| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 57238411
Identifier: 57238411
GI number: 57238411
Start: 1457884
End: 1460232
Strand: Reverse
Name: 57238411
Synonym: CJE1559
Alternate gene names: NA
Gene position: 1460232-1457884 (Counterclockwise)
Preceding gene: 57238418
Following gene: 57238410
Centisome position: 82.14
GC content: 25.03
Gene sequence:
>2349_bases TTGTTAAATAAAGAATTAGAAATTTTTAAAAAAAATCTTAGTTCCTATACCCAAAGTTGTAGAAAATTTTTTCTTAAGCA AGGGGCGTTTAGCTTATATCATTCTAAAAATATGGATAATTTCATAAAAAAAGCTTATGATATAGTTCTTAAAGATTATT TTGATGATTTTTCACCTCCAAGTGATAATATCCCTTTTTGTGTTTTAGCAAGCAAAGCATATGCAAATAATAGTCTTTGT TTTAATGAAAGTATTTCTTTGATTTTTGTTTATAAAGATATTAAGGCTTTTCATTTAAAACCTATGATTAAGGCTTTTAT CGAAATTTTAAATGATGCGCATTTGCAAATTGATTCGGTTATCTTAGAATTTAATGGACTTTATAATGCTAGCAATGAGC TTAAGACTTCTATAATACAAACTCGTTTCATATGTGGTTCTAGGATTTTATTTAAAGGGATTAAGATAAAATTTGAGAGT ATTATAAAAGAAAATAAAAATGATTTTGCCAAGCTTTTGCTAGAAAATTTTAAAGAATTTGACATTCCATTTATAAAGCA AGAATTTAATATCTTAAAAGATTTTGGCGGATTAAATCATTTAAGATCCTTAGAGAGTTTGCTTGTTCTTTTTAAGACTT CTCCAAAAAATTATGCTTTAAATTTTATAGATGAAAAAAATTTAAGCGAGTTGCGTTTAGCTGGAGATTTTTTACTTTCT TTAAAATCAGCGATGAATTTATTAAGTGCTAAAGATGAGGATGAATTTTTACTTATTAATGTTCATGATTTGAGTGAATT AATGTATAAAAAAGCTAAAAAACATTTTGGAGCAAATGAGTTGTTGGTTCAAAAGGCTTTGCAAAGTATGCATACTATAG GTTTTTATACACACTTTTTAGCAAAGCAAATTCAAGATGGATTAAATCATACTCTTAAACAAGAATATAAATTTAAAACT CTTGTGGAAGTTTTAGAATACTTATTAAAACTTGAAGATAAACATGTTATTTTCGATCTTAACTTGGTTTTTGCCCTAAG AAGATTGAAATACGGTAAAAAAGATATAGAAAAAGCTTTAATACTTTTTGAGAAAATTTTTTATAAAAGGCATAGTTTTT GTGTTTTAAAACTTTTGCTTGATAGTGGAATTTTAAAAGATTTATGTAAGCCTTTTTGGACAGTTCGTTTTTTAAGCGAT GAAGAAGGAAATTATAGTTTTGATGAGCAAGTTTTTCTTATGTTAAGTGAATTTGAAAAATACGAAGATGAGCTTGAGAT ACTCCAAAAACTTAAAACCGATGAAAAAATGATTTTAAAGCTTGTGATACTTTTAAGCGCTATAGAAAGTGAAAATGAAA TTTCTTTAGCAGGCATATATAGAGCGTATTGCTCTAAATTTGATTTAAAGAATGAAATTTTAGAATGGGGTCTTAAGATA TTTAAAAACAATAATGCCTTAAAAGATCTTGTAGAAAAAGAAGATATATACAATCCTATTGTTGTAAGTAGCTTGGTTTC TAAGCTAGAAAATTTAGAAAATTTAGAGCTTTTATATACTTTAACTTGGCTAAAGGCTAAGGCTTTAAATTATAATGCTT TTTATTTTAGAGTTCTTGATAAACTTTTAGAAAATGCAAAACAAGGTTTTGAAGATGAAAATCTACTTGAAGAAAGCGCA AGAAGAGTAAAAAAAGAATTAACACTTAAAAGAAGTAAGATTTTTTTAGAGCAAGATGAAATTTTGCAAGATAAAATCAT ACATATCAAATCAAATCTTTTTATTATAAAAAATACTTTTGAAGATATTGTTATGATTTCTAAATTAGCCAAAGAAAATG ATTTTAAATTTTGGTTTAATAATGAAACAAATCTTAGTTTGCAAATTGTTGCACCACTTCATTTTAATATTGCCATTATT TTAAGTTCTTTAACAAATTTAAATCTTATTTTCATGAATTTTTTTGAACTTTTTGATAATAAAATTTATTTAAGATTTGA ATATGATAATATTATCAGTGATGAGCAAAAACTAAAACTTTGCGAGCTTTTAAATTCAAATCTTTCTGGTTTTAATTTGA AAAAAATTAAAAAGCCAATCATTAAAAAAGATGAGTTAAAATTAGACTTAAACTATTCTAAAATGTATGCCAAATTAGGT CTTAATACGAAAGATCAGCAGGGTTTAATGGCGTATTTGATGAATGTTTTTAATGAACTTGAACTTGTTTTATGTGCAGC AAAAATTCAAACCATAAGACAAAGGACGCGTAATATTTTTATTTTTCAAAAGAATGAAAAATTAGAACATAGCGAGCAAA AGTTAGTTAATTTATTAATAAGTGAGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTTGCTTACTGAAAAAGAGTTTATAGAAAAAGCCAAAATAAAAGATATTTTTGTTAAGATTATTATTAAAATATTAAAA TTTTAAAGAGAGTAGAAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAATGTGTGGAATCGTAGGTTATATAGGAAATAATGAAAAAAAACAAATTATACTAAATGGACTTAAAGAATTGGAAT ATCGTGGCTATGATAGTGCG
Product: GlnD family protein
Products: NA
Alternate protein names: Nucleotidyltransferase; GlnD Family Protein; Protein-P-II Uridylyltransferase; (Protein-PII) Uridylyltransferase; GlnD PII-Uridylyltransferase Family; Nucleotidyltransferase GlnD Family; ATP-Dependent DNA Helicase UvrD
Number of amino acids: Translated: 782; Mature: 782
Protein sequence:
>782_residues MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPPSDNIPFCVLASKAYANNSLC FNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSVILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKIKFES IIKENKNDFAKLLLENFKEFDIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFLAKQIQDGLNHTLKQEYKFKT LVEVLEYLLKLEDKHVIFDLNLVFALRRLKYGKKDIEKALILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSD EEGNYSFDEQVFLMLSEFEKYEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLDKLLENAKQGFEDENLLEESA RRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTFEDIVMISKLAKENDFKFWFNNETNLSLQIVAPLHFNIAII LSSLTNLNLIFMNFFELFDNKIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLISE
Sequences:
>Translated_782_residues MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPPSDNIPFCVLASKAYANNSLC FNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSVILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKIKFES IIKENKNDFAKLLLENFKEFDIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFLAKQIQDGLNHTLKQEYKFKT LVEVLEYLLKLEDKHVIFDLNLVFALRRLKYGKKDIEKALILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSD EEGNYSFDEQVFLMLSEFEKYEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLDKLLENAKQGFEDENLLEESA RRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTFEDIVMISKLAKENDFKFWFNNETNLSLQIVAPLHFNIAII LSSLTNLNLIFMNFFELFDNKIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLISE >Mature_782_residues MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPPSDNIPFCVLASKAYANNSLC FNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSVILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKIKFES IIKENKNDFAKLLLENFKEFDIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFLAKQIQDGLNHTLKQEYKFKT LVEVLEYLLKLEDKHVIFDLNLVFALRRLKYGKKDIEKALILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSD EEGNYSFDEQVFLMLSEFEKYEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLDKLLENAKQGFEDENLLEESA RRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTFEDIVMISKLAKENDFKFWFNNETNLSLQIVAPLHFNIAII LSSLTNLNLIFMNFFELFDNKIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLISE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 91743; Mature: 91743
Theoretical pI: Translated: 8.11; Mature: 8.11
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPP CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC SDNIPFCVLASKAYANNSLCFNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSV CCCCCEEEEECHHHCCCCEEECCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH ILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKIKFESIIKENKNDFAKLLLENFKEF HEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC DIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS CCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFL HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AKQIQDGLNHTLKQEYKFKTLVEVLEYLLKLEDKHVIFDLNLVFALRRLKYGKKDIEKAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH ILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSDEEGNYSFDEQVFLMLSEFEK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH YEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLD HCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH KLLENAKQGFEDENLLEESARRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTF HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHEEECCEEEEECCH EDIVMISKLAKENDFKFWFNNETNLSLQIVAPLHFNIAIILSSLTNLNLIFMNFFELFDN HHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCC KIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG EEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHC LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLI CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHH SE CC >Mature Secondary Structure MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPP CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC SDNIPFCVLASKAYANNSLCFNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSV CCCCCEEEEECHHHCCCCEEECCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH ILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKIKFESIIKENKNDFAKLLLENFKEF HEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC DIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS CCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFL HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AKQIQDGLNHTLKQEYKFKTLVEVLEYLLKLEDKHVIFDLNLVFALRRLKYGKKDIEKAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH ILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSDEEGNYSFDEQVFLMLSEFEK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH YEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLD HCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH KLLENAKQGFEDENLLEESARRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTF HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHEEECCEEEEECCH EDIVMISKLAKENDFKFWFNNETNLSLQIVAPLHFNIAIILSSLTNLNLIFMNFFELFDN HHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCC KIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG EEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHC LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLI CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHH SE CC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA