| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is 15921123
Identifier: 15921123
GI number: 15921123
Start: 862527
End: 864512
Strand: Reverse
Name: 15921123
Synonym: ST0887
Alternate gene names: NA
Gene position: 864512-862527 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15921124
Following gene: 15921122
Centisome position: 32.08
GC content: 30.21
Gene sequence:
>1986_bases ATGCAAAGTTTAAACAGATTAACAAAGAGAATTGATCTTATTTTTCCCATTATACTTAGTATTATAATTAACTATCTATG GTATAGAGGGTTACCGATTTATGCTGGAGATCAAGGTATCTTCATAGGCAATGGGGTTAAACCGGATTACCTAATCAACC CCGTATTATACGCTTTCACTAATTATCCTTATGGTTTCGTACCGTCAGAAGGGGGCACTTCTTGGGTTAATCTCATTTTT CTTCCTTTTGTTCCTTTAGGCAATTTAGGAGAAGAAGTTTTCTCAACAATTCTCTCAGCAATTGGATCAATATATTTGTT TAAGCTATCCTCAAGATATTATTCTCTTTTCCCTTCAATATTAGCTGCATTTTTGTATCTAACAAATTGGTTCATCTTTA TAGGATTTATAGAAATGCCATATATTTTCTGGAATATAACCTTTATATATTTCTTTTTGCCCCTTATAGTTTACTATTCG TTGTTACTTGGAGAGGGAAAGACCTCTTTCTTTAAAGCCTATCCTATAATTACTGTACTAACTGCTTACTGCCTAGCGTC TTCTGGTGAAATCTTTCCTATAGCATGGTTAGGTTTTGTTTTATTGATAGGATATTACTTAAGAAATAAGGTAATCCAGT TTATCATTATAGTACTTTCATTTACAATTTCACAATTTTACTGGATTTTCTCATTTGCCTCTTATATTATACCGAAACTT CAAAATATCACAAACGCTTCTACCACTTTAGTCCTTCACTTATCATCTTCTCCTTTATATGCTTCTGTGAGTTCTTATTT GCCTTCTGTAACTCCAGTGGGTATTAACTTTATTTTTCTTATTATTATGAGTTTTATCTCACTATTAGCACTCCTTTTAA ATAGACATGGAGATATCAAATATTTGTCTCTTTTATGGTTAATAATTCTTGGTTTTGATTCTATTTCCCCATGGTCTCCT ATAGAGAAATTCCTAGTATCTCATTATGCGTTTTTTGCAGTTCTAAGGACTACACAGTTTGCTACTGCACCTTTTGCTGG TTTCCTATTTTCCATTATTATACCATCACTAATTAAGAAATATAACATGGCACTACTAATTCTACTTTTGATCTTATTTT CTATTTTTAATCTTCCAATCTTATCTGGGCAATTAGCTAATAGGGTAGATACTCCATCATATTTTCTTCAAGCAATTAAT TATCTTAATCATCAGCAAGGAGATTTCACAATTTTAGTTTTTCCAACTGTACAATATGGCTGGTACTCCACAACCTGGTA TTATGGTAATAATATCTATCTGTACTATTCTACTCATCCAATCCTGATAGGTGGTATATATTCAGGAGCATATTTTTACT ATGATTATTATAAGTTAAACTTCTTGCTATATAATCTTAATATTTCTAATAGAGGCGAGATGACAGAAATTTACAACTTT TTGCTTCTATTTAATGCAAAATATATAATTATTGAAGGAGATGCTCACAGTAATATTTCATTTATTTCACTTTTATATTT GCCAGTAAAACCATATATTCAAAATTTAAATTATTTACAAAAACTTGGATGGGTTTCTTTAGTGAAAACTTACGGTCCAC TATATATTTATAAAGTTAATTTAAATTCGTCTTATGCTTATTATACTAACATTTCCTCCTTACCTTTGAATGAGAATTTG AGTCAAATCTTAATTCCAGCTAAAATTAATTGGATTTCTCCTACGGAATTCGAAGTTCCTAGTTATAATTCTAAATACGT TTTAATTACTTTTGCTTACTCTCCATACTGGGTTTCAAATTTTGGAAAACCGGGAGATGCTTCTAATTTTACCGTATACT ATAGTGGAAGTAAGGAGTTAATTATACATGATGCCTTACAAGGAGAGTTAATTAAAGATGACATTTTTGGGTTTCTATCA ATTATTATTCCAGTAATTATTAGCGGAATAGATATTGTGATAATAAAGAGAAAAATTTTTAAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TCTACTCCCTCTTATCTTAGTTTTAGTATTTTAGCTAGTGTTGTTTCATTTGTAATATCATTAATCTATGTTATCTTTAG AGATAGGTTGGTGAGAATCT
Downstream 100 bases:
>100_bases AATAATTTACAAGTATCTATGATTCACGTTATTATACCAGCTTATAATGAAGAACGAAGAATTTCGCAAACACTTTCCTT GATAAAACAGAAATTTCCTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 661; Mature: 661
Protein sequence:
>661_residues MQSLNRLTKRIDLIFPIILSIIINYLWYRGLPIYAGDQGIFIGNGVKPDYLINPVLYAFTNYPYGFVPSEGGTSWVNLIF LPFVPLGNLGEEVFSTILSAIGSIYLFKLSSRYYSLFPSILAAFLYLTNWFIFIGFIEMPYIFWNITFIYFFLPLIVYYS LLLGEGKTSFFKAYPIITVLTAYCLASSGEIFPIAWLGFVLLIGYYLRNKVIQFIIIVLSFTISQFYWIFSFASYIIPKL QNITNASTTLVLHLSSSPLYASVSSYLPSVTPVGINFIFLIIMSFISLLALLLNRHGDIKYLSLLWLIILGFDSISPWSP IEKFLVSHYAFFAVLRTTQFATAPFAGFLFSIIIPSLIKKYNMALLILLLILFSIFNLPILSGQLANRVDTPSYFLQAIN YLNHQQGDFTILVFPTVQYGWYSTTWYYGNNIYLYYSTHPILIGGIYSGAYFYYDYYKLNFLLYNLNISNRGEMTEIYNF LLLFNAKYIIIEGDAHSNISFISLLYLPVKPYIQNLNYLQKLGWVSLVKTYGPLYIYKVNLNSSYAYYTNISSLPLNENL SQILIPAKINWISPTEFEVPSYNSKYVLITFAYSPYWVSNFGKPGDASNFTVYYSGSKELIIHDALQGELIKDDIFGFLS IIIPVIISGIDIVIIKRKIFK
Sequences:
>Translated_661_residues MQSLNRLTKRIDLIFPIILSIIINYLWYRGLPIYAGDQGIFIGNGVKPDYLINPVLYAFTNYPYGFVPSEGGTSWVNLIF LPFVPLGNLGEEVFSTILSAIGSIYLFKLSSRYYSLFPSILAAFLYLTNWFIFIGFIEMPYIFWNITFIYFFLPLIVYYS LLLGEGKTSFFKAYPIITVLTAYCLASSGEIFPIAWLGFVLLIGYYLRNKVIQFIIIVLSFTISQFYWIFSFASYIIPKL QNITNASTTLVLHLSSSPLYASVSSYLPSVTPVGINFIFLIIMSFISLLALLLNRHGDIKYLSLLWLIILGFDSISPWSP IEKFLVSHYAFFAVLRTTQFATAPFAGFLFSIIIPSLIKKYNMALLILLLILFSIFNLPILSGQLANRVDTPSYFLQAIN YLNHQQGDFTILVFPTVQYGWYSTTWYYGNNIYLYYSTHPILIGGIYSGAYFYYDYYKLNFLLYNLNISNRGEMTEIYNF LLLFNAKYIIIEGDAHSNISFISLLYLPVKPYIQNLNYLQKLGWVSLVKTYGPLYIYKVNLNSSYAYYTNISSLPLNENL SQILIPAKINWISPTEFEVPSYNSKYVLITFAYSPYWVSNFGKPGDASNFTVYYSGSKELIIHDALQGELIKDDIFGFLS IIIPVIISGIDIVIIKRKIFK >Mature_661_residues MQSLNRLTKRIDLIFPIILSIIINYLWYRGLPIYAGDQGIFIGNGVKPDYLINPVLYAFTNYPYGFVPSEGGTSWVNLIF LPFVPLGNLGEEVFSTILSAIGSIYLFKLSSRYYSLFPSILAAFLYLTNWFIFIGFIEMPYIFWNITFIYFFLPLIVYYS LLLGEGKTSFFKAYPIITVLTAYCLASSGEIFPIAWLGFVLLIGYYLRNKVIQFIIIVLSFTISQFYWIFSFASYIIPKL QNITNASTTLVLHLSSSPLYASVSSYLPSVTPVGINFIFLIIMSFISLLALLLNRHGDIKYLSLLWLIILGFDSISPWSP IEKFLVSHYAFFAVLRTTQFATAPFAGFLFSIIIPSLIKKYNMALLILLLILFSIFNLPILSGQLANRVDTPSYFLQAIN YLNHQQGDFTILVFPTVQYGWYSTTWYYGNNIYLYYSTHPILIGGIYSGAYFYYDYYKLNFLLYNLNISNRGEMTEIYNF LLLFNAKYIIIEGDAHSNISFISLLYLPVKPYIQNLNYLQKLGWVSLVKTYGPLYIYKVNLNSSYAYYTNISSLPLNENL SQILIPAKINWISPTEFEVPSYNSKYVLITFAYSPYWVSNFGKPGDASNFTVYYSGSKELIIHDALQGELIKDDIFGFLS IIIPVIISGIDIVIIKRKIFK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 75835; Mature: 75835
Theoretical pI: Translated: 8.98; Mature: 8.98
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 0.8 %Met (Translated Protein) 0.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 0.8 %Met (Mature Protein) 0.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQSLNRLTKRIDLIFPIILSIIINYLWYRGLPIYAGDQGIFIGNGVKPDYLINPVLYAFT CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHC NYPYGFVPSEGGTSWVNLIFLPFVPLGNLGEEVFSTILSAIGSIYLFKLSSRYYSLFPSI CCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHH LAAFLYLTNWFIFIGFIEMPYIFWNITFIYFFLPLIVYYSLLLGEGKTSFFKAYPIITVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH TAYCLASSGEIFPIAWLGFVLLIGYYLRNKVIQFIIIVLSFTISQFYWIFSFASYIIPKL HHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QNITNASTTLVLHLSSSPLYASVSSYLPSVTPVGINFIFLIIMSFISLLALLLNRHGDIK HCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH YLSLLWLIILGFDSISPWSPIEKFLVSHYAFFAVLRTTQFATAPFAGFLFSIIIPSLIKK HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH YNMALLILLLILFSIFNLPILSGQLANRVDTPSYFLQAINYLNHQQGDFTILVFPTVQYG HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCC WYSTTWYYGNNIYLYYSTHPILIGGIYSGAYFYYDYYKLNFLLYNLNISNRGEMTEIYNF CEEEEEEECCEEEEEEECCCEEEEEEECCEEEEEEEEEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHH LLLFNAKYIIIEGDAHSNISFISLLYLPVKPYIQNLNYLQKLGWVSLVKTYGPLYIYKVN HHHHCCEEEEEECCCCCCCCEEHEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEE LNSSYAYYTNISSLPLNENLSQILIPAKINWISPTEFEVPSYNSKYVLITFAYSPYWVSN CCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCHHHCC FGKPGDASNFTVYYSGSKELIIHDALQGELIKDDIFGFLSIIIPVIISGIDIVIIKRKIF CCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHC K C >Mature Secondary Structure MQSLNRLTKRIDLIFPIILSIIINYLWYRGLPIYAGDQGIFIGNGVKPDYLINPVLYAFT CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHC NYPYGFVPSEGGTSWVNLIFLPFVPLGNLGEEVFSTILSAIGSIYLFKLSSRYYSLFPSI CCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHH LAAFLYLTNWFIFIGFIEMPYIFWNITFIYFFLPLIVYYSLLLGEGKTSFFKAYPIITVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH TAYCLASSGEIFPIAWLGFVLLIGYYLRNKVIQFIIIVLSFTISQFYWIFSFASYIIPKL HHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QNITNASTTLVLHLSSSPLYASVSSYLPSVTPVGINFIFLIIMSFISLLALLLNRHGDIK HCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH YLSLLWLIILGFDSISPWSPIEKFLVSHYAFFAVLRTTQFATAPFAGFLFSIIIPSLIKK HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH YNMALLILLLILFSIFNLPILSGQLANRVDTPSYFLQAINYLNHQQGDFTILVFPTVQYG HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCC WYSTTWYYGNNIYLYYSTHPILIGGIYSGAYFYYDYYKLNFLLYNLNISNRGEMTEIYNF CEEEEEEECCEEEEEEECCCEEEEEEECCEEEEEEEEEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHH LLLFNAKYIIIEGDAHSNISFISLLYLPVKPYIQNLNYLQKLGWVSLVKTYGPLYIYKVN HHHHCCEEEEEECCCCCCCCEEHEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEE LNSSYAYYTNISSLPLNENLSQILIPAKINWISPTEFEVPSYNSKYVLITFAYSPYWVSN CCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCHHHCC FGKPGDASNFTVYYSGSKELIIHDALQGELIKDDIFGFLSIIIPVIISGIDIVIIKRKIF CCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHC K C
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA