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The map label for this gene is 39996952

Identifier: 39996952

GI number: 39996952

Start: 2024777

End: 2026000

Strand: Reverse

Name: 39996952

Synonym: GSU1853

Alternate gene names: NA

Gene position: 2026000-2024777 (Counterclockwise)

Preceding gene: 39996953

Following gene: 39996951

Centisome position: 53.12

GC content: 32.03

Gene sequence:

>1224_bases
GTGATTAATCTCGAGGCAACTAAACATAAAATAAGAAGTCACGCATCATTTGGTGTAATGGCTATTGGAGCTATTTCGAT
ATTTGTCATAAATTTTGTACTTAAGCACGTAATGGGACCAGCTGATTACGGCAAATATACTGTACTGATGACGTATTTGT
CAGCGCTGATTTCTTTTGGTTTTTTAGGCTTCGACCAAATAGTTGTTAGATTGTCAAATGTTGTGGATCAGATTGTCTAT
ATCAATCGCAAATTAATATATTACATCTTAATATCTGGATTAATTACCGCCTTGTTTGCAGCTTGTATTGCGTATTTAAC
CTATATAGCGACAGATTCGTTTATACAATTGTTTGTAATATTCTTGCTCAGTAATTTTATTTATTTAGTGTCTACTGTGA
ATCGACTCAAGTCACAATTTGTTCTTTCACAAGTATGTAGTCACGCATGGAAGTTTTTCTTATTGTTTTATGTAATTAAT
GCAGTTGTCACTTCTGGCAAGCTAACTTATCTTGAAGTTACGTTTGCAATAACTATCAGTATGATATTTTGCGGGCTCAT
CGCGTTAGTTACCTGTTGTAGATCAAAGATTAGAGGGTGCGATGATACAAATAATAACTCAAAATTATTGGTTGGATTTA
TATTGTCAATAGCAATCATTACTTATTTGAATTATTTTGATAGACTCATAATCAATAATAAGGTCGGACTGATAGAGGTT
GGCGATTACTTTTATTTGCAGAACTTTTTTAGTTATCCATTTGTATTAATTAGTACGTACGTTGGATTTAAAGAAATGAT
CTACTTTAAGACCCATATTTCTATGGATATTGTAAGAACAAAGATCATTCATGCAATTAAGTTGGGAATCGCATTGTTGC
TGCTAATAACAGTTATGGTTACTGTGGTACAATTAAAATATCACAATTTGTCGGTTACTGTTTATGATGCACCGCTAATT
ATTATTATGAGTATTACTTCTGTTATACGCCTAATATATTCAGTACTATCATCAGTCATGGGTGCTATCGGTACTAGTCA
TGCCGTTTTAACAAGTAACATTGTGTCAGGAGTATCTGTATTAGTTGGTACGTTGATAGTTATAGCATACTTAAAATCAA
TTATTATGATTGCATTTATATTTGCAGTATTTTGGACTATCAGAACTATAACATATTATTATCAAATACGAGGATTTATA
TATGAATATCGCGAGAGCGATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCATCAAGAATTCAAAAACATAAGACCAGATACCCTAAAAGAAAAAATTATTATTGATACACGAGGTATTTGGAGTTAG
GCTGAAACCAAAGGTGGATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCACGAAATATTGATGTGGATCCAGTTTGTTGTAAAATACATTCCTGGTCGCACAGGCTGTTGGATTAGAAATATTCTTT
ATCCGTACCGATGCGGCAAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 407; Mature: 407

Protein sequence:

>407_residues
MINLEATKHKIRSHASFGVMAIGAISIFVINFVLKHVMGPADYGKYTVLMTYLSALISFGFLGFDQIVVRLSNVVDQIVY
INRKLIYYILISGLITALFAACIAYLTYIATDSFIQLFVIFLLSNFIYLVSTVNRLKSQFVLSQVCSHAWKFFLLFYVIN
AVVTSGKLTYLEVTFAITISMIFCGLIALVTCCRSKIRGCDDTNNNSKLLVGFILSIAIITYLNYFDRLIINNKVGLIEV
GDYFYLQNFFSYPFVLISTYVGFKEMIYFKTHISMDIVRTKIIHAIKLGIALLLLITVMVTVVQLKYHNLSVTVYDAPLI
IIMSITSVIRLIYSVLSSVMGAIGTSHAVLTSNIVSGVSVLVGTLIVIAYLKSIIMIAFIFAVFWTIRTITYYYQIRGFI
YEYRESD

Sequences:

>Translated_407_residues
MINLEATKHKIRSHASFGVMAIGAISIFVINFVLKHVMGPADYGKYTVLMTYLSALISFGFLGFDQIVVRLSNVVDQIVY
INRKLIYYILISGLITALFAACIAYLTYIATDSFIQLFVIFLLSNFIYLVSTVNRLKSQFVLSQVCSHAWKFFLLFYVIN
AVVTSGKLTYLEVTFAITISMIFCGLIALVTCCRSKIRGCDDTNNNSKLLVGFILSIAIITYLNYFDRLIINNKVGLIEV
GDYFYLQNFFSYPFVLISTYVGFKEMIYFKTHISMDIVRTKIIHAIKLGIALLLLITVMVTVVQLKYHNLSVTVYDAPLI
IIMSITSVIRLIYSVLSSVMGAIGTSHAVLTSNIVSGVSVLVGTLIVIAYLKSIIMIAFIFAVFWTIRTITYYYQIRGFI
YEYRESD
>Mature_407_residues
MINLEATKHKIRSHASFGVMAIGAISIFVINFVLKHVMGPADYGKYTVLMTYLSALISFGFLGFDQIVVRLSNVVDQIVY
INRKLIYYILISGLITALFAACIAYLTYIATDSFIQLFVIFLLSNFIYLVSTVNRLKSQFVLSQVCSHAWKFFLLFYVIN
AVVTSGKLTYLEVTFAITISMIFCGLIALVTCCRSKIRGCDDTNNNSKLLVGFILSIAIITYLNYFDRLIINNKVGLIEV
GDYFYLQNFFSYPFVLISTYVGFKEMIYFKTHISMDIVRTKIIHAIKLGIALLLLITVMVTVVQLKYHNLSVTVYDAPLI
IIMSITSVIRLIYSVLSSVMGAIGTSHAVLTSNIVSGVSVLVGTLIVIAYLKSIIMIAFIFAVFWTIRTITYYYQIRGFI
YEYRESD

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45956; Mature: 45956

Theoretical pI: Translated: 9.45; Mature: 9.45

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA