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The map label for this gene is 17229734

Identifier: 17229734

GI number: 17229734

Start: 2693858

End: 2696203

Strand: Direct

Name: 17229734

Synonym: alr2242

Alternate gene names: NA

Gene position: 2693858-2696203 (Clockwise)

Preceding gene: 17229733

Following gene: 17229738

Centisome position: 42.0

GC content: 33.25

Gene sequence:

>2346_bases
ATGGCTAAACGATCTCTCCAAGCCTCGGATGAAGGTATTAGGAAAGCCAAAAGAGCTTTTAATCATAAAGGTTGGACACA
AGAATATCTAGCCAGTCAAGTTGGACTAGATAGTCGCCAACCAATTTGGAAGTTTTTTTCTGGCAAACCTGTTGCCCGGC
ATATATTCCATGAAATTTGCTTTAGCCTAGCCCTAAATCCAGAAGAGATTGTTCAAACACCAGAATTTGAACCAGATGAA
CACTTAGAAACCCAACAGATACTAGAAGGTCAAAACTCTACAGTCATTGAATCTTTAGTGACTAAAATACGTGCTGCCCA
CTCAGAAAAAATTCAAAATCAATGTGGTACTATCCGGTTGTTAGATGTTGCGCGTACCGTAGAATTGGATGAATTATTTA
TTGAGGTCAATGTATTAGAAGAAATTACTAATCAAAGATGGCTGGATATTTCAGAGTTACAAAAGTCTGATAATAAAGCT
TTAAACGAATTTGTATTAGAGGAAGTTACTACTAAAAAAATTACAGGACTACAAGCTATTGAGAAATTTTCTAAGCTTTT
TGTCTTTGGCAATCCAGGTGCGGGAAAAACTACTTTTTTGCAATCAATCGCCACACTTTGTAACCAAGGTAAATTTCAGC
CTCAACGTGTTCCTATTTTTATTAGCCTGAAAGATTTTGCCGAAAATATTGACTACGATGATAAAAACCCTTTATTAAGC
TATTTAATTGAGGAATTAAGTATTTGTAAAATAGCTCAACAGGAAGTAGAAGAATTACTTCATAAAGGTAAAGTTTTAAT
TTTACTAGATGGATTGGATGAAGTTGCAGATAAATATACGGATAAAATCAATAAAACAATTAGTACTTTTTTGGATATTT
TTTATAAAAATGTAGTAATTATCAGTTGTCGAATTGCATTTAGGCATCAAAAATTTAAAGGTTTTGCTGAAGTACAAATT
TCTAAATTTACAAAATCACAAATATCAGATTTTGCTAATAAATGGTTTGCAGCTTTTGCTAAAAATAATACCCGGTTAAA
GAAAACATTAGCCTCTAAATTTATTGATAAAATAACCCTTCCGGAAAATCGACTAATCCAAAATCTAGCATCCACACCTA
TTTTATTAAACCTCACCTGTTTAGTATTCCAATATCTCGGCGATTTCCCTACTAAGCGGTCTGAAATTTATCAGCAAGGT
TTAGAGCTATTACTAGTACGTTGGGACGAAGCCAAAGGAATCAAAAGAGATGAAGTTTATGCTAATTTAACCTTAGCCCA
GAAAATTAAGTTGCTTAGTTATATCGCTGCCACTTTTTTTGAAAAGGGCAATTACTTTTTTGAAGAAAACATCATTTGTC
AATTAATAGCTGACTTTTTATATCTGTTACCAAATGCACCAACTGATTTAGAAGCTTTACAAGTAGATAGTAAAGCTGTG
CTTAAAGCAATGGAGTTACAGCATGGATTATTAGTTGAACAAGCTAGGGGCATTTATTCTTTTTCTCATTTAACATTTCA
TGAATATTTTACCGCCAGATTTCTTGCTAACAGCGACCATAAAAAATTAGAACAAATTGCCGATTGTTTAATTGATAAGC
GATGGTGTGAAGTTATATTGCTCACATCGGAAATTATCAAATCCTTTGAGGACTTATTCCAGCTAATCAAGCAACAAATT
GATAAGTTAGCAGTTGCAGATGAAACAGTAAAACTTTTTCTCACTTGGGTAATGAACAAGTCCTCAACAGTTATTTCCAA
TTATCATTCGTCTGCTGTACGTGCTTTTTACTTTACCCTAGCCTTACCTCCAGATTATGCTTTATCACGTAACCAAACTC
TAGCTACAGTTTTAGATAGTCATTTAACAGGAAAACTAGCTGATGATTTAGCTTTGGATTTAGCTTTAAGTCATATTTTT
GCAGTTAGCATTTCTTTGACTCCAGAGCTTTTCTGCAAGCGTATATCTGCTCTCAAATTAGCTCTTGATATTGATTATTT
ACTACAATCACATTCATCCTTAGATGAATCGCTACAAAACCTCAAACAAGAACTGCCTAGTTCACAACAAGATAAAGAGA
TATTAAAAGCATGGTGGCAATCTCATGGGCAATCTTGGACAACACAGTTAAAAGAAGTAATCAAAATACATCGCCAAATG
GATTGCGCTTGGCAATTTACTGAGAAACAATTACATTTAATTCAAAAATACTGGGAGGCAAACAACTTATTAGTATATTG
TTTTAATACCGCTAGCAATGTTACTCCCAATTTAAAAGAAATTATTAAAGAATCTTTGATTTTACCTCCAGAACAAACAG
AAATAACCACTCTAAATAATGTTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAAAAATTGATATTATAAATAATTAACTTGCCGCTAATTTAAAAACTAAATATAATTGATAGAAATTCATGATGTAATTG
AATTAATTTCTGATATAAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTTAAATTTTTCAGGCTGCATCAAGTTTTAAAATCAACTCAATATTGCTTTATATCTATGCGCTGTTATACCAATTCA
CAAGATATTTGAGACAGTCG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NACHT Domain Family; Signal Transduction Protein With Nacht Domain; Signal Transduction Protein With Nacht Domain Protein; XRE Family Transcriptional Regulator; NTPase-Like Protein; P-Loop Containing NTPase; GUN4 Domain Protein; PBS Lyase HEAT-Like Repeat Domain Protein

Number of amino acids: Translated: 781; Mature: 780

Protein sequence:

>781_residues
MAKRSLQASDEGIRKAKRAFNHKGWTQEYLASQVGLDSRQPIWKFFSGKPVARHIFHEICFSLALNPEEIVQTPEFEPDE
HLETQQILEGQNSTVIESLVTKIRAAHSEKIQNQCGTIRLLDVARTVELDELFIEVNVLEEITNQRWLDISELQKSDNKA
LNEFVLEEVTTKKITGLQAIEKFSKLFVFGNPGAGKTTFLQSIATLCNQGKFQPQRVPIFISLKDFAENIDYDDKNPLLS
YLIEELSICKIAQQEVEELLHKGKVLILLDGLDEVADKYTDKINKTISTFLDIFYKNVVIISCRIAFRHQKFKGFAEVQI
SKFTKSQISDFANKWFAAFAKNNTRLKKTLASKFIDKITLPENRLIQNLASTPILLNLTCLVFQYLGDFPTKRSEIYQQG
LELLLVRWDEAKGIKRDEVYANLTLAQKIKLLSYIAATFFEKGNYFFEENIICQLIADFLYLLPNAPTDLEALQVDSKAV
LKAMELQHGLLVEQARGIYSFSHLTFHEYFTARFLANSDHKKLEQIADCLIDKRWCEVILLTSEIIKSFEDLFQLIKQQI
DKLAVADETVKLFLTWVMNKSSTVISNYHSSAVRAFYFTLALPPDYALSRNQTLATVLDSHLTGKLADDLALDLALSHIF
AVSISLTPELFCKRISALKLALDIDYLLQSHSSLDESLQNLKQELPSSQQDKEILKAWWQSHGQSWTTQLKEVIKIHRQM
DCAWQFTEKQLHLIQKYWEANNLLVYCFNTASNVTPNLKEIIKESLILPPEQTEITTLNNV

Sequences:

>Translated_781_residues
MAKRSLQASDEGIRKAKRAFNHKGWTQEYLASQVGLDSRQPIWKFFSGKPVARHIFHEICFSLALNPEEIVQTPEFEPDE
HLETQQILEGQNSTVIESLVTKIRAAHSEKIQNQCGTIRLLDVARTVELDELFIEVNVLEEITNQRWLDISELQKSDNKA
LNEFVLEEVTTKKITGLQAIEKFSKLFVFGNPGAGKTTFLQSIATLCNQGKFQPQRVPIFISLKDFAENIDYDDKNPLLS
YLIEELSICKIAQQEVEELLHKGKVLILLDGLDEVADKYTDKINKTISTFLDIFYKNVVIISCRIAFRHQKFKGFAEVQI
SKFTKSQISDFANKWFAAFAKNNTRLKKTLASKFIDKITLPENRLIQNLASTPILLNLTCLVFQYLGDFPTKRSEIYQQG
LELLLVRWDEAKGIKRDEVYANLTLAQKIKLLSYIAATFFEKGNYFFEENIICQLIADFLYLLPNAPTDLEALQVDSKAV
LKAMELQHGLLVEQARGIYSFSHLTFHEYFTARFLANSDHKKLEQIADCLIDKRWCEVILLTSEIIKSFEDLFQLIKQQI
DKLAVADETVKLFLTWVMNKSSTVISNYHSSAVRAFYFTLALPPDYALSRNQTLATVLDSHLTGKLADDLALDLALSHIF
AVSISLTPELFCKRISALKLALDIDYLLQSHSSLDESLQNLKQELPSSQQDKEILKAWWQSHGQSWTTQLKEVIKIHRQM
DCAWQFTEKQLHLIQKYWEANNLLVYCFNTASNVTPNLKEIIKESLILPPEQTEITTLNNV
>Mature_780_residues
AKRSLQASDEGIRKAKRAFNHKGWTQEYLASQVGLDSRQPIWKFFSGKPVARHIFHEICFSLALNPEEIVQTPEFEPDEH
LETQQILEGQNSTVIESLVTKIRAAHSEKIQNQCGTIRLLDVARTVELDELFIEVNVLEEITNQRWLDISELQKSDNKAL
NEFVLEEVTTKKITGLQAIEKFSKLFVFGNPGAGKTTFLQSIATLCNQGKFQPQRVPIFISLKDFAENIDYDDKNPLLSY
LIEELSICKIAQQEVEELLHKGKVLILLDGLDEVADKYTDKINKTISTFLDIFYKNVVIISCRIAFRHQKFKGFAEVQIS
KFTKSQISDFANKWFAAFAKNNTRLKKTLASKFIDKITLPENRLIQNLASTPILLNLTCLVFQYLGDFPTKRSEIYQQGL
ELLLVRWDEAKGIKRDEVYANLTLAQKIKLLSYIAATFFEKGNYFFEENIICQLIADFLYLLPNAPTDLEALQVDSKAVL
KAMELQHGLLVEQARGIYSFSHLTFHEYFTARFLANSDHKKLEQIADCLIDKRWCEVILLTSEIIKSFEDLFQLIKQQID
KLAVADETVKLFLTWVMNKSSTVISNYHSSAVRAFYFTLALPPDYALSRNQTLATVLDSHLTGKLADDLALDLALSHIFA
VSISLTPELFCKRISALKLALDIDYLLQSHSSLDESLQNLKQELPSSQQDKEILKAWWQSHGQSWTTQLKEVIKIHRQMD
CAWQFTEKQLHLIQKYWEANNLLVYCFNTASNVTPNLKEIIKESLILPPEQTEITTLNNV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89529; Mature: 89398

Theoretical pI: Translated: 6.34; Mature: 6.34

Prosite motif: PS50837 NACHT ; PS00622 HTH_LUXR_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
0.5 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
0.4 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAKRSLQASDEGIRKAKRAFNHKGWTQEYLASQVGLDSRQPIWKFFSGKPVARHIFHEIC
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
FSLALNPEEIVQTPEFEPDEHLETQQILEGQNSTVIESLVTKIRAAHSEKIQNQCGTIRL
HHHCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
LDVARTVELDELFIEVNVLEEITNQRWLDISELQKSDNKALNEFVLEEVTTKKITGLQAI
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EKFSKLFVFGNPGAGKTTFLQSIATLCNQGKFQPQRVPIFISLKDFAENIDYDDKNPLLS
HHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHCCCCCCCCHHHH
YLIEELSICKIAQQEVEELLHKGKVLILLDGLDEVADKYTDKINKTISTFLDIFYKNVVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEE
ISCRIAFRHQKFKGFAEVQISKFTKSQISDFANKWFAAFAKNNTRLKKTLASKFIDKITL
EEEHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
PENRLIQNLASTPILLNLTCLVFQYLGDFPTKRSEIYQQGLELLLVRWDEAKGIKRDEVY
CHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCHHHHH
ANLTLAQKIKLLSYIAATFFEKGNYFFEENIICQLIADFLYLLPNAPTDLEALQVDSKAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCHHHH
LKAMELQHGLLVEQARGIYSFSHLTFHEYFTARFLANSDHKKLEQIADCLIDKRWCEVIL
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTSEIIKSFEDLFQLIKQQIDKLAVADETVKLFLTWVMNKSSTVISNYHSSAVRAFYFTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEE
ALPPDYALSRNQTLATVLDSHLTGKLADDLALDLALSHIFAVSISLTPELFCKRISALKL
ECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
ALDIDYLLQSHSSLDESLQNLKQELPSSQQDKEILKAWWQSHGQSWTTQLKEVIKIHRQM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
DCAWQFTEKQLHLIQKYWEANNLLVYCFNTASNVTPNLKEIIKESLILPPEQTEITTLNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
V
C
>Mature Secondary Structure 
AKRSLQASDEGIRKAKRAFNHKGWTQEYLASQVGLDSRQPIWKFFSGKPVARHIFHEIC
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
FSLALNPEEIVQTPEFEPDEHLETQQILEGQNSTVIESLVTKIRAAHSEKIQNQCGTIRL
HHHCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
LDVARTVELDELFIEVNVLEEITNQRWLDISELQKSDNKALNEFVLEEVTTKKITGLQAI
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EKFSKLFVFGNPGAGKTTFLQSIATLCNQGKFQPQRVPIFISLKDFAENIDYDDKNPLLS
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ISCRIAFRHQKFKGFAEVQISKFTKSQISDFANKWFAAFAKNNTRLKKTLASKFIDKITL
EEEHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
PENRLIQNLASTPILLNLTCLVFQYLGDFPTKRSEIYQQGLELLLVRWDEAKGIKRDEVY
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ANLTLAQKIKLLSYIAATFFEKGNYFFEENIICQLIADFLYLLPNAPTDLEALQVDSKAV
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ALPPDYALSRNQTLATVLDSHLTGKLADDLALDLALSHIFAVSISLTPELFCKRISALKL
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
V
C

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA