| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
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The map label for this gene is 57237858
Identifier: 57237858
GI number: 57237858
Start: 1033187
End: 1035799
Strand: Reverse
Name: 57237858
Synonym: CJE1113
Alternate gene names: NA
Gene position: 1035799-1033187 (Counterclockwise)
Preceding gene: 57237859
Following gene: 57237857
Centisome position: 58.26
GC content: 22.39
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases AACTTCAAATCGCACAAGGACTAGATGAAATCTTAGAAGATGAAGATAGAAAACAAGAGCTTTATGTTTGTAAATTTGTG GTGGTAAATGGGGTTAAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTTCTATTAAAATGAGTAAAGACTTGAGCGTGGATATATTAAAAAGTTTAGCAGGATCTTTTATTGATACACTTTTAC CTACAAATTATGAAAGATTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 870; Mature: 870
Protein sequence:
>870_residues MKIKNFTLIASNHNLEIELKNLTKNANKIIFICSDFDGYKEAKNSLYKTLHTIEDNFKIDNTKTFKIIHLNQANKDEITK EQKFSSDKNLSSIKKIIFNNLKFLNNAINQNENKTLNKIIDENNVENIENFLKEIQKELNILLKNIKESNYFEQEIKPKI QLTLDTLFNTLLKNITQSNDDEYKQIIRAIAKFFINILDSVTNLKKPVSLVKKNPYVFVVNTLFEAYNSSAEYQEYKEQK YYYDFAYPLLELITSKLYPIIALCNEEILSDVLIIDDKVLLDFSSYSNVPSISLYKNSFYKVILDEEFQGIFDNFLENNL KFENEKLDNTLLVNSSLNNFDTTLKKAINLNISKLNHFFYAEYPDLNSSMLVEMILDKKNTDQINTTKMGKNYLLITNPP QLNNAGLCEDLYQKKLGAIIKNRPKALTKNEKLALKGDFPSKRDYGSYFIERDVKKEDDYVLQLCPFVKLDGQIYQKYKG YFNFYNQTYSWMKLYLLEHINERLEYEKVKQDFAYIDSFFKLPKELEEISEKEKEKVKEYVELFNNYLDNINSRYDQTQS NLNSKPLMFKTYENVDFKKYSPLTVVLLTLTLYVLQKDLAFTQEYSLGYKLFQANIGNYQKIKIPNYFNEYISFIPDDIY FYDNDKKIYIFLSKELNKNKKEDEVIYLDELAKAMFENDFEEEDQTYVNFLKTLNESFDEEIEFEENIQTDKTLPSKKDL DKSIQDIMLDKELAKLSIDITFFNIIKQLFPFTEFFMSQPDFFKKMILFFIDSSLDKKYYGNKLFSSFKAHFFKELGIFY ALSPKGRFIKINPKSKKSLNKLFLYQIGTNYYYFNQLEYASKLKKSKSFSRLDKAKQIHLISKVKKTISY
Sequences:
>Translated_870_residues MKIKNFTLIASNHNLEIELKNLTKNANKIIFICSDFDGYKEAKNSLYKTLHTIEDNFKIDNTKTFKIIHLNQANKDEITK EQKFSSDKNLSSIKKIIFNNLKFLNNAINQNENKTLNKIIDENNVENIENFLKEIQKELNILLKNIKESNYFEQEIKPKI QLTLDTLFNTLLKNITQSNDDEYKQIIRAIAKFFINILDSVTNLKKPVSLVKKNPYVFVVNTLFEAYNSSAEYQEYKEQK YYYDFAYPLLELITSKLYPIIALCNEEILSDVLIIDDKVLLDFSSYSNVPSISLYKNSFYKVILDEEFQGIFDNFLENNL KFENEKLDNTLLVNSSLNNFDTTLKKAINLNISKLNHFFYAEYPDLNSSMLVEMILDKKNTDQINTTKMGKNYLLITNPP QLNNAGLCEDLYQKKLGAIIKNRPKALTKNEKLALKGDFPSKRDYGSYFIERDVKKEDDYVLQLCPFVKLDGQIYQKYKG YFNFYNQTYSWMKLYLLEHINERLEYEKVKQDFAYIDSFFKLPKELEEISEKEKEKVKEYVELFNNYLDNINSRYDQTQS NLNSKPLMFKTYENVDFKKYSPLTVVLLTLTLYVLQKDLAFTQEYSLGYKLFQANIGNYQKIKIPNYFNEYISFIPDDIY FYDNDKKIYIFLSKELNKNKKEDEVIYLDELAKAMFENDFEEEDQTYVNFLKTLNESFDEEIEFEENIQTDKTLPSKKDL DKSIQDIMLDKELAKLSIDITFFNIIKQLFPFTEFFMSQPDFFKKMILFFIDSSLDKKYYGNKLFSSFKAHFFKELGIFY ALSPKGRFIKINPKSKKSLNKLFLYQIGTNYYYFNQLEYASKLKKSKSFSRLDKAKQIHLISKVKKTISY >Mature_870_residues MKIKNFTLIASNHNLEIELKNLTKNANKIIFICSDFDGYKEAKNSLYKTLHTIEDNFKIDNTKTFKIIHLNQANKDEITK EQKFSSDKNLSSIKKIIFNNLKFLNNAINQNENKTLNKIIDENNVENIENFLKEIQKELNILLKNIKESNYFEQEIKPKI QLTLDTLFNTLLKNITQSNDDEYKQIIRAIAKFFINILDSVTNLKKPVSLVKKNPYVFVVNTLFEAYNSSAEYQEYKEQK YYYDFAYPLLELITSKLYPIIALCNEEILSDVLIIDDKVLLDFSSYSNVPSISLYKNSFYKVILDEEFQGIFDNFLENNL KFENEKLDNTLLVNSSLNNFDTTLKKAINLNISKLNHFFYAEYPDLNSSMLVEMILDKKNTDQINTTKMGKNYLLITNPP QLNNAGLCEDLYQKKLGAIIKNRPKALTKNEKLALKGDFPSKRDYGSYFIERDVKKEDDYVLQLCPFVKLDGQIYQKYKG YFNFYNQTYSWMKLYLLEHINERLEYEKVKQDFAYIDSFFKLPKELEEISEKEKEKVKEYVELFNNYLDNINSRYDQTQS NLNSKPLMFKTYENVDFKKYSPLTVVLLTLTLYVLQKDLAFTQEYSLGYKLFQANIGNYQKIKIPNYFNEYISFIPDDIY FYDNDKKIYIFLSKELNKNKKEDEVIYLDELAKAMFENDFEEEDQTYVNFLKTLNESFDEEIEFEENIQTDKTLPSKKDL DKSIQDIMLDKELAKLSIDITFFNIIKQLFPFTEFFMSQPDFFKKMILFFIDSSLDKKYYGNKLFSSFKAHFFKELGIFY ALSPKGRFIKINPKSKKSLNKLFLYQIGTNYYYFNQLEYASKLKKSKSFSRLDKAKQIHLISKVKKTISY
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 103101; Mature: 103101
Theoretical pI: Translated: 7.85; Mature: 7.85
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 1.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKIKNFTLIASNHNLEIELKNLTKNANKIIFICSDFDGYKEAKNSLYKTLHTIEDNFKID CCCCEEEEEEECCCEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEC NTKTFKIIHLNQANKDEITKEQKFSSDKNLSSIKKIIFNNLKFLNNAINQNENKTLNKII CCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH DENNVENIENFLKEIQKELNILLKNIKESNYFEQEIKPKIQLTLDTLFNTLLKNITQSND CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHCCCC DEYKQIIRAIAKFFINILDSVTNLKKPVSLVKKNPYVFVVNTLFEAYNSSAEYQEYKEQK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH YYYDFAYPLLELITSKLYPIIALCNEEILSDVLIIDDKVLLDFSSYSNVPSISLYKNSFY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHEEEEHHCCCCCCEEEECCCEE KVILDEEFQGIFDNFLENNLKFENEKLDNTLLVNSSLNNFDTTLKKAINLNISKLNHFFY EEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHCCEEE AEYPDLNSSMLVEMILDKKNTDQINTTKMGKNYLLITNPPQLNNAGLCEDLYQKKLGAII EECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH KNRPKALTKNEKLALKGDFPSKRDYGSYFIERDVKKEDDYVLQLCPFVKLDGQIYQKYKG HCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHH YFNFYNQTYSWMKLYLLEHINERLEYEKVKQDFAYIDSFFKLPKELEEISEKEKEKVKEY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHH VELFNNYLDNINSRYDQTQSNLNSKPLMFKTYENVDFKKYSPLTVVLLTLTLYVLQKDLA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH FTQEYSLGYKLFQANIGNYQKIKIPNYFNEYISFIPDDIYFYDNDKKIYIFLSKELNKNK HHHHHHHHHHEEECCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCEEEEEEECCCCCCC KEDEVIYLDELAKAMFENDFEEEDQTYVNFLKTLNESFDEEIEFEENIQTDKTLPSKKDL CCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCHHHH DKSIQDIMLDKELAKLSIDITFFNIIKQLFPFTEFFMSQPDFFKKMILFFIDSSLDKKYY HHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH GNKLFSSFKAHFFKELGIFYALSPKGRFIKINPKSKKSLNKLFLYQIGTNYYYFNQLEYA HHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCEEEECCCCHHHHHHEEEEEECCCEEEEHHHHHH SKLKKSKSFSRLDKAKQIHLISKVKKTISY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MKIKNFTLIASNHNLEIELKNLTKNANKIIFICSDFDGYKEAKNSLYKTLHTIEDNFKID CCCCEEEEEEECCCEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEC NTKTFKIIHLNQANKDEITKEQKFSSDKNLSSIKKIIFNNLKFLNNAINQNENKTLNKII CCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH DENNVENIENFLKEIQKELNILLKNIKESNYFEQEIKPKIQLTLDTLFNTLLKNITQSND CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHCCCC DEYKQIIRAIAKFFINILDSVTNLKKPVSLVKKNPYVFVVNTLFEAYNSSAEYQEYKEQK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH YYYDFAYPLLELITSKLYPIIALCNEEILSDVLIIDDKVLLDFSSYSNVPSISLYKNSFY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHEEEEHHCCCCCCEEEECCCEE KVILDEEFQGIFDNFLENNLKFENEKLDNTLLVNSSLNNFDTTLKKAINLNISKLNHFFY EEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHCCEEE AEYPDLNSSMLVEMILDKKNTDQINTTKMGKNYLLITNPPQLNNAGLCEDLYQKKLGAII EECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH KNRPKALTKNEKLALKGDFPSKRDYGSYFIERDVKKEDDYVLQLCPFVKLDGQIYQKYKG HCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHH YFNFYNQTYSWMKLYLLEHINERLEYEKVKQDFAYIDSFFKLPKELEEISEKEKEKVKEY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHH VELFNNYLDNINSRYDQTQSNLNSKPLMFKTYENVDFKKYSPLTVVLLTLTLYVLQKDLA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH FTQEYSLGYKLFQANIGNYQKIKIPNYFNEYISFIPDDIYFYDNDKKIYIFLSKELNKNK HHHHHHHHHHEEECCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCEEEEEEECCCCCCC KEDEVIYLDELAKAMFENDFEEEDQTYVNFLKTLNESFDEEIEFEENIQTDKTLPSKKDL CCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCHHHH DKSIQDIMLDKELAKLSIDITFFNIIKQLFPFTEFFMSQPDFFKKMILFFIDSSLDKKYY HHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH GNKLFSSFKAHFFKELGIFYALSPKGRFIKINPKSKKSLNKLFLYQIGTNYYYFNQLEYA HHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCEEEECCCCHHHHHHEEEEEECCCEEEEHHHHHH SKLKKSKSFSRLDKAKQIHLISKVKKTISY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA