| Definition | Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002942 |
| Length | 3,397,754 |
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The map label for this gene is sdhB
Identifier: 52840390
GI number: 52840390
Start: 157650
End: 163277
Strand: Reverse
Name: sdhB
Synonym: lpg0135
Alternate gene names: NA
Gene position: 163277-157650 (Counterclockwise)
Preceding gene: 52840391
Following gene: 52840387
Centisome position: 4.81
GC content: 38.02
Gene sequence:
>5628_bases ATGCTACTATTAAGCATAGAGGTGATAAATATGCCAGATCATAACTCATCAGATATTCCGTTATCGCAGCAAATAGATGA AGTCAGGGGATTGCTCCTTAAAGCCCTTAAAGCGCAATTGGATGATCTGATAGCTGGAAAACTCACACCACAACCAAGTG GCGTTCCTTTTGTTCATTTTGAGAAGGATCCACCACAAATTGCAACTCTAAAAAAAGTCATTAATTGTCTTTATCATGCT GAGGAAGCATTTAAAAGCTGGGAAAGCATTGATACCAGTACGCTATTGGGTAAAGCCAAAGCAGCACCCAAATTAATCCG TGCACTAACCCAGATATACAAATCCCTGGGTTTACTTGATGAGGCTACCCCTGAAATAAGGAGTGTCATAGCCGACAATT ATCATTTACTTGAACCGCTGTTTACTCAAGCTTATACCATCGTGCAAGAGTCTGGCTGGCTATCAGAATTCATGGAAATG GATGTGACCGATAAAGCATCCAAAGTGATCTTCCAAGGGATGGATTTATTGGGTCCCGATATCGATAAATGGCATGATAC GCATCCTCTTGTTGACGCCTTTGCAAAAATATCAAAACTGGTAGAAACCATATCCAAACTACAAGAAAAGGACATGCCAG GAAAAGAGAAAGAACAAGCGGTAGAATTGGTTCGCGCCTTACTTGATGACCTGGACAATAACCCTTTTATCAGCAAATTA AGTATCAGTGATTTTGAAGACTCAAAAGCCATAAAGGATTTATTAGAATGGTTTAAGAACATACAAGACGATGGTTTTGA TTTTAGCAAGAAATCCATTAAGCAATATGTTTCCTGGGCTAATCACTATTTACCCACATTAATCACCTTCGCTGATCAAC TGGAACGACAAAACTATTTAAAACCAGGCAGTTTAAGTACCAATTTGTGTTCTCAAATAGAGCATTTAGGCAAGCAAGTG 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Upstream 100 bases:
>100_bases TGTTGTCTGAGTTCAAGATATCCTGTTAATTAAAGCAAGGTTCTTTCATAAAAGACCAAAATGATTATTTTAATGACACT TTAATCAAATTATCACCTCT
Downstream 100 bases:
>100_bases GACTCAATAAGCCATATTGGTAAAAAATGATTCTATACTCTGGACTTACCCCGTGAACAGTGTGTAAACAGTAATGGCAA AAATATTGATGTGAAATGCC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: SdhA GRIP Coiled-Coil Protein GCC
Number of amino acids: Translated: 1875; Mature: 1875
Protein sequence:
>1875_residues MLLLSIEVINMPDHNSSDIPLSQQIDEVRGLLLKALKAQLDDLIAGKLTPQPSGVPFVHFEKDPPQIATLKKVINCLYHA EEAFKSWESIDTSTLLGKAKAAPKLIRALTQIYKSLGLLDEATPEIRSVIADNYHLLEPLFTQAYTIVQESGWLSEFMEM DVTDKASKVIFQGMDLLGPDIDKWHDTHPLVDAFAKISKLVETISKLQEKDMPGKEKEQAVELVRALLDDLDNNPFISKL SISDFEDSKAIKDLLEWFKNIQDDGFDFSKKSIKQYVSWANHYLPTLITFADQLERQNYLKPGSLSTNLCSQIEHLGKQV NGILSEPNFGITERVVSIESLKGKREQQIHNAQANSVRAIMATEKQQAATADFYRILEAYKGMNLSQVTEPDRILLRQLY PQIQTALAHASLDLENLLTSVLNTTGPEKTPAKPKSWWELAKGGLGYVASYVVNYNVDKILGTRESVDRFLSSQIASEQF KILIAEKAREKLRTGSDKLEETALQYKAEVRVNAIKSTLRKQPLQREAPPSTFVAVKPSKLVNLRGTLTAIQEMQLSTTV NSTRTNVDTLIHRHLPEKYQACFSTLPYQVNEKDPELVKQIKTIENNLFQLEKALKDFEKIDLSYGIMIRLHYFIAIASA ASKLKSSVKELSPEGQKALAPLLQQIMTLGSSFSDTNYTTNDLSALQQLKTEGQARPGSPLGTSPEKTKTLPEETIKGND KKPKEKTTELLDYADKISTARTLLLSKFKSTLSPAIADSLNPQEHGVPFIHLDQDPPQTAAIKKIINSMYHAECALKTWH GIDTSTRLGKIAAAHQGVAALSQVYKSFALFTEDFSDIHNLIRENHDLIAPVIIEANKLVKEYGWASQFSELDVAQKLGS ILGQGINTVQPKTDEITQTASLVKLFSEIPRLLNNISSSLDENAEKSVDELRINSKKIEAIGAVFELFFEENAYLMSMFK GFSAISGLIELNKKIQREGNNLQEITIRQYQKWLKEGYPNLMMMLDEIETRHYLTPGLLSAPIALELDQINDKLNEIIET KPDFKLQKIPLSFYMGDKRIERLMTKKTEHCLALLQIEEQKKAVNTFFGILKHYSGQPLSNIKPNELAQLRLAFVKIQSA MANSNLELSNDFVAALNQLETSPSEEINKIKVTVSQLIKLQPAVENNLSEQKKSSELKIAVIDKAIEHVIAKSFELKSDV SKEINIPQLRRTFLETESKKPIVGPGELKPTSVSSLNTVRGNLAYIQELKLSSTVGMIREQFSALTRDNFSTRMQKYLIK PPGKPLHVINDKDPLMVRQIKEVENSLYHLETALKQFEQMKKSDSFVSQTKALVEIANHAHELKMAVERFSPELKEHYGP VVRTALSFSNKVQSINYNKEDWADLQFILNRAHKELLKRKTPRDHRIEKAFFEAGIREVQIDRTESAGKKAAKLGVKYAH LASPQLEKARAYLSSRYKNAFGQQPKAIRSLTREQLANEEFMDAEISRLKKTLEEKYGFNIATIKVLLALLEQIQRAGAQ AAEVAGMVNTLVTYDFPKIKENAYRDLLTKLSQEEDYLNLKPGTLINPAMAAVNQLFLSAALELDMPFSKKLSILDDTTY VNILVRQTESDLQTLRKKLSEDPSNHEIAFEIEIKNDKLAFLRQQMVLLEDKNPNQTRNVLLDMQFEVSLRNHLVYTTLK APIAQEYEQIAREYYKKNKNRFLYADDCSKELLQGLKEFEKKHLPDHLIVFEAYDRLRLFSAKLPPKNQDVKEYIENINR ELQNRDIPIEQRAIKVKSLPNDAVFIEKLSSADKGTHFLRKFIQFITIITASITEAIKTGGSLIYIYRQKQMEQSIKNIE KSISLKEELHTIKNTDGASPRKGEGQEGEIEFTKL
Sequences:
>Translated_1875_residues MLLLSIEVINMPDHNSSDIPLSQQIDEVRGLLLKALKAQLDDLIAGKLTPQPSGVPFVHFEKDPPQIATLKKVINCLYHA EEAFKSWESIDTSTLLGKAKAAPKLIRALTQIYKSLGLLDEATPEIRSVIADNYHLLEPLFTQAYTIVQESGWLSEFMEM DVTDKASKVIFQGMDLLGPDIDKWHDTHPLVDAFAKISKLVETISKLQEKDMPGKEKEQAVELVRALLDDLDNNPFISKL SISDFEDSKAIKDLLEWFKNIQDDGFDFSKKSIKQYVSWANHYLPTLITFADQLERQNYLKPGSLSTNLCSQIEHLGKQV NGILSEPNFGITERVVSIESLKGKREQQIHNAQANSVRAIMATEKQQAATADFYRILEAYKGMNLSQVTEPDRILLRQLY PQIQTALAHASLDLENLLTSVLNTTGPEKTPAKPKSWWELAKGGLGYVASYVVNYNVDKILGTRESVDRFLSSQIASEQF KILIAEKAREKLRTGSDKLEETALQYKAEVRVNAIKSTLRKQPLQREAPPSTFVAVKPSKLVNLRGTLTAIQEMQLSTTV NSTRTNVDTLIHRHLPEKYQACFSTLPYQVNEKDPELVKQIKTIENNLFQLEKALKDFEKIDLSYGIMIRLHYFIAIASA ASKLKSSVKELSPEGQKALAPLLQQIMTLGSSFSDTNYTTNDLSALQQLKTEGQARPGSPLGTSPEKTKTLPEETIKGND KKPKEKTTELLDYADKISTARTLLLSKFKSTLSPAIADSLNPQEHGVPFIHLDQDPPQTAAIKKIINSMYHAECALKTWH GIDTSTRLGKIAAAHQGVAALSQVYKSFALFTEDFSDIHNLIRENHDLIAPVIIEANKLVKEYGWASQFSELDVAQKLGS ILGQGINTVQPKTDEITQTASLVKLFSEIPRLLNNISSSLDENAEKSVDELRINSKKIEAIGAVFELFFEENAYLMSMFK GFSAISGLIELNKKIQREGNNLQEITIRQYQKWLKEGYPNLMMMLDEIETRHYLTPGLLSAPIALELDQINDKLNEIIET KPDFKLQKIPLSFYMGDKRIERLMTKKTEHCLALLQIEEQKKAVNTFFGILKHYSGQPLSNIKPNELAQLRLAFVKIQSA MANSNLELSNDFVAALNQLETSPSEEINKIKVTVSQLIKLQPAVENNLSEQKKSSELKIAVIDKAIEHVIAKSFELKSDV SKEINIPQLRRTFLETESKKPIVGPGELKPTSVSSLNTVRGNLAYIQELKLSSTVGMIREQFSALTRDNFSTRMQKYLIK PPGKPLHVINDKDPLMVRQIKEVENSLYHLETALKQFEQMKKSDSFVSQTKALVEIANHAHELKMAVERFSPELKEHYGP VVRTALSFSNKVQSINYNKEDWADLQFILNRAHKELLKRKTPRDHRIEKAFFEAGIREVQIDRTESAGKKAAKLGVKYAH LASPQLEKARAYLSSRYKNAFGQQPKAIRSLTREQLANEEFMDAEISRLKKTLEEKYGFNIATIKVLLALLEQIQRAGAQ AAEVAGMVNTLVTYDFPKIKENAYRDLLTKLSQEEDYLNLKPGTLINPAMAAVNQLFLSAALELDMPFSKKLSILDDTTY VNILVRQTESDLQTLRKKLSEDPSNHEIAFEIEIKNDKLAFLRQQMVLLEDKNPNQTRNVLLDMQFEVSLRNHLVYTTLK APIAQEYEQIAREYYKKNKNRFLYADDCSKELLQGLKEFEKKHLPDHLIVFEAYDRLRLFSAKLPPKNQDVKEYIENINR ELQNRDIPIEQRAIKVKSLPNDAVFIEKLSSADKGTHFLRKFIQFITIITASITEAIKTGGSLIYIYRQKQMEQSIKNIE KSISLKEELHTIKNTDGASPRKGEGQEGEIEFTKL >Mature_1875_residues MLLLSIEVINMPDHNSSDIPLSQQIDEVRGLLLKALKAQLDDLIAGKLTPQPSGVPFVHFEKDPPQIATLKKVINCLYHA EEAFKSWESIDTSTLLGKAKAAPKLIRALTQIYKSLGLLDEATPEIRSVIADNYHLLEPLFTQAYTIVQESGWLSEFMEM DVTDKASKVIFQGMDLLGPDIDKWHDTHPLVDAFAKISKLVETISKLQEKDMPGKEKEQAVELVRALLDDLDNNPFISKL SISDFEDSKAIKDLLEWFKNIQDDGFDFSKKSIKQYVSWANHYLPTLITFADQLERQNYLKPGSLSTNLCSQIEHLGKQV NGILSEPNFGITERVVSIESLKGKREQQIHNAQANSVRAIMATEKQQAATADFYRILEAYKGMNLSQVTEPDRILLRQLY PQIQTALAHASLDLENLLTSVLNTTGPEKTPAKPKSWWELAKGGLGYVASYVVNYNVDKILGTRESVDRFLSSQIASEQF KILIAEKAREKLRTGSDKLEETALQYKAEVRVNAIKSTLRKQPLQREAPPSTFVAVKPSKLVNLRGTLTAIQEMQLSTTV NSTRTNVDTLIHRHLPEKYQACFSTLPYQVNEKDPELVKQIKTIENNLFQLEKALKDFEKIDLSYGIMIRLHYFIAIASA ASKLKSSVKELSPEGQKALAPLLQQIMTLGSSFSDTNYTTNDLSALQQLKTEGQARPGSPLGTSPEKTKTLPEETIKGND KKPKEKTTELLDYADKISTARTLLLSKFKSTLSPAIADSLNPQEHGVPFIHLDQDPPQTAAIKKIINSMYHAECALKTWH GIDTSTRLGKIAAAHQGVAALSQVYKSFALFTEDFSDIHNLIRENHDLIAPVIIEANKLVKEYGWASQFSELDVAQKLGS ILGQGINTVQPKTDEITQTASLVKLFSEIPRLLNNISSSLDENAEKSVDELRINSKKIEAIGAVFELFFEENAYLMSMFK GFSAISGLIELNKKIQREGNNLQEITIRQYQKWLKEGYPNLMMMLDEIETRHYLTPGLLSAPIALELDQINDKLNEIIET KPDFKLQKIPLSFYMGDKRIERLMTKKTEHCLALLQIEEQKKAVNTFFGILKHYSGQPLSNIKPNELAQLRLAFVKIQSA MANSNLELSNDFVAALNQLETSPSEEINKIKVTVSQLIKLQPAVENNLSEQKKSSELKIAVIDKAIEHVIAKSFELKSDV SKEINIPQLRRTFLETESKKPIVGPGELKPTSVSSLNTVRGNLAYIQELKLSSTVGMIREQFSALTRDNFSTRMQKYLIK PPGKPLHVINDKDPLMVRQIKEVENSLYHLETALKQFEQMKKSDSFVSQTKALVEIANHAHELKMAVERFSPELKEHYGP VVRTALSFSNKVQSINYNKEDWADLQFILNRAHKELLKRKTPRDHRIEKAFFEAGIREVQIDRTESAGKKAAKLGVKYAH LASPQLEKARAYLSSRYKNAFGQQPKAIRSLTREQLANEEFMDAEISRLKKTLEEKYGFNIATIKVLLALLEQIQRAGAQ AAEVAGMVNTLVTYDFPKIKENAYRDLLTKLSQEEDYLNLKPGTLINPAMAAVNQLFLSAALELDMPFSKKLSILDDTTY VNILVRQTESDLQTLRKKLSEDPSNHEIAFEIEIKNDKLAFLRQQMVLLEDKNPNQTRNVLLDMQFEVSLRNHLVYTTLK APIAQEYEQIAREYYKKNKNRFLYADDCSKELLQGLKEFEKKHLPDHLIVFEAYDRLRLFSAKLPPKNQDVKEYIENINR ELQNRDIPIEQRAIKVKSLPNDAVFIEKLSSADKGTHFLRKFIQFITIITASITEAIKTGGSLIYIYRQKQMEQSIKNIE KSISLKEELHTIKNTDGASPRKGEGQEGEIEFTKL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 212253; Mature: 212253
Theoretical pI: Translated: 8.12; Mature: 8.12
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLLLSIEVINMPDHNSSDIPLSQQIDEVRGLLLKALKAQLDDLIAGKLTPQPSGVPFVHF CEEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEE EKDPPQIATLKKVINCLYHAEEAFKSWESIDTSTLLGKAKAAPKLIRALTQIYKSLGLLD CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC EATPEIRSVIADNYHLLEPLFTQAYTIVQESGWLSEFMEMDVTDKASKVIFQGMDLLGPD CCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCHHHCCCC IDKWHDTHPLVDAFAKISKLVETISKLQEKDMPGKEKEQAVELVRALLDDLDNNPFISKL HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEC SISDFEDSKAIKDLLEWFKNIQDDGFDFSKKSIKQYVSWANHYLPTLITFADQLERQNYL CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC KPGSLSTNLCSQIEHLGKQVNGILSEPNFGITERVVSIESLKGKREQQIHNAQANSVRAI CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH MATEKQQAATADFYRILEAYKGMNLSQVTEPDRILLRQLYPQIQTALAHASLDLENLLTS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH VLNTTGPEKTPAKPKSWWELAKGGLGYVASYVVNYNVDKILGTRESVDRFLSSQIASEQF 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