| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is actII-3 [H]
Identifier: 15921981
GI number: 15921981
Start: 1675310
End: 1677838
Strand: Reverse
Name: actII-3 [H]
Synonym: ST1678
Alternate gene names: 15921981
Gene position: 1677838-1675310 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15921982
Following gene: 15921980
Centisome position: 62.26
GC content: 33.45
Gene sequence:
>2529_bases ATGAATAGAAAGTTTATCGTAACAATAATAGTTTGGGTCTTAATTCTTCTTTTCTCGATGTATTTGGCCTCACAATCTTT CGCACACCTTTCCTATAACGAAAACGTAACACTTCCATCAAACAGTAAAGCATTTATCGCAACTAATCTACTTAGTAAAT ACTTCCCATCAGGTAGCGGTAACAACTCTATTGATATTGTCTTAGTTAACTCCACACCTTACGAGGATTATTTAATAGAA CAAAAACTACTTAATATACCTTTGATAACTAATGTAAGTGGAGTACCTAACGTTTACATAAGCTATGCGAACTTTTTAGG AAAAGTAATTAACCAAACCGGATCGTTACTTAACGAAAGTGCTTATGCACTTTATATCTTTCCAGAAAAATTCCTGTTCT TGTTAAACGAAACACATAACGAAAGTCTAGCCTTAAGTGAAGCTGAAAAAGGAATGCCTTCTTCATACTCCTCGTTTTAT GAAAACTTCGCTAATACTTACGTGAAAACTGAAAATTATACTTTAGCATTTGAACTTAGTATTTCGACCTTAAACAAAAC TCAGTTAATCGCATTAGCATTTATCAATCCTCAAGGATTTGTTACGCCAGAGTACGTAGAGAAGCAATTACCAATTGCTA CTGCAAAAGTTTTAAACATTTCACCACAAGTATCTTCCCTTCTACTGTTTAAAAGTGTTAATAATGCATTAGAATCGAAC CCTAAAGCTTTCTTCAGCCTTTTAAATCCTCCCTCCTCACTACTTGCAGTTTATTCTAAGAACCACACAGATGTTATTCT TATTTACACTAAATATTCAGCTACTGCTGTATATTCAAACGGTACCTTTATTGATGAGCAAATTGTACCACAGATAAAGG AAAGTGTTAAGGAAGTTTTTAACGGAACATTTTACGTTACTGGTGAAACACCAGTATTTGCTGAGCTTTCTCAATTGCAG AATGAGTATGATGCAATTACATTTATCTTAATTTTCGCTTTCCTACTTGTCGTAACAGCTATCTACTTCAGAAGCATTTT AGCACCTATTATAACCTTAATTACTATAAGCCTTTCGATCATTTCCGGTTTAGCTATGGTAACCCTAGTGAGTTTAGTAA CAAAACAGCAAATAGACTTCCAAGTAATAGAACCTATGATAGCCGTAATCATGGGTGTAGGAACTGATTATAGTATATTC TTACTCTCACGTTTCAGAGAAGAACTAAGTAAAGGAGTTGATAAATGGAAGGCCATGGAAATTTCTGTGAAAACGTCTGG GAAAGCGATTTTGATAAGTGGAACAACAGTAACTATAGTCTTTCTTTCAATGACTTTTATTCCGTTTGCTGGACAATGGG GATTAATAATCGGTCTTTCAGTACCGTTTGCTGTAGGAATTGCTGTAACTTTATTACCAATAATCTACGGAGCTTTAGGG AAAAAGGTGTTCTGGCCTTCAAAAGAATTTAAGGTAAAACCAAGGTTTGAAAAAGTTGCTAAACTGTCAACATCTAAACC GGTAATAGTGTTTGTAATTGCTTTAGTCATTGGTTTAATAGCAGGCTTCTATGTATTTTCAACTCCTTTAAATTTAAATT TCCAATCGTACTTACCTAATACACCAGCTGTACAAGGATTAAATGTAATTAATAAGGCTTTTGGAGAAAATTATCTAAAC CCTATTCTTGTAGTATTTAACTATTCTCACCCTATAACGCTACAGGATTTAATCCAGGTAGGGAAATTTGAGGCTGAGGT TAGTAAGTTAAATGGTATTGAGGAAGTCTTTGGACCAGTACCACCAAACTTTAACGGCACAATAACACCATCAGTTCTTA GTATGTTTAAGGCAAATGTTGGAAATAATAATAGGACATTGCTCGTTACTATAATACCCTCTTACAAGTATGATAGTATA CAGGCTTACAACTTGGTCAAGGAAATTCAAAGTTTAACTAAAACTGGTTATGTTGGGGGAACTACTGCTGATTACTTAGC TTTCATGGATTATTTATTTCCTTACTACTATACATTAATGCTTCTATTACCCGTAGTTTTAGCAATAATAGTAGCAATTT TCATACGTTCAATTAGAATAGGTATTGGTGTCTCATTAAGTATAATACTAACTATAGTATCCGCTTTAGCTATAGTGTAT TTAGGATTTAGAATTTCACCAGATGTAGGAATACTATTCTTGATTCCTATAGCAGTTTACGTATTAATGATGGGTTTAGG AAATGATTACAGTATATTTATTCTTTCTAGAGTGAAAGAAGAAATTGAGAATGGCGAAAAAGATCCAATAGTAAAGGGAT TATCTATTTCAGCCAATACTATAACTGCTTTGGGTGTAATTTTAGCCTTTTCGTTCGGCGCATTAGCTATAAATCCCATT AAATCTATTCAAGAACTTGGTTTAGCAATAGCTTTGGCTGCAATTCTAGATACTTTCATAGTTAGAACTATAATTTATCC AGCAATTCTCAAAATCTCTTTAGTAAAAAGAGTGGAACAAAGTAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTTATATGGTAAAGTGAACGAAGAAGGTCTGTTAAGATGGTTAGTTTAAACAGAGAGAAAGAATGTTGAGTTTTTAATT TTATCTGTTTAACCTATATT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTGAATTTTACTAAAATCCATTTTGCTTGTTCGTATTAAACTTATATAGTCGAAACGTTTTTCTTTATCGTGATGAAAA AGGTAATATATGCTCTACTA
Product: antibiotic transport-associated protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 842; Mature: 842
Protein sequence:
>842_residues MNRKFIVTIIVWVLILLFSMYLASQSFAHLSYNENVTLPSNSKAFIATNLLSKYFPSGSGNNSIDIVLVNSTPYEDYLIE QKLLNIPLITNVSGVPNVYISYANFLGKVINQTGSLLNESAYALYIFPEKFLFLLNETHNESLALSEAEKGMPSSYSSFY ENFANTYVKTENYTLAFELSISTLNKTQLIALAFINPQGFVTPEYVEKQLPIATAKVLNISPQVSSLLLFKSVNNALESN PKAFFSLLNPPSSLLAVYSKNHTDVILIYTKYSATAVYSNGTFIDEQIVPQIKESVKEVFNGTFYVTGETPVFAELSQLQ NEYDAITFILIFAFLLVVTAIYFRSILAPIITLITISLSIISGLAMVTLVSLVTKQQIDFQVIEPMIAVIMGVGTDYSIF LLSRFREELSKGVDKWKAMEISVKTSGKAILISGTTVTIVFLSMTFIPFAGQWGLIIGLSVPFAVGIAVTLLPIIYGALG KKVFWPSKEFKVKPRFEKVAKLSTSKPVIVFVIALVIGLIAGFYVFSTPLNLNFQSYLPNTPAVQGLNVINKAFGENYLN PILVVFNYSHPITLQDLIQVGKFEAEVSKLNGIEEVFGPVPPNFNGTITPSVLSMFKANVGNNNRTLLVTIIPSYKYDSI QAYNLVKEIQSLTKTGYVGGTTADYLAFMDYLFPYYYTLMLLLPVVLAIIVAIFIRSIRIGIGVSLSIILTIVSALAIVY LGFRISPDVGILFLIPIAVYVLMMGLGNDYSIFILSRVKEEIENGEKDPIVKGLSISANTITALGVILAFSFGALAINPI KSIQELGLAIALAAILDTFIVRTIIYPAILKISLVKRVEQSK
Sequences:
>Translated_842_residues MNRKFIVTIIVWVLILLFSMYLASQSFAHLSYNENVTLPSNSKAFIATNLLSKYFPSGSGNNSIDIVLVNSTPYEDYLIE QKLLNIPLITNVSGVPNVYISYANFLGKVINQTGSLLNESAYALYIFPEKFLFLLNETHNESLALSEAEKGMPSSYSSFY ENFANTYVKTENYTLAFELSISTLNKTQLIALAFINPQGFVTPEYVEKQLPIATAKVLNISPQVSSLLLFKSVNNALESN PKAFFSLLNPPSSLLAVYSKNHTDVILIYTKYSATAVYSNGTFIDEQIVPQIKESVKEVFNGTFYVTGETPVFAELSQLQ NEYDAITFILIFAFLLVVTAIYFRSILAPIITLITISLSIISGLAMVTLVSLVTKQQIDFQVIEPMIAVIMGVGTDYSIF LLSRFREELSKGVDKWKAMEISVKTSGKAILISGTTVTIVFLSMTFIPFAGQWGLIIGLSVPFAVGIAVTLLPIIYGALG KKVFWPSKEFKVKPRFEKVAKLSTSKPVIVFVIALVIGLIAGFYVFSTPLNLNFQSYLPNTPAVQGLNVINKAFGENYLN PILVVFNYSHPITLQDLIQVGKFEAEVSKLNGIEEVFGPVPPNFNGTITPSVLSMFKANVGNNNRTLLVTIIPSYKYDSI QAYNLVKEIQSLTKTGYVGGTTADYLAFMDYLFPYYYTLMLLLPVVLAIIVAIFIRSIRIGIGVSLSIILTIVSALAIVY LGFRISPDVGILFLIPIAVYVLMMGLGNDYSIFILSRVKEEIENGEKDPIVKGLSISANTITALGVILAFSFGALAINPI KSIQELGLAIALAAILDTFIVRTIIYPAILKISLVKRVEQSK >Mature_842_residues MNRKFIVTIIVWVLILLFSMYLASQSFAHLSYNENVTLPSNSKAFIATNLLSKYFPSGSGNNSIDIVLVNSTPYEDYLIE QKLLNIPLITNVSGVPNVYISYANFLGKVINQTGSLLNESAYALYIFPEKFLFLLNETHNESLALSEAEKGMPSSYSSFY ENFANTYVKTENYTLAFELSISTLNKTQLIALAFINPQGFVTPEYVEKQLPIATAKVLNISPQVSSLLLFKSVNNALESN PKAFFSLLNPPSSLLAVYSKNHTDVILIYTKYSATAVYSNGTFIDEQIVPQIKESVKEVFNGTFYVTGETPVFAELSQLQ NEYDAITFILIFAFLLVVTAIYFRSILAPIITLITISLSIISGLAMVTLVSLVTKQQIDFQVIEPMIAVIMGVGTDYSIF LLSRFREELSKGVDKWKAMEISVKTSGKAILISGTTVTIVFLSMTFIPFAGQWGLIIGLSVPFAVGIAVTLLPIIYGALG KKVFWPSKEFKVKPRFEKVAKLSTSKPVIVFVIALVIGLIAGFYVFSTPLNLNFQSYLPNTPAVQGLNVINKAFGENYLN PILVVFNYSHPITLQDLIQVGKFEAEVSKLNGIEEVFGPVPPNFNGTITPSVLSMFKANVGNNNRTLLVTIIPSYKYDSI QAYNLVKEIQSLTKTGYVGGTTADYLAFMDYLFPYYYTLMLLLPVVLAIIVAIFIRSIRIGIGVSLSIILTIVSALAIVY LGFRISPDVGILFLIPIAVYVLMMGLGNDYSIFILSRVKEEIENGEKDPIVKGLSISANTITALGVILAFSFGALAINPI KSIQELGLAIALAAILDTFIVRTIIYPAILKISLVKRVEQSK
Specific function: Unknown
COG id: COG2409
COG function: function code R; Predicted drug exporters of the RND superfamily
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the mmpL family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004707 - InterPro: IPR004869 - InterPro: IPR000731 [H]
Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 92764; Mature: 92764
Theoretical pI: Translated: 8.61; Mature: 8.61
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 1.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 1.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNRKFIVTIIVWVLILLFSMYLASQSFAHLSYNENVTLPSNSKAFIATNLLSKYFPSGSG CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC NNSIDIVLVNSTPYEDYLIEQKLLNIPLITNVSGVPNVYISYANFLGKVINQTGSLLNES CCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC AYALYIFPEKFLFLLNETHNESLALSEAEKGMPSSYSSFYENFANTYVKTENYTLAFELS CEEEEECHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCEEEEEEEE ISTLNKTQLIALAFINPQGFVTPEYVEKQLPIATAKVLNISPQVSSLLLFKSVNNALESN EEECCCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC PKAFFSLLNPPSSLLAVYSKNHTDVILIYTKYSATAVYSNGTFIDEQIVPQIKESVKEVF HHHHHHHCCCCHHHHHHEECCCCEEEEEEEECCEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHH NGTFYVTGETPVFAELSQLQNEYDAITFILIFAFLLVVTAIYFRSILAPIITLITISLSI CCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISGLAMVTLVSLVTKQQIDFQVIEPMIAVIMGVGTDYSIFLLSRFREELSKGVDKWKAME HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE ISVKTSGKAILISGTTVTIVFLSMTFIPFAGQWGLIIGLSVPFAVGIAVTLLPIIYGALG EEEECCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC KKVFWPSKEFKVKPRFEKVAKLSTSKPVIVFVIALVIGLIAGFYVFSTPLNLNFQSYLPN CCEECCCCCCEECCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCC TPAVQGLNVINKAFGENYLNPILVVFNYSHPITLQDLIQVGKFEAEVSKLNGIEEVFGPV CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCC PPNFNGTITPSVLSMFKANVGNNNRTLLVTIIPSYKYDSIQAYNLVKEIQSLTKTGYVGG CCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC TTADYLAFMDYLFPYYYTLMLLLPVVLAIIVAIFIRSIRIGIGVSLSIILTIVSALAIVY CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LGFRISPDVGILFLIPIAVYVLMMGLGNDYSIFILSRVKEEIENGEKDPIVKGLSISANT HCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCHH ITALGVILAFSFGALAINPIKSIQELGLAIALAAILDTFIVRTIIYPAILKISLVKRVEQ HHHHHHHHHHHHCHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SK CC >Mature Secondary Structure MNRKFIVTIIVWVLILLFSMYLASQSFAHLSYNENVTLPSNSKAFIATNLLSKYFPSGSG CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC NNSIDIVLVNSTPYEDYLIEQKLLNIPLITNVSGVPNVYISYANFLGKVINQTGSLLNES CCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC AYALYIFPEKFLFLLNETHNESLALSEAEKGMPSSYSSFYENFANTYVKTENYTLAFELS CEEEEECHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCEEEEEEEE ISTLNKTQLIALAFINPQGFVTPEYVEKQLPIATAKVLNISPQVSSLLLFKSVNNALESN EEECCCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC PKAFFSLLNPPSSLLAVYSKNHTDVILIYTKYSATAVYSNGTFIDEQIVPQIKESVKEVF HHHHHHHCCCCHHHHHHEECCCCEEEEEEEECCEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHH NGTFYVTGETPVFAELSQLQNEYDAITFILIFAFLLVVTAIYFRSILAPIITLITISLSI CCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISGLAMVTLVSLVTKQQIDFQVIEPMIAVIMGVGTDYSIFLLSRFREELSKGVDKWKAME HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE ISVKTSGKAILISGTTVTIVFLSMTFIPFAGQWGLIIGLSVPFAVGIAVTLLPIIYGALG EEEECCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC KKVFWPSKEFKVKPRFEKVAKLSTSKPVIVFVIALVIGLIAGFYVFSTPLNLNFQSYLPN CCEECCCCCCEECCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCC TPAVQGLNVINKAFGENYLNPILVVFNYSHPITLQDLIQVGKFEAEVSKLNGIEEVFGPV CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCC PPNFNGTITPSVLSMFKANVGNNNRTLLVTIIPSYKYDSIQAYNLVKEIQSLTKTGYVGG CCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC TTADYLAFMDYLFPYYYTLMLLLPVVLAIIVAIFIRSIRIGIGVSLSIILTIVSALAIVY CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LGFRISPDVGILFLIPIAVYVLMMGLGNDYSIFILSRVKEEIENGEKDPIVKGLSISANT HCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCHH ITALGVILAFSFGALAINPIKSIQELGLAIALAAILDTFIVRTIIYPAILKISLVKRVEQ HHHHHHHHHHHHCHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SK CC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 1878971; 12000953 [H]