| Definition | Thermoanaerobacter tengcongensis MB4, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003869 |
| Length | 2,689,445 |
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The map label for this gene is ndvB [H]
Identifier: 20808536
GI number: 20808536
Start: 2061462
End: 2070050
Strand: Reverse
Name: ndvB [H]
Synonym: TTE2146
Alternate gene names: 20808536
Gene position: 2070050-2061462 (Counterclockwise)
Preceding gene: 20808537
Following gene: 20808535
Centisome position: 76.97
GC content: 38.23
Gene sequence:
>8589_bases TTGTGGTATGCGGTATTTGTTTTGATACTACTTCTGGCAGGGATTTACTTAAAAAGTAAAAAGATTGAAGTAGATGATTC AATGAGAGAGTTTGACGATATAATCTTAAGTTCAGAAGAAATGGAAAAGCACGCTGAGGAATTAGCTCAGAATCACGTAA TAGCAAATAGAAACAGAGCTTCCTTTCTTTTAATTCCTAGAATGAATAAAAATTATGAGTACATAAAAAGTGTGTACAGG AGTTTGAACAATCTTTTAAAAGAGAAAGATACATATATTTCTCAAGAAGAAGAATGGCTTTTGGACAATTTCTATATAAT TGAAGAACAGGTGAAAGAGATAAGGAAAAGCCTCAGCAAAAAATACTATGCCGGGCTCCCAGTTCTCAAAAACGGGGCTT TTAGAGGATATCCTAGAGTGTATGCTTTGGCTTTTGAGCTTGTTTTGCACACAGATGGAAAGATTGAGGAAAAGGGAATT ATCAATTTCATAAAGGCATATCAGAAAAAGGCTTTGCTCACTACTTCTGAGTTGTGGGCTTTAAGCCTTATGATACGTAT TGCTTTGATTGAAAAGATAAAAAAAGTGTGCGAGGAAATTGTTGAATCAAGACTTCAAAGGGAAAAGGCAGAAAAAATGT TATCAGCATTGATGGAAAAAGAGATGTCTTATGAAGAGGTAAAGAAGCTAATAAAGAGCAATATAAAAGTTGTGGACAGA TTTCCTCTTCAGTTTGTAGAATATCTTGTGAGCAGGATAAAGAGAGAAGGAAGCAATTCTTCAGACATTCTAAAAACCTT AGAGAAAATTCTCATGGAATATGATTCTAGCATAAACGATATTGCTGAAAAGGCGCACTATTTCCAGGCAAAAAGGCAGG TATCAATAGGTAATGCTATTGTAAGTTTAAAAACAGTCTCCTCATTGGACTGGGCTGAGATTTTTGAGACATTAAGCCCT 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GATAAGGAAGAAAGGATTTTGTATATAAGAAATGTGTACAATGAAGATTTTGTTAATAGAATAGCATTTCTAGCCACATC AGAGGGGATAAACTCTTATGAAAGCGAAAGAGGGGAGTTTATAGGGGTAGGTTTTGACTTAAGTAGCCCTCAAGCTCTTT CCTATGAAACTCTTTCTAATTCAGAAGGACTGGCGGTTGATCCTTGCAGTGCAATTGAGTTTTCTGTAGAAATAGGACCT GGTGAAGAGAAAGAGATATCAATCCTGTTAGGACATGCTAAAGAGAAGAAAGAGGCAAAAGATTTGGTTTTGAAATATTT AAAAGTAGAAAACTGTAAAAAAGAACTAGAAAAGGTAAAGGGATTTTGGGGGGAAATTTTGGGTAAACTCACGGTAAATA CGCCTGATAAATCTCTTGATTTGCTTGTAAATGGGTGGTTACCCTATCAGACGATAGCCTGTAGATTGTGGGCGCGCTCA GCATTTTATCAGTCAGGGGGTGCATATGGATTTAGGGACCAATTGCAGGATGCCATGAATATGGTACTTTTGAATCCAGA GTTTACAAAAAGGCAAATAATAAATGCTTGTGAGCATCAATTTATAGAAGGAGATGTGCAGCATTGGTGGCATCCTGTTT TAAACAAGGGAATAAGAACGAAATTTTCAGATGACCTTCTATGGCTTCCTTATGTAGTAGCTGACTATTTAGAGAAGACA GAAGATTGGGCAATATTAGAAGAAAAAGCGGGATATTTAGAAGACCTTCCTCTCAAGGAAGAGGAAGAGGAGAGATATTC TGTTCCCTCTATCTCTTCACATAAAGGAACAGTGTACGAGCACTGTGTCAAAGCCATAGATTATGCTTTGAAATTTGGGG AACACGGTCTTCCTCTAATTGGAACAGGTGACTGGAACGATGGAATGAACAAGGTGGGGCATAGAGGGAAGGGTGAGAGT 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Upstream 100 bases:
>100_bases GCCCTACTAAAGGGGCTTTTATTTTTTGCTTTAAAAAGTTAATTTTGGGGGAATAATATTTTTAGCATAAAAACTGCGAT GTAGGAGGAGTTGACGGGCC
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAAAGAGGCATTTTGTGTCTTCTTTTTGTCAGCACAAAATGCCTCTTTAATGACTTTTCGGTCTTAACTAAGTCTTAAC AGTTTGTACACAGATTTTTA
Product: cyclic beta 1-2 glucan synthetase
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 2862; Mature: 2862
Protein sequence:
>2862_residues MWYAVFVLILLLAGIYLKSKKIEVDDSMREFDDIILSSEEMEKHAEELAQNHVIANRNRASFLLIPRMNKNYEYIKSVYR SLNNLLKEKDTYISQEEEWLLDNFYIIEEQVKEIRKSLSKKYYAGLPVLKNGAFRGYPRVYALAFELVLHTDGKIEEKGI INFIKAYQKKALLTTSELWALSLMIRIALIEKIKKVCEEIVESRLQREKAEKMLSALMEKEMSYEEVKKLIKSNIKVVDR FPLQFVEYLVSRIKREGSNSSDILKTLEKILMEYDSSINDIAEKAHYFQAKRQVSIGNAIVSLKTVSSLDWAEIFETLSP VEQVLKQDPDGTYPKMDFESKDYYRHEIEKLARYYNVSETYVAKKAVECAREVADQGENLGYINHVGFYLIGKGRSILES KLNNKKRRFFDFYRIRQKNPATVYFGLIILFFALGEIISLGYLRHFTGSFWNLFASSLVLAIPLSEISIQMTNWVLMHIF KPVMLPKIELKDGIPDDAKTFVVISSLLPDEKKAKELVENLEVYYHANRERNLYFGILGDFKDAPLEVMPEDEKIVKATL EEIEKLNEKYAENGEKVFYYFHRKRIYNEMQKSWMGWERKRGALMEFVDLLRGEKDTTFYIVSDDVSKLGIKYVITLDAD TNLPIDTAKKLVGAMLHPLNRAIIDRDEGIVVEGYGLLQPRIGVDIESANASLFSKIYGGEGGIDPYTTATSDIYQDLFG EGIYTGKGIFDVDVFRELLKDTIPDNSILSHDLLEGSFVRTGLVTDIELIDGFPAKYNSYMMRLHRWVRGDWQLLPYLRS KIRNRRGELIRNPLSLITKWKIMDNLRRSLISISLIVMLFLGFSALPASALFWVAVAALTVFFPVMPALFDLIFRGQLRQ YLEKRHRAVITGVEVAFYQALLNFIFLPYNAYIMADAIIRTISRMYITKRNLLEWVTAADMEKRLKNDFISFVKRMWVVL LKGVVLILLTAYFKPGALIFAVGVFFLWAFSPYVAFYISQPVLLKIKFILDEDIEEVRLIARKTWKFFEDTVTEAQNYLP PDNFQEDPPNGIAERTSPTNIGLYLVSTVGARDLGYITTSEMVDRIENTINTIKKMEKWNGHLFNWYDTRTLKPLRPYYV STVDSGNLVGYLITVKEALEEFLDKPVIDLEFLRGLKDTVRMLKIERIDKSLFEEFLKKGDIDPLAWKKILDDLEEVEEE RLRDIVKKFKNEIREFMPWLEFEDAEGGYGEIFNECNSFEELKKVYEKYLEETFRAKKEGLPEFKIKQIQRAVEKIEELK ERILKLKQEIEDIIEKTEFKHLYDEKRQLFSIGYNVEEEKLTKSYYDLLASEARQASFIAIAKREVDKKHWFKLGRMLTR ANRSKGLVSWSGTMFEYFMPLLIMKNYENTLLDETYSFAAKVQKEYGVKLGIPWGISESGFYAFDMSLNYQYKAFGVPIL GLKRGLSHDKVVAPYGSILAISVDPEGVMKNIEFLKKEGAEGEYGLYEAIDYTPERVPFGKKNAIVKSFMAHHQGMIFVA IDNFIHENIMQKRFHRDPRVKATQILLQEKAPIYLDMTREEREEPRKIQKIRKEDLDFVRVLGESRSWIPEVHIVSSGKY FVMLTEKGTGYSKNIKGIFLNRWRKDIAQDYGTFIFIRNVDSNEVWSATFAPFYQKGQHYRVVFSADKAEYFKRVGGIDS YLEITVSPEDDVEIRRLTLKNHSKYPQILEITSFSEISLMDLPSDVAHPAFNKLFVKTEFLKDEDAIIVCRRPRDPEKSR LWALHKVVVLSGEAMGDTQFETDRLKFIGRGRSVRKPLALEPDQPLSNTEGAVLDPIVSLRKRIRIMPGGVAKIAYISAI TETKEEAVKIVSKYKEENAIERAFEMSWTRSRVELEYINLKPRELGLFQRMLPYLIFASPQRKMREEMILKNTKGQSGLW AHGISGDLPIVLLEVEKMEEIELVKWFLKAYEYWRMKGINIDLVIVNKDKSGYLQPLNDKIKEVINTTFAYDVFGKYGGV YLLQENNLKEDDFYLLNAVAALKFDGKNESIYDQIMVKVHKKALKPRSFQEKVSSCRDDGLEEIELQYYNGFGGFTPDGK EYVIKWEGKSSPAPWINIISNPNFGFQVSEVGAGYTWAENSREYKLTPWYNDPVLDPHGEVIYLIDEITGEKWTITPHPA GNSGIYYIRHGFGYSTFESASCELKSRLTMFVPKEDSVKINLIKLKNTSKNSRKIQIVYYIRPVLGVTDEATSQYIASEF DKEERILYIRNVYNEDFVNRIAFLATSEGINSYESERGEFIGVGFDLSSPQALSYETLSNSEGLAVDPCSAIEFSVEIGP GEEKEISILLGHAKEKKEAKDLVLKYLKVENCKKELEKVKGFWGEILGKLTVNTPDKSLDLLVNGWLPYQTIACRLWARS AFYQSGGAYGFRDQLQDAMNMVLLNPEFTKRQIINACEHQFIEGDVQHWWHPVLNKGIRTKFSDDLLWLPYVVADYLEKT EDWAILEEKAGYLEDLPLKEEEEERYSVPSISSHKGTVYEHCVKAIDYALKFGEHGLPLIGTGDWNDGMNKVGHRGKGES VWLGWFLYTVLKKFASISEKMGDIERKEKYIKEAERLLKSIEENAWDGSWYKRAYFDDGTPLGSINNLECKIDSISQSWA LISKGGRIERAKEAMKAVVNYLVNEEEGIIKLLTPPFDSGDLNPGYIKGYVPGVRENGGQYTHAAAWVILAFTELGDGDT AWKLYNMINPINHTRTPIECMKYKVEPYVMAADVYAVDPHAGRGGWTWYTGAAGWMYRVAVEHILGLKKYGDKFTVDPCV PRNWESFVIEYAHGHSKYVIKVINPDRVNKGVREIYLDGEPVDKFVPLKDENKVFRVLVVMG
Sequences:
>Translated_2862_residues MWYAVFVLILLLAGIYLKSKKIEVDDSMREFDDIILSSEEMEKHAEELAQNHVIANRNRASFLLIPRMNKNYEYIKSVYR SLNNLLKEKDTYISQEEEWLLDNFYIIEEQVKEIRKSLSKKYYAGLPVLKNGAFRGYPRVYALAFELVLHTDGKIEEKGI INFIKAYQKKALLTTSELWALSLMIRIALIEKIKKVCEEIVESRLQREKAEKMLSALMEKEMSYEEVKKLIKSNIKVVDR FPLQFVEYLVSRIKREGSNSSDILKTLEKILMEYDSSINDIAEKAHYFQAKRQVSIGNAIVSLKTVSSLDWAEIFETLSP VEQVLKQDPDGTYPKMDFESKDYYRHEIEKLARYYNVSETYVAKKAVECAREVADQGENLGYINHVGFYLIGKGRSILES KLNNKKRRFFDFYRIRQKNPATVYFGLIILFFALGEIISLGYLRHFTGSFWNLFASSLVLAIPLSEISIQMTNWVLMHIF KPVMLPKIELKDGIPDDAKTFVVISSLLPDEKKAKELVENLEVYYHANRERNLYFGILGDFKDAPLEVMPEDEKIVKATL EEIEKLNEKYAENGEKVFYYFHRKRIYNEMQKSWMGWERKRGALMEFVDLLRGEKDTTFYIVSDDVSKLGIKYVITLDAD TNLPIDTAKKLVGAMLHPLNRAIIDRDEGIVVEGYGLLQPRIGVDIESANASLFSKIYGGEGGIDPYTTATSDIYQDLFG EGIYTGKGIFDVDVFRELLKDTIPDNSILSHDLLEGSFVRTGLVTDIELIDGFPAKYNSYMMRLHRWVRGDWQLLPYLRS KIRNRRGELIRNPLSLITKWKIMDNLRRSLISISLIVMLFLGFSALPASALFWVAVAALTVFFPVMPALFDLIFRGQLRQ YLEKRHRAVITGVEVAFYQALLNFIFLPYNAYIMADAIIRTISRMYITKRNLLEWVTAADMEKRLKNDFISFVKRMWVVL 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Specific function: Involved in the production of beta-(1,2)-glucan. It is involved not only in invasion but also in bacteroid development [H]
COG id: COG3459
COG function: function code G; Cellobiose phosphorylase
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To A.tumefaciens ChvB [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR008928 - InterPro: IPR009342 - InterPro: IPR019282 - InterPro: IPR021478 - InterPro: IPR011013 - InterPro: IPR010383 - InterPro: IPR010403 [H]
Pfam domain/function: PF06204 CBM_X; PF10091 DUF2329; PF11329 DUF3131; PF06165 Glyco_transf_36; PF06205 GT36_AF [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 330547; Mature: 330547
Theoretical pI: Translated: 6.54; Mature: 6.54
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MWYAVFVLILLLAGIYLKSKKIEVDDSMREFDDIILSSEEMEKHAEELAQNHVIANRNRA CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCC SFLLIPRMNKNYEYIKSVYRSLNNLLKEKDTYISQEEEWLLDNFYIIEEQVKEIRKSLSK EEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYYAGLPVLKNGAFRGYPRVYALAFELVLHTDGKIEEKGIINFIKAYQKKALLTTSELWA HHHCCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSLMIRIALIEKIKKVCEEIVESRLQREKAEKMLSALMEKEMSYEEVKKLIKSNIKVVDR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCEEHH FPLQFVEYLVSRIKREGSNSSDILKTLEKILMEYDSSINDIAEKAHYFQAKRQVSIGNAI CHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHE VSLKTVSSLDWAEIFETLSPVEQVLKQDPDGTYPKMDFESKDYYRHEIEKLARYYNVSET EEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHH YVAKKAVECAREVADQGENLGYINHVGFYLIGKGRSILESKLNNKKRRFFDFYRIRQKNP HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCEEEEECCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCC ATVYFGLIILFFALGEIISLGYLRHFTGSFWNLFASSLVLAIPLSEISIQMTNWVLMHIF 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HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCEEEEECCCHH GLKRGLSHDKVVAPYGSILAISVDPEGVMKNIEFLKKEGAEGEYGLYEAIDYTPERVPFG HHHCCCCCCCEECCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCC KKNAIVKSFMAHHQGMIFVAIDNFIHENIMQKRFHRDPRVKATQILLQEKAPIYLDMTRE CHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEECHH EREEPRKIQKIRKEDLDFVRVLGESRSWIPEVHIVSSGKYFVMLTEKGTGYSKNIKGIFL HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHH NRWRKDIAQDYGTFIFIRNVDSNEVWSATFAPFYQKGQHYRVVFSADKAEYFKRVGGIDS HHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHHHHHHCCCCC YLEITVSPEDDVEIRRLTLKNHSKYPQILEITSFSEISLMDLPSDVAHPAFNKLFVKTEF EEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCHHCCHHHHHHHEEEHH LKDEDAIIVCRRPRDPEKSRLWALHKVVVLSGEAMGDTQFETDRLKFIGRGRSVRKPLAL CCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCC EPDQPLSNTEGAVLDPIVSLRKRIRIMPGGVAKIAYISAITETKEEAVKIVSKYKEENAI CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ERAFEMSWTRSRVELEYINLKPRELGLFQRMLPYLIFASPQRKMREEMILKNTKGQSGLW 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References: 2154461; 11481430 [H]