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Definition Campylobacter jejuni RM1221, complete genome.
Accession NC_003912
Length 1,777,831

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The map label for this gene is 57237858

Identifier: 57237858

GI number: 57237858

Start: 1033187

End: 1035799

Strand: Reverse

Name: 57237858

Synonym: CJE1113

Alternate gene names: NA

Gene position: 1035799-1033187 (Counterclockwise)

Preceding gene: 57237859

Following gene: 57237857

Centisome position: 58.26

GC content: 22.39

Gene sequence:

>2613_bases
ATGAAAATAAAAAATTTTACTTTAATTGCATCAAATCATAATTTAGAAATCGAGTTAAAAAATCTTACCAAAAATGCTAA
TAAAATTATTTTTATATGCAGTGATTTTGATGGATATAAAGAAGCTAAGAATTCTTTGTATAAGACACTACATACTATTG
AAGATAATTTTAAAATTGATAATACAAAAACTTTTAAAATCATACATTTAAATCAAGCCAATAAAGACGAAATCACAAAA
GAACAAAAATTTAGCTCTGATAAAAATTTATCTAGCATTAAAAAAATTATCTTTAATAATTTAAAATTTTTAAATAATGC
AATTAATCAAAATGAAAATAAAACGCTCAATAAAATTATTGATGAAAACAATGTAGAAAATATTGAAAATTTTTTAAAAG
AAATTCAAAAAGAATTAAATATATTATTAAAAAATATCAAAGAATCTAACTATTTTGAGCAAGAAATTAAACCAAAGATA
CAACTTACCCTAGATACACTTTTTAATACACTTTTAAAAAATATTACTCAATCTAATGATGATGAATATAAGCAAATTAT
TAGAGCTATAGCAAAATTTTTTATCAATATATTAGATTCTGTAACCAATCTTAAAAAACCTGTCTCTTTAGTCAAAAAAA
ATCCTTATGTTTTTGTTGTAAATACATTATTTGAAGCTTATAATTCTTCTGCTGAGTATCAAGAGTATAAGGAACAAAAA
TATTATTATGATTTTGCTTATCCACTTTTAGAGCTTATTACTAGTAAGCTTTATCCTATTATCGCTTTGTGCAATGAAGA
AATTTTATCTGATGTATTAATTATAGATGATAAAGTATTATTAGATTTTTCATCTTATTCTAATGTACCTTCTATTAGTC
TTTATAAAAATAGTTTTTATAAAGTTATTTTAGATGAAGAATTTCAAGGTATTTTTGATAATTTTTTAGAAAATAATCTA
AAATTTGAAAATGAAAAGTTAGATAATACACTTTTAGTGAATTCTAGTTTAAATAATTTTGATACAACATTAAAAAAAGC
AATCAATTTAAATATCTCTAAACTCAATCATTTCTTTTATGCAGAATATCCTGATTTAAATTCTTCCATGCTAGTAGAAA
TGATATTAGATAAAAAAAATACTGATCAAATCAATACAACCAAAATGGGTAAAAATTATTTGCTTATTACTAATCCACCA
CAGCTTAACAATGCAGGACTTTGTGAGGACTTGTATCAAAAAAAATTAGGAGCAATAATAAAAAATCGCCCCAAAGCTCT
TACAAAAAATGAAAAACTTGCATTAAAAGGCGATTTTCCTAGCAAAAGAGATTATGGTTCTTATTTTATAGAAAGAGATG
TTAAAAAAGAAGATGATTATGTATTGCAACTTTGTCCTTTTGTGAAACTTGATGGACAGATTTATCAAAAATATAAGGGA
TATTTTAATTTTTATAATCAAACATATTCTTGGATGAAACTTTATTTATTGGAACATATAAACGAACGATTAGAATATGA
AAAAGTTAAGCAAGATTTTGCTTATATTGATAGCTTTTTTAAATTGCCTAAAGAACTTGAAGAAATTAGCGAAAAAGAAA
AAGAAAAAGTAAAAGAATATGTCGAGCTTTTTAATAATTATTTAGATAATATCAATTCTCGCTATGACCAAACACAATCC
AATCTTAACTCAAAACCATTAATGTTTAAAACATATGAAAATGTAGATTTTAAGAAATACTCACCTTTAACGGTTGTTTT
ATTGACTTTGACTTTGTATGTTTTACAAAAAGACTTAGCTTTTACGCAAGAATATTCTTTGGGATATAAATTGTTTCAGG
CAAATATTGGTAATTATCAAAAGATTAAAATACCAAATTATTTTAATGAGTATATTTCATTTATCCCTGATGATATTTAT
TTTTATGATAATGATAAAAAAATTTATATCTTTTTATCTAAAGAATTAAATAAAAATAAAAAAGAAGATGAAGTTATTTA
TTTAGATGAATTAGCCAAAGCTATGTTTGAAAATGATTTTGAAGAAGAAGATCAAACTTATGTAAATTTTTTAAAAACCT
TAAATGAAAGCTTTGATGAGGAGATTGAATTTGAAGAAAATATACAAACAGACAAAACTCTTCCTTCAAAAAAAGATTTA
GATAAAAGCATTCAAGATATTATGCTTGATAAAGAACTTGCAAAATTATCTATAGATATTACTTTTTTTAATATCATTAA
GCAACTTTTTCCTTTTACAGAATTTTTTATGAGTCAGCCTGATTTTTTTAAAAAAATGATTTTATTTTTTATAGATTCAA
GCTTAGATAAAAAGTATTATGGTAATAAATTATTTTCTAGTTTTAAAGCACATTTTTTTAAAGAACTAGGGATATTTTAT
GCACTTAGCCCTAAGGGGCGTTTTATAAAAATTAATCCAAAAAGTAAAAAATCACTCAATAAGCTTTTTTTATATCAAAT
AGGAACAAATTATTATTATTTTAATCAATTAGAATATGCAAGTAAGTTAAAAAAGTCAAAGAGTTTTTCAAGATTGGATA
AAGCTAAGCAAATTCATTTGATATCAAAAGTAAAAAAAACAATTAGCTATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACTTCAAATCGCACAAGGACTAGATGAAATCTTAGAAGATGAAGATAGAAAACAAGAGCTTTATGTTTGTAAATTTGTG
GTGGTAAATGGGGTTAAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTCTATTAAAATGAGTAAAGACTTGAGCGTGGATATATTAAAAAGTTTAGCAGGATCTTTTATTGATACACTTTTAC
CTACAAATTATGAAAGATTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 870; Mature: 870

Protein sequence:

>870_residues
MKIKNFTLIASNHNLEIELKNLTKNANKIIFICSDFDGYKEAKNSLYKTLHTIEDNFKIDNTKTFKIIHLNQANKDEITK
EQKFSSDKNLSSIKKIIFNNLKFLNNAINQNENKTLNKIIDENNVENIENFLKEIQKELNILLKNIKESNYFEQEIKPKI
QLTLDTLFNTLLKNITQSNDDEYKQIIRAIAKFFINILDSVTNLKKPVSLVKKNPYVFVVNTLFEAYNSSAEYQEYKEQK
YYYDFAYPLLELITSKLYPIIALCNEEILSDVLIIDDKVLLDFSSYSNVPSISLYKNSFYKVILDEEFQGIFDNFLENNL
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QLNNAGLCEDLYQKKLGAIIKNRPKALTKNEKLALKGDFPSKRDYGSYFIERDVKKEDDYVLQLCPFVKLDGQIYQKYKG
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FYDNDKKIYIFLSKELNKNKKEDEVIYLDELAKAMFENDFEEEDQTYVNFLKTLNESFDEEIEFEENIQTDKTLPSKKDL
DKSIQDIMLDKELAKLSIDITFFNIIKQLFPFTEFFMSQPDFFKKMILFFIDSSLDKKYYGNKLFSSFKAHFFKELGIFY
ALSPKGRFIKINPKSKKSLNKLFLYQIGTNYYYFNQLEYASKLKKSKSFSRLDKAKQIHLISKVKKTISY

Sequences:

>Translated_870_residues
MKIKNFTLIASNHNLEIELKNLTKNANKIIFICSDFDGYKEAKNSLYKTLHTIEDNFKIDNTKTFKIIHLNQANKDEITK
EQKFSSDKNLSSIKKIIFNNLKFLNNAINQNENKTLNKIIDENNVENIENFLKEIQKELNILLKNIKESNYFEQEIKPKI
QLTLDTLFNTLLKNITQSNDDEYKQIIRAIAKFFINILDSVTNLKKPVSLVKKNPYVFVVNTLFEAYNSSAEYQEYKEQK
YYYDFAYPLLELITSKLYPIIALCNEEILSDVLIIDDKVLLDFSSYSNVPSISLYKNSFYKVILDEEFQGIFDNFLENNL
KFENEKLDNTLLVNSSLNNFDTTLKKAINLNISKLNHFFYAEYPDLNSSMLVEMILDKKNTDQINTTKMGKNYLLITNPP
QLNNAGLCEDLYQKKLGAIIKNRPKALTKNEKLALKGDFPSKRDYGSYFIERDVKKEDDYVLQLCPFVKLDGQIYQKYKG
YFNFYNQTYSWMKLYLLEHINERLEYEKVKQDFAYIDSFFKLPKELEEISEKEKEKVKEYVELFNNYLDNINSRYDQTQS
NLNSKPLMFKTYENVDFKKYSPLTVVLLTLTLYVLQKDLAFTQEYSLGYKLFQANIGNYQKIKIPNYFNEYISFIPDDIY
FYDNDKKIYIFLSKELNKNKKEDEVIYLDELAKAMFENDFEEEDQTYVNFLKTLNESFDEEIEFEENIQTDKTLPSKKDL
DKSIQDIMLDKELAKLSIDITFFNIIKQLFPFTEFFMSQPDFFKKMILFFIDSSLDKKYYGNKLFSSFKAHFFKELGIFY
ALSPKGRFIKINPKSKKSLNKLFLYQIGTNYYYFNQLEYASKLKKSKSFSRLDKAKQIHLISKVKKTISY
>Mature_870_residues
MKIKNFTLIASNHNLEIELKNLTKNANKIIFICSDFDGYKEAKNSLYKTLHTIEDNFKIDNTKTFKIIHLNQANKDEITK
EQKFSSDKNLSSIKKIIFNNLKFLNNAINQNENKTLNKIIDENNVENIENFLKEIQKELNILLKNIKESNYFEQEIKPKI
QLTLDTLFNTLLKNITQSNDDEYKQIIRAIAKFFINILDSVTNLKKPVSLVKKNPYVFVVNTLFEAYNSSAEYQEYKEQK
YYYDFAYPLLELITSKLYPIIALCNEEILSDVLIIDDKVLLDFSSYSNVPSISLYKNSFYKVILDEEFQGIFDNFLENNL
KFENEKLDNTLLVNSSLNNFDTTLKKAINLNISKLNHFFYAEYPDLNSSMLVEMILDKKNTDQINTTKMGKNYLLITNPP
QLNNAGLCEDLYQKKLGAIIKNRPKALTKNEKLALKGDFPSKRDYGSYFIERDVKKEDDYVLQLCPFVKLDGQIYQKYKG
YFNFYNQTYSWMKLYLLEHINERLEYEKVKQDFAYIDSFFKLPKELEEISEKEKEKVKEYVELFNNYLDNINSRYDQTQS
NLNSKPLMFKTYENVDFKKYSPLTVVLLTLTLYVLQKDLAFTQEYSLGYKLFQANIGNYQKIKIPNYFNEYISFIPDDIY
FYDNDKKIYIFLSKELNKNKKEDEVIYLDELAKAMFENDFEEEDQTYVNFLKTLNESFDEEIEFEENIQTDKTLPSKKDL
DKSIQDIMLDKELAKLSIDITFFNIIKQLFPFTEFFMSQPDFFKKMILFFIDSSLDKKYYGNKLFSSFKAHFFKELGIFY
ALSPKGRFIKINPKSKKSLNKLFLYQIGTNYYYFNQLEYASKLKKSKSFSRLDKAKQIHLISKVKKTISY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 103101; Mature: 103101

Theoretical pI: Translated: 7.85; Mature: 7.85

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKIKNFTLIASNHNLEIELKNLTKNANKIIFICSDFDGYKEAKNSLYKTLHTIEDNFKID
CCCCEEEEEEECCCEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEC
NTKTFKIIHLNQANKDEITKEQKFSSDKNLSSIKKIIFNNLKFLNNAINQNENKTLNKII
CCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
DENNVENIENFLKEIQKELNILLKNIKESNYFEQEIKPKIQLTLDTLFNTLLKNITQSND
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHCCCC
DEYKQIIRAIAKFFINILDSVTNLKKPVSLVKKNPYVFVVNTLFEAYNSSAEYQEYKEQK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
YYYDFAYPLLELITSKLYPIIALCNEEILSDVLIIDDKVLLDFSSYSNVPSISLYKNSFY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHEEEEHHCCCCCCEEEECCCEE
KVILDEEFQGIFDNFLENNLKFENEKLDNTLLVNSSLNNFDTTLKKAINLNISKLNHFFY
EEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHCCEEE
AEYPDLNSSMLVEMILDKKNTDQINTTKMGKNYLLITNPPQLNNAGLCEDLYQKKLGAII
EECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
KNRPKALTKNEKLALKGDFPSKRDYGSYFIERDVKKEDDYVLQLCPFVKLDGQIYQKYKG
HCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHH
YFNFYNQTYSWMKLYLLEHINERLEYEKVKQDFAYIDSFFKLPKELEEISEKEKEKVKEY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VELFNNYLDNINSRYDQTQSNLNSKPLMFKTYENVDFKKYSPLTVVLLTLTLYVLQKDLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FTQEYSLGYKLFQANIGNYQKIKIPNYFNEYISFIPDDIYFYDNDKKIYIFLSKELNKNK
HHHHHHHHHHEEECCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCEEEEEEECCCCCCC
KEDEVIYLDELAKAMFENDFEEEDQTYVNFLKTLNESFDEEIEFEENIQTDKTLPSKKDL
CCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCHHHH
DKSIQDIMLDKELAKLSIDITFFNIIKQLFPFTEFFMSQPDFFKKMILFFIDSSLDKKYY
HHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
GNKLFSSFKAHFFKELGIFYALSPKGRFIKINPKSKKSLNKLFLYQIGTNYYYFNQLEYA
HHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCEEEECCCCHHHHHHEEEEEECCCEEEEHHHHHH
SKLKKSKSFSRLDKAKQIHLISKVKKTISY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKIKNFTLIASNHNLEIELKNLTKNANKIIFICSDFDGYKEAKNSLYKTLHTIEDNFKID
CCCCEEEEEEECCCEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEC
NTKTFKIIHLNQANKDEITKEQKFSSDKNLSSIKKIIFNNLKFLNNAINQNENKTLNKII
CCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
DENNVENIENFLKEIQKELNILLKNIKESNYFEQEIKPKIQLTLDTLFNTLLKNITQSND
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHCCCC
DEYKQIIRAIAKFFINILDSVTNLKKPVSLVKKNPYVFVVNTLFEAYNSSAEYQEYKEQK
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KVILDEEFQGIFDNFLENNLKFENEKLDNTLLVNSSLNNFDTTLKKAINLNISKLNHFFY
EEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHCCEEE
AEYPDLNSSMLVEMILDKKNTDQINTTKMGKNYLLITNPPQLNNAGLCEDLYQKKLGAII
EECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
KNRPKALTKNEKLALKGDFPSKRDYGSYFIERDVKKEDDYVLQLCPFVKLDGQIYQKYKG
HCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHH
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VELFNNYLDNINSRYDQTQSNLNSKPLMFKTYENVDFKKYSPLTVVLLTLTLYVLQKDLA
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KEDEVIYLDELAKAMFENDFEEEDQTYVNFLKTLNESFDEEIEFEENIQTDKTLPSKKDL
CCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCHHHH
DKSIQDIMLDKELAKLSIDITFFNIIKQLFPFTEFFMSQPDFFKKMILFFIDSSLDKKYY
HHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
GNKLFSSFKAHFFKELGIFYALSPKGRFIKINPKSKKSLNKLFLYQIGTNYYYFNQLEYA
HHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCEEEECCCCHHHHHHEEEEEECCCEEEEHHHHHH
SKLKKSKSFSRLDKAKQIHLISKVKKTISY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA