAGAAGACCGGGTGATCCCTAAGGAAAATCGAGTTTCAGCTGTTCATCGTAA
GCCTTTATCAGATTTACACGCCCCGATTGCCGTTGTAGCTACGACTTCTGCTGTAGGTAGTAGTGACAGCTTACCTACAG
AAGACCCTTTCTATAATGCGACTAAACAACAGTGGGCCCACAACTTATTAGGAGAAATCAAAAATGTAGTGGATAAGATC
GTGGGAGCCGTAGTGAGACTGGCTGGTAAGCCAACCTTACTTCCAAGAGATGGGAGTGTGCGCTCTTCAATCGAAAAGGT
GGAAAAAGAACCAGAGAAACCCTCACAAGAGGAGTTAGATAAAGCAGCGCTTTTGAAAATCCAAACAGAGGTTCAACGTT
TATTTGATCTTGGTACGAATTTAACAAACGCAGATTTTGAATCTCTATACCGCTTGTCGAAGCAGATTTTCGATACGGTT
CAAACATCCACTCTTTTTATGGGTGGCCAGAAAACAGATTTTATCAATGAGCTCTCAGCAGAATATGGCAATGCAGATCA
ATTAGCTCAAGTTTTTGCGGATGGTCGTATTGAGGGATTAAAAGATGTTCTCAATGTAGTTAAAAGGAAGTTAACAGAAG
AAGAATACAGCATTTTCTCAGAAGTAGAAAAAGCATTAGCGAGTTTGCAAACCTCAGTACACACCTACGACCAAGAAAAA
TTTGATCTTATCGATCAAATCGGAGACGAATTAGCAGATACAATTAATGCATCTGCCTTATCGAGAAATGATAAAATCGA
TTTATGTGCACAGATCTCCTATTTATATAAAGATCAAGTATCTGCTGTAGATTCTTTTAATGTTGTTGTTGATGCAACTA
TTTTCGTCAACAGTCACCAAGAGGCTATTTTCGATCAGATATCTAATTTAGTATCCTCCTTGATGGGGGTATTTGCTCCT
ATCAACTTAGGACAAGTGACTACGGAGATCAGTAGTGCGGCCATAGCCGGAGCATTACAAGCTGTCCGTGCAATCAATTC
TAGGTTCAATGATCTAACAGATGCACAACAAAAATTAGTCAATGATGCTTTTAAAACACTAACAACGTTCAAAGCTCCTA
GTTATATAGGGGCGATATGGGCCTATTTTGTTGCTTCGACTGTATTAGCTACTAATACAACAGCTTCAATGGAGAATATT
GGTGCTGTCATAAGAGAAGCGGCAAAAGAGATGGGGAGCTCAAAACTTGATATAGCCTCCTCTATTAAGACTACAATGGA
GAACATTGTATCAGCAAATGGGCAGTTTAAACCGGGGAATACTGATAACGGGCAAGAAGAAACTTATACAATTTATTCAC
AACAAAACGGCTCTGGAGTAAAAATCAATGCCCAGCTTTTAAATCGTGGAAACGTAGGATTTTTACCTAAAATAACGGTT
GCAGCCAACGCGCATGCAGAAAGTACAGCTAGAGCTTATTTCGCATTTAAAGGACTAGCTGGAGTACAAATAGCACAACT
CCAATCTAAGATAGATGAATCCCGAGGGCAACTTAAGGATTATCAAGCTTTAAAGGCAGAGCTCTATAAGGATCAATTAT
ATGCACAATCTAATGAGCTGCAAGCGATGGCATTACCTTCAGCTGTGGCTTCGGTATTAATCGATCGTTATATGCCTAAG
GAAGTGGGTTTTTTAAATGGTATTTACGATCAGCTGTACTATAGCAACCTCGGATCGTCAGTTGGAAATGCAATGATAGA
CGTTATTTCCGAGTATGTGAACGCGGCTACATATTTCAATTTTGCCAGTTATGTGGGTCAGCAACCTGCTGTAGGACAGA
AAGGTAAAGATGTATTTCCTGGAACTGCGGATAGCGCGAGAAATAAATTAGAAACAGAACGAAAAAAAGCAGCTGCCTAT
CTTAAAAGTACGCAAGATGCAAAAATAGTATTGGAAGAGCAGGTAAAAAGAGTCACTGAAGATTCCAAAATTTCGAATGA
GCAACGTACACGCATCATCGATTCTTTAAATAACTACAGAGATAATTTGAATGTGATATCAGGATCTTTAGTCTTGTTAC
AAAACTATTTAGCTCCTTTAGGTGTGAGTGAAGGTGAAGTTGCTGGAACGTTTCAAGTTACCGGTGGAGAAGAACAATGG
CAGGCACGACTGGAGATTTTAGAAGATGCGTTAGTATCTGGGTTATCAGGTAATGCTATCAGTGGGGGGATGTTCCCATT
ACAAGCTACTATACAATCAGATCAGCAGTCTTATGCCGACATGGGACAGAACTACCAGCTAGAGTTACAAATGCACCTAA
CGTCTATGCAGCAAGAATGGACCGTTGTCGCGACATCTTTACAGGTGTTAAATCAGATGTATCTGAGTTTGGCAAGAAGT
TTGATGGGCAATTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAACTTTTTTTCTATTAAATTTTTTATTTTTCTTATAGTCCTGTTATTTTTGTTTTTAAGAAAAACGATTTATTTTTGAT
TAATTATAAAAATAGTTTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATTTTTCTTATAGGCAACCAGGGTTTGGCATGATTTTCGCTCCTTATTTTCTTGTGAAAGGAAGAAATAGAAGGGAGGG
AGTTATGACCACGCCACAGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 885; Mature: 885

Protein sequence:

>885_residues
MLILLKIKVNKTVFRMDIINSYSVSANYKKLPILPCSDSIQKRHQLLESVFHYEKTEFERYVVQRLICILDQKADEKYRQ
LIDKLHKFEIEDRVIPKENRVSAVHRKPLSDLHAPIAVVATTSAVGSSDSLPTEDPFYNATKQQWAHNLLGEIKNVVDKI
VGAVVRLAGKPTLLPRDGSVRSSIEKVEKEPEKPSQEELDKAALLKIQTEVQRLFDLGTNLTNADFESLYRLSKQIFDTV
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QARLEILEDALVSGLSGNAISGGMFPLQATIQSDQQSYADMGQNYQLELQMHLTSMQQEWTVVATSLQVLNQMYLSLARS
LMGNL

Sequences:

>Translated_885_residues
MLILLKIKVNKTVFRMDIINSYSVSANYKKLPILPCSDSIQKRHQLLESVFHYEKTEFERYVVQRLICILDQKADEKYRQ
LIDKLHKFEIEDRVIPKENRVSAVHRKPLSDLHAPIAVVATTSAVGSSDSLPTEDPFYNATKQQWAHNLLGEIKNVVDKI
VGAVVRLAGKPTLLPRDGSVRSSIEKVEKEPEKPSQEELDKAALLKIQTEVQRLFDLGTNLTNADFESLYRLSKQIFDTV
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AANAHAESTARAYFAFKGLAGVQIAQLQSKIDESRGQLKDYQALKAELYKDQLYAQSNELQAMALPSAVASVLIDRYMPK
EVGFLNGIYDQLYYSNLGSSVGNAMIDVISEYVNAATYFNFASYVGQQPAVGQKGKDVFPGTADSARNKLETERKKAAAY
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LMGNL
>Mature_885_residues
MLILLKIKVNKTVFRMDIINSYSVSANYKKLPILPCSDSIQKRHQLLESVFHYEKTEFERYVVQRLICILDQKADEKYRQ
LIDKLHKFEIEDRVIPKENRVSAVHRKPLSDLHAPIAVVATTSAVGSSDSLPTEDPFYNATKQQWAHNLLGEIKNVVDKI
VGAVVRLAGKPTLLPRDGSVRSSIEKVEKEPEKPSQEELDKAALLKIQTEVQRLFDLGTNLTNADFESLYRLSKQIFDTV
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FDLIDQIGDELADTINASALSRNDKIDLCAQISYLYKDQVSAVDSFNVVVDATIFVNSHQEAIFDQISNLVSSLMGVFAP
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QARLEILEDALVSGLSGNAISGGMFPLQATIQSDQQSYADMGQNYQLELQMHLTSMQQEWTVVATSLQVLNQMYLSLARS
LMGNL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 97757; Mature: 97757

Theoretical pI: Translated: 4.98; Mature: 4.98

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLILLKIKVNKTVFRMDIINSYSVSANYKKLPILPCSDSIQKRHQLLESVFHYEKTEFER
CEEEEEEEECCEEEEEEHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YVVQRLICILDQKADEKYRQLIDKLHKFEIEDRVIPKENRVSAVHRKPLSDLHAPIAVVA
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHCCCEEEEE
TTSAVGSSDSLPTEDPFYNATKQQWAHNLLGEIKNVVDKIVGAVVRLAGKPTLLPRDGSV
ECHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH
RSSIEKVEKEPEKPSQEELDKAALLKIQTEVQRLFDLGTNLTNADFESLYRLSKQIFDTV
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHEECCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EVEKALASLQTSVHTYDQEKFDLIDQIGDELADTINASALSRNDKIDLCAQISYLYKDQV
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SAVDSFNVVVDATIFVNSHQEAIFDQISNLVSSLMGVFAPINLGQVTTEISSAAIAGALQ
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MGQNYQLELQMHLTSMQQEWTVVATSLQVLNQMYLSLARSLMGNL
CCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
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MGQNYQLELQMHLTSMQQEWTVVATSLQVLNQMYLSLARSLMGNL
CCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA