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Definition Campylobacter jejuni RM1221, complete genome.
Accession NC_003912
Length 1,777,831

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The map label for this gene is 57238206

Identifier: 57238206

GI number: 57238206

Start: 631554

End: 632996

Strand: Direct

Name: 57238206

Synonym: CJE0701

Alternate gene names: NA

Gene position: 631554-632996 (Clockwise)

Preceding gene: 57238207

Following gene: 57238205

Centisome position: 35.52

GC content: 29.73

Gene sequence:

>1443_bases
ATGGATATTAAATCAGATGAAATTTCAGAACTTGTTTTGCCTGAAGGCAAAGATGCAAGAGGTTCTTTGGTTTATTTTAA
AATTATTTTTATTCCAGCTTTTCTTTATATTTTGATTTTATTGGGTTATTTTAATGTAATTGACTTTAAGGTCGAATTAC
ATACGGTTATTATGACAGGTGTGATTTTTTTTACAGCATTGATTTTTGCTAGACATAGTGCTGAGTATGCGTATAGTATT
TTTGAACAACAAAAAGATGAATTTAAACAGGCTTTAAAAAGACATATTATGAGGCATTTTCTTGCCATAGGGAAAGACAC
GAAATCAAATGCCAATTTTGATGACTTTGCTTATACATATATTAAGGGTGCAAGAAATGAGAATTTTGCTAGTATAGGTT
CGGCAATTTTTCCAATGATGGGAATTTTAGGAACTTTTATCAGTATAGCTTTTTCAATGCCAAATTTTAGTTCTAGTGAT
ACAGCCGCTTTAGAACAAGAAATTGCAGATTTGTTAAGTGGAGTGGGAACTGCTTTTTATGTTTCAATTTATGGAATTTT
TCTTGCATTATGGTGGATGTTTTTTGAAAAATATGGTAAAAGCAAAATAGATCGTTTGCTAAATCGTCAAAAAAACGCTA
CAAGTGGATTTTTTTGGACAAAAGAAGAGCTTGATCAAAGATATTTAACTGAAAGTTTGCAACATTTTGAAAAAATTGGA
GCAATTTTTAAACAAGTTAGTAATGATGATTTTTTTGCAGAGCTTGATCATGCTATTGATAGAAAATTTGGTATTTTCCA
AGATATGCTAAATGTAGAAGAAAAGGCTATTAGATTAAGTAGTGAACATATCAAACAAACCATGGGTGAGCTTAGTAAAG
CACAAAGAGATCAACGCGATCTTGGAAAGCTTTATAGTGAAATGTTAAATGGTATAGGTTTGCTCAATCAAAATTTAAAA
GAAATCAATACAAGAATGTCAGAACAATATAATCGCTTGCTTGATATCAGTAGTGATAAAATTCATCATCTTGATAAGAC
ATTAAGTGCATTCGATGAAAAAATAGAGCGTTTTGGTAAAAATTTTGAACTTTATGAAAAAGCAATGTTGGAAAGTCAAG
AAAAGGTTTTTGAGGGATTTAAAGCAAGCTTGTTTGAAGGTATGCATAAATTTAAAGAAGTATATGAAGAAGAAAAAAGT
ATTGATGCTAAAATCAAAATGATGGATGAGCTTAAAAAAGAAATGAAAGCACTTGATGAAGAAACAAGTCAAATGATGAG
CAAGCTTTCTGGGGATGAAAATCAGAATAAAGAAAATGAAACCAAACAAATAGAAGATTTTTCAGAGTCTAAGACTGAAG
AAAATCAAGATGAAATTCAAGCAGAAATATCTAAGCAAGAAAGCAATGATGAGCTAAAAAATGAAGATAAAGAAAATAAA
TGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACTAAGCATTTTAAAAGCTTAGTTTTATTTTGTTTTAAAAATTTTTATCAAATTAAGTAGCAATCTTTAAAATAAAATT
TTTAATGAGGTATTGGTTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATGAGTCAAAAGAAGATAGCAATTTTTGGATAGCTTATGCTGATTTAATGGCAGGATTGCTGTTTGTTTTTATTTTA
CTAATAGGTGCTATTGTTGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 480; Mature: 480

Protein sequence:

>480_residues
MDIKSDEISELVLPEGKDARGSLVYFKIIFIPAFLYILILLGYFNVIDFKVELHTVIMTGVIFFTALIFARHSAEYAYSI
FEQQKDEFKQALKRHIMRHFLAIGKDTKSNANFDDFAYTYIKGARNENFASIGSAIFPMMGILGTFISIAFSMPNFSSSD
TAALEQEIADLLSGVGTAFYVSIYGIFLALWWMFFEKYGKSKIDRLLNRQKNATSGFFWTKEELDQRYLTESLQHFEKIG
AIFKQVSNDDFFAELDHAIDRKFGIFQDMLNVEEKAIRLSSEHIKQTMGELSKAQRDQRDLGKLYSEMLNGIGLLNQNLK
EINTRMSEQYNRLLDISSDKIHHLDKTLSAFDEKIERFGKNFELYEKAMLESQEKVFEGFKASLFEGMHKFKEVYEEEKS
IDAKIKMMDELKKEMKALDEETSQMMSKLSGDENQNKENETKQIEDFSESKTEENQDEIQAEISKQESNDELKNEDKENK

Sequences:

>Translated_480_residues
MDIKSDEISELVLPEGKDARGSLVYFKIIFIPAFLYILILLGYFNVIDFKVELHTVIMTGVIFFTALIFARHSAEYAYSI
FEQQKDEFKQALKRHIMRHFLAIGKDTKSNANFDDFAYTYIKGARNENFASIGSAIFPMMGILGTFISIAFSMPNFSSSD
TAALEQEIADLLSGVGTAFYVSIYGIFLALWWMFFEKYGKSKIDRLLNRQKNATSGFFWTKEELDQRYLTESLQHFEKIG
AIFKQVSNDDFFAELDHAIDRKFGIFQDMLNVEEKAIRLSSEHIKQTMGELSKAQRDQRDLGKLYSEMLNGIGLLNQNLK
EINTRMSEQYNRLLDISSDKIHHLDKTLSAFDEKIERFGKNFELYEKAMLESQEKVFEGFKASLFEGMHKFKEVYEEEKS
IDAKIKMMDELKKEMKALDEETSQMMSKLSGDENQNKENETKQIEDFSESKTEENQDEIQAEISKQESNDELKNEDKENK
>Mature_480_residues
MDIKSDEISELVLPEGKDARGSLVYFKIIFIPAFLYILILLGYFNVIDFKVELHTVIMTGVIFFTALIFARHSAEYAYSI
FEQQKDEFKQALKRHIMRHFLAIGKDTKSNANFDDFAYTYIKGARNENFASIGSAIFPMMGILGTFISIAFSMPNFSSSD
TAALEQEIADLLSGVGTAFYVSIYGIFLALWWMFFEKYGKSKIDRLLNRQKNATSGFFWTKEELDQRYLTESLQHFEKIG
AIFKQVSNDDFFAELDHAIDRKFGIFQDMLNVEEKAIRLSSEHIKQTMGELSKAQRDQRDLGKLYSEMLNGIGLLNQNLK
EINTRMSEQYNRLLDISSDKIHHLDKTLSAFDEKIERFGKNFELYEKAMLESQEKVFEGFKASLFEGMHKFKEVYEEEKS
IDAKIKMMDELKKEMKALDEETSQMMSKLSGDENQNKENETKQIEDFSESKTEENQDEIQAEISKQESNDELKNEDKENK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55670; Mature: 55670

Theoretical pI: Translated: 4.80; Mature: 4.80

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDIKSDEISELVLPEGKDARGSLVYFKIIFIPAFLYILILLGYFNVIDFKVELHTVIMTG
CCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIFFTALIFARHSAEYAYSIFEQQKDEFKQALKRHIMRHFLAIGKDTKSNANFDDFAYTY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH
IKGARNENFASIGSAIFPMMGILGTFISIAFSMPNFSSSDTAALEQEIADLLSGVGTAFY
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSIYGIFLALWWMFFEKYGKSKIDRLLNRQKNATSGFFWTKEELDQRYLTESLQHFEKIG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIFKQVSNDDFFAELDHAIDRKFGIFQDMLNVEEKAIRLSSEHIKQTMGELSKAQRDQRD
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGKLYSEMLNGIGLLNQNLKEINTRMSEQYNRLLDISSDKIHHLDKTLSAFDEKIERFGK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NFELYEKAMLESQEKVFEGFKASLFEGMHKFKEVYEEEKSIDAKIKMMDELKKEMKALDE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ETSQMMSKLSGDENQNKENETKQIEDFSESKTEENQDEIQAEISKQESNDELKNEDKENK
HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MDIKSDEISELVLPEGKDARGSLVYFKIIFIPAFLYILILLGYFNVIDFKVELHTVIMTG
CCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIFFTALIFARHSAEYAYSIFEQQKDEFKQALKRHIMRHFLAIGKDTKSNANFDDFAYTY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH
IKGARNENFASIGSAIFPMMGILGTFISIAFSMPNFSSSDTAALEQEIADLLSGVGTAFY
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSIYGIFLALWWMFFEKYGKSKIDRLLNRQKNATSGFFWTKEELDQRYLTESLQHFEKIG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIFKQVSNDDFFAELDHAIDRKFGIFQDMLNVEEKAIRLSSEHIKQTMGELSKAQRDQRD
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGKLYSEMLNGIGLLNQNLKEINTRMSEQYNRLLDISSDKIHHLDKTLSAFDEKIERFGK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NFELYEKAMLESQEKVFEGFKASLFEGMHKFKEVYEEEKSIDAKIKMMDELKKEMKALDE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ETSQMMSKLSGDENQNKENETKQIEDFSESKTEENQDEIQAEISKQESNDELKNEDKENK
HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA