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Definition Campylobacter jejuni RM1221, complete genome.
Accession NC_003912
Length 1,777,831

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The map label for this gene is 57238566

Identifier: 57238566

GI number: 57238566

Start: 1620475

End: 1622805

Strand: Direct

Name: 57238566

Synonym: CJE1721

Alternate gene names: NA

Gene position: 1620475-1622805 (Clockwise)

Preceding gene: 57238564

Following gene: 57238567

Centisome position: 91.15

GC content: 22.69

Gene sequence:

>2331_bases
ATGAAAATTTTAAAATTTAATGAAATAAATTTTGGCTCTTATAAAAATTTTAAATGGGGTAATAATCTTGAAGAATTTAA
AACAATTAATATTTTTTATGGTAGAAATTATTCAGGTAAAACTACACTTTCAAGGATAGCTAGAAGTTTTGAGCTTAAAA
AACATAATGAAGATTTTTTGGATGGAAATTTTAAAATAAAACTAGAAGATGGTAGTTTTTTAACCCAAAATGATGTTATA
AATTCTAATCTAGATATTAGAGTTTATAATAGTGATTTTGCAAAGGAAAATTTAAATTATTTATATGATAAAAAAGGAAA
TATAAAAGGTTTTAAAAGTATAGGTGTGGAGCAAAAAGATATAAAAGAAAGTATTGAAAAAAGAAAGGAAATTTTAAAAA
CAAGAAATGAAAAATTAAAAGATATACAAGCCAATCGGGAAAATATTTCTAAAACACAACAAGCTAAAATAAAAACTTTA
AACGAAAAGCTTATAGATAAAGCTAAGTTAGTAAAAAGTGAACCAAATTTAATAAAACAGGGCAGTAATTATGATAAAAG
AAATTTAGAAAATGATTTAATAGAAATTAAAGATAATATAAATGCTTATATTCTTAACAATGAAGAACAAAATCAACTTA
TAAAAATCTTAGAAGATAAAGAAAAACAAAATATAATTTTCAAAAATACTTTTAATAAAGATAATTTTCAAGGTATTTTC
ACATATTCATTAAAGATTCTTGAAAAAGAAGTTATCATTAAAGAAAATTTAACAAGCGAATTGAGAAAATGGCTAGAAGA
GGGTTTGGAATTTCACAAAGAGCATTCATTTACACAGCAATGTAAATTTTGCAATAACCCTTTAACACTAGAAAGAATAG
CTTGGATTGAAAATAACATAAAAGATGATAGCGGAGAAAAAGAACAAATTGAAAAAGAATTAAAAGATTTACTAGATAAT
TTTGAAAGCTATAAGCTAGAATCAAAAAAATTATTGCTAGGTATTGAATATGAAAATTTTTATTCTAACTATAAAGATAT
TTTTATTGGCTTGAAAGAACAGCTAGGAGTAAGTATTGCAAATTACAACGAAGAGTTGTTAAAAATAGAAAAAAAATTAA
CAAAAAAGAAAAAAGATGTTTTTACCCCTATGAAATTAGAAAACATAAATGATTTTTCAGATGAGATATTGCAGATATTA
AATAAAATTGAAAATTTATGTAAAGAAAATAACGAATACGCAAAAAATTTATTATCAAAGCAAGATGAAGCAAGAAAAAA
ACTAAGACTAAATGAAGTAGCAAAATTTGCTAAAGATAGTGATTGTTTTGCTAAACAAGATGAAATTAAAAACTTAGGCC
AAAAACTAAGCAATATGCAAAGTACTATTGAGACAGAAAAAAATGAAATAAATAACTACAACCTTGAAATAGAAAAATAT
AAAGAAAAACTTAGTAATCTAGAAACCTCTACAAGCAATATAAACAAATATTTAAAATCATATTTTGGACATAATATGCT
AGAGTTAAAAGTAAAAAAAGATGACAAAGGACAATTAAATGGAGAATTTGAGATTTTAAGGAATGGCAAACAAGCTAAGA
ATTTAAGTGAGGGTGAGTGTAGTTTGGTAGCCTTTTGCTATTTTGTGGCAAGTTTGGAAGATGCAAAAACTAAAGATAAA
AATCCTATAATATGGATAGATGACCCTATCTCTAGCCTAGATAACAATCATATATTTTTTATCTTCTCTTTAATAGAAGC
TAAAATTGCAAAAAAGATTAAAGATAACAAATATTCTCAACTTTTTATATCAACGCATAATTTAGATTTTCTAAAATACC
TAAAAAGTTTAACAGGATACGATAAAAATGATAAAAAAAGTTTTATGTATTTGATAGAAAAAACAAACAATAGTGATATT
AAAATTTTACCTGATTATATTCGTAAGTATGTAACTGAATTTAATTATCTATTTGAGCAAATTTTTAAAAACTATAACAA
CACAAATATTACTATAGATTCATATTATAGTCTGGCAAATAATATTAGAAAATTTTTAGATACTTATATGTATTTTAAAT
ATCCAAATAATGATAGTCTAATGACAAAATATTATATTTTTTTTGGAGAAGAGAATGCTATTTTAATTAATAGAGTAATT
AACGAATTTTCTCATTTAGAAAATATTGAAAGAGCCAAAATGCCTTTAGATTTATTAGAAATACATAAAGTTATTAATAT
TATTATTGAAAATATTAAAAATAAAGACAAAGAACAATTTGAGGCATTATTAAAAAGCCTTGATATAGAAGAAAATGACA
ATGCAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTGGGTAATGTAAGAGAATTGGCCGATGAATTTGGTGGCTTAGAAATTCTAAAACAAAGCTTTGATGATTTACAAAGGG
AGATTTATGCGAGGTAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATGACAAATTTACCACAGGGTTGGGAAGTTAAAAAGCTTGAAGAAATTGCAAATATCAAAGGAGGTAAAAGACTTCCCA
AGGGTAAAAATTTATTAGAC

Product: RloC protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 776; Mature: 776

Protein sequence:

>776_residues
MKILKFNEINFGSYKNFKWGNNLEEFKTINIFYGRNYSGKTTLSRIARSFELKKHNEDFLDGNFKIKLEDGSFLTQNDVI
NSNLDIRVYNSDFAKENLNYLYDKKGNIKGFKSIGVEQKDIKESIEKRKEILKTRNEKLKDIQANRENISKTQQAKIKTL
NEKLIDKAKLVKSEPNLIKQGSNYDKRNLENDLIEIKDNINAYILNNEEQNQLIKILEDKEKQNIIFKNTFNKDNFQGIF
TYSLKILEKEVIIKENLTSELRKWLEEGLEFHKEHSFTQQCKFCNNPLTLERIAWIENNIKDDSGEKEQIEKELKDLLDN
FESYKLESKKLLLGIEYENFYSNYKDIFIGLKEQLGVSIANYNEELLKIEKKLTKKKKDVFTPMKLENINDFSDEILQIL
NKIENLCKENNEYAKNLLSKQDEARKKLRLNEVAKFAKDSDCFAKQDEIKNLGQKLSNMQSTIETEKNEINNYNLEIEKY
KEKLSNLETSTSNINKYLKSYFGHNMLELKVKKDDKGQLNGEFEILRNGKQAKNLSEGECSLVAFCYFVASLEDAKTKDK
NPIIWIDDPISSLDNNHIFFIFSLIEAKIAKKIKDNKYSQLFISTHNLDFLKYLKSLTGYDKNDKKSFMYLIEKTNNSDI
KILPDYIRKYVTEFNYLFEQIFKNYNNTNITIDSYYSLANNIRKFLDTYMYFKYPNNDSLMTKYYIFFGEENAILINRVI
NEFSHLENIERAKMPLDLLEIHKVINIIIENIKNKDKEQFEALLKSLDIEENDNAK

Sequences:

>Translated_776_residues
MKILKFNEINFGSYKNFKWGNNLEEFKTINIFYGRNYSGKTTLSRIARSFELKKHNEDFLDGNFKIKLEDGSFLTQNDVI
NSNLDIRVYNSDFAKENLNYLYDKKGNIKGFKSIGVEQKDIKESIEKRKEILKTRNEKLKDIQANRENISKTQQAKIKTL
NEKLIDKAKLVKSEPNLIKQGSNYDKRNLENDLIEIKDNINAYILNNEEQNQLIKILEDKEKQNIIFKNTFNKDNFQGIF
TYSLKILEKEVIIKENLTSELRKWLEEGLEFHKEHSFTQQCKFCNNPLTLERIAWIENNIKDDSGEKEQIEKELKDLLDN
FESYKLESKKLLLGIEYENFYSNYKDIFIGLKEQLGVSIANYNEELLKIEKKLTKKKKDVFTPMKLENINDFSDEILQIL
NKIENLCKENNEYAKNLLSKQDEARKKLRLNEVAKFAKDSDCFAKQDEIKNLGQKLSNMQSTIETEKNEINNYNLEIEKY
KEKLSNLETSTSNINKYLKSYFGHNMLELKVKKDDKGQLNGEFEILRNGKQAKNLSEGECSLVAFCYFVASLEDAKTKDK
NPIIWIDDPISSLDNNHIFFIFSLIEAKIAKKIKDNKYSQLFISTHNLDFLKYLKSLTGYDKNDKKSFMYLIEKTNNSDI
KILPDYIRKYVTEFNYLFEQIFKNYNNTNITIDSYYSLANNIRKFLDTYMYFKYPNNDSLMTKYYIFFGEENAILINRVI
NEFSHLENIERAKMPLDLLEIHKVINIIIENIKNKDKEQFEALLKSLDIEENDNAK
>Mature_776_residues
MKILKFNEINFGSYKNFKWGNNLEEFKTINIFYGRNYSGKTTLSRIARSFELKKHNEDFLDGNFKIKLEDGSFLTQNDVI
NSNLDIRVYNSDFAKENLNYLYDKKGNIKGFKSIGVEQKDIKESIEKRKEILKTRNEKLKDIQANRENISKTQQAKIKTL
NEKLIDKAKLVKSEPNLIKQGSNYDKRNLENDLIEIKDNINAYILNNEEQNQLIKILEDKEKQNIIFKNTFNKDNFQGIF
TYSLKILEKEVIIKENLTSELRKWLEEGLEFHKEHSFTQQCKFCNNPLTLERIAWIENNIKDDSGEKEQIEKELKDLLDN
FESYKLESKKLLLGIEYENFYSNYKDIFIGLKEQLGVSIANYNEELLKIEKKLTKKKKDVFTPMKLENINDFSDEILQIL
NKIENLCKENNEYAKNLLSKQDEARKKLRLNEVAKFAKDSDCFAKQDEIKNLGQKLSNMQSTIETEKNEINNYNLEIEKY
KEKLSNLETSTSNINKYLKSYFGHNMLELKVKKDDKGQLNGEFEILRNGKQAKNLSEGECSLVAFCYFVASLEDAKTKDK
NPIIWIDDPISSLDNNHIFFIFSLIEAKIAKKIKDNKYSQLFISTHNLDFLKYLKSLTGYDKNDKKSFMYLIEKTNNSDI
KILPDYIRKYVTEFNYLFEQIFKNYNNTNITIDSYYSLANNIRKFLDTYMYFKYPNNDSLMTKYYIFFGEENAILINRVI
NEFSHLENIERAKMPLDLLEIHKVINIIIENIKNKDKEQFEALLKSLDIEENDNAK

Specific function: Unknown

COG id: COG4694

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91644; Mature: 91644

Theoretical pI: Translated: 7.79; Mature: 7.79

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.0 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKILKFNEINFGSYKNFKWGNNLEEFKTINIFYGRNYSGKTTLSRIARSFELKKHNEDFL
CCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
DGNFKIKLEDGSFLTQNDVINSNLDIRVYNSDFAKENLNYLYDKKGNIKGFKSIGVEQKD
CCCEEEEECCCCEEECCCCCCCCCEEEEECCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHH
IKESIEKRKEILKTRNEKLKDIQANRENISKTQQAKIKTLNEKLIDKAKLVKSEPNLIKQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHC
GSNYDKRNLENDLIEIKDNINAYILNNEEQNQLIKILEDKEKQNIIFKNTFNKDNFQGIF
CCCCCHHCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCEEH
TYSLKILEKEVIIKENLTSELRKWLEEGLEFHKEHSFTQQCKFCNNPLTLERIAWIENNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCC
KDDSGEKEQIEKELKDLLDNFESYKLESKKLLLGIEYENFYSNYKDIFIGLKEQLGVSIA
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHH
NYNEELLKIEKKLTKKKKDVFTPMKLENINDFSDEILQILNKIENLCKENNEYAKNLLSK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHC
QDEARKKLRLNEVAKFAKDSDCFAKQDEIKNLGQKLSNMQSTIETEKNEINNYNLEIEKY
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHH
KEKLSNLETSTSNINKYLKSYFGHNMLELKVKKDDKGQLNGEFEILRNGKQAKNLSEGEC
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHCCCHHHCCCCCCCH
SLVAFCYFVASLEDAKTKDKNPIIWIDDPISSLDNNHIFFIFSLIEAKIAKKIKDNKYSQ
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
LFISTHNLDFLKYLKSLTGYDKNDKKSFMYLIEKTNNSDIKILPDYIRKYVTEFNYLFEQ
EEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFKNYNNTNITIDSYYSLANNIRKFLDTYMYFKYPNNDSLMTKYYIFFGEENAILINRVI
HHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCEEEEEEEEECCCCCCHHHHHH
NEFSHLENIERAKMPLDLLEIHKVINIIIENIKNKDKEQFEALLKSLDIEENDNAK
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKILKFNEINFGSYKNFKWGNNLEEFKTINIFYGRNYSGKTTLSRIARSFELKKHNEDFL
CCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
DGNFKIKLEDGSFLTQNDVINSNLDIRVYNSDFAKENLNYLYDKKGNIKGFKSIGVEQKD
CCCEEEEECCCCEEECCCCCCCCCEEEEECCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHH
IKESIEKRKEILKTRNEKLKDIQANRENISKTQQAKIKTLNEKLIDKAKLVKSEPNLIKQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHC
GSNYDKRNLENDLIEIKDNINAYILNNEEQNQLIKILEDKEKQNIIFKNTFNKDNFQGIF
CCCCCHHCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCEEH
TYSLKILEKEVIIKENLTSELRKWLEEGLEFHKEHSFTQQCKFCNNPLTLERIAWIENNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCC
KDDSGEKEQIEKELKDLLDNFESYKLESKKLLLGIEYENFYSNYKDIFIGLKEQLGVSIA
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHH
NYNEELLKIEKKLTKKKKDVFTPMKLENINDFSDEILQILNKIENLCKENNEYAKNLLSK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHC
QDEARKKLRLNEVAKFAKDSDCFAKQDEIKNLGQKLSNMQSTIETEKNEINNYNLEIEKY
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHH
KEKLSNLETSTSNINKYLKSYFGHNMLELKVKKDDKGQLNGEFEILRNGKQAKNLSEGEC
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHCCCHHHCCCCCCCH
SLVAFCYFVASLEDAKTKDKNPIIWIDDPISSLDNNHIFFIFSLIEAKIAKKIKDNKYSQ
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
LFISTHNLDFLKYLKSLTGYDKNDKKSFMYLIEKTNNSDIKILPDYIRKYVTEFNYLFEQ
EEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFKNYNNTNITIDSYYSLANNIRKFLDTYMYFKYPNNDSLMTKYYIFFGEENAILINRVI
HHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCEEEEEEEEECCCCCCHHHHHH
NEFSHLENIERAKMPLDLLEIHKVINIIIENIKNKDKEQFEALLKSLDIEENDNAK
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA