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Definition Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome.
Accession NC_003106
Length 2,694,756

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The map label for this gene is 15921251

Identifier: 15921251

GI number: 15921251

Start: 985162

End: 986805

Strand: Direct

Name: 15921251

Synonym: ST1005

Alternate gene names: NA

Gene position: 985162-986805 (Clockwise)

Preceding gene: 15921250

Following gene: 15921252

Centisome position: 36.56

GC content: 30.96

Gene sequence:

>1644_bases
ATGGAAAAGCGGTATATTTCGCCGTTGACTTCAAATCTTTCTGAAATCTTAATTTGGGCTTCTATGGCTCTCTTCTCTTT
ATTTTATTATCCTACGTTATGGAGTGATATTCTAATAGTTATTCTACTTTCTCTAGCTGGTATTCTTCTTTTCTTTAAAG
GTGATTCCAGATTTGTGAAATTAACTATTTACACTGAATTGTTCTTAGTTCCCATTGAATATTGGTATTTTTTCCACAAC
TTGTACCTTCTTCTAATCTTATATTTAATTTTTCTAGCTGGATTATTGTTAAGACGACTTGATATTGCTTCACTTATTGC
AGTTGTTTTAGTTGCTGTTTCATCTAGAGTAGCAAAACCTTTCGGTACTGATGAATTAATGATTGATTATTATTCTGCCT
ATCAATTTCTTCACGGTTTAAATCCTTACATACCGTCAGTTACAAGTAATGTTTATCAAATTTATAATCTTTCTGCTGAG
ATTTATGGTACTCCTTATACAACTGGAGGTATTGTGACAAATTTAAATTACCCTTCACTGTCCTTTTTGCTTTATATTCC
AGCTGTTATTTTCCACTTTAATCCTAATTATATTATTCTTTTCTTCTATGTTCTCTTACCCTTTATACTTTGGTATAGAC
TTGATAAAACAACTTTTCTTCTATTTATCTCCTCTTATCTATTTAATATTTACTACTTGCTTTATTCTTCTGGGGGTATT
GATGATATTATCTGGATTACTTTTCTTATTTTATCTTTCATATCGAGCAGTGAGTGGGTTAAGGGTTTCTTTTACGGCTT
ATCAGTTTCGTTTAAGCAAGATCCATTAATTTTCCTACCTTTTTATCTTATACAGTTACATAGTGAAAGAAAAAATATCT
GTCAATTTCTATTATCGGGAGTTATGACTTTTATCTCCTTAAACCTCTATTTTATTATTTCCTCGCCAGTTTACTATTTT
CATGACATAGCTACCCCGGTGTTTGATAATTTGTTACAAATTGGTTTTGGTTTTGATATATTTTCAGTAATAGGCGTGTT
TTTTGAGTATAAATATTTCTTCTTAGTATCACAACTTCTTATCTTTTCTACGTTTTTCTATCTTTATTTAAAAGGGAAGA
TTTCAAATTACTTAGGTGGTATATATTTTGTAATGCTCTTTATGTATAGAATGTTATGGAATTATGTAATGTATATACCA
TTTCTTAATTACTTAGACGGTAGTGTAGATGAGAAGATGAAGATAAATAAGGAAGTTGTGAAGCCCCTATCTGTCCTTTT
CTTGCTAATACTCTCATCAGCTTTGGTATTTCATTATGCTTTTTCTTCTTACTATAACGGCTTAAAGGTTGAAGTACTTC
ATGTTTACACCGAGTCTAATGAAGTTTATATGATGGTTTTGAATGTATCTTACCAAGGTCCCTTAAGTGAGGTTAAACCA
TTCTTTAGGTTATTCTCTGTTAACGCTATCCATGACGGAAATGGTATTCTTTGGCTTTCAAACTCTACCTGGATAAAGAG
TGGTGAGTGGGAAATTGTTGTTATTAAGTCTCCATCTCCAGCTTTTAATGTTGGATTAGGAGAGATAATCATAAATGCGT
ATTATGGTAATATTAATGGGTTTCTTACTATTACGGTGAAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTTACTAGTACACTTTCAATATTACTATCAAGTTTTTAATTCTTGATTTAGTAGTTATGAAAAGATTTAAAATAAGTT
GAGTTGAAAGTTGTTATAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATATCGAAAAATTTAATAGGTAGCTTGTCTTTCCCTTTATCCATGGATTATAAAAGTAAGACACTACTCATCTTATCT
GCAATGCTTTTGATTGTTAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 547; Mature: 547

Protein sequence:

>547_residues
MEKRYISPLTSNLSEILIWASMALFSLFYYPTLWSDILIVILLSLAGILLFFKGDSRFVKLTIYTELFLVPIEYWYFFHN
LYLLLILYLIFLAGLLLRRLDIASLIAVVLVAVSSRVAKPFGTDELMIDYYSAYQFLHGLNPYIPSVTSNVYQIYNLSAE
IYGTPYTTGGIVTNLNYPSLSFLLYIPAVIFHFNPNYIILFFYVLLPFILWYRLDKTTFLLFISSYLFNIYYLLYSSGGI
DDIIWITFLILSFISSSEWVKGFFYGLSVSFKQDPLIFLPFYLIQLHSERKNICQFLLSGVMTFISLNLYFIISSPVYYF
HDIATPVFDNLLQIGFGFDIFSVIGVFFEYKYFFLVSQLLIFSTFFYLYLKGKISNYLGGIYFVMLFMYRMLWNYVMYIP
FLNYLDGSVDEKMKINKEVVKPLSVLFLLILSSALVFHYAFSSYYNGLKVEVLHVYTESNEVYMMVLNVSYQGPLSEVKP
FFRLFSVNAIHDGNGILWLSNSTWIKSGEWEIVVIKSPSPAFNVGLGEIIINAYYGNINGFLTITVK

Sequences:

>Translated_547_residues
MEKRYISPLTSNLSEILIWASMALFSLFYYPTLWSDILIVILLSLAGILLFFKGDSRFVKLTIYTELFLVPIEYWYFFHN
LYLLLILYLIFLAGLLLRRLDIASLIAVVLVAVSSRVAKPFGTDELMIDYYSAYQFLHGLNPYIPSVTSNVYQIYNLSAE
IYGTPYTTGGIVTNLNYPSLSFLLYIPAVIFHFNPNYIILFFYVLLPFILWYRLDKTTFLLFISSYLFNIYYLLYSSGGI
DDIIWITFLILSFISSSEWVKGFFYGLSVSFKQDPLIFLPFYLIQLHSERKNICQFLLSGVMTFISLNLYFIISSPVYYF
HDIATPVFDNLLQIGFGFDIFSVIGVFFEYKYFFLVSQLLIFSTFFYLYLKGKISNYLGGIYFVMLFMYRMLWNYVMYIP
FLNYLDGSVDEKMKINKEVVKPLSVLFLLILSSALVFHYAFSSYYNGLKVEVLHVYTESNEVYMMVLNVSYQGPLSEVKP
FFRLFSVNAIHDGNGILWLSNSTWIKSGEWEIVVIKSPSPAFNVGLGEIIINAYYGNINGFLTITVK
>Mature_547_residues
MEKRYISPLTSNLSEILIWASMALFSLFYYPTLWSDILIVILLSLAGILLFFKGDSRFVKLTIYTELFLVPIEYWYFFHN
LYLLLILYLIFLAGLLLRRLDIASLIAVVLVAVSSRVAKPFGTDELMIDYYSAYQFLHGLNPYIPSVTSNVYQIYNLSAE
IYGTPYTTGGIVTNLNYPSLSFLLYIPAVIFHFNPNYIILFFYVLLPFILWYRLDKTTFLLFISSYLFNIYYLLYSSGGI
DDIIWITFLILSFISSSEWVKGFFYGLSVSFKQDPLIFLPFYLIQLHSERKNICQFLLSGVMTFISLNLYFIISSPVYYF
HDIATPVFDNLLQIGFGFDIFSVIGVFFEYKYFFLVSQLLIFSTFFYLYLKGKISNYLGGIYFVMLFMYRMLWNYVMYIP
FLNYLDGSVDEKMKINKEVVKPLSVLFLLILSSALVFHYAFSSYYNGLKVEVLHVYTESNEVYMMVLNVSYQGPLSEVKP
FFRLFSVNAIHDGNGILWLSNSTWIKSGEWEIVVIKSPSPAFNVGLGEIIINAYYGNINGFLTITVK

Specific function: Unknown

COG id: COG5650

COG function: function code S; Predicted integral membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 63569; Mature: 63569

Theoretical pI: Translated: 6.52; Mature: 6.52

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEKRYISPLTSNLSEILIWASMALFSLFYYPTLWSDILIVILLSLAGILLFFKGDSRFVK
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEE
LTIYTELFLVPIEYWYFFHNLYLLLILYLIFLAGLLLRRLDIASLIAVVLVAVSSRVAKP
EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
FGTDELMIDYYSAYQFLHGLNPYIPSVTSNVYQIYNLSAEIYGTPYTTGGIVTNLNYPSL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHEECCEEEEECCCCCCCEEEECCCCHH
SFLLYIPAVIFHFNPNYIILFFYVLLPFILWYRLDKTTFLLFISSYLFNIYYLLYSSGGI
HHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
DDIIWITFLILSFISSSEWVKGFFYGLSVSFKQDPLIFLPFYLIQLHSERKNICQFLLSG
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VMTFISLNLYFIISSPVYYFHDIATPVFDNLLQIGFGFDIFSVIGVFFEYKYFFLVSQLL
HHHHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFSTFFYLYLKGKISNYLGGIYFVMLFMYRMLWNYVMYIPFLNYLDGSVDEKMKINKEVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
KPLSVLFLLILSSALVFHYAFSSYYNGLKVEVLHVYTESNEVYMMVLNVSYQGPLSEVKP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHH
FFRLFSVNAIHDGNGILWLSNSTWIKSGEWEIVVIKSPSPAFNVGLGEIIINAYYGNING
HHHHHEEEEEECCCEEEEECCCCEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHEEEEEECCCCE
FLTITVK
EEEEEEC
>Mature Secondary Structure
MEKRYISPLTSNLSEILIWASMALFSLFYYPTLWSDILIVILLSLAGILLFFKGDSRFVK
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEE
LTIYTELFLVPIEYWYFFHNLYLLLILYLIFLAGLLLRRLDIASLIAVVLVAVSSRVAKP
EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
FGTDELMIDYYSAYQFLHGLNPYIPSVTSNVYQIYNLSAEIYGTPYTTGGIVTNLNYPSL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHEECCEEEEECCCCCCCEEEECCCCHH
SFLLYIPAVIFHFNPNYIILFFYVLLPFILWYRLDKTTFLLFISSYLFNIYYLLYSSGGI
HHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
DDIIWITFLILSFISSSEWVKGFFYGLSVSFKQDPLIFLPFYLIQLHSERKNICQFLLSG
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VMTFISLNLYFIISSPVYYFHDIATPVFDNLLQIGFGFDIFSVIGVFFEYKYFFLVSQLL
HHHHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFSTFFYLYLKGKISNYLGGIYFVMLFMYRMLWNYVMYIPFLNYLDGSVDEKMKINKEVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
KPLSVLFLLILSSALVFHYAFSSYYNGLKVEVLHVYTESNEVYMMVLNVSYQGPLSEVKP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHH
FFRLFSVNAIHDGNGILWLSNSTWIKSGEWEIVVIKSPSPAFNVGLGEIIINAYYGNING
HHHHHEEEEEECCCEEEEECCCCEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHEEEEEECCCCE
FLTITVK
EEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA