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The map label for this gene is norM [H]

Identifier: 18309846

GI number: 18309846

Start: 1059103

End: 1060527

Strand: Direct

Name: norM [H]

Synonym: CPE0864

Alternate gene names: 18309846

Gene position: 1059103-1060527 (Clockwise)

Preceding gene: 18309845

Following gene: 18309847

Centisome position: 34.94

GC content: 29.82

Gene sequence:

>1425_bases
ATGTACATTGACTTTTATAAGAATATATTTTTAGTAAGGGGGCTAATTATGATTATAACTAGAGACAAAAGATTTTATAG
GTTACTTTTTAGTATTGCTTTGCCAATAGCAGTACAAAATTTAATAACCTTTATGGTAAGTATGGTAGATACTTTGATGG
TTGGAGATTTGGGGGAAATTCAACTATCAGCAGTTTCTATAGCTAATAATTTATTTTTTGTACTTACAATTTTAATGTTT
GGACTAGCTGGGGGATCTAATATTATGATTTCTCAGTATTGGGGAAAGGGAAATGTTAAAACAATTCATAAGATTTTGGC
CATAATGTATAGGGTATGTTTATTAATAACTGGTATTTTCATATTTATAGCATTATTTTTACCAAAATACTTTATGGGAA
TTTTCACAACTGATAAGGCTGTTATAGATTTTGGAGCAAGTTATTTAAGAATTGTGTGCATAGGATATTTGTTCTATTCC
ATAACAAACTGTACAATAATGATGCTTCGTTCAGTAAAAACTGTTAGTATATCAATTATAGTTTATACTGCTTCTTTAGT
GGTAAATTCAATATTAAACTGGATTTTTATATTTGGAAATTTAGGTGCGCCTGAACTTGGCATAAGAGGAGCTGCCATAG
CTACTGTCTGTGCTAGAATTACTGAGTTTTCAATAGTTTTAGTGTTTATGTTTATATATGAAAGAAAGATTGGTCTTAAG
ATAGAACATTTATTAAAGCTAGATAAAGAGATTTTAAAAGACTATGTTGGATTATGTACTCCTGTTTTATGTAATGAATT
ACTTTGGGCAATTGGAGCTTCTATGATATCTGTAATAGTCGGTAGAATGGGAACAGAGGTTGTAGCTGCTAATAGTATAA
ATGGAGTTGCACATCAATTTGTAACAGTTTTTATATTTGGTATGTCTAATGCTACAGCAGTAATTATAGGAAATACCATA
GGAGAAGGTAAAAAAGAAAAAGCAAAGGAATATGCCTATAGTATAGGGATTTTCAGTGTTGTCATGGGATGTATATCAGG
ACTTATGATTTTACTTATAAAGCCATTTGTTGTTAATTTCTATAATGTATCTTATTCAACAAAATTAATAGCTATGGAAA
TAATGACTGTAACTTCAGGAATAATAGTATTTCAATCTCTTGCAAGTAATTTTATGATGGGTGTACTTAGAGGTGGTGGA
GATGCTAAGTTTGTCTTGATAAATGATCTTATTTTTATGTGGCTTGTTGCTATTCCAGGTGGATTTTTTGTAGCCTTTGT
TTTAGAACTTCCAGTTGCCTTAGTATTCTTAGTTATAAAATGTGATGAAATATTAAAATCTCTTACCAGTGTATATAGGG
TAATTAGTGGAAAATGGGTAAATGATGTAACTAAGGATTATGAATTTGAGGAAGTAAAGTGTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAAGAATTAATTTAAAAATAAAAATATTAATAAAATTGCTTTAATATTCATATATTGTTAAATTTAAACACATATTATA
AGTTAGTACAGAGTGCTATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGTTTTTAGGAAATAGTCAACAGTTTTGGAAAGTTGTTTTAAGGATATATGAGTTATTAAAGTTAAATACTAATTAAGA
AATTAATTTGAAAGGAGTGT

Product: MATE efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: Multidrug-efflux transporter [H]

Number of amino acids: Translated: 474; Mature: 474

Protein sequence:

>474_residues
MYIDFYKNIFLVRGLIMIITRDKRFYRLLFSIALPIAVQNLITFMVSMVDTLMVGDLGEIQLSAVSIANNLFFVLTILMF
GLAGGSNIMISQYWGKGNVKTIHKILAIMYRVCLLITGIFIFIALFLPKYFMGIFTTDKAVIDFGASYLRIVCIGYLFYS
ITNCTIMMLRSVKTVSISIIVYTASLVVNSILNWIFIFGNLGAPELGIRGAAIATVCARITEFSIVLVFMFIYERKIGLK
IEHLLKLDKEILKDYVGLCTPVLCNELLWAIGASMISVIVGRMGTEVVAANSINGVAHQFVTVFIFGMSNATAVIIGNTI
GEGKKEKAKEYAYSIGIFSVVMGCISGLMILLIKPFVVNFYNVSYSTKLIAMEIMTVTSGIIVFQSLASNFMMGVLRGGG
DAKFVLINDLIFMWLVAIPGGFFVAFVLELPVALVFLVIKCDEILKSLTSVYRVISGKWVNDVTKDYEFEEVKC

Sequences:

>Translated_474_residues
MYIDFYKNIFLVRGLIMIITRDKRFYRLLFSIALPIAVQNLITFMVSMVDTLMVGDLGEIQLSAVSIANNLFFVLTILMF
GLAGGSNIMISQYWGKGNVKTIHKILAIMYRVCLLITGIFIFIALFLPKYFMGIFTTDKAVIDFGASYLRIVCIGYLFYS
ITNCTIMMLRSVKTVSISIIVYTASLVVNSILNWIFIFGNLGAPELGIRGAAIATVCARITEFSIVLVFMFIYERKIGLK
IEHLLKLDKEILKDYVGLCTPVLCNELLWAIGASMISVIVGRMGTEVVAANSINGVAHQFVTVFIFGMSNATAVIIGNTI
GEGKKEKAKEYAYSIGIFSVVMGCISGLMILLIKPFVVNFYNVSYSTKLIAMEIMTVTSGIIVFQSLASNFMMGVLRGGG
DAKFVLINDLIFMWLVAIPGGFFVAFVLELPVALVFLVIKCDEILKSLTSVYRVISGKWVNDVTKDYEFEEVKC
>Mature_474_residues
MYIDFYKNIFLVRGLIMIITRDKRFYRLLFSIALPIAVQNLITFMVSMVDTLMVGDLGEIQLSAVSIANNLFFVLTILMF
GLAGGSNIMISQYWGKGNVKTIHKILAIMYRVCLLITGIFIFIALFLPKYFMGIFTTDKAVIDFGASYLRIVCIGYLFYS
ITNCTIMMLRSVKTVSISIIVYTASLVVNSILNWIFIFGNLGAPELGIRGAAIATVCARITEFSIVLVFMFIYERKIGLK
IEHLLKLDKEILKDYVGLCTPVLCNELLWAIGASMISVIVGRMGTEVVAANSINGVAHQFVTVFIFGMSNATAVIIGNTI
GEGKKEKAKEYAYSIGIFSVVMGCISGLMILLIKPFVVNFYNVSYSTKLIAMEIMTVTSGIIVFQSLASNFMMGVLRGGG
DAKFVLINDLIFMWLVAIPGGFFVAFVLELPVALVFLVIKCDEILKSLTSVYRVISGKWVNDVTKDYEFEEVKC

Specific function: Multidrug efflux pump [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI22907060, Length=426, Percent_Identity=25.3521126760563, Blast_Score=72, Evalue=8e-13,
Organism=Homo sapiens, GI153792564, Length=416, Percent_Identity=24.5192307692308, Blast_Score=66, Evalue=8e-11,
Organism=Escherichia coli, GI48994890, Length=418, Percent_Identity=22.9665071770335, Blast_Score=80, Evalue=2e-16,
Organism=Escherichia coli, GI226510954, Length=468, Percent_Identity=20.2991452991453, Blast_Score=80, Evalue=2e-16,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52632; Mature: 52632

Theoretical pI: Translated: 8.84; Mature: 8.84

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.9 %Cys     (Translated Protein)
4.6 %Met     (Translated Protein)
6.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.9 %Cys     (Mature Protein)
4.6 %Met     (Mature Protein)
6.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYIDFYKNIFLVRGLIMIITRDKRFYRLLFSIALPIAVQNLITFMVSMVDTLMVGDLGEI
CEEHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
QLSAVSIANNLFFVLTILMFGLAGGSNIMISQYWGKGNVKTIHKILAIMYRVCLLITGIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFIALFLPKYFMGIFTTDKAVIDFGASYLRIVCIGYLFYSITNCTIMMLRSVKTVSISII
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHH
VYTASLVVNSILNWIFIFGNLGAPELGIRGAAIATVCARITEFSIVLVFMFIYERKIGLK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
IEHLLKLDKEILKDYVGLCTPVLCNELLWAIGASMISVIVGRMGTEVVAANSINGVAHQF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCHHHHHHH
VTVFIFGMSNATAVIIGNTIGEGKKEKAKEYAYSIGIFSVVMGCISGLMILLIKPFVVNF
HHHHHEECCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YNVSYSTKLIAMEIMTVTSGIIVFQSLASNFMMGVLRGGGDAKFVLINDLIFMWLVAIPG
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCC
GFFVAFVLELPVALVFLVIKCDEILKSLTSVYRVISGKWVNDVTKDYEFEEVKC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MYIDFYKNIFLVRGLIMIITRDKRFYRLLFSIALPIAVQNLITFMVSMVDTLMVGDLGEI
CEEHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
QLSAVSIANNLFFVLTILMFGLAGGSNIMISQYWGKGNVKTIHKILAIMYRVCLLITGIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFIALFLPKYFMGIFTTDKAVIDFGASYLRIVCIGYLFYSITNCTIMMLRSVKTVSISII
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHH
VYTASLVVNSILNWIFIFGNLGAPELGIRGAAIATVCARITEFSIVLVFMFIYERKIGLK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
IEHLLKLDKEILKDYVGLCTPVLCNELLWAIGASMISVIVGRMGTEVVAANSINGVAHQF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCHHHHHHH
VTVFIFGMSNATAVIIGNTIGEGKKEKAKEYAYSIGIFSVVMGCISGLMILLIKPFVVNF
HHHHHEECCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YNVSYSTKLIAMEIMTVTSGIIVFQSLASNFMMGVLRGGGDAKFVLINDLIFMWLVAIPG
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCC
GFFVAFVLELPVALVFLVIKCDEILKSLTSVYRVISGKWVNDVTKDYEFEEVKC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10360571 [H]