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The map label for this gene is gerKA [H]

Identifier: 23098149

GI number: 23098149

Start: 730663

End: 732213

Strand: Direct

Name: gerKA [H]

Synonym: OB0694

Alternate gene names: 23098149

Gene position: 730663-732213 (Clockwise)

Preceding gene: 23098146

Following gene: 23098150

Centisome position: 20.13

GC content: 34.04

Gene sequence:

>1551_bases
TTGAAAAGATCTATACTATCTAAGTTAAAAAATCAGCAATTAGATAAAAAACGTGCTACTTCTATACAGCGGCCTGCAAA
AACGGAATTATCGATATCAAGTAAGTTAAGTACAAACCTTCAAAATATAAAGCAATCTATCGGTAATCCAGACGATTTAA
ATTTACGTAATATCAAAGTCGGTAAGATGAATACAAACTGTGGTATTGCCTATATTTCCGGAATAACCGATGAAACACTT
ATTAATAATAATATTATCCAAAACCTTCAACAAAATTTAAAAGATGTTGAAGTCGATCTAATAGAGAACATTAAGTTAGA
GGTAATATCCATAACTTCAATTGAAGAAACGGAGAATATGGATAAGATTATTGATTATATCTTAGATGGACAAACTGTAT
TTTTTATTGATGGTGAAAAGATGGCTTTAGTCATCGGTTCTTCTGGTGGTAAGGAACGCTCTGTGGAACAGCCTCAATCA
GAAACATTAATTCATGGTCCACGAGACGGGTTTATCGAAAATCTAGAGGTGAATTTATCTTTAATTCGAAGAGATTTAAG
AGATCCGAAATTGCGTTATAAAAGCTTTGAGATCGGATCGAGATCAAAACAAAAGGTCGTGCTTTGTTATATAGAGGATT
TAATTAATCCTGATATTTTAGAGGAAGTAATACGAAGAATTCAATCTATAGATACGGAATATGTAACGGATTCTGCACAA
ATTGAACAATGGATCGAGGATAGTTCCCTATCACCTTTTCCTCAAATGATTAGCTCAGAAAGACCAGATAAAGCATCATT
TGAAATGTTACATGGGAAATTTGTAATTTTAGTAGATGGTACTCCTTTTTGTATCATTGGCCCAATTGTTCTGAATGATA
TTGTGAAATCAATGGAAGATTATAACCAACGTTGGATAATGGCATCTTTGTTGCGTGTATTGCGATTTATTGCATGTATC
ATTGCATTATTTTTGCCAGGAATTTATATTGCTTTGGTATCATTTCATCCTGGTATGCTGCCTACATCTTTAGTATTTTC
TATTGCGGCTAGTAGAGAAGGTATGCCTTTTAATGCAGCTGTTGAAGTGTTATTAATGGCTATGGTGTTTGAGATGCTTC
AAGAAGCTGCTATACGGCTGCCAAAAGTAATTGGCCAAACTATTAGTATAGTTGGAGGTTTAGTAATTGGGGAATCAGCT
GTAAATGCAGGAATTGCGAGTCCGATTATCGTTATTGTGACAGCATTAACAGCTATTGCAAGTTTTTGTGTTCCCTATTA
TAGTGTAGCAATTAGTTTTCGCGCAATACGATTTGGTGTAATGTTCGCCTCTGCAGTACTCGGACTTTACGGGCTGATTC
TATCTTTAATTGTAATGGTTATTCATATTACAAACCTAAAAAGTTTTGGTGTACCATACAGTGTTCCGTTAATGCCGATG
ATGAAAAAAGATATATCCGATATTATTATCCGTGCGCCAATTACTATTTTAACAAAGCGTGATAACTTTTTGCAGAACTT
AAATCAACCGAAAAAAGGTCGGAAAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TACTCAAGTAAAATTAGTTAATTCGGTCATCCTGTAGTGAATAATTAACCTGTTCTGTGGAATGGTAAAAGAAAAATACT
AGATGTTTGGGGGTATCGCG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAGAACAGTAAATTATACGGATGGAAAAATTTCAAATGTAACCATTGGTGTTTCGGTTTTGAGTATGGTTGTTGCAGTG
GGGATCTTAACCTATCCACG

Product: spore germination protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 516; Mature: 516

Protein sequence:

>516_residues
MKRSILSKLKNQQLDKKRATSIQRPAKTELSISSKLSTNLQNIKQSIGNPDDLNLRNIKVGKMNTNCGIAYISGITDETL
INNNIIQNLQQNLKDVEVDLIENIKLEVISITSIEETENMDKIIDYILDGQTVFFIDGEKMALVIGSSGGKERSVEQPQS
ETLIHGPRDGFIENLEVNLSLIRRDLRDPKLRYKSFEIGSRSKQKVVLCYIEDLINPDILEEVIRRIQSIDTEYVTDSAQ
IEQWIEDSSLSPFPQMISSERPDKASFEMLHGKFVILVDGTPFCIIGPIVLNDIVKSMEDYNQRWIMASLLRVLRFIACI
IALFLPGIYIALVSFHPGMLPTSLVFSIAASREGMPFNAAVEVLLMAMVFEMLQEAAIRLPKVIGQTISIVGGLVIGESA
VNAGIASPIIVIVTALTAIASFCVPYYSVAISFRAIRFGVMFASAVLGLYGLILSLIVMVIHITNLKSFGVPYSVPLMPM
MKKDISDIIIRAPITILTKRDNFLQNLNQPKKGRKN

Sequences:

>Translated_516_residues
MKRSILSKLKNQQLDKKRATSIQRPAKTELSISSKLSTNLQNIKQSIGNPDDLNLRNIKVGKMNTNCGIAYISGITDETL
INNNIIQNLQQNLKDVEVDLIENIKLEVISITSIEETENMDKIIDYILDGQTVFFIDGEKMALVIGSSGGKERSVEQPQS
ETLIHGPRDGFIENLEVNLSLIRRDLRDPKLRYKSFEIGSRSKQKVVLCYIEDLINPDILEEVIRRIQSIDTEYVTDSAQ
IEQWIEDSSLSPFPQMISSERPDKASFEMLHGKFVILVDGTPFCIIGPIVLNDIVKSMEDYNQRWIMASLLRVLRFIACI
IALFLPGIYIALVSFHPGMLPTSLVFSIAASREGMPFNAAVEVLLMAMVFEMLQEAAIRLPKVIGQTISIVGGLVIGESA
VNAGIASPIIVIVTALTAIASFCVPYYSVAISFRAIRFGVMFASAVLGLYGLILSLIVMVIHITNLKSFGVPYSVPLMPM
MKKDISDIIIRAPITILTKRDNFLQNLNQPKKGRKN
>Mature_516_residues
MKRSILSKLKNQQLDKKRATSIQRPAKTELSISSKLSTNLQNIKQSIGNPDDLNLRNIKVGKMNTNCGIAYISGITDETL
INNNIIQNLQQNLKDVEVDLIENIKLEVISITSIEETENMDKIIDYILDGQTVFFIDGEKMALVIGSSGGKERSVEQPQS
ETLIHGPRDGFIENLEVNLSLIRRDLRDPKLRYKSFEIGSRSKQKVVLCYIEDLINPDILEEVIRRIQSIDTEYVTDSAQ
IEQWIEDSSLSPFPQMISSERPDKASFEMLHGKFVILVDGTPFCIIGPIVLNDIVKSMEDYNQRWIMASLLRVLRFIACI
IALFLPGIYIALVSFHPGMLPTSLVFSIAASREGMPFNAAVEVLLMAMVFEMLQEAAIRLPKVIGQTISIVGGLVIGESA
VNAGIASPIIVIVTALTAIASFCVPYYSVAISFRAIRFGVMFASAVLGLYGLILSLIVMVIHITNLKSFGVPYSVPLMPM
MKKDISDIIIRAPITILTKRDNFLQNLNQPKKGRKN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the gerABKA family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004995 [H]

Pfam domain/function: PF03323 GerA [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57478; Mature: 57478

Theoretical pI: Translated: 7.41; Mature: 7.41

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKRSILSKLKNQQLDKKRATSIQRPAKTELSISSKLSTNLQNIKQSIGNPDDLNLRNIKV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEE
GKMNTNCGIAYISGITDETLINNNIIQNLQQNLKDVEVDLIENIKLEVISITSIEETENM
EEECCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCHHHCCH
DKIIDYILDGQTVFFIDGEKMALVIGSSGGKERSVEQPQSETLIHGPRDGFIENLEVNLS
HHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHH
LIRRDLRDPKLRYKSFEIGSRSKQKVVLCYIEDLINPDILEEVIRRIQSIDTEYVTDSAQ
HHHHHHCCCHHHCCEECCCCCCCCCEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHH
IEQWIEDSSLSPFPQMISSERPDKASFEMLHGKFVILVDGTPFCIIGPIVLNDIVKSMED
HHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHCCEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHH
YNQRWIMASLLRVLRFIACIIALFLPGIYIALVSFHPGMLPTSLVFSIAASREGMPFNAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
VEVLLMAMVFEMLQEAAIRLPKVIGQTISIVGGLVIGESAVNAGIASPIIVIVTALTAIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
SFCVPYYSVAISFRAIRFGVMFASAVLGLYGLILSLIVMVIHITNLKSFGVPYSVPLMPM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCCHHH
MKKDISDIIIRAPITILTKRDNFLQNLNQPKKGRKN
HHHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKRSILSKLKNQQLDKKRATSIQRPAKTELSISSKLSTNLQNIKQSIGNPDDLNLRNIKV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEE
GKMNTNCGIAYISGITDETLINNNIIQNLQQNLKDVEVDLIENIKLEVISITSIEETENM
EEECCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCHHHCCH
DKIIDYILDGQTVFFIDGEKMALVIGSSGGKERSVEQPQSETLIHGPRDGFIENLEVNLS
HHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHH
LIRRDLRDPKLRYKSFEIGSRSKQKVVLCYIEDLINPDILEEVIRRIQSIDTEYVTDSAQ
HHHHHHCCCHHHCCEECCCCCCCCCEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHH
IEQWIEDSSLSPFPQMISSERPDKASFEMLHGKFVILVDGTPFCIIGPIVLNDIVKSMED
HHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHCCEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHH
YNQRWIMASLLRVLRFIACIIALFLPGIYIALVSFHPGMLPTSLVFSIAASREGMPFNAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
VEVLLMAMVFEMLQEAAIRLPKVIGQTISIVGGLVIGESAVNAGIASPIIVIVTALTAIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
SFCVPYYSVAISFRAIRFGVMFASAVLGLYGLILSLIVMVIHITNLKSFGVPYSVPLMPM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCCHHH
MKKDISDIIIRAPITILTKRDNFLQNLNQPKKGRKN
HHHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]