| Definition | Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002942 |
| Length | 3,397,754 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 52842457
Identifier: 52842457
GI number: 52842457
Start: 2542341
End: 2545283
Strand: Direct
Name: 52842457
Synonym: lpg2244
Alternate gene names: NA
Gene position: 2542341-2545283 (Clockwise)
Preceding gene: 52842456
Following gene: 52842460
Centisome position: 74.82
GC content: 35.85
Gene sequence:
>2943_bases TTGCATAAAGTCATATCTAATCACTCTACGAGGGAGCGAAGAATGTTAGAACTGAACGACAAAGAAACTGCAGTCATTAA GGCTATTCATCATAACCATAAGAAGCGACTTGAAAGCCAAATGATAACCCGTTTTGGGGTATATTTTGAGCAATCAAAAC ATCCTGAAAAATTATATTCCTGGATAGAAAAAATTGAAGACACGCGCCTCTTAGCTAATCACTATCTCGACACTATCGCT CTAAGCCGAGCTCCAAGCACAATATCTTCATTGGAAAAGGAAACAGCAGGTTCTTCCTACTACATTGAAAAGGCAAAACT GCTTATCCCGGAATCTATAAGAAATTTTCTTTCTGATATCAATTCTTCCAATGACAATACCTTATTCAATTTTGTAGCCG CCGAGGTCTTTTCTCTCGCTTTAGGCAAATCAATTACCGACCTGTTATTCGATTACTTCAATAATGAATTTTTAGGGGCG CCAGAGAATGTACAAAAAGAATTTAATGAAACCCTGGAAAAACAAACTGAATTATCCAATTTGATAAAAAAAGAATGTGA GCGCATCTCCATAGAAATTATCAAATTATTTCATTTCAGAGAAATGTTGCTGCTTGGGAAAATAAGCAAATCACCAATCG AACCCAATTCCAGAGAGGAATTCATTGCCAAAGCAAAAATTGCCAACCAATCTGGCGAATCTGTTCATTTGGCTATAGAA ATCTATTTTGCACGTGAATTAAGTCGTATTTTTAACTCAGGTTTTAAATCACTTTATCAAGTCCACGATGTGGAAATTCA AAGTGAACATCAATCGCCTCTGGTCAAGTGGATCAATCAAATGTCAGAGTCTGAACAGGTTCGATTGGCCTTTACTCAGG AAATCCAGTTGAAATTCATGCTTCTGGCAAAAGATTTTTTACTGGAAAAAATGAATCAGAAAGGGATACTCGCAAGATAC CCTATCATTTTTTCACTCTTTGCAGGAGTCATTATTGCTCCAATAGTCGGTGTGACTATGATTATTATGACTGGCGGTAC TTTTCTATGGGCGATAGGTGCTCTAGCTGTCCTGGTTTTTGCTCTCTCTTGCATAGCAACGCACCTCCTGATCAATAAAC TCAGCGTATTAACTTACCAACGTTCTTCGGATAATAGAGCTCATATTCAGCAATCTATCGACATGATAAATGGAGAGTTT TTACGTTTGAAAAAAGAAAGTTTATTAAAAAAAGAAACAACCAGTGAGGTTATTGAAAATACAAGAGATTTTCAAAAAAT CAACCAGAATTTTCATTTAGTCACGATTGGTAAAAAGGTAGCCAGAGGCTCAGTATCTGGATGGTTAAGAGAATACGCTT CTCGGTATAGGCACAGTAAAGCCATCGAAATTGATTTGGGGGATGAATACAAAGAATTAATTACTCAAAGCAGGATACAA ACTCAAGAACTCATTCATTCGATTAACAAGAAAAACTCCAAGTTATTGATTAAGTGGATTCACGATACCATGACTTATTT GCAGGATGAAAAAAATCAATCTGTGATTGAAGAATTTGAATTAATCCCCAAAATGAAAGAGCAAGTCCTTGAGATTGTCT GTCAACTCAATTACATCCCCCCTATGTTATTGAAATTCTATTCTAACTCCAGAGAGAAAGGTGGCCTGGGAGGTAATGAA TCTGATTTTTCTCATATAAAACGTTTGACCCCCATTGATGCGCCAGATAAACCCAGGCATAATCCCTATAATTATCTCTG CGATACAGCTCTGAATCTGTTTAAAAAATATGAGCCTTTATATACTTCGACTTGTATTTTTTTAGGAGACCCGGAATATC GACAAATGTTAGGTATCGCCAGAAGAGATGCCGGGGAGCCTCTAACAGCGGAAAACATCAATCGTTATCTTGATAACTCC TATGCCTTTTTATTATCGCTTTGCCATAAAATCAAACCTGGATTAGGCTTGGATCCCTTACAACAATCAGCGCGTGTCAC TGATGAATTCGTTCTCTACAGAATGCTGTTGTTAAAACAGCTGGCAGCAATTTCCGAATCTGATAGCAAAGAAATAAGCA ATGAAATCAAATTTAAGATTAGGCTTTTTATTCAAAAATACTTTAATCAGGATACCAAAATCATTTTTGATGATCTTGAA AACCAAATGTTTTTGCTAAACAAGGAAGCCCCCAACTCCCGTATCTATAAAAACAGCGATCATTTTGAGGTAATTGATAC GGAATTGGATAACATTTTTCAAGCCATCACTCTTGATATGGCTTATAACTCCAATAATTTCAGATTCATTGATATTCTTG ACTACTTCATTAATAAATTTATTAAAGAATACGACTCCCAGTCCGCAACAGTATTTGCTTATGGAAAAGCAGAACAGGAA ATCAACCCTCAAGGCACAAAATACTATCTCAAAACTCTTGCTCAATACTGTAACAATACGACCGAATTTTTAAAAAGCGC TCAAACCAATACAACATTAACGGCCACAAATCTCCTTGATTGCTATCGATACAACATCAGTTTGCAAGTTTGTAGAACGC AAATTCGGATTATCTGTAGCATAAAGGAAATCAATAAATTAAAAATAACAAATGAGACTACTGAACAAATAACCCTTCTA CTCAAATCCTTTCAACAACTTGCAGAGTTCGCAAAAATCCATTGTTTCTTGTTAAAGACTGACTCTTCTTGTTATCGATT ATTTAAACTGATTGAAAACAAAGCAATGCAATCTACTTTATCCAGAGATTGGATAAGACAGCTCGATGCAAAAGAAGCGC TCGTTTACATGATGGATGATCTGCCTAATCAGTTAAGACTTTCTACAGATTACAACGTTTCAAATTTATTTTTTAGTTCG ACAAAGCAAAATAAAAGAGAAAAAATGGAACCCTTGGAAGAACATATAGTGAAACCAACCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CGGGAACAACAGATGTGATGTATCAAGATTCTAAAGAATTTTGGCAGGGAAATGCCAGGAAACAAGCAACAGCAAATATA GTCTCTTGGCATAGCCCTTA
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTAATTTAGAGGTATTATTGGTAAATAAAAACTCGGTATTTTGGAGCCTGGATGGCTAATACAAGGACATCCAGGTTTT TCTATAAGCTTGATTTTTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 980; Mature: 980
Protein sequence:
>980_residues MHKVISNHSTRERRMLELNDKETAVIKAIHHNHKKRLESQMITRFGVYFEQSKHPEKLYSWIEKIEDTRLLANHYLDTIA LSRAPSTISSLEKETAGSSYYIEKAKLLIPESIRNFLSDINSSNDNTLFNFVAAEVFSLALGKSITDLLFDYFNNEFLGA PENVQKEFNETLEKQTELSNLIKKECERISIEIIKLFHFREMLLLGKISKSPIEPNSREEFIAKAKIANQSGESVHLAIE IYFARELSRIFNSGFKSLYQVHDVEIQSEHQSPLVKWINQMSESEQVRLAFTQEIQLKFMLLAKDFLLEKMNQKGILARY PIIFSLFAGVIIAPIVGVTMIIMTGGTFLWAIGALAVLVFALSCIATHLLINKLSVLTYQRSSDNRAHIQQSIDMINGEF LRLKKESLLKKETTSEVIENTRDFQKINQNFHLVTIGKKVARGSVSGWLREYASRYRHSKAIEIDLGDEYKELITQSRIQ TQELIHSINKKNSKLLIKWIHDTMTYLQDEKNQSVIEEFELIPKMKEQVLEIVCQLNYIPPMLLKFYSNSREKGGLGGNE SDFSHIKRLTPIDAPDKPRHNPYNYLCDTALNLFKKYEPLYTSTCIFLGDPEYRQMLGIARRDAGEPLTAENINRYLDNS YAFLLSLCHKIKPGLGLDPLQQSARVTDEFVLYRMLLLKQLAAISESDSKEISNEIKFKIRLFIQKYFNQDTKIIFDDLE NQMFLLNKEAPNSRIYKNSDHFEVIDTELDNIFQAITLDMAYNSNNFRFIDILDYFINKFIKEYDSQSATVFAYGKAEQE INPQGTKYYLKTLAQYCNNTTEFLKSAQTNTTLTATNLLDCYRYNISLQVCRTQIRIICSIKEINKLKITNETTEQITLL LKSFQQLAEFAKIHCFLLKTDSSCYRLFKLIENKAMQSTLSRDWIRQLDAKEALVYMMDDLPNQLRLSTDYNVSNLFFSS TKQNKREKMEPLEEHIVKPT
Sequences:
>Translated_980_residues MHKVISNHSTRERRMLELNDKETAVIKAIHHNHKKRLESQMITRFGVYFEQSKHPEKLYSWIEKIEDTRLLANHYLDTIA LSRAPSTISSLEKETAGSSYYIEKAKLLIPESIRNFLSDINSSNDNTLFNFVAAEVFSLALGKSITDLLFDYFNNEFLGA PENVQKEFNETLEKQTELSNLIKKECERISIEIIKLFHFREMLLLGKISKSPIEPNSREEFIAKAKIANQSGESVHLAIE IYFARELSRIFNSGFKSLYQVHDVEIQSEHQSPLVKWINQMSESEQVRLAFTQEIQLKFMLLAKDFLLEKMNQKGILARY PIIFSLFAGVIIAPIVGVTMIIMTGGTFLWAIGALAVLVFALSCIATHLLINKLSVLTYQRSSDNRAHIQQSIDMINGEF LRLKKESLLKKETTSEVIENTRDFQKINQNFHLVTIGKKVARGSVSGWLREYASRYRHSKAIEIDLGDEYKELITQSRIQ TQELIHSINKKNSKLLIKWIHDTMTYLQDEKNQSVIEEFELIPKMKEQVLEIVCQLNYIPPMLLKFYSNSREKGGLGGNE SDFSHIKRLTPIDAPDKPRHNPYNYLCDTALNLFKKYEPLYTSTCIFLGDPEYRQMLGIARRDAGEPLTAENINRYLDNS YAFLLSLCHKIKPGLGLDPLQQSARVTDEFVLYRMLLLKQLAAISESDSKEISNEIKFKIRLFIQKYFNQDTKIIFDDLE NQMFLLNKEAPNSRIYKNSDHFEVIDTELDNIFQAITLDMAYNSNNFRFIDILDYFINKFIKEYDSQSATVFAYGKAEQE INPQGTKYYLKTLAQYCNNTTEFLKSAQTNTTLTATNLLDCYRYNISLQVCRTQIRIICSIKEINKLKITNETTEQITLL LKSFQQLAEFAKIHCFLLKTDSSCYRLFKLIENKAMQSTLSRDWIRQLDAKEALVYMMDDLPNQLRLSTDYNVSNLFFSS TKQNKREKMEPLEEHIVKPT >Mature_980_residues MHKVISNHSTRERRMLELNDKETAVIKAIHHNHKKRLESQMITRFGVYFEQSKHPEKLYSWIEKIEDTRLLANHYLDTIA LSRAPSTISSLEKETAGSSYYIEKAKLLIPESIRNFLSDINSSNDNTLFNFVAAEVFSLALGKSITDLLFDYFNNEFLGA PENVQKEFNETLEKQTELSNLIKKECERISIEIIKLFHFREMLLLGKISKSPIEPNSREEFIAKAKIANQSGESVHLAIE IYFARELSRIFNSGFKSLYQVHDVEIQSEHQSPLVKWINQMSESEQVRLAFTQEIQLKFMLLAKDFLLEKMNQKGILARY PIIFSLFAGVIIAPIVGVTMIIMTGGTFLWAIGALAVLVFALSCIATHLLINKLSVLTYQRSSDNRAHIQQSIDMINGEF LRLKKESLLKKETTSEVIENTRDFQKINQNFHLVTIGKKVARGSVSGWLREYASRYRHSKAIEIDLGDEYKELITQSRIQ TQELIHSINKKNSKLLIKWIHDTMTYLQDEKNQSVIEEFELIPKMKEQVLEIVCQLNYIPPMLLKFYSNSREKGGLGGNE SDFSHIKRLTPIDAPDKPRHNPYNYLCDTALNLFKKYEPLYTSTCIFLGDPEYRQMLGIARRDAGEPLTAENINRYLDNS YAFLLSLCHKIKPGLGLDPLQQSARVTDEFVLYRMLLLKQLAAISESDSKEISNEIKFKIRLFIQKYFNQDTKIIFDDLE NQMFLLNKEAPNSRIYKNSDHFEVIDTELDNIFQAITLDMAYNSNNFRFIDILDYFINKFIKEYDSQSATVFAYGKAEQE INPQGTKYYLKTLAQYCNNTTEFLKSAQTNTTLTATNLLDCYRYNISLQVCRTQIRIICSIKEINKLKITNETTEQITLL LKSFQQLAEFAKIHCFLLKTDSSCYRLFKLIENKAMQSTLSRDWIRQLDAKEALVYMMDDLPNQLRLSTDYNVSNLFFSS TKQNKREKMEPLEEHIVKPT
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 113661; Mature: 113661
Theoretical pI: Translated: 7.76; Mature: 7.76
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MHKVISNHSTRERRMLELNDKETAVIKAIHHNHKKRLESQMITRFGVYFEQSKHPEKLYS CCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH WIEKIEDTRLLANHYLDTIALSRAPSTISSLEKETAGSSYYIEKAKLLIPESIRNFLSDI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHCHHHHHHHHHHC NSSNDNTLFNFVAAEVFSLALGKSITDLLFDYFNNEFLGAPENVQKEFNETLEKQTELSN CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIKKECERISIEIIKLFHFREMLLLGKISKSPIEPNSREEFIAKAKIANQSGESVHLAIE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEE IYFARELSRIFNSGFKSLYQVHDVEIQSEHQSPLVKWINQMSESEQVRLAFTQEIQLKFM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHH LLAKDFLLEKMNQKGILARYPIIFSLFAGVIIAPIVGVTMIIMTGGTFLWAIGALAVLVF HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH ALSCIATHLLINKLSVLTYQRSSDNRAHIQQSIDMINGEFLRLKKESLLKKETTSEVIEN HHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TRDFQKINQNFHLVTIGKKVARGSVSGWLREYASRYRHSKAIEIDLGDEYKELITQSRIQ HHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHH TQELIHSINKKNSKLLIKWIHDTMTYLQDEKNQSVIEEFELIPKMKEQVLEIVCQLNYIP HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH PMLLKFYSNSREKGGLGGNESDFSHIKRLTPIDAPDKPRHNPYNYLCDTALNLFKKYEPL HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC YTSTCIFLGDPEYRQMLGIARRDAGEPLTAENINRYLDNSYAFLLSLCHKIKPGLGLDPL HHCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH QQSARVTDEFVLYRMLLLKQLAAISESDSKEISNEIKFKIRLFIQKYFNQDTKIIFDDLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHCCCC NQMFLLNKEAPNSRIYKNSDHFEVIDTELDNIFQAITLDMAYNSNNFRFIDILDYFINKF CCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEHHHHHHHHHHH IKEYDSQSATVFAYGKAEQEINPQGTKYYLKTLAQYCNNTTEFLKSAQTNTTLTATNLLD HHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHH CYRYNISLQVCRTQIRIICSIKEINKLKITNETTEQITLLLKSFQQLAEFAKIHCFLLKT HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEC DSSCYRLFKLIENKAMQSTLSRDWIRQLDAKEALVYMMDDLPNQLRLSTDYNVSNLFFSS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCHHHHEECC TKQNKREKMEPLEEHIVKPT HHHHHHHHHCHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MHKVISNHSTRERRMLELNDKETAVIKAIHHNHKKRLESQMITRFGVYFEQSKHPEKLYS CCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH WIEKIEDTRLLANHYLDTIALSRAPSTISSLEKETAGSSYYIEKAKLLIPESIRNFLSDI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHCHHHHHHHHHHC NSSNDNTLFNFVAAEVFSLALGKSITDLLFDYFNNEFLGAPENVQKEFNETLEKQTELSN CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIKKECERISIEIIKLFHFREMLLLGKISKSPIEPNSREEFIAKAKIANQSGESVHLAIE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEE IYFARELSRIFNSGFKSLYQVHDVEIQSEHQSPLVKWINQMSESEQVRLAFTQEIQLKFM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHH LLAKDFLLEKMNQKGILARYPIIFSLFAGVIIAPIVGVTMIIMTGGTFLWAIGALAVLVF HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH ALSCIATHLLINKLSVLTYQRSSDNRAHIQQSIDMINGEFLRLKKESLLKKETTSEVIEN HHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TRDFQKINQNFHLVTIGKKVARGSVSGWLREYASRYRHSKAIEIDLGDEYKELITQSRIQ HHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHH TQELIHSINKKNSKLLIKWIHDTMTYLQDEKNQSVIEEFELIPKMKEQVLEIVCQLNYIP HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH PMLLKFYSNSREKGGLGGNESDFSHIKRLTPIDAPDKPRHNPYNYLCDTALNLFKKYEPL HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC YTSTCIFLGDPEYRQMLGIARRDAGEPLTAENINRYLDNSYAFLLSLCHKIKPGLGLDPL HHCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH QQSARVTDEFVLYRMLLLKQLAAISESDSKEISNEIKFKIRLFIQKYFNQDTKIIFDDLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHCCCC NQMFLLNKEAPNSRIYKNSDHFEVIDTELDNIFQAITLDMAYNSNNFRFIDILDYFINKF CCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEHHHHHHHHHHH IKEYDSQSATVFAYGKAEQEINPQGTKYYLKTLAQYCNNTTEFLKSAQTNTTLTATNLLD HHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHH CYRYNISLQVCRTQIRIICSIKEINKLKITNETTEQITLLLKSFQQLAEFAKIHCFLLKT HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEC DSSCYRLFKLIENKAMQSTLSRDWIRQLDAKEALVYMMDDLPNQLRLSTDYNVSNLFFSS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCHHHHEECC TKQNKREKMEPLEEHIVKPT HHHHHHHHHCHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA