| Definition | Methanosarcina mazei Go1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003901 |
| Length | 4,096,345 |
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The map label for this gene is 21227744
Identifier: 21227744
GI number: 21227744
Start: 1957242
End: 1959467
Strand: Direct
Name: 21227744
Synonym: MM_1642
Alternate gene names: NA
Gene position: 1957242-1959467 (Clockwise)
Preceding gene: 21227743
Following gene: 21227745
Centisome position: 47.78
GC content: 29.47
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AAAACAATTTTGCACAGGGATCGTAATAAGCAGGCAAGAAAACTATTAAACTAATGACAAATGAAGGAGTTCGACAATGA TTTCATACATTCAAACAAAA
Product: transmembrane protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 741; Mature: 741
Protein sequence:
>741_residues MIIPDLFRLNDWSTRRFNLFIWSILVAYDFSFISNVPLYSIEILSKILGFVILTFIPGYIILRIFKVHDIDRVVTLLLAI GLSLSFIMIFGFTVNMFLPYIGVSKPISTFPLFYSLNISILVLMIIYYFRDKKFNSSQNQLRITFSPMLFYFILLPLFSI LGTESVNHYNFNMPVLILLFVISLSPILIALDRISRDLYPFMILSISLAILYNMNLISTHLWSYDIFYEAHTSKYVLENG IWNPGNKTMVPLLLFTILSPVYSLICDLNVIWVFKIIFPFFFSLTPLALYYVYKELDFGNYKIDSEIAMLSVFVFIFFYG FYKDMPDKQHIAELFLALILILSIFNTQKRILLFIFSFSLVVSHYGISYFFVFSLIFVSMMSRFRVNADTSFLTPTYTLL FSVLTFSWYIYISAGDVFEVITQVGYHFLSGIKDIFQANNDGRSASAYLSYLSNGILWVIYMLIHLILQFFIFIGVLNLL LSIMHNKTKSFEIALLTIIFYAFLFVQFFKTYGMGLDRILQITLILLSPLSIWGYSFCVKNLNSVYARIISKRIYRNKEN GNLNLIFESTLTRNEAINKNHITNLSKKARLCFSIFLMIFFVFNSGFIFWMTGYPLPGYCININPNSGWPVYSESEICGV DWLKSHENEHNRIAVFNQWDTIKSRDGLLVAENFYSKDLIPIQTNTTTLYNSYLFLGKYSVDKVEDGEEDVDLQDTLFYN STLKNSNKIYNSEKSHLYLAE
Sequences:
>Translated_741_residues MIIPDLFRLNDWSTRRFNLFIWSILVAYDFSFISNVPLYSIEILSKILGFVILTFIPGYIILRIFKVHDIDRVVTLLLAI GLSLSFIMIFGFTVNMFLPYIGVSKPISTFPLFYSLNISILVLMIIYYFRDKKFNSSQNQLRITFSPMLFYFILLPLFSI LGTESVNHYNFNMPVLILLFVISLSPILIALDRISRDLYPFMILSISLAILYNMNLISTHLWSYDIFYEAHTSKYVLENG IWNPGNKTMVPLLLFTILSPVYSLICDLNVIWVFKIIFPFFFSLTPLALYYVYKELDFGNYKIDSEIAMLSVFVFIFFYG FYKDMPDKQHIAELFLALILILSIFNTQKRILLFIFSFSLVVSHYGISYFFVFSLIFVSMMSRFRVNADTSFLTPTYTLL FSVLTFSWYIYISAGDVFEVITQVGYHFLSGIKDIFQANNDGRSASAYLSYLSNGILWVIYMLIHLILQFFIFIGVLNLL LSIMHNKTKSFEIALLTIIFYAFLFVQFFKTYGMGLDRILQITLILLSPLSIWGYSFCVKNLNSVYARIISKRIYRNKEN GNLNLIFESTLTRNEAINKNHITNLSKKARLCFSIFLMIFFVFNSGFIFWMTGYPLPGYCININPNSGWPVYSESEICGV DWLKSHENEHNRIAVFNQWDTIKSRDGLLVAENFYSKDLIPIQTNTTTLYNSYLFLGKYSVDKVEDGEEDVDLQDTLFYN STLKNSNKIYNSEKSHLYLAE >Mature_741_residues MIIPDLFRLNDWSTRRFNLFIWSILVAYDFSFISNVPLYSIEILSKILGFVILTFIPGYIILRIFKVHDIDRVVTLLLAI GLSLSFIMIFGFTVNMFLPYIGVSKPISTFPLFYSLNISILVLMIIYYFRDKKFNSSQNQLRITFSPMLFYFILLPLFSI LGTESVNHYNFNMPVLILLFVISLSPILIALDRISRDLYPFMILSISLAILYNMNLISTHLWSYDIFYEAHTSKYVLENG IWNPGNKTMVPLLLFTILSPVYSLICDLNVIWVFKIIFPFFFSLTPLALYYVYKELDFGNYKIDSEIAMLSVFVFIFFYG FYKDMPDKQHIAELFLALILILSIFNTQKRILLFIFSFSLVVSHYGISYFFVFSLIFVSMMSRFRVNADTSFLTPTYTLL FSVLTFSWYIYISAGDVFEVITQVGYHFLSGIKDIFQANNDGRSASAYLSYLSNGILWVIYMLIHLILQFFIFIGVLNLL LSIMHNKTKSFEIALLTIIFYAFLFVQFFKTYGMGLDRILQITLILLSPLSIWGYSFCVKNLNSVYARIISKRIYRNKEN GNLNLIFESTLTRNEAINKNHITNLSKKARLCFSIFLMIFFVFNSGFIFWMTGYPLPGYCININPNSGWPVYSESEICGV DWLKSHENEHNRIAVFNQWDTIKSRDGLLVAENFYSKDLIPIQTNTTTLYNSYLFLGKYSVDKVEDGEEDVDLQDTLFYN STLKNSNKIYNSEKSHLYLAE
Specific function: Unknown
COG id: COG4906
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 86338; Mature: 86338
Theoretical pI: Translated: 8.13; Mature: 8.13
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIIPDLFRLNDWSTRRFNLFIWSILVAYDFSFISNVPLYSIEILSKILGFVILTFIPGYI CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILRIFKVHDIDRVVTLLLAIGLSLSFIMIFGFTVNMFLPYIGVSKPISTFPLFYSLNISI HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCHHEEHHHHH LVLMIIYYFRDKKFNSSQNQLRITFSPMLFYFILLPLFSILGTESVNHYNFNMPVLILLF HHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHH VISLSPILIALDRISRDLYPFMILSISLAILYNMNLISTHLWSYDIFYEAHTSKYVLENG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHEEEEEEEECCCHHHHHCC IWNPGNKTMVPLLLFTILSPVYSLICDLNVIWVFKIIFPFFFSLTPLALYYVYKELDFGN CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC YKIDSEIAMLSVFVFIFFYGFYKDMPDKQHIAELFLALILILSIFNTQKRILLFIFSFSL EEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH VVSHYGISYFFVFSLIFVSMMSRFRVNADTSFLTPTYTLLFSVLTFSWYIYISAGDVFEV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCHHHHH ITQVGYHFLSGIKDIFQANNDGRSASAYLSYLSNGILWVIYMLIHLILQFFIFIGVLNLL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSIMHNKTKSFEIALLTIIFYAFLFVQFFKTYGMGLDRILQITLILLSPLSIWGYSFCVK HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NLNSVYARIISKRIYRNKENGNLNLIFESTLTRNEAINKNHITNLSKKARLCFSIFLMIF HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECHHCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH FVFNSGFIFWMTGYPLPGYCININPNSGWPVYSESEICGVDWLKSHENEHNRIAVFNQWD HHHCCCEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCEEEEEECCC TIKSRDGLLVAENFYSKDLIPIQTNTTTLYNSYLFLGKYSVDKVEDGEEDVDLQDTLFYN CCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEECCCEEHHHCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHEEC STLKNSNKIYNSEKSHLYLAE CCCCCCCCCCCCCCCEEEEEC >Mature Secondary Structure MIIPDLFRLNDWSTRRFNLFIWSILVAYDFSFISNVPLYSIEILSKILGFVILTFIPGYI CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILRIFKVHDIDRVVTLLLAIGLSLSFIMIFGFTVNMFLPYIGVSKPISTFPLFYSLNISI HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCHHEEHHHHH LVLMIIYYFRDKKFNSSQNQLRITFSPMLFYFILLPLFSILGTESVNHYNFNMPVLILLF HHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHH VISLSPILIALDRISRDLYPFMILSISLAILYNMNLISTHLWSYDIFYEAHTSKYVLENG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHEEEEEEEECCCHHHHHCC IWNPGNKTMVPLLLFTILSPVYSLICDLNVIWVFKIIFPFFFSLTPLALYYVYKELDFGN CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC YKIDSEIAMLSVFVFIFFYGFYKDMPDKQHIAELFLALILILSIFNTQKRILLFIFSFSL EEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH VVSHYGISYFFVFSLIFVSMMSRFRVNADTSFLTPTYTLLFSVLTFSWYIYISAGDVFEV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCHHHHH ITQVGYHFLSGIKDIFQANNDGRSASAYLSYLSNGILWVIYMLIHLILQFFIFIGVLNLL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSIMHNKTKSFEIALLTIIFYAFLFVQFFKTYGMGLDRILQITLILLSPLSIWGYSFCVK HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NLNSVYARIISKRIYRNKENGNLNLIFESTLTRNEAINKNHITNLSKKARLCFSIFLMIF HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECHHCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH FVFNSGFIFWMTGYPLPGYCININPNSGWPVYSESEICGVDWLKSHENEHNRIAVFNQWD HHHCCCEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCEEEEEECCC TIKSRDGLLVAENFYSKDLIPIQTNTTTLYNSYLFLGKYSVDKVEDGEEDVDLQDTLFYN CCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEECCCEEHHHCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHEEC STLKNSNKIYNSEKSHLYLAE CCCCCCCCCCCCCCCEEEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA