Definition Nostoc sp. PCC 7120, complete genome.
Accession NC_003272
Length 6,413,771

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The map label for this gene is 17229536

Identifier: 17229536

GI number: 17229536

Start: 2447411

End: 2450458

Strand: Direct

Name: 17229536

Synonym: alr2044

Alternate gene names: NA

Gene position: 2447411-2450458 (Clockwise)

Preceding gene: 17229535

Following gene: 17229537

Centisome position: 38.16

GC content: 38.35

Gene sequence:

>3048_bases
ATGCCAAAACCAACTATCTTACTTGCACTCGATCCTCACAGTACGGCTTTATGTGCAGCTATCAAGCGGCAACTCCCACA
ACTTCCTAACCCCCAAAGTCGCTTAATTCAGGCTTACACTCTGACTTGGGACGGTCAAACTTTTGGGTTTAGTAATGAGT
TAGATTCTTTTGCCGATGCGAGTTTTGACCTCACACTCACCAACCCTAGACAAACTGCTGTCTCCCAACTGCGTCACCAG
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CGCGAAAAATGCTGGAGTTGATATCAGTTCTTGGTATAGAATCTATATCATGTTCTCAGCCAACGACCATCGGGCGCGAG
AACTGGTATTTGAACTATCCCGCTTGATTCATTGGCTATTTAATGTCTACTTTGCTGACGTTCCCCATAGTTTGGAAGCT
TTATTACTCTTACCAGGATTATTTGCTCAAGCCAGAACTGAGGATTATAGTGCGGCTTATCAACTCCTGAAGGAATTAGA
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GGATTGTTGATTGGGGCGCATACAATCCGGGGAAAACTTCCTGCTTACAGTACCTTTGGCTATGGGGAGTTATTTTTTCC
TGCACAGACAGTTGTAGATCGTTTGAGTACAGCGTTAGCAGCCGATATTATCACCCAGGAGTTTCTCCCCTCAGCAAAAC
TCACTCCTGAAGCAAATCGCCAATTACTATTAGATGCTAAAGAATTTGTCCTCAGCGAAGATTATAACGATGCTTTGCAG
CAATTAGAACGAGACAACGGTAAACCAGTTTGGCAAGATTTCAGCCCCCGTCTTGATATTCGTCCCGGCCAGACACAAGA
ATATGGGATGGAATTGCAATGTGCTTATAAGCAATTTGAAAATAAAGAACTGATTTCATCTAAGCGCACTCTAGAAATTT
GTGGTAAACAAGCACAAGCCACCTTAACCAAACTCTTAGACCAGAAGATTAATCAATATGCGGATGCTGCAACTAGTGGC
TTACATGAAGCTGTTAGATTATCTACTGTTTTGAATAATCCTTATTTGGAATTGCAAACAGAGTCTATTAGCGATCACCC
AGAAAATCTGATTACAGAACTACGCGCCGCCGAATCATTTTTAGATACTCGGTTGCAGATCACAATCAACAAAGAAAATA
GTCAAAAGCTACTCAATCAATTCTTCACACTCAAATCCCAAAGACAACAATTACAAGACACGATAGCTGAGACTAATTCG
GAAGCACTCACCCAAGAGTTACAGAAAATTCAAGAACAATTAAAAGTAGCTGTTTCCGACTATCACCAAGCTATAAATGC
AGAACTCGAACAAACTAGACAAACCCGCTTATTAGCAATTGAAGATGCTCGTTCCAAGGCACAAACAGCGATTAGTCAGG
CACAAAAACAGTTAAATTATTTAGAAAATCAACATGAAATAGCTACAGATCAATTAAATGAATTGATAGCAGAAGAAAAC
CGTTTTCGTTCTCTATATCTCATAGTTTTTCCTGCTGTCGTTGCTATTGCCTTAATTGGGATTTTGCTGCTCACCGGGCT
TTTCAGCCAATCAACCCTTTGGATATTATTACAACAGATAGGGGTCAACTTATTGAATTACATACTTTGGGGTTTAGTTA
GTGTACTCAGTTACTTAGGTATAGTTTGGCTGAAGTACAGTACCAGTATCCGCGATCGCATTCAAAAAGTTCAGAAGCAA
ATCAAACGCCTAGAAAGTAGTTTAAAAGCTACTGGTGTGGAATTACGCCGTAATTATAATGACCAATTAAAGTTAGAATA
TGACCTCTATGCTCAAAATATCCGCGTTGAAGTAGCGAATCATTTGATTAAAACATCTAAACAAAAGACTGAGATTTTAC
GGCAAAGTTTATCTAATTTTTCTCAAATATATGATATTTTAATTGCTCAACATGATAAAGCCTCGACAAATTATTCGGAA
ACTAGATTAGCTATTTTAACAAACTCAGATATCGATATTTATTATCATCAAAATATTCTCAAAACTCTACCCATTAATAA
ATTTACCCAAGAAGAAGTTAGTCGTTCTCAATCATGGCAAATTTCGTCCACAGAATTTCAGAACAAACTGGATTTGTTTG
CCAGAAAGCAGTTTGAACATTTAAGTAAGTTATCCATTGGAGACGTTTTAAAATCAGATTTGATCGCAGAAAATACAGCT
AGTATTAGATTAAATCAACTTTATAACAGTGCGAAGCTCTTGTTGCGTCTTCAAGATAGTGATGCTCACTTAAACCCAAC
TTCTCAACCAGAAATTACACTTTGGGTAGGAGCAAAAGATAAAGAAGAAATACTCCGACTTTATAGTCGCTTTAGCCGTT
CTTTAACTCCCTATGTCGCGGAAGACGAAAGTAGTTTATGCGTTTTGGTACGTTCTTTAGGTTTTCCGATTTACTTTCTC
AGTCAAATAGAGTTTTATCGAGACTGTTATGAACGTACTCAGAAAGAACAAGAGGAAAATATTCCCGACTTAATTCCTGA
AGAAATTAGTTCTAGTCGAGAATTAATTTGGGCTTATGATACTCTGTTGCTAGCGATCGCTCTGGAATTATTGTCTCAAG
ACACTCACGGTAACTATCAATTCAATGGTCAATTACTTGGTCAAGAACGAGAAAAAATTGCCTCGGCTCTTGCAAATGAG
TTCAGCCATCAAGAATTATATGGAGAACTCAAAGAACGTATAGAGGCGTTTGAACAAGATTTAATTTACCAGCAATTAGA
AAAATCTGAAAAATCTGTCCCAGGTTTAACGCATTACGAACGCAAGCGTTTAAATCATCTATTGTCAAAGTATAGTCCTC
TAAACTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGTGATTAGCTAATACATAACGGTGTAAATCAAGCAAATATTTTCACTGTTACTCAGCCAAAACCAGCATTTAAAATTC
CGCGTAGTGGTACTAGCCTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATCTTCGGGAAGTGTTGACTAAATAAAACCCTCAAGGCTAGTAAAAAAGATAGAGTAATTATCCTGGAACGATTAATC
ATAAATAATTTCTCAGTTTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1015; Mature: 1014

Protein sequence:

>1015_residues
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FSHQELYGELKERIEAFEQDLIYQQLEKSEKSVPGLTHYERKRLNHLLSKYSPLN

Sequences:

>Translated_1015_residues
MPKPTILLALDPHSTALCAAIKRQLPQLPNPQSRLIQAYTLTWDGQTFGFSNELDSFADASFDLTLTNPRQTAVSQLRHQ
FKEGAKDLQTTLIDLIKSVNQSPEAIAAKNAGVDISSWYRIYIMFSANDHRARELVFELSRLIHWLFNVYFADVPHSLEA
LLLLPGLFAQARTEDYSAAYQLLKELDDKMTKGVVIRGTQKRPPFDNCWLIDERIGELGVNLDSYADAFAGFLTVEPETG
GLLIGAHTIRGKLPAYSTFGYGELFFPAQTVVDRLSTALAADIITQEFLPSAKLTPEANRQLLLDAKEFVLSEDYNDALQ
QLERDNGKPVWQDFSPRLDIRPGQTQEYGMELQCAYKQFENKELISSKRTLEICGKQAQATLTKLLDQKINQYADAATSG
LHEAVRLSTVLNNPYLELQTESISDHPENLITELRAAESFLDTRLQITINKENSQKLLNQFFTLKSQRQQLQDTIAETNS
EALTQELQKIQEQLKVAVSDYHQAINAELEQTRQTRLLAIEDARSKAQTAISQAQKQLNYLENQHEIATDQLNELIAEEN
RFRSLYLIVFPAVVAIALIGILLLTGLFSQSTLWILLQQIGVNLLNYILWGLVSVLSYLGIVWLKYSTSIRDRIQKVQKQ
IKRLESSLKATGVELRRNYNDQLKLEYDLYAQNIRVEVANHLIKTSKQKTEILRQSLSNFSQIYDILIAQHDKASTNYSE
TRLAILTNSDIDIYYHQNILKTLPINKFTQEEVSRSQSWQISSTEFQNKLDLFARKQFEHLSKLSIGDVLKSDLIAENTA
SIRLNQLYNSAKLLLRLQDSDAHLNPTSQPEITLWVGAKDKEEILRLYSRFSRSLTPYVAEDESSLCVLVRSLGFPIYFL
SQIEFYRDCYERTQKEQEENIPDLIPEEISSSRELIWAYDTLLLAIALELLSQDTHGNYQFNGQLLGQEREKIASALANE
FSHQELYGELKERIEAFEQDLIYQQLEKSEKSVPGLTHYERKRLNHLLSKYSPLN
>Mature_1014_residues
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KEGAKDLQTTLIDLIKSVNQSPEAIAAKNAGVDISSWYRIYIMFSANDHRARELVFELSRLIHWLFNVYFADVPHSLEAL
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LLIGAHTIRGKLPAYSTFGYGELFFPAQTVVDRLSTALAADIITQEFLPSAKLTPEANRQLLLDAKEFVLSEDYNDALQQ
LERDNGKPVWQDFSPRLDIRPGQTQEYGMELQCAYKQFENKELISSKRTLEICGKQAQATLTKLLDQKINQYADAATSGL
HEAVRLSTVLNNPYLELQTESISDHPENLITELRAAESFLDTRLQITINKENSQKLLNQFFTLKSQRQQLQDTIAETNSE
ALTQELQKIQEQLKVAVSDYHQAINAELEQTRQTRLLAIEDARSKAQTAISQAQKQLNYLENQHEIATDQLNELIAEENR
FRSLYLIVFPAVVAIALIGILLLTGLFSQSTLWILLQQIGVNLLNYILWGLVSVLSYLGIVWLKYSTSIRDRIQKVQKQI
KRLESSLKATGVELRRNYNDQLKLEYDLYAQNIRVEVANHLIKTSKQKTEILRQSLSNFSQIYDILIAQHDKASTNYSET
RLAILTNSDIDIYYHQNILKTLPINKFTQEEVSRSQSWQISSTEFQNKLDLFARKQFEHLSKLSIGDVLKSDLIAENTAS
IRLNQLYNSAKLLLRLQDSDAHLNPTSQPEITLWVGAKDKEEILRLYSRFSRSLTPYVAEDESSLCVLVRSLGFPIYFLS
QIEFYRDCYERTQKEQEENIPDLIPEEISSSRELIWAYDTLLLAIALELLSQDTHGNYQFNGQLLGQEREKIASALANEF
SHQELYGELKERIEAFEQDLIYQQLEKSEKSVPGLTHYERKRLNHLLSKYSPLN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 115959; Mature: 115828

Theoretical pI: Translated: 5.22; Mature: 5.22

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
0.4 %Met     (Translated Protein)
1.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
0.3 %Met     (Mature Protein)
0.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPKPTILLALDPHSTALCAAIKRQLPQLPNPQSRLIQAYTLTWDGQTFGFSNELDSFADA
CCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHCCC
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EEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
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>Mature Secondary Structure 
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FSHQELYGELKERIEAFEQDLIYQQLEKSEKSVPGLTHYERKRLNHLLSKYSPLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA