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Definition Campylobacter jejuni RM1221, complete genome.
Accession NC_003912
Length 1,777,831

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The map label for this gene is 57238411

Identifier: 57238411

GI number: 57238411

Start: 1457884

End: 1460232

Strand: Reverse

Name: 57238411

Synonym: CJE1559

Alternate gene names: NA

Gene position: 1460232-1457884 (Counterclockwise)

Preceding gene: 57238418

Following gene: 57238410

Centisome position: 82.14

GC content: 25.03

Gene sequence:

>2349_bases
TTGTTAAATAAAGAATTAGAAATTTTTAAAAAAAATCTTAGTTCCTATACCCAAAGTTGTAGAAAATTTTTTCTTAAGCA
AGGGGCGTTTAGCTTATATCATTCTAAAAATATGGATAATTTCATAAAAAAAGCTTATGATATAGTTCTTAAAGATTATT
TTGATGATTTTTCACCTCCAAGTGATAATATCCCTTTTTGTGTTTTAGCAAGCAAAGCATATGCAAATAATAGTCTTTGT
TTTAATGAAAGTATTTCTTTGATTTTTGTTTATAAAGATATTAAGGCTTTTCATTTAAAACCTATGATTAAGGCTTTTAT
CGAAATTTTAAATGATGCGCATTTGCAAATTGATTCGGTTATCTTAGAATTTAATGGACTTTATAATGCTAGCAATGAGC
TTAAGACTTCTATAATACAAACTCGTTTCATATGTGGTTCTAGGATTTTATTTAAAGGGATTAAGATAAAATTTGAGAGT
ATTATAAAAGAAAATAAAAATGATTTTGCCAAGCTTTTGCTAGAAAATTTTAAAGAATTTGACATTCCATTTATAAAGCA
AGAATTTAATATCTTAAAAGATTTTGGCGGATTAAATCATTTAAGATCCTTAGAGAGTTTGCTTGTTCTTTTTAAGACTT
CTCCAAAAAATTATGCTTTAAATTTTATAGATGAAAAAAATTTAAGCGAGTTGCGTTTAGCTGGAGATTTTTTACTTTCT
TTAAAATCAGCGATGAATTTATTAAGTGCTAAAGATGAGGATGAATTTTTACTTATTAATGTTCATGATTTGAGTGAATT
AATGTATAAAAAAGCTAAAAAACATTTTGGAGCAAATGAGTTGTTGGTTCAAAAGGCTTTGCAAAGTATGCATACTATAG
GTTTTTATACACACTTTTTAGCAAAGCAAATTCAAGATGGATTAAATCATACTCTTAAACAAGAATATAAATTTAAAACT
CTTGTGGAAGTTTTAGAATACTTATTAAAACTTGAAGATAAACATGTTATTTTCGATCTTAACTTGGTTTTTGCCCTAAG
AAGATTGAAATACGGTAAAAAAGATATAGAAAAAGCTTTAATACTTTTTGAGAAAATTTTTTATAAAAGGCATAGTTTTT
GTGTTTTAAAACTTTTGCTTGATAGTGGAATTTTAAAAGATTTATGTAAGCCTTTTTGGACAGTTCGTTTTTTAAGCGAT
GAAGAAGGAAATTATAGTTTTGATGAGCAAGTTTTTCTTATGTTAAGTGAATTTGAAAAATACGAAGATGAGCTTGAGAT
ACTCCAAAAACTTAAAACCGATGAAAAAATGATTTTAAAGCTTGTGATACTTTTAAGCGCTATAGAAAGTGAAAATGAAA
TTTCTTTAGCAGGCATATATAGAGCGTATTGCTCTAAATTTGATTTAAAGAATGAAATTTTAGAATGGGGTCTTAAGATA
TTTAAAAACAATAATGCCTTAAAAGATCTTGTAGAAAAAGAAGATATATACAATCCTATTGTTGTAAGTAGCTTGGTTTC
TAAGCTAGAAAATTTAGAAAATTTAGAGCTTTTATATACTTTAACTTGGCTAAAGGCTAAGGCTTTAAATTATAATGCTT
TTTATTTTAGAGTTCTTGATAAACTTTTAGAAAATGCAAAACAAGGTTTTGAAGATGAAAATCTACTTGAAGAAAGCGCA
AGAAGAGTAAAAAAAGAATTAACACTTAAAAGAAGTAAGATTTTTTTAGAGCAAGATGAAATTTTGCAAGATAAAATCAT
ACATATCAAATCAAATCTTTTTATTATAAAAAATACTTTTGAAGATATTGTTATGATTTCTAAATTAGCCAAAGAAAATG
ATTTTAAATTTTGGTTTAATAATGAAACAAATCTTAGTTTGCAAATTGTTGCACCACTTCATTTTAATATTGCCATTATT
TTAAGTTCTTTAACAAATTTAAATCTTATTTTCATGAATTTTTTTGAACTTTTTGATAATAAAATTTATTTAAGATTTGA
ATATGATAATATTATCAGTGATGAGCAAAAACTAAAACTTTGCGAGCTTTTAAATTCAAATCTTTCTGGTTTTAATTTGA
AAAAAATTAAAAAGCCAATCATTAAAAAAGATGAGTTAAAATTAGACTTAAACTATTCTAAAATGTATGCCAAATTAGGT
CTTAATACGAAAGATCAGCAGGGTTTAATGGCGTATTTGATGAATGTTTTTAATGAACTTGAACTTGTTTTATGTGCAGC
AAAAATTCAAACCATAAGACAAAGGACGCGTAATATTTTTATTTTTCAAAAGAATGAAAAATTAGAACATAGCGAGCAAA
AGTTAGTTAATTTATTAATAAGTGAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTGCTTACTGAAAAAGAGTTTATAGAAAAAGCCAAAATAAAAGATATTTTTGTTAAGATTATTATTAAAATATTAAAA
TTTTAAAGAGAGTAGAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAATGTGTGGAATCGTAGGTTATATAGGAAATAATGAAAAAAAACAAATTATACTAAATGGACTTAAAGAATTGGAAT
ATCGTGGCTATGATAGTGCG

Product: GlnD family protein

Products: NA

Alternate protein names: Nucleotidyltransferase; GlnD Family Protein; Protein-P-II Uridylyltransferase; (Protein-PII) Uridylyltransferase; GlnD PII-Uridylyltransferase Family; Nucleotidyltransferase GlnD Family; ATP-Dependent DNA Helicase UvrD

Number of amino acids: Translated: 782; Mature: 782

Protein sequence:

>782_residues
MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPPSDNIPFCVLASKAYANNSLC
FNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSVILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKIKFES
IIKENKNDFAKLLLENFKEFDIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS
LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFLAKQIQDGLNHTLKQEYKFKT
LVEVLEYLLKLEDKHVIFDLNLVFALRRLKYGKKDIEKALILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSD
EEGNYSFDEQVFLMLSEFEKYEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI
FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLDKLLENAKQGFEDENLLEESA
RRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTFEDIVMISKLAKENDFKFWFNNETNLSLQIVAPLHFNIAII
LSSLTNLNLIFMNFFELFDNKIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG
LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLISE

Sequences:

>Translated_782_residues
MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPPSDNIPFCVLASKAYANNSLC
FNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSVILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKIKFES
IIKENKNDFAKLLLENFKEFDIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS
LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFLAKQIQDGLNHTLKQEYKFKT
LVEVLEYLLKLEDKHVIFDLNLVFALRRLKYGKKDIEKALILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSD
EEGNYSFDEQVFLMLSEFEKYEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI
FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLDKLLENAKQGFEDENLLEESA
RRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTFEDIVMISKLAKENDFKFWFNNETNLSLQIVAPLHFNIAII
LSSLTNLNLIFMNFFELFDNKIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG
LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLISE
>Mature_782_residues
MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPPSDNIPFCVLASKAYANNSLC
FNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSVILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKIKFES
IIKENKNDFAKLLLENFKEFDIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS
LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFLAKQIQDGLNHTLKQEYKFKT
LVEVLEYLLKLEDKHVIFDLNLVFALRRLKYGKKDIEKALILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSD
EEGNYSFDEQVFLMLSEFEKYEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI
FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLDKLLENAKQGFEDENLLEESA
RRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTFEDIVMISKLAKENDFKFWFNNETNLSLQIVAPLHFNIAII
LSSLTNLNLIFMNFFELFDNKIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG
LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLISE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91743; Mature: 91743

Theoretical pI: Translated: 8.11; Mature: 8.11

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPP
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
SDNIPFCVLASKAYANNSLCFNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSV
CCCCCEEEEECHHHCCCCEEECCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
ILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKIKFESIIKENKNDFAKLLLENFKEF
HEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC
DIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS
CCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH
LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFL
HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKQIQDGLNHTLKQEYKFKTLVEVLEYLLKLEDKHVIFDLNLVFALRRLKYGKKDIEKAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
ILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSDEEGNYSFDEQVFLMLSEFEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
YEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLD
HCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
KLLENAKQGFEDENLLEESARRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTF
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHEEECCEEEEECCH
EDIVMISKLAKENDFKFWFNNETNLSLQIVAPLHFNIAIILSSLTNLNLIFMNFFELFDN
HHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCC
KIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG
EEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHC
LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLI
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHH
SE
CC
>Mature Secondary Structure
MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPP
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
SDNIPFCVLASKAYANNSLCFNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSV
CCCCCEEEEECHHHCCCCEEECCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
ILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKIKFESIIKENKNDFAKLLLENFKEF
HEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC
DIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS
CCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH
LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFL
HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKQIQDGLNHTLKQEYKFKTLVEVLEYLLKLEDKHVIFDLNLVFALRRLKYGKKDIEKAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
ILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSDEEGNYSFDEQVFLMLSEFEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
YEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLD
HCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
KLLENAKQGFEDENLLEESARRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTF
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHEEECCEEEEECCH
EDIVMISKLAKENDFKFWFNNETNLSLQIVAPLHFNIAIILSSLTNLNLIFMNFFELFDN
HHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCC
KIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG
EEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHC
LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLI
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHH
SE
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA