| Definition | Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum), complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004061 |
| Length | 641,454 |
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The map label for this gene is mviN
Identifier: 21672597
GI number: 21672597
Start: 367801
End: 369345
Strand: Reverse
Name: mviN
Synonym: BUsg321
Alternate gene names: 21672597
Gene position: 369345-367801 (Counterclockwise)
Preceding gene: 21672599
Following gene: 21672596
Centisome position: 57.58
GC content: 23.62
Gene sequence:
>1545_bases ATGAATATTCTAAAGTCTTTAATATCAGTAGGCATAATGACATTAATATCACGCATATTTGGTTTTTTTCGTGATGTTTT AATTGCTCACATCTTCGGTGCCTCTATGTTTACTGATGCTTTTTTTATAGCTTTTAAAATTCCTAATTTATTACGTCGAA TTTTTGCTGAAGGGGCATTTTATCAATCTTTTATTCCTATTTTAATAGATTACAAATCAAGAAAAGACAAGGAATATATA CAAGAATTCATTAGATCTACATGTGGTTTTACTATATTAGTTTTAACTACTTTTGTTATTTTAGGAATAATTTTTTCTGA TTATATTATTTTTATTAGCGCTCCAGGATTTTCTGAATCGTCTAAAAAATTACAATTAGCTAGTAACTTGTTAAAAATTA TGTTTCCTTATATTTTATTTATTTCTTTATCATCATTATGTTCATCTATTTTGAATAGTTATAATTATTTTTTTATCCCT TCTCTTTCTTCTAGTCTGTTAAACATTAGTATAATAGTTTTTTCATTTTTTTTTAGTGATTATTTTGAACCTTCTATAAT CTCCTTAGCATGGTCTGTTATGATAGGTGGTTTTTTTCAGCTATTTTATCAATTTCCACATTTGTATAAAATAAAAATGT TGGTTTTTCCTAAGATTAATTTTAAAAATATTGGTCTTATAAAGGTTTTAAAGAAGATGGGACCTTCTACCTTAGGTTCT TGTGCCAATCAAATTTCTTTAATCTTTAATACTATTTTTAGCTCTCTTTTGCACTCTGGTTCAATATCTTGGATTTATTA TGCTGATCGATTAATTGAATTTCCAATAGGTATTATAGGTGTATCTTTAAGTACTATTTTATTTACATCTTTTTCTTGTA GTTATTCAAATAATACTCAATCAGAATATAAAATATTACTTAATTGGGGAATTCGTTTTGGTTTAATTTTGTCTTTACCT ATTTCTGTTATATTATTTATGTTTTCAAAACCATTAGTTATTATTTTATTTCAATATGGAAAATTTACAGATTTTGATGT TCTAATGACTCAAAAAGCACTAGAATTGTATTCTTTTGGTTTAGTTTCTTTTATTTTAGTCAAAATTTTAGTTTCAGCTT TTTATTCTTGTCAAGAAGTCAATATTCCAATGCGAATTTCAATTTTAACATTGTTTTTAACACAATTAATGAATCCATTC TTAATTTTTTATTTTCAGCATTCAGGTCTTGCTTTGTCTTGTAGTATAGCTAGCTGGATAAATTTTTTTTTACTTTATTG GAAATTATATCAAAAGGGAATAATCAATTTTAAATTGAATGATTTTATTTTTATTTTTCGTTTATTAATTGCAGTATTAG TCATGACATTTTTTTTAATTTTTATGTTATATTTTATTCCTTCTTGGAAGATTGGTTCATTTTTTGATAAGATAATACGT TTATTTACTATTTTATCAATTTCTGGAATAGTATATTTAATTGCTTTACATTTTTTAGGAATACGTTTATTGAATTATTC TGATAAATTATTTCAAAAAAAATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTATTAAAACACTCTATATGTAAAAATATATTTATTTTTTAAAAATTAATTCTAAATTATGATTATAATGTTTTAACCTC ATAGGTTAGATTAATTTCAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTATATATGGAAAAATTAATTTAAATATATTATTTTTAATACTAATATAGTATTTGTATTATAATTTAATATTATAAGTA TTTTTTGTCAAAAATATAAA
Product: virulence factor MviN
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 514; Mature: 514
Protein sequence:
>514_residues MNILKSLISVGIMTLISRIFGFFRDVLIAHIFGASMFTDAFFIAFKIPNLLRRIFAEGAFYQSFIPILIDYKSRKDKEYI QEFIRSTCGFTILVLTTFVILGIIFSDYIIFISAPGFSESSKKLQLASNLLKIMFPYILFISLSSLCSSILNSYNYFFIP SLSSSLLNISIIVFSFFFSDYFEPSIISLAWSVMIGGFFQLFYQFPHLYKIKMLVFPKINFKNIGLIKVLKKMGPSTLGS CANQISLIFNTIFSSLLHSGSISWIYYADRLIEFPIGIIGVSLSTILFTSFSCSYSNNTQSEYKILLNWGIRFGLILSLP ISVILFMFSKPLVIILFQYGKFTDFDVLMTQKALELYSFGLVSFILVKILVSAFYSCQEVNIPMRISILTLFLTQLMNPF LIFYFQHSGLALSCSIASWINFFLLYWKLYQKGIINFKLNDFIFIFRLLIAVLVMTFFLIFMLYFIPSWKIGSFFDKIIR LFTILSISGIVYLIALHFLGIRLLNYSDKLFQKK
Sequences:
>Translated_514_residues MNILKSLISVGIMTLISRIFGFFRDVLIAHIFGASMFTDAFFIAFKIPNLLRRIFAEGAFYQSFIPILIDYKSRKDKEYI QEFIRSTCGFTILVLTTFVILGIIFSDYIIFISAPGFSESSKKLQLASNLLKIMFPYILFISLSSLCSSILNSYNYFFIP SLSSSLLNISIIVFSFFFSDYFEPSIISLAWSVMIGGFFQLFYQFPHLYKIKMLVFPKINFKNIGLIKVLKKMGPSTLGS CANQISLIFNTIFSSLLHSGSISWIYYADRLIEFPIGIIGVSLSTILFTSFSCSYSNNTQSEYKILLNWGIRFGLILSLP ISVILFMFSKPLVIILFQYGKFTDFDVLMTQKALELYSFGLVSFILVKILVSAFYSCQEVNIPMRISILTLFLTQLMNPF LIFYFQHSGLALSCSIASWINFFLLYWKLYQKGIINFKLNDFIFIFRLLIAVLVMTFFLIFMLYFIPSWKIGSFFDKIIR LFTILSISGIVYLIALHFLGIRLLNYSDKLFQKK >Mature_514_residues MNILKSLISVGIMTLISRIFGFFRDVLIAHIFGASMFTDAFFIAFKIPNLLRRIFAEGAFYQSFIPILIDYKSRKDKEYI QEFIRSTCGFTILVLTTFVILGIIFSDYIIFISAPGFSESSKKLQLASNLLKIMFPYILFISLSSLCSSILNSYNYFFIP SLSSSLLNISIIVFSFFFSDYFEPSIISLAWSVMIGGFFQLFYQFPHLYKIKMLVFPKINFKNIGLIKVLKKMGPSTLGS CANQISLIFNTIFSSLLHSGSISWIYYADRLIEFPIGIIGVSLSTILFTSFSCSYSNNTQSEYKILLNWGIRFGLILSLP ISVILFMFSKPLVIILFQYGKFTDFDVLMTQKALELYSFGLVSFILVKILVSAFYSCQEVNIPMRISILTLFLTQLMNPF LIFYFQHSGLALSCSIASWINFFLLYWKLYQKGIINFKLNDFIFIFRLLIAVLVMTFFLIFMLYFIPSWKIGSFFDKIIR LFTILSISGIVYLIALHFLGIRLLNYSDKLFQKK
Specific function: Unknown
COG id: COG0728
COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the mviN family
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=509, Percent_Identity=48.7229862475442, Blast_Score=510, Evalue=1e-146,
Paralogues:
None
Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]
Swissprot (AC and ID): MVIN_BUCAP (Q8K9L3)
Other databases:
- EMBL: AE013218 - RefSeq: NP_660664.1 - EnsemblBacteria: EBBUCT00000000243 - GeneID: 1005526 - GenomeReviews: AE013218_GR - KEGG: bas:BUsg321 - GeneTree: EBGT00050000007923 - HOGENOM: HBG731814 - OMA: MLKITFP - ProtClustDB: CLSK315891 - BioCyc: BAPH198804:BUSG321-MONOMER - InterPro: IPR004268 - PRINTS: PR01806 - TIGRFAMs: TIGR01695
Pfam domain/function: PF03023 MVIN
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 59243; Mature: 59243
Theoretical pI: Translated: 9.91; Mature: 9.91
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
HASH(0x40486c78)-; HASH(0xb923f98)-; HASH(0xc0674f8)-; HASH(0xc11ff28)-; HASH(0xb0dff78)-; HASH(0xc684958)-; HASH(0xc6ce830)-; HASH(0x40482cb8)-; HASH(0xb0e05c0)-; HASH(0xc4a8d20)-; HASH(0xb2cc788)-; HASH(0xb218584)-; HASH(0xbfd57a4)-; HASH(0xc0a3a48)-;
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 3.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 3.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNILKSLISVGIMTLISRIFGFFRDVLIAHIFGASMFTDAFFIAFKIPNLLRRIFAEGAF CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH YQSFIPILIDYKSRKDKEYIQEFIRSTCGFTILVLTTFVILGIIFSDYIIFISAPGFSES HHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCC SKKLQLASNLLKIMFPYILFISLSSLCSSILNSYNYFFIPSLSSSLLNISIIVFSFFFSD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFEPSIISLAWSVMIGGFFQLFYQFPHLYKIKMLVFPKINFKNIGLIKVLKKMGPSTLGS HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHH CANQISLIFNTIFSSLLHSGSISWIYYADRLIEFPIGIIGVSLSTILFTSFSCSYSNNTQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC SEYKILLNWGIRFGLILSLPISVILFMFSKPLVIILFQYGKFTDFDVLMTQKALELYSFG HHHEEHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LVSFILVKILVSAFYSCQEVNIPMRISILTLFLTQLMNPFLIFYFQHSGLALSCSIASWI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEEEHHHHHH NFFLLYWKLYQKGIINFKLNDFIFIFRLLIAVLVMTFFLIFMLYFIPSWKIGSFFDKIIR HHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH LFTILSISGIVYLIALHFLGIRLLNYSDKLFQKK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCH >Mature Secondary Structure MNILKSLISVGIMTLISRIFGFFRDVLIAHIFGASMFTDAFFIAFKIPNLLRRIFAEGAF CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH YQSFIPILIDYKSRKDKEYIQEFIRSTCGFTILVLTTFVILGIIFSDYIIFISAPGFSES HHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCC SKKLQLASNLLKIMFPYILFISLSSLCSSILNSYNYFFIPSLSSSLLNISIIVFSFFFSD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFEPSIISLAWSVMIGGFFQLFYQFPHLYKIKMLVFPKINFKNIGLIKVLKKMGPSTLGS HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHH CANQISLIFNTIFSSLLHSGSISWIYYADRLIEFPIGIIGVSLSTILFTSFSCSYSNNTQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC SEYKILLNWGIRFGLILSLPISVILFMFSKPLVIILFQYGKFTDFDVLMTQKALELYSFG HHHEEHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LVSFILVKILVSAFYSCQEVNIPMRISILTLFLTQLMNPFLIFYFQHSGLALSCSIASWI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEEEHHHHHH NFFLLYWKLYQKGIINFKLNDFIFIFRLLIAVLVMTFFLIFMLYFIPSWKIGSFFDKIIR HHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH LFTILSISGIVYLIALHFLGIRLLNYSDKLFQKK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCH
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 12089438