| Definition | Nostoc sp. PCC 7120, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003272 |
| Length | 6,413,771 |
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The map label for this gene is 17230997
Identifier: 17230997
GI number: 17230997
Start: 4222175
End: 4226074
Strand: Direct
Name: 17230997
Synonym: alr3505
Alternate gene names: NA
Gene position: 4222175-4226074 (Clockwise)
Preceding gene: 17230996
Following gene: 17230998
Centisome position: 65.83
GC content: 44.46
Gene sequence:
>3900_bases ATGTCATCGCCCTCTGATCACCCGTTGAGAATTGAACTTAGGCTCCCGTCTTCTCACCCTGAACTACTGGAAGGGTTAGA TATATGGTTGCGTTTGGGTTTGATATCAGACACTCAAGTTAAGCAAATATGTCGAGATTACCTTGTTTGTCGAATAGAGT TACAATCCCAATCTGTCCCGGAACCACAAAGGGTAGTTGCAACTATTAGAACACCAGAAAGGCCATTAGTTGCTCAGTTA CAAGAAAAACCCAGAAAACAACCAAAAGAACCGACACAACCCAACATCGCCAGCAGGATGTTGCAGTCGCTAGGAGAGGA ATTAAGTGTTCGTTGGTTATTGTTTCTGGGTGTATTCTTAGTTGTAATTTCCTCAGGGGTATTGGCGGCTAGCCAATGGG AGAGATTCCCAGCATCTGGACAGTACGGGGTTTTATTGGCTTATACTTTGAGTTTTTGGGGGTTTAGCTTTTGGGCTGGT AGACAAAATAACCTAAGATTAACAGCGCAGACATTATTGATTGTCACGCTGTTATTAGTACCAGTTAACTTTTGGGCAAT GGACAGTTTCGGGTTGTGGCACAATCCTTTAGATTGGGTAACAGTAGCGATCGCCACCCCAATATTAACGGTAGTAACAG TATTGCTGTGGAGAAATCGCACAGTTATCAGCAATTTCCCCAGAGGAAAACTACCGCTAATAAATCTTCTAGGGTTGAGT TATCTGCATTGGGGGTGGAAATTACCAGGATCTCCCTTAATTGCTGTTTATGTGGCGATGATTAGCACAACCATCATCAC AATTTATCACAGTCGCCGCCAACCCATTCCCTTGGTTGATGAAGGTGAACAACCCCATAAACCAATCATCAACATATATG CGGCTGTCATTGTCTACGCTTTATTACTCCTGCTATCGCGGGCAATTTTCGTTGCTGGGGTTGAGATTACCCAATTAGGT TTAGCCATTGGTATTTGTGGTTGGTTAACAACTTGGATAGCACAGCAAGAAAGACAAAAACAAACATCCCCCACATCTCC TACATCTCCTACATCCCCCCTCCCCTGGGAAAAACTCGGAGGTATTCTCCTGTTCATCGGTTGGCTAGTAGCAGTAATAG AACAGCCAGCCCAAGCGATCGCCGTTAGTGGCTTGATTTTGTGGGTGGGAGGAGTGCGCCTATACAGATACAGCTGGCAA GGTGATTTAGCCTTGATATTTGTCGTCGGCTTACAGACGATTTGGTTAGGTTGGCGGTTAGTTCCCTCTGGATTTAAGCA ATTAGCGATCGCCTTTGGCACCCAACTCACCCAAGCCCAAAATGAACCTTGGGCGTTAATCAGTATTGCTTTATTTCCTT ATATAGTTTTCATGGTGGTGCTGACAGAAACCCTGCATCATTACCGCAAGCGTGAAGTTGCCCAGTTTGGCGAATTTTTA ACACTGCTACTGGGTACTTGTTTAACAACGATCGCCACCGTTAATCCTACCTTGCGATCGCTCAATTTGTTGTTTTCCAC CATCACCTTAGTAGTCATCAGCAAACGTCGTTCTTCTGTACCTGTTCCTTTGGTATATCTAACTCACGTTGGTGGATTAT TAACACTTTGTTCAATTATTGATAGACTTTTACCGAACCTAGATTTACATACTTGGGCAAGCATTTTCCTCGTGTTGATG TTGGCAGAGTGGGTGTATAGTCTGGGTACTGGATTATGGCAACGTAGTGGCTGGTATATCGGTCTAGGATTAGCTGTTGT TAGTTTTTGGTTATTGTGGAATAATGCACAGCCTATCTGGGCGGGTGGCGTTGAAAGCCAAGCCCATTGGAATGTGATTT GGTTAGTCACACCCATAGCCCTGACAGCTTTAGCCAGTCGCACAACAGACCATTACCGTACCACCAACAGTCTTTTAAGC ATCCTCACAGTGGGTATGGCACAGCTCTTAACCTTACCCTTACCCGGAACCAGATTGATTAGTTTGGCGGTGAGTACAGG TGTGATGTATGCCAATAGCCGTTACTTACCCAGTTTACAAGTTGCAGGGGTTACCATTGGTTTTGGTTTAAGCTTCGTTG GGGCGTTGCTGTGGGAAGGTTTACCACGCCTCACAGTTGCAGGATGGTGTGTTGTGGGTGCGATCGCTACCTTAGGTTTA TGGTTAGGACGCACAGTATTACTACGCCGTCACCAAGAATTAGCCAGTATATATGCAGATGCGGCAGATAAATGGGCGAT CGCTTTATGTGGCTTAGAACTATTAAATCTCACCCGTCATTCCCTAGTTGTTTATCAGGGGTTTGAAGCTCCTGGGGTTT TATACTTAATTGCTACAACTATCACCTTAGGGGCAATTACTTATCGTCATTGGCGACAACCCACAGACTGGGCATTTTAT GGAATTGCTTGGTGTGTAGAGTTATTGATTGCTGAGGTTTTGGGATTTGGTGGACGTTCAATTATTCACGTAGCCATTGC CAATATCGCCTTGGGTTTATTCACCCAATTGTTAGGAGAGTGGTGGCGACGACGTTACCAATTAACTAAACTACCCAATA GTTTCCACATCCTGCCTGTATTTTATGGTTTATTTAGTGTACTACTGCGGTTTAACACCTTTACCGATTGGTCGGGGTTG TGTTCCTTAGGTGTAGCCTTAATTTTCATTGGTGTAGGAAGACGTAGCCAAGACTTCAAACCCCTGCTTTACTTAGGGAT TATTGGTGTATCCGTCTCAGCTTATGAGATGTTGTTCTATCAAATGTCACAAGCCTCTGGCGGTGGTTTAGGTGACGGCT TAATTGCGATGGCTGCTTTGGGTACAACTATTATGTCTGCCTACCGCATCCTTACTCCTTGGGTGACAAATTACCTACGT CTTAGCACCCAAGAACTGAAACTCATTGCTCATCTACACTGGGCTTGGAGTAGCGCCTTACTCATGACAGCAATTACCTT ACCCATCCAAGTTAATCGCCTTGTGGGGTTGGGGACGGGAGTATTTTTAATTACCTACGCCATCCTACAAGGTAGAACAA AACCAGATGAATCCGTTTCCCGTGTTTTTGATCGCATCACCACCGCAGACTTATGGGTTTATCTCGGCTTTGTATTAATA GCTGGCATGAGAGTATATTGGCGGGAAACTGCCGTAGGACAACTAATCACAGGGGTTTTAGTTCCTTGGAATGGTGCGAT CGCCTGCGTATTTGCTTATTTCTTATATATCTTACCGTGGCAAAGTTGGGGATGGTCACAAAAACCTTGGCGACAAGCCG CCTATATTGTGCCACTAGTAATTTTAGGAGAAACCAGACTCTTCGTTCACCCCATTACATTACTCATAGCCGCAGGATTT TACATCTTTTTAGCCAAAGTAGGGGAAAACATCCGTTTTACTTATATTAGTGTGGCGTTGATAGATTGGGCGCTATTTTC CTGGTTTCATCAGTTACGCCTCACCGATAACTTGTGGTATGTCACAGTGATTGGTTTATCACTGCTATATATTGCCCAAG TCGATCCAGAACTGGTACAGCCAGAATCTAAACTAACTCGTCACACCCTCCGAGTCTTAGGTAGCGGCGTAATATGTGGA TGGGCAATCTTATTTCACCAAAATGCTCCTCTTCTGCCTGGAAGTTTGGCCTTAGTTGCCATTTTCGCCGGATTAGCTTT AAGAATCAGAGCATTTCTCTATGTTGGTACAGCCACTTTTCTCATCACCAGTATTTACCAGCTAGTAATTTTTAGCTTGC GTTACCCCTTCTTAAAATGGGTTGTAGGTTTATTTGTTGGTATTGCCCTAATTTCCATCGCCGCCAACTTTGAAACCCGC CGCGCTCAACTAAATTCCATCCTCCGCAACACCACCAATCAATTTGACGAATGGGAGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAAAAAATTAATTAGTCAGCCAGACAAGTGGCACAGCGATCGCATAAATATAGACTAAGCCAATGATGATGTTACGTATA TACTGATACGTCTGCGATTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TCAATTCAAAATTCGTCTTGAAAAATTGAGTCACTGGGTTGGATAGCTTCCCCGGCTTGTAGCAAGTGGCGTTCCTAAGT CGGGAAACCAACCTACAGAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1299; Mature: 1298
Protein sequence:
>1299_residues MSSPSDHPLRIELRLPSSHPELLEGLDIWLRLGLISDTQVKQICRDYLVCRIELQSQSVPEPQRVVATIRTPERPLVAQL QEKPRKQPKEPTQPNIASRMLQSLGEELSVRWLLFLGVFLVVISSGVLAASQWERFPASGQYGVLLAYTLSFWGFSFWAG RQNNLRLTAQTLLIVTLLLVPVNFWAMDSFGLWHNPLDWVTVAIATPILTVVTVLLWRNRTVISNFPRGKLPLINLLGLS YLHWGWKLPGSPLIAVYVAMISTTIITIYHSRRQPIPLVDEGEQPHKPIINIYAAVIVYALLLLLSRAIFVAGVEITQLG LAIGICGWLTTWIAQQERQKQTSPTSPTSPTSPLPWEKLGGILLFIGWLVAVIEQPAQAIAVSGLILWVGGVRLYRYSWQ GDLALIFVVGLQTIWLGWRLVPSGFKQLAIAFGTQLTQAQNEPWALISIALFPYIVFMVVLTETLHHYRKREVAQFGEFL TLLLGTCLTTIATVNPTLRSLNLLFSTITLVVISKRRSSVPVPLVYLTHVGGLLTLCSIIDRLLPNLDLHTWASIFLVLM LAEWVYSLGTGLWQRSGWYIGLGLAVVSFWLLWNNAQPIWAGGVESQAHWNVIWLVTPIALTALASRTTDHYRTTNSLLS ILTVGMAQLLTLPLPGTRLISLAVSTGVMYANSRYLPSLQVAGVTIGFGLSFVGALLWEGLPRLTVAGWCVVGAIATLGL WLGRTVLLRRHQELASIYADAADKWAIALCGLELLNLTRHSLVVYQGFEAPGVLYLIATTITLGAITYRHWRQPTDWAFY GIAWCVELLIAEVLGFGGRSIIHVAIANIALGLFTQLLGEWWRRRYQLTKLPNSFHILPVFYGLFSVLLRFNTFTDWSGL CSLGVALIFIGVGRRSQDFKPLLYLGIIGVSVSAYEMLFYQMSQASGGGLGDGLIAMAALGTTIMSAYRILTPWVTNYLR LSTQELKLIAHLHWAWSSALLMTAITLPIQVNRLVGLGTGVFLITYAILQGRTKPDESVSRVFDRITTADLWVYLGFVLI AGMRVYWRETAVGQLITGVLVPWNGAIACVFAYFLYILPWQSWGWSQKPWRQAAYIVPLVILGETRLFVHPITLLIAAGF YIFLAKVGENIRFTYISVALIDWALFSWFHQLRLTDNLWYVTVIGLSLLYIAQVDPELVQPESKLTRHTLRVLGSGVICG WAILFHQNAPLLPGSLALVAIFAGLALRIRAFLYVGTATFLITSIYQLVIFSLRYPFLKWVVGLFVGIALISIAANFETR RAQLNSILRNTTNQFDEWE
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 145108; Mature: 144977
Theoretical pI: Translated: 9.69; Mature: 9.69
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.0 %Met (Mature Protein) 1.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSSPSDHPLRIELRLPSSHPELLEGLDIWLRLGLISDTQVKQICRDYLVCRIELQSQSVP CCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCC EPQRVVATIRTPERPLVAQLQEKPRKQPKEPTQPNIASRMLQSLGEELSVRWLLFLGVFL CHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VVISSGVLAASQWERFPASGQYGVLLAYTLSFWGFSFWAGRQNNLRLTAQTLLIVTLLLV HHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH PVNFWAMDSFGLWHNPLDWVTVAIATPILTVVTVLLWRNRTVISNFPRGKLPLINLLGLS HHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH YLHWGWKLPGSPLIAVYVAMISTTIITIYHSRRQPIPLVDEGEQPHKPIINIYAAVIVYA HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LLLLLSRAIFVAGVEITQLGLAIGICGWLTTWIAQQERQKQTSPTSPTSPTSPLPWEKLG HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH GILLFIGWLVAVIEQPAQAIAVSGLILWVGGVRLYRYSWQGDLALIFVVGLQTIWLGWRL HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VPSGFKQLAIAFGTQLTQAQNEPWALISIALFPYIVFMVVLTETLHHYRKREVAQFGEFL 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CHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VVISSGVLAASQWERFPASGQYGVLLAYTLSFWGFSFWAGRQNNLRLTAQTLLIVTLLLV HHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH PVNFWAMDSFGLWHNPLDWVTVAIATPILTVVTVLLWRNRTVISNFPRGKLPLINLLGLS HHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHH YLHWGWKLPGSPLIAVYVAMISTTIITIYHSRRQPIPLVDEGEQPHKPIINIYAAVIVYA HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LLLLLSRAIFVAGVEITQLGLAIGICGWLTTWIAQQERQKQTSPTSPTSPTSPLPWEKLG HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH GILLFIGWLVAVIEQPAQAIAVSGLILWVGGVRLYRYSWQGDLALIFVVGLQTIWLGWRL HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VPSGFKQLAIAFGTQLTQAQNEPWALISIALFPYIVFMVVLTETLHHYRKREVAQFGEFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLLLGTCLTTIATVNPTLRSLNLLFSTITLVVISKRRSSVPVPLVYLTHVGGLLTLCSII HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH DRLLPNLDLHTWASIFLVLMLAEWVYSLGTGLWQRSGWYIGLGLAVVSFWLLWNNAQPIW HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCEE AGGVESQAHWNVIWLVTPIALTALASRTTDHYRTTNSLLSILTVGMAQLLTLPLPGTRLI ECCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH SLAVSTGVMYANSRYLPSLQVAGVTIGFGLSFVGALLWEGLPRLTVAGWCVVGAIATLGL HHHHHHCEEEECCCCCCCEEECCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH WLGRTVLLRRHQELASIYADAADKWAIALCGLELLNLTRHSLVVYQGFEAPGVLYLIATT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHH ITLGAITYRHWRQPTDWAFYGIAWCVELLIAEVLGFGGRSIIHVAIANIALGLFTQLLGE HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WWRRRYQLTKLPNSFHILPVFYGLFSVLLRFNTFTDWSGLCSLGVALIFIGVGRRSQDFK HHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC PLLYLGIIGVSVSAYEMLFYQMSQASGGGLGDGLIAMAALGTTIMSAYRILTPWVTNYLR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSTQELKLIAHLHWAWSSALLMTAITLPIQVNRLVGLGTGVFLITYAILQGRTKPDESVS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH RVFDRITTADLWVYLGFVLIAGMRVYWRETAVGQLITGVLVPWNGAIACVFAYFLYILPW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHCC QSWGWSQKPWRQAAYIVPLVILGETRLFVHPITLLIAAGFYIFLAKVGENIRFTYISVAL CCCCCCCCCHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHH IDWALFSWFHQLRLTDNLWYVTVIGLSLLYIAQVDPELVQPESKLTRHTLRVLGSGVICG HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHH WAILFHQNAPLLPGSLALVAIFAGLALRIRAFLYVGTATFLITSIYQLVIFSLRYPFLKW HHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VVGLFVGIALISIAANFETRRAQLNSILRNTTNQFDEWE HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA