| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
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The map label for this gene is 57237586
Identifier: 57237586
GI number: 57237586
Start: 522718
End: 526419
Strand: Direct
Name: 57237586
Synonym: CJE0584
Alternate gene names: NA
Gene position: 522718-526419 (Clockwise)
Preceding gene: 57237585
Following gene: 57237589
Centisome position: 29.4
GC content: 28.58
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TATTATCGCCCCTAGCTTAGCCGATACGCACTAAAGCTAGGCTTAATACTGACACTTTAAGCGTGAGTAGTGTCAATGGC GATTATTAATTATAGCATAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1233; Mature: 1233
Protein sequence:
>1233_residues MNIREFLLEKPQENNIISFLQDGASQSENQNTSEYLSNLKNEVINDFYKNKDKYAKEYEKYNFKDQNLTNHMGNISEYKR DLYDYNKNPSMNADDLSNYILDKQSKFNASKPIFTDDNEVARKSNQFMRDLGDELQKSGRGRLLQDDDGSYWVQDNNGNY SKVQGSAMGDLYRGLRDNGASMALGTAGAIGGTMLGGGVGMVAGGALGASLGAGYDYYGNTKDTNQDANLKEALMLMGEN AGLSLIGDAAFAGVVKGARALKNTYNMAKTGAQAGKDMIDGMAVKGGNLKENIGDKLRKISPSILNDLASQGSETSKAYA RELIESGNRNYDDILQKSRAMPLEVNQGNALVDGVASKIKDFSNTAKNGFVKNTADNVTNSLNNISKNIGSKEAALNQQD LINLSFMNDDLANMARSVLANDPKMANKVANSLHLQDEAILKELNLNNASKADELYALRDARAKRAYDEFGKGLDKLDEL NPNGVKVDKQTIDDIVLNSSVYSESTPAMIKNFIHEAKSGALDGKSVKEIYDRIDAIGNKIKESSSYNYKDFLNSLKDAF LENIVKSADNPQEAKEILTKIRKDYADFKVYDKSKLGKKLEGSEKEISKDIDKILNETNPKKNYEAITKGLNDDEIKVLD NQIITRALEKNKVNIGDANNPKFAVNYKAVMDNFENFKPKSKSGQEKIEVLKTIGDLRTNFETVIDGILNSKAKELGHGI STNFIERAKTMLVNNFTDYIAFYFMRLWEVGKRAGTRIQMRRGFSNINNLKDFDRSAKEFIESIKDKTLKEEAQEARKEF NSKVKDLTKGDNFFMDKADPKDNSLRFIGKNGKEYTINKDVRNEWMKTFNLKNIDDEYIPNIPKEAKIALKDREIKLTKG SLLKLIEKDRIKYIPHIKETLESPQAILKDKDDFIFIKNIDNQTYFTSIGKDYETHLTIISNSPKKQNNIKNKIKNAEAV YYNNARALPTSRASSETNQVSFSDKNSTQTKPKTNLMEDIKENIEAKEVEKKNKKSVKQRLDKKIQNDKKASEDILKRYD NFLKENKDNKLDFLDKMNLNTVEYNLTRQMIINAKESTNKGVKKDIPSALRGKIEQELNIQPLKEFGENYAEYYHDGKGA LQKLLIEKQGQVAGAFHRKDLGDIDLVWGDGNFGLSHIVNRREEDFIKQGLNKIEAKNKALNFIKEIENIINNGNVKKGN NRAFIDVKNSRVMVALDYKGKDKKWIITAYNFY
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 139097; Mature: 139097
Theoretical pI: Translated: 9.46; Mature: 9.46
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNIREFLLEKPQENNIISFLQDGASQSENQNTSEYLSNLKNEVINDFYKNKDKYAKEYEK CCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH YNFKDQNLTNHMGNISEYKRDLYDYNKNPSMNADDLSNYILDKQSKFNASKPIFTDDNEV CCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCHHH ARKSNQFMRDLGDELQKSGRGRLLQDDDGSYWVQDNNGNYSKVQGSAMGDLYRGLRDNGA HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCEEEECCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHCCCC SMALGTAGAIGGTMLGGGVGMVAGGALGASLGAGYDYYGNTKDTNQDANLKEALMLMGEN CEEECCCHHCCCHHHCCCHHHHHCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCC AGLSLIGDAAFAGVVKGARALKNTYNMAKTGAQAGKDMIDGMAVKGGNLKENIGDKLRKI CCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHC SPSILNDLASQGSETSKAYARELIESGNRNYDDILQKSRAMPLEVNQGNALVDGVASKIK CHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHH DFSNTAKNGFVKNTADNVTNSLNNISKNIGSKEAALNQQDLINLSFMNDDLANMARSVLA HHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHCEEEEECCHHHHHHHHHHHC NDPKMANKVANSLHLQDEAILKELNLNNASKADELYALRDARAKRAYDEFGKGLDKLDEL 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
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General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA