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The map label for this gene is yodF [H]

Identifier: 15920855

GI number: 15920855

Start: 619155

End: 620729

Strand: Direct

Name: yodF [H]

Synonym: ST0635

Alternate gene names: 15920855

Gene position: 619155-620729 (Clockwise)

Preceding gene: 15920852

Following gene: 15920858

Centisome position: 22.98

GC content: 36.44

Gene sequence:

>1575_bases
ATGAACAATTATAATTTAAATGTAGATTATGTAACTGTCACTGTATTTTTGATACTTTTTGCTATCTTTACATTCTTAGG
ATTTTACGGAGCTAAATGGAGAAAGGGAGACTTAAATAAGCTTGATGAGTGGGGACTTGGAGGAAGAAGACTAGGGTGGC
TACTGGTATGGTTTTTATTGGGGGCGGACTTATTTACAGCTTATACATTTATTGCTGTTCCTTCAGCATTCTTTGCTACT
GGTTCATTATACTTCTTTGCTGTTCCTTATGTAGCCTGGGGATTTGGGGTAGCAATGCTAACGATGCCTAAGCTTTGGAC
AGTAGCTAGAAATAAAGGTTATGTGACTGCTGCAGATTATGTAAAAGATAGATTCAACAGTAAAGGATTAGCAATTGCTG
TAGCAATAACTGGTGCTATAGCGGAATTACCTTATATTGCATTACAAATTATAGGAATGCAAGCAGTTATTGCCATACTC
TTTATAGGACTAGGAATTACAAGTACAAAATTGAGTAGTGATCTAGCATTATTAGTAGCATTTATAATACTAGCCGCATT
TACCTTTGTTAGTGGTTTAAGAGGTGCAGCGCTAAGCGGAGTTTATAAGGACATACTAGTTTGGATTACAGTGTTAACTA
CAATTGGAGTAGTATTGGCTCATTATGGTAATTTCCAAGGAGCGTTAGCTATAGCTCATCAAGTATCACCCAAAGTAGAT
TTCCTTGATTTACCACCTAAACTCTTCTTAGCTTATTGGAGCTTAGCACTAGGAAGCACATTTGCCCTATATTTATATCC
ACATGCTATAAACGGTTCGTTATCTGCTGAAAGTAGAGAAAGATTAAAAATAGGTACGGCATTACTACCTTTATACGGAA
TAGGGTTAGCATTAATTACGTTGTTTGGATTATTAATCTTCTTAGTACCAAACGCATTAAAAGTTGTATTAACTACTAAA
AATGGTGCGTTAACAGTTCCTTCCCTAATTGCAGCTACAACTCCTGACTGGTTTACTGGTTTAGCATTTACAGCAATATT
TATTGGTGGTCTAGTCCCTGCGGCTATTATGGCTATAGGCGTAGCAAACTTATTGACAAGAAATGTAATTGGCGAGTTTA
CTAAACTTTCGCCAACAAATGAGGCTAGGCTTGCTAAGATACTATCAACAGTATTTAAGTTTATAGCGTTAGCTTTCGTA
TTTATTGTTCCAGCAACATATGCTATACAACTTCAACTATTAGGCGGCATAATTGTGACTCAAACACTACCAGCAGTATT
CCTTTCCCTATTCACTGATAAACTTGAGAAAAACTCTACTTTAGGTGGCTGGGCAGCAGGTGTAATAAGCGGTGTAGGGT
TAGTGGTTTACGTTAACTTGATCTTGGAGCATTACGGTTCACTAAAAACCTCATTATTTACTACGCCATTAGGTCCTATA
TATATTGCTTTGATAGCTTTAGGAATTAACTTACTCGTAACGTTAATCGGTTCCTTGGTTGCATATGCTAAAGGTTGGAG
ACCTTATAGGAAAATAAGTGAAAAAGACTTTGAAGTAAAAGAAGTTGCAAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTGGAGGACTTCCCTTCTTTTATGTATACCAAATAATAATGCTGGCTGTGACTACGATAATCTATTTAATAGTAGCAT
TCATAAAGGGGTGATAGAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACAAAGGAATAAAATATTTTTCTTTTTGTTTCTTTTTACATATTATTAAAAATATCAAATAAAATTATGTCTTCAAGCAT
CATCGTTTCTATTAAAGATA

Product: hypothetical protein

Products: Na (I) [Cytoplasm]; pantothenate [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 524; Mature: 524

Protein sequence:

>524_residues
MNNYNLNVDYVTVTVFLILFAIFTFLGFYGAKWRKGDLNKLDEWGLGGRRLGWLLVWFLLGADLFTAYTFIAVPSAFFAT
GSLYFFAVPYVAWGFGVAMLTMPKLWTVARNKGYVTAADYVKDRFNSKGLAIAVAITGAIAELPYIALQIIGMQAVIAIL
FIGLGITSTKLSSDLALLVAFIILAAFTFVSGLRGAALSGVYKDILVWITVLTTIGVVLAHYGNFQGALAIAHQVSPKVD
FLDLPPKLFLAYWSLALGSTFALYLYPHAINGSLSAESRERLKIGTALLPLYGIGLALITLFGLLIFLVPNALKVVLTTK
NGALTVPSLIAATTPDWFTGLAFTAIFIGGLVPAAIMAIGVANLLTRNVIGEFTKLSPTNEARLAKILSTVFKFIALAFV
FIVPATYAIQLQLLGGIIVTQTLPAVFLSLFTDKLEKNSTLGGWAAGVISGVGLVVYVNLILEHYGSLKTSLFTTPLGPI
YIALIALGINLLVTLIGSLVAYAKGWRPYRKISEKDFEVKEVAK

Sequences:

>Translated_524_residues
MNNYNLNVDYVTVTVFLILFAIFTFLGFYGAKWRKGDLNKLDEWGLGGRRLGWLLVWFLLGADLFTAYTFIAVPSAFFAT
GSLYFFAVPYVAWGFGVAMLTMPKLWTVARNKGYVTAADYVKDRFNSKGLAIAVAITGAIAELPYIALQIIGMQAVIAIL
FIGLGITSTKLSSDLALLVAFIILAAFTFVSGLRGAALSGVYKDILVWITVLTTIGVVLAHYGNFQGALAIAHQVSPKVD
FLDLPPKLFLAYWSLALGSTFALYLYPHAINGSLSAESRERLKIGTALLPLYGIGLALITLFGLLIFLVPNALKVVLTTK
NGALTVPSLIAATTPDWFTGLAFTAIFIGGLVPAAIMAIGVANLLTRNVIGEFTKLSPTNEARLAKILSTVFKFIALAFV
FIVPATYAIQLQLLGGIIVTQTLPAVFLSLFTDKLEKNSTLGGWAAGVISGVGLVVYVNLILEHYGSLKTSLFTTPLGPI
YIALIALGINLLVTLIGSLVAYAKGWRPYRKISEKDFEVKEVAK
>Mature_524_residues
MNNYNLNVDYVTVTVFLILFAIFTFLGFYGAKWRKGDLNKLDEWGLGGRRLGWLLVWFLLGADLFTAYTFIAVPSAFFAT
GSLYFFAVPYVAWGFGVAMLTMPKLWTVARNKGYVTAADYVKDRFNSKGLAIAVAITGAIAELPYIALQIIGMQAVIAIL
FIGLGITSTKLSSDLALLVAFIILAAFTFVSGLRGAALSGVYKDILVWITVLTTIGVVLAHYGNFQGALAIAHQVSPKVD
FLDLPPKLFLAYWSLALGSTFALYLYPHAINGSLSAESRERLKIGTALLPLYGIGLALITLFGLLIFLVPNALKVVLTTK
NGALTVPSLIAATTPDWFTGLAFTAIFIGGLVPAAIMAIGVANLLTRNVIGEFTKLSPTNEARLAKILSTVFKFIALAFV
FIVPATYAIQLQLLGGIIVTQTLPAVFLSLFTDKLEKNSTLGGWAAGVISGVGLVVYVNLILEHYGSLKTSLFTTPLGPI
YIALIALGINLLVTLIGSLVAYAKGWRPYRKISEKDFEVKEVAK

Specific function: Catalyzes The Sodium-Dependent Uptake Of Extracellular Pantothenate. [C]

COG id: COG0591

COG function: function code ER; Na+/proline symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:solute symporter (SSF) (TC 2.A.21) family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001734 [H]

Pfam domain/function: PF00474 SSF [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56528; Mature: 56528

Theoretical pI: Translated: 9.96; Mature: 9.96

Prosite motif: PS50283 NA_SOLUT_SYMP_3

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.0 %Met     (Translated Protein)
1.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
1.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCHHHHCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Na (I) [Periplasm]; pantothenate [Periplasm] [C]

Specific reaction: Na (I) [Periplasm] + pantothenate [Periplasm] = Na (I) [Cytoplasm] + pantothenate [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9734814; 9384377 [H]