Definition Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 chromosome, complete genome.
Accession NC_002942
Length 3,397,754

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yejM [H]

Identifier: 52841539

GI number: 52841539

Start: 1437841

End: 1439760

Strand: Direct

Name: yejM [H]

Synonym: lpg1308

Alternate gene names: 52841539

Gene position: 1437841-1439760 (Clockwise)

Preceding gene: 52841538

Following gene: 52841540

Centisome position: 42.32

GC content: 33.8

Gene sequence:

>1920_bases
TTGGTAATGAATATAAAAACATATCTAAGAAAAAATAATTTAACCTTACGATTTGTTGGATGGTTCTTTTTAATAAACTC
ATTCATATTTTGGCTTGTTGGCTTGGGGTATTTAAAGTCCATTTTATTAAATGCCTCCCTGTTTAAAAATTATATCGCTG
ATTATTCAAGCCTATCAGGAAAAATTCTCATTCTGGTTTTCTCAGTTTTAAATTATTTTACTTATATGATGTTTTTAGCT
TTTGTCCCTGCAATACCAATCATAATAATGGCATTTTTTTTACCTTATAAACGAATAATTTGGATTATCAGTGTTGTTGC
GGCTGCCACAAGTCTTATTTTTTTATTTGTTGATAGTCAAGTTTTTTCAATGTTTAAGTTTCATCTTAATAAAACAATAT
TATCGTTTATTTTTAATTCAGATTGGAGTGTCATTTTCACTTTTTCCAGATATGAACTGATTTTGTCTTTTTTTATGATT
GTCTTTATACTCTTTCTGGAGTCTATTGTTGCCTGGTTGGTATGGAAAAAAATAGTTTTAAAAGAACGTTTGAAAATTGG
TAAAACTATTTCATTATTTTGGCTTGGTGGGGCATTAATAAGTTATTTTATATTGCTCTTATCGATAGCTCAAAATAATA
ATTTATTTGCTCAGCAAATACCTAATTTGCCCCTTTATAATCAACTCATTGCTTATACTATCCCTGATAAAAACGCGGAT
GATATATTACGCCGCTACAGTGAGCACCATTTTACACAGCCTCTTTTCCCCAATTATCCATTGCATTATCCCTTACATCC
CATGCAATGTAAGATGCCTGAAAAACCTTATAACATTATCCTTATAATGGTAGATTCACTTCGCTATGATTCCCTAAGGG
CAAAATATATGCCGAATACGGCACAATTTGCAAAAAGAAGTTGGCAATTTTCTCAGCATATGAGTGCTGGAAATGCCACA
CAACCAGGATTGTTTTCTTTATTTTATTCGATTCCCAGTAATTACTCGACGGCAGTCCTGGAGCAAAAAAAATCACCAGT
TTTAATTGATTTATTATTACAACATGGTTTTCAGACAAAAATTATTTGGTCTGGCTCTATGGCTCCACTGCCATTAGATC
AGACTATTTATAAAAAAATTGCCAATCTCAATACCAATGGAGCGCCAATAGACGATACCGGAGACAAGGACAGATATTCC
ACCAAGGAAGCTATCCAATTTTTAACAGATCCTAAAACAAATAACCCATTCTTTCTTCACATTTTTTACAATGCGCCACA
TGACTATTGTAGATATCAAAGTTTTCCGCAGTTATACAAACCCGCAATAGAAGAATGTGTACGAATTGGAATGACAAATC
ATGTTGATCCAGTACCTTACTACAATCGTTATTTGAATGCAGTCACATTTATTGACCAGGAAATTTCGAAAGTATTAGGG
GTTATCGAAAAAAAAGGTTATTTAAAAAACAGCATCATTATAATTACCTCTGATCATGGCCAAGAATTTAATGATAATCG
TCAAAATTATTGGGGACATACCAGTAATTTTACCCCTATTCAACTACACGTTCCCTTGATTATTCATTGGCCAGGGGAGT
TAGCTCGTCGTTTTAATTATCTCACCAGCAGCTATGATATTGTACCTACAATATTACAGCGTTTATTTGCTTGCAAAAAT
CCTGTTTCTGACTACAGCATCGGGTATAACTTGCTAATTGAGGGCAATCGAGCCTCATTTCTATTGGTAGGAAGTTATAT
TAATATGGGAATTTTTGAAGCAGATCGAGCCACAGCATTAGAAACCTCCGGAAGAATTACAATTACTGGTATGAAGGCAG
AGCCTCTTGACGATGCGGTACCCAGAGTGGATGTTATTACCCAGGCATTGGATTTGATGCGCAAGTATTATGGGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATTACCTTTTCAGAAATTTTAAATCAGGTATATTGGCTACATTAATTGCTGTTTATTGACTGGATTGTTCATTAAGATA
AATTCGAAATTACATTTGAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGATTGTCTTTAAAAATAAATTGGCAATTAACCTTTTTATTCTCAATTTAGGCCATACAGCGGATATCTTTAAATTTCT
AGGCAAAAATATGGCTATAA

Product: sulfatase domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 639; Mature: 639

Protein sequence:

>639_residues
MVMNIKTYLRKNNLTLRFVGWFFLINSFIFWLVGLGYLKSILLNASLFKNYIADYSSLSGKILILVFSVLNYFTYMMFLA
FVPAIPIIIMAFFLPYKRIIWIISVVAAATSLIFLFVDSQVFSMFKFHLNKTILSFIFNSDWSVIFTFSRYELILSFFMI
VFILFLESIVAWLVWKKIVLKERLKIGKTISLFWLGGALISYFILLLSIAQNNNLFAQQIPNLPLYNQLIAYTIPDKNAD
DILRRYSEHHFTQPLFPNYPLHYPLHPMQCKMPEKPYNIILIMVDSLRYDSLRAKYMPNTAQFAKRSWQFSQHMSAGNAT
QPGLFSLFYSIPSNYSTAVLEQKKSPVLIDLLLQHGFQTKIIWSGSMAPLPLDQTIYKKIANLNTNGAPIDDTGDKDRYS
TKEAIQFLTDPKTNNPFFLHIFYNAPHDYCRYQSFPQLYKPAIEECVRIGMTNHVDPVPYYNRYLNAVTFIDQEISKVLG
VIEKKGYLKNSIIIITSDHGQEFNDNRQNYWGHTSNFTPIQLHVPLIIHWPGELARRFNYLTSSYDIVPTILQRLFACKN
PVSDYSIGYNLLIEGNRASFLLVGSYINMGIFEADRATALETSGRITITGMKAEPLDDAVPRVDVITQALDLMRKYYGK

Sequences:

>Translated_639_residues
MVMNIKTYLRKNNLTLRFVGWFFLINSFIFWLVGLGYLKSILLNASLFKNYIADYSSLSGKILILVFSVLNYFTYMMFLA
FVPAIPIIIMAFFLPYKRIIWIISVVAAATSLIFLFVDSQVFSMFKFHLNKTILSFIFNSDWSVIFTFSRYELILSFFMI
VFILFLESIVAWLVWKKIVLKERLKIGKTISLFWLGGALISYFILLLSIAQNNNLFAQQIPNLPLYNQLIAYTIPDKNAD
DILRRYSEHHFTQPLFPNYPLHYPLHPMQCKMPEKPYNIILIMVDSLRYDSLRAKYMPNTAQFAKRSWQFSQHMSAGNAT
QPGLFSLFYSIPSNYSTAVLEQKKSPVLIDLLLQHGFQTKIIWSGSMAPLPLDQTIYKKIANLNTNGAPIDDTGDKDRYS
TKEAIQFLTDPKTNNPFFLHIFYNAPHDYCRYQSFPQLYKPAIEECVRIGMTNHVDPVPYYNRYLNAVTFIDQEISKVLG
VIEKKGYLKNSIIIITSDHGQEFNDNRQNYWGHTSNFTPIQLHVPLIIHWPGELARRFNYLTSSYDIVPTILQRLFACKN
PVSDYSIGYNLLIEGNRASFLLVGSYINMGIFEADRATALETSGRITITGMKAEPLDDAVPRVDVITQALDLMRKYYGK
>Mature_639_residues
MVMNIKTYLRKNNLTLRFVGWFFLINSFIFWLVGLGYLKSILLNASLFKNYIADYSSLSGKILILVFSVLNYFTYMMFLA
FVPAIPIIIMAFFLPYKRIIWIISVVAAATSLIFLFVDSQVFSMFKFHLNKTILSFIFNSDWSVIFTFSRYELILSFFMI
VFILFLESIVAWLVWKKIVLKERLKIGKTISLFWLGGALISYFILLLSIAQNNNLFAQQIPNLPLYNQLIAYTIPDKNAD
DILRRYSEHHFTQPLFPNYPLHYPLHPMQCKMPEKPYNIILIMVDSLRYDSLRAKYMPNTAQFAKRSWQFSQHMSAGNAT
QPGLFSLFYSIPSNYSTAVLEQKKSPVLIDLLLQHGFQTKIIWSGSMAPLPLDQTIYKKIANLNTNGAPIDDTGDKDRYS
TKEAIQFLTDPKTNNPFFLHIFYNAPHDYCRYQSFPQLYKPAIEECVRIGMTNHVDPVPYYNRYLNAVTFIDQEISKVLG
VIEKKGYLKNSIIIITSDHGQEFNDNRQNYWGHTSNFTPIQLHVPLIIHWPGELARRFNYLTSSYDIVPTILQRLFACKN
PVSDYSIGYNLLIEGNRASFLLVGSYINMGIFEADRATALETSGRITITGMKAEPLDDAVPRVDVITQALDLMRKYYGK

Specific function: Unknown

COG id: COG3083

COG function: function code R; Predicted hydrolase of alkaline phosphatase superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To H.influenzae HI_0842 [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788515, Length=641, Percent_Identity=25.2730109204368, Blast_Score=206, Evalue=4e-54,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR017849
- InterPro:   IPR017850
- InterPro:   IPR012159
- InterPro:   IPR000917 [H]

Pfam domain/function: PF00884 Sulfatase [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 73890; Mature: 73890

Theoretical pI: Translated: 9.52; Mature: 9.52

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVMNIKTYLRKNNLTLRFVGWFFLINSFIFWLVGLGYLKSILLNASLFKNYIADYSSLSG
CEEEHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
KILILVFSVLNYFTYMMFLAFVPAIPIIIMAFFLPYKRIIWIISVVAAATSLIFLFVDSQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFSMFKFHLNKTILSFIFNSDWSVIFTFSRYELILSFFMIVFILFLESIVAWLVWKKIVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KERLKIGKTISLFWLGGALISYFILLLSIAQNNNLFAQQIPNLPLYNQLIAYTIPDKNAD
HHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCHHEEEEECCCCCHH
DILRRYSEHHFTQPLFPNYPLHYPLHPMQCKMPEKPYNIILIMVDSLRYDSLRAKYMPNT
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHCCCCH
AQFAKRSWQFSQHMSAGNATQPGLFSLFYSIPSNYSTAVLEQKKSPVLIDLLLQHGFQTK
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCEE
IIWSGSMAPLPLDQTIYKKIANLNTNGAPIDDTGDKDRYSTKEAIQFLTDPKTNNPFFLH
EEECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCEEEE
IFYNAPHDYCRYQSFPQLYKPAIEECVRIGMTNHVDPVPYYNRYLNAVTFIDQEISKVLG
EEECCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIEKKGYLKNSIIIITSDHGQEFNDNRQNYWGHTSNFTPIQLHVPLIIHWPGELARRFNY
HHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHH
LTSSYDIVPTILQRLFACKNPVSDYSIGYNLLIEGNRASFLLVGSYINMGIFEADRATAL
HHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECHHCCCEEECCCCCEE
ETSGRITITGMKAEPLDDAVPRVDVITQALDLMRKYYGK
ECCCEEEEEECCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MVMNIKTYLRKNNLTLRFVGWFFLINSFIFWLVGLGYLKSILLNASLFKNYIADYSSLSG
CEEEHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
KILILVFSVLNYFTYMMFLAFVPAIPIIIMAFFLPYKRIIWIISVVAAATSLIFLFVDSQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFSMFKFHLNKTILSFIFNSDWSVIFTFSRYELILSFFMIVFILFLESIVAWLVWKKIVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KERLKIGKTISLFWLGGALISYFILLLSIAQNNNLFAQQIPNLPLYNQLIAYTIPDKNAD
HHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCHHEEEEECCCCCHH
DILRRYSEHHFTQPLFPNYPLHYPLHPMQCKMPEKPYNIILIMVDSLRYDSLRAKYMPNT
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHCCCCH
AQFAKRSWQFSQHMSAGNATQPGLFSLFYSIPSNYSTAVLEQKKSPVLIDLLLQHGFQTK
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCEE
IIWSGSMAPLPLDQTIYKKIANLNTNGAPIDDTGDKDRYSTKEAIQFLTDPKTNNPFFLH
EEECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCEEEE
IFYNAPHDYCRYQSFPQLYKPAIEECVRIGMTNHVDPVPYYNRYLNAVTFIDQEISKVLG
EEECCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIEKKGYLKNSIIIITSDHGQEFNDNRQNYWGHTSNFTPIQLHVPLIIHWPGELARRFNY
HHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHH
LTSSYDIVPTILQRLFACKNPVSDYSIGYNLLIEGNRASFLLVGSYINMGIFEADRATAL
HHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECHHCCCEEECCCCCEE
ETSGRITITGMKAEPLDDAVPRVDVITQALDLMRKYYGK
ECCCEEEEEECCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11206551; 11258796 [H]