| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
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The map label for this gene is 57237690
Identifier: 57237690
GI number: 57237690
Start: 873360
End: 875471
Strand: Reverse
Name: 57237690
Synonym: CJE0936
Alternate gene names: NA
Gene position: 875471-873360 (Counterclockwise)
Preceding gene: 57237691
Following gene: 57237689
Centisome position: 49.24
GC content: 26.52
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
>100_bases GCAAAATCAAAAGATCGATTAAAAAAGCTGTAGCTCTAGGCTATCAAAAAGAAAAAAACTCTGCACCAAAAGTACTTGCA AGTGGCAAAGGCGAAAGTGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 703; Mature: 703
Protein sequence:
>703_residues MINTQLASQIANTQKNDLKVDNSASKDKTNLKDNPKEALAQALKQNLGLSKDASSEEILAKFVQNETGTKLKELVNKLLD QINAQKNPDSPVLKQGKNLNLAPNFANELKILSTELAKSDTFTQVLDRLNQILKPASEIKNNNLAPLFKNSGVFLEAKLK DALNEELLPKSFHSLLSTIKGLSSEKLSVQIAQLANTNLSPKDTLKELKNIINSSKNENKQILNQSSFKALLNLSSKLEN FKNYISKNPSHAQEKITPIANKILKELNSIKNDFFKALNKPENLMIKDPNILKQTATAFEKLENTLKNILGNQASKIQDK ENILENLLSNKENIKEEKLNHNTKNQDEEKYIKVSKEETLADDAKTDIKQDVKNEENLPKKEVNANLDSSTKTHEENIKE NPKFYETKTENKTSINTNTNTSNPNTNNTQNLNNTQNIQSNNNQTMQNIFKNQEFIKQNIVKNLAFNVENLDLEQVQDLS KNLSNLSRRLNESLKELEPYTQNAKLNQAELKNLEHKLNLSIKDLAQIKPKTEQDIAESLHHDVKSTLLQISNLAKNEGN EAVYNQANRLLAQIEINQLMSLANDSINTYLPFSWDDLNDSKIMFRRGKKDKFFAQIKLEFAKLGDLEILISLNNEKYID INIMAENIEFRKTIYENAHELKRNINKAGLLSANFFVGDIIRSKFDTRNMKNLDLEMGMDKKV
Sequences:
>Translated_703_residues MINTQLASQIANTQKNDLKVDNSASKDKTNLKDNPKEALAQALKQNLGLSKDASSEEILAKFVQNETGTKLKELVNKLLD QINAQKNPDSPVLKQGKNLNLAPNFANELKILSTELAKSDTFTQVLDRLNQILKPASEIKNNNLAPLFKNSGVFLEAKLK DALNEELLPKSFHSLLSTIKGLSSEKLSVQIAQLANTNLSPKDTLKELKNIINSSKNENKQILNQSSFKALLNLSSKLEN FKNYISKNPSHAQEKITPIANKILKELNSIKNDFFKALNKPENLMIKDPNILKQTATAFEKLENTLKNILGNQASKIQDK ENILENLLSNKENIKEEKLNHNTKNQDEEKYIKVSKEETLADDAKTDIKQDVKNEENLPKKEVNANLDSSTKTHEENIKE NPKFYETKTENKTSINTNTNTSNPNTNNTQNLNNTQNIQSNNNQTMQNIFKNQEFIKQNIVKNLAFNVENLDLEQVQDLS KNLSNLSRRLNESLKELEPYTQNAKLNQAELKNLEHKLNLSIKDLAQIKPKTEQDIAESLHHDVKSTLLQISNLAKNEGN EAVYNQANRLLAQIEINQLMSLANDSINTYLPFSWDDLNDSKIMFRRGKKDKFFAQIKLEFAKLGDLEILISLNNEKYID INIMAENIEFRKTIYENAHELKRNINKAGLLSANFFVGDIIRSKFDTRNMKNLDLEMGMDKKV >Mature_703_residues MINTQLASQIANTQKNDLKVDNSASKDKTNLKDNPKEALAQALKQNLGLSKDASSEEILAKFVQNETGTKLKELVNKLLD QINAQKNPDSPVLKQGKNLNLAPNFANELKILSTELAKSDTFTQVLDRLNQILKPASEIKNNNLAPLFKNSGVFLEAKLK DALNEELLPKSFHSLLSTIKGLSSEKLSVQIAQLANTNLSPKDTLKELKNIINSSKNENKQILNQSSFKALLNLSSKLEN FKNYISKNPSHAQEKITPIANKILKELNSIKNDFFKALNKPENLMIKDPNILKQTATAFEKLENTLKNILGNQASKIQDK ENILENLLSNKENIKEEKLNHNTKNQDEEKYIKVSKEETLADDAKTDIKQDVKNEENLPKKEVNANLDSSTKTHEENIKE NPKFYETKTENKTSINTNTNTSNPNTNNTQNLNNTQNIQSNNNQTMQNIFKNQEFIKQNIVKNLAFNVENLDLEQVQDLS KNLSNLSRRLNESLKELEPYTQNAKLNQAELKNLEHKLNLSIKDLAQIKPKTEQDIAESLHHDVKSTLLQISNLAKNEGN EAVYNQANRLLAQIEINQLMSLANDSINTYLPFSWDDLNDSKIMFRRGKKDKFFAQIKLEFAKLGDLEILISLNNEKYID INIMAENIEFRKTIYENAHELKRNINKAGLLSANFFVGDIIRSKFDTRNMKNLDLEMGMDKKV
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 79879; Mature: 79879
Theoretical pI: Translated: 9.43; Mature: 9.43
Prosite motif: PS00063 ALDOKETO_REDUCTASE_3
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 1.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 1.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MINTQLASQIANTQKNDLKVDNSASKDKTNLKDNPKEALAQALKQNLGLSKDASSEEILA CCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH KFVQNETGTKLKELVNKLLDQINAQKNPDSPVLKQGKNLNLAPNFANELKILSTELAKSD HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCC TFTQVLDRLNQILKPASEIKNNNLAPLFKNSGVFLEAKLKDALNEELLPKSFHSLLSTIK HHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH GLSSEKLSVQIAQLANTNLSPKDTLKELKNIINSSKNENKQILNQSSFKALLNLSSKLEN CCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FKNYISKNPSHAQEKITPIANKILKELNSIKNDFFKALNKPENLMIKDPNILKQTATAFE HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHH KLENTLKNILGNQASKIQDKENILENLLSNKENIKEEKLNHNTKNQDEEKYIKVSKEETL HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHH ADDAKTDIKQDVKNEENLPKKEVNANLDSSTKTHEENIKENPKFYETKTENKTSINTNTN HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCC TSNPNTNNTQNLNNTQNIQSNNNQTMQNIFKNQEFIKQNIVKNLAFNVENLDLEQVQDLS CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH KNLSNLSRRLNESLKELEPYTQNAKLNQAELKNLEHKLNLSIKDLAQIKPKTEQDIAESL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHH HHDVKSTLLQISNLAKNEGNEAVYNQANRLLAQIEINQLMSLANDSINTYLPFSWDDLND HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC SKIMFRRGKKDKFFAQIKLEFAKLGDLEILISLNNEKYIDINIMAENIEFRKTIYENAHE CHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHH LKRNINKAGLLSANFFVGDIIRSKFDTRNMKNLDLEMGMDKKV HHHCCCHHCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MINTQLASQIANTQKNDLKVDNSASKDKTNLKDNPKEALAQALKQNLGLSKDASSEEILA CCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH KFVQNETGTKLKELVNKLLDQINAQKNPDSPVLKQGKNLNLAPNFANELKILSTELAKSD HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCC TFTQVLDRLNQILKPASEIKNNNLAPLFKNSGVFLEAKLKDALNEELLPKSFHSLLSTIK HHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH GLSSEKLSVQIAQLANTNLSPKDTLKELKNIINSSKNENKQILNQSSFKALLNLSSKLEN CCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FKNYISKNPSHAQEKITPIANKILKELNSIKNDFFKALNKPENLMIKDPNILKQTATAFE HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHH KLENTLKNILGNQASKIQDKENILENLLSNKENIKEEKLNHNTKNQDEEKYIKVSKEETL HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHH ADDAKTDIKQDVKNEENLPKKEVNANLDSSTKTHEENIKENPKFYETKTENKTSINTNTN HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCC TSNPNTNNTQNLNNTQNIQSNNNQTMQNIFKNQEFIKQNIVKNLAFNVENLDLEQVQDLS CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH KNLSNLSRRLNESLKELEPYTQNAKLNQAELKNLEHKLNLSIKDLAQIKPKTEQDIAESL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHH HHDVKSTLLQISNLAKNEGNEAVYNQANRLLAQIEINQLMSLANDSINTYLPFSWDDLND HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC SKIMFRRGKKDKFFAQIKLEFAKLGDLEILISLNNEKYIDINIMAENIEFRKTIYENAHE CHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHH LKRNINKAGLLSANFFVGDIIRSKFDTRNMKNLDLEMGMDKKV HHHCCCHHCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA