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The map label for this gene is glnT [H]

Identifier: 57237732

GI number: 57237732

Start: 920441

End: 921907

Strand: Reverse

Name: glnT [H]

Synonym: CJE0982

Alternate gene names: 57237732

Gene position: 921907-920441 (Counterclockwise)

Preceding gene: 57237733

Following gene: 57237729

Centisome position: 51.86

GC content: 31.83

Gene sequence:

>1467_bases
ATGAAATTAGATATTATGCTAGATTTTGCCAATAAAGCGTCTGATATTATAGCTAATAAGATTGTCCCAAATACAGACAT
TATTATGGTAGTTTTACTTATTGTTTGTGGGCTTTATTATAGTTTTTTAACTCGCTTTGTTCAGTTTCGTATGTTGAGTT
CTGTATTTAAAATTCTTACAGAAAAAAACGAAGGACACGCTAAAGAACATATTTCACCTTTTCAAGCATTAATGATCTCA
ACTGCTTCTAGAGTTGGTATAGGAAATATTGCTGGAATTTCTTTGGCATTGGCTACAGGTGGAGCTGGTGCTTTATTTTG
GATGTGGGTTATGGCATTTTTTGGTGGTGCCTCAGCATTTGCTGAAAGTACCTTAGCTCAAGTTTACAAATCAAAAGATG
ATACAGGCGGGTTTAAAGGTGGTCCAGCTTATTATATAAAAAAAGCCTTAGGCTCACATTTTTTTGGAGCTTTTTTTGCT
TTTATTCTTATTATTACTTATGCTTATGGATTTAATGGACTTCAAAGTCAAACAATGACTTCGTCTTTTAAAGTTTATTA
TGATATGTTTAATCCAAATGCTGCTGTAGATTTTGCATCAAGTTCTTGGCCAATGATTATTGGTATTGTTTTAACTATTT
TTGGTGCATGGATGTTTTTTTCTCACCATACTAAAATAGGTAAAATTAGTTCTTTAATTGTTCCTTTTATGGCTTTAGCT
TATGTTTTACTTGCCGTGATTGCTGTTTTAATGAATTTTGATAAAATTCCTTCTGTGATTCATATGATTTTACAAAGTGC
TTTTGATTTTAAAGCGATTTTTGGTGGTTTTGCTGGTTCTGCTTTGGTTATAGGGATTAAAAGAGGACTTTTTTCAAATG
AAGCGGGTATGGGCTCGGCACCTAATGCAGCTGCAGCAGCTTTGACAAGTCATCCAGCTAAACAAGGTGTTATACAAGCT
TTTTCAGTTTTAATTGATGTTGTTGTTTGTACAAGTTCTGGATTTTTAGTTCTTTTTTCTATGGCATATTTAGGACTTGG
AGAAAGTAAAATTGATGGTGGAATGCCTTTAGTTCAAGAAGCTATGCGTGAGTATTACGGTAGCTTTGGAATCCATTTTA
TTACTATAGCTATTGTTCTTTTTGCAATAACTTCTTTAATAGGAAATTATTATTATGCTCAAGCTAATGTTAAATATTTA
ACAAATTCCAAATTTGTAATGAATTTGTTTAGAATTACAGCTGTGGCTATGATTTTTATAGGCTCGCAAATGAATTTAAA
ACTTGCTTGGAATTTGGCTGATTTGACTATGGCTTTCATGGCAACGACAAATATTATATCTTTATTGCTTTTAGGTGGTA
TAGTAAATAAAGTTTTAAAAGATTTTAATACGCAACAAAAATCTGGTATAGATCCTAAATTTAATGCTAGCAAACTTGGA
ATTAAAAACGCTGAATGTTGGGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTCAAATTTACACAATAGCTTAAAACAAATAAAATCATAAAGTCCTTTTTATAAAAATTATGTTAAAGTAAAATTTAGA
TTATTTTTTGAGGAGTTTGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTCATAAGCCTTAGTGGCTTATGAATTAATGATTCAAAACCTTGTTTAAAAATTCTCTCAATCTTTCATTGCTAGGAT
TTTCAAATACTTCTTTAGGG

Product: amino acid carrier protein

Products: Na (I) [Cytoplasm]; L-alanine [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 488; Mature: 488

Protein sequence:

>488_residues
MKLDIMLDFANKASDIIANKIVPNTDIIMVVLLIVCGLYYSFLTRFVQFRMLSSVFKILTEKNEGHAKEHISPFQALMIS
TASRVGIGNIAGISLALATGGAGALFWMWVMAFFGGASAFAESTLAQVYKSKDDTGGFKGGPAYYIKKALGSHFFGAFFA
FILIITYAYGFNGLQSQTMTSSFKVYYDMFNPNAAVDFASSSWPMIIGIVLTIFGAWMFFSHHTKIGKISSLIVPFMALA
YVLLAVIAVLMNFDKIPSVIHMILQSAFDFKAIFGGFAGSALVIGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAAAALTSHPAKQGVIQA
FSVLIDVVVCTSSGFLVLFSMAYLGLGESKIDGGMPLVQEAMREYYGSFGIHFITIAIVLFAITSLIGNYYYAQANVKYL
TNSKFVMNLFRITAVAMIFIGSQMNLKLAWNLADLTMAFMATTNIISLLLLGGIVNKVLKDFNTQQKSGIDPKFNASKLG
IKNAECWD

Sequences:

>Translated_488_residues
MKLDIMLDFANKASDIIANKIVPNTDIIMVVLLIVCGLYYSFLTRFVQFRMLSSVFKILTEKNEGHAKEHISPFQALMIS
TASRVGIGNIAGISLALATGGAGALFWMWVMAFFGGASAFAESTLAQVYKSKDDTGGFKGGPAYYIKKALGSHFFGAFFA
FILIITYAYGFNGLQSQTMTSSFKVYYDMFNPNAAVDFASSSWPMIIGIVLTIFGAWMFFSHHTKIGKISSLIVPFMALA
YVLLAVIAVLMNFDKIPSVIHMILQSAFDFKAIFGGFAGSALVIGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAAAALTSHPAKQGVIQA
FSVLIDVVVCTSSGFLVLFSMAYLGLGESKIDGGMPLVQEAMREYYGSFGIHFITIAIVLFAITSLIGNYYYAQANVKYL
TNSKFVMNLFRITAVAMIFIGSQMNLKLAWNLADLTMAFMATTNIISLLLLGGIVNKVLKDFNTQQKSGIDPKFNASKLG
IKNAECWD
>Mature_488_residues
MKLDIMLDFANKASDIIANKIVPNTDIIMVVLLIVCGLYYSFLTRFVQFRMLSSVFKILTEKNEGHAKEHISPFQALMIS
TASRVGIGNIAGISLALATGGAGALFWMWVMAFFGGASAFAESTLAQVYKSKDDTGGFKGGPAYYIKKALGSHFFGAFFA
FILIITYAYGFNGLQSQTMTSSFKVYYDMFNPNAAVDFASSSWPMIIGIVLTIFGAWMFFSHHTKIGKISSLIVPFMALA
YVLLAVIAVLMNFDKIPSVIHMILQSAFDFKAIFGGFAGSALVIGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAAAALTSHPAKQGVIQA
FSVLIDVVVCTSSGFLVLFSMAYLGLGESKIDGGMPLVQEAMREYYGSFGIHFITIAIVLFAITSLIGNYYYAQANVKYL
TNSKFVMNLFRITAVAMIFIGSQMNLKLAWNLADLTMAFMATTNIISLLLLGGIVNKVLKDFNTQQKSGIDPKFNASKLG
IKNAECWD

Specific function: Probably functions as a sodium/glutamine symporter for glutamine uptake [H]

COG id: COG1115

COG function: function code E; Na+/alanine symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:alanine (SAF) symporter family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786188, Length=475, Percent_Identity=37.6842105263158, Blast_Score=290, Evalue=2e-79,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001463 [H]

Pfam domain/function: PF01235 Na_Ala_symp [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52996; Mature: 52996

Theoretical pI: Translated: 9.56; Mature: 9.56

Prosite motif: PS00873 NA_ALANINE_SYMP

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
4.7 %Met     (Translated Protein)
5.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
4.7 %Met     (Mature Protein)
5.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKLDIMLDFANKASDIIANKIVPNTDIIMVVLLIVCGLYYSFLTRFVQFRMLSSVFKILT
CEEEEEEECHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EKNEGHAKEHISPFQALMISTASRVGIGNIAGISLALATGGAGALFWMWVMAFFGGASAF
CCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHH
AESTLAQVYKSKDDTGGFKGGPAYYIKKALGSHFFGAFFAFILIITYAYGFNGLQSQTMT
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
SSFKVYYDMFNPNAAVDFASSSWPMIIGIVLTIFGAWMFFSHHTKIGKISSLIVPFMALA
HHHEEEEEECCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
YVLLAVIAVLMNFDKIPSVIHMILQSAFDFKAIFGGFAGSALVIGIKRGLFSNEAGMGSA
HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
PNAAAAALTSHPAKQGVIQAFSVLIDVVVCTSSGFLVLFSMAYLGLGESKIDGGMPLVQE
CCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHH
AMREYYGSFGIHFITIAIVLFAITSLIGNYYYAQANVKYLTNSKFVMNLFRITAVAMIFI
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GSQMNLKLAWNLADLTMAFMATTNIISLLLLGGIVNKVLKDFNTQQKSGIDPKFNASKLG
CCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCHHCC
IKNAECWD
CCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKLDIMLDFANKASDIIANKIVPNTDIIMVVLLIVCGLYYSFLTRFVQFRMLSSVFKILT
CEEEEEEECHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EKNEGHAKEHISPFQALMISTASRVGIGNIAGISLALATGGAGALFWMWVMAFFGGASAF
CCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHH
AESTLAQVYKSKDDTGGFKGGPAYYIKKALGSHFFGAFFAFILIITYAYGFNGLQSQTMT
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
SSFKVYYDMFNPNAAVDFASSSWPMIIGIVLTIFGAWMFFSHHTKIGKISSLIVPFMALA
HHHEEEEEECCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
YVLLAVIAVLMNFDKIPSVIHMILQSAFDFKAIFGGFAGSALVIGIKRGLFSNEAGMGSA
HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
PNAAAAALTSHPAKQGVIQAFSVLIDVVVCTSSGFLVLFSMAYLGLGESKIDGGMPLVQE
CCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHH
AMREYYGSFGIHFITIAIVLFAITSLIGNYYYAQANVKYLTNSKFVMNLFRITAVAMIFI
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GSQMNLKLAWNLADLTMAFMATTNIISLLLLGGIVNKVLKDFNTQQKSGIDPKFNASKLG
CCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCHHCC
IKNAECWD
CCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Na (I) [Periplasm]; L-alanine [Periplasm] [C]

Specific reaction: Na (I) [Periplasm] + L-alanine [Periplasm] = Na (I) [Cytoplasm] + L-alanine [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]