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The map label for this gene is 15899402

Identifier: 15899402

GI number: 15899402

Start: 2438416

End: 2440404

Strand: Reverse

Name: 15899402

Synonym: SSO2679

Alternate gene names: NA

Gene position: 2440404-2438416 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15899403

Following gene: 15899401

Centisome position: 81.56

GC content: 34.19

Gene sequence:

>1989_bases
ATGGTGATAAGAGTGACTGAGAGAAGAGTTAAATTAGCTAGTATAATCTCATACGATTTCTTATTTCTAGTTTTACTATC
AGGCTTACTAAACTTAATTATTACAATATTTAGAGAACGTCTCCTATATGTGCTTTCTAGTTTTTTCCAATATATCGTGA
GTAACCCTTCGGTAGCACTTGGGGATGCGTTGGGTTTTATATTCGTTCTTCAAGCATTACTTCTAGGCCTATTTATTGGA
GGAATAGTTATTTTAAGTATAAGCTTTACAATAAATTTGACGCGAATAAGGAGTGAATATGAAGAGGGCGTTCCATTATC
AACCATTCTAAGGTCTAGGATAATTACAAGTAGTAGATTAGGTATCATAGCAAATTGGATAAGTGAGCGTAGTAAGAGAT
ATATTAACGCGAGTGCTGATTTGGAAAGTCCTACTGAGGTTGGCGTTAGATACGTTGCATATTTTTTAGTCTCATTACTT
GTCGTAATACCGGTATCATTAGCACTTAGTATAGCATTACTCTCTCCTCTACCATTTCTATTAATATTTTTTCCGTTAAC
TTTTATCTTTTATCCAGAACAGAAATACAAGAGTAGGGCTAGAGAAATAAGAGACGATATTCAAGATGAGATACCTTTCT
TTGTGACTCTAATCACTATCATTAATGCAAGTGGTACAACCATATATGAGGGAATGAGAAAAATTTTACAATTTCCAATA
TTTAAAGCTATGAAAAAGGAGGCATTACTCATTATAAGGGATATAGAATTCTTTGGAAAATCCCCGCTAGATGCTCTGGA
GCATAGATCTCGATTAACACTAAATAGAGATTACTCTTGGTTTTTAGCTGGCTATTCTTCGATCATAAGAAGTGGTGGCG
ATATTGAAGCATATTTGTTCCAAAAGGCTAGAGAGTTTCTCAATTGGCTCCAATTCCGTTGGAGGTTTTACTCTGAAAGG
ACTTCGTTCCTAGGAGAGTTAATAGTGATCTTATTCCTTATTTTCCCCATGTTCTTAATTGCATTAGCCTTCTTCACAAG
TGGTGCAGTTATATCATTTTTGCTCATAATACCTATATTATTTGGTACAATATTATATACAATTACAGCTAATAATAGAC
CTAGATATATGGATAGTATAGGTCTCACCAAGTTACAGTTACTAATAGGATTTATCGCTGCATTATTAACAGCAGGGGTA
ATCGAAATATTTCTTGATGAAATATATTACGCAATTGGTTTAGGGCTCTTATCGTTCTCTCTAGCATCAACAATATTCAT
GTATAACCAAATAAGAGAAATTAACGATGTTGAAAACTCGTTACCGCAATTTCTAAGAGATATTACAGAGTTCAGAAAGA
TAGGTTACGATCTAAGTAGGGCTATTAAGACATTGGCCGAGGAAAAGAGATATAGAAGGGAGTTTAATAGGGTACTAAAT
GAAATAACAAAACAAGATTCCATGGGGATTCCAATAACTAGAGCTAAGATAAATACTAGAAGCTGGTTGGGTAAGTTCTC
TCTTACCACTGTCCAGATACTAATAGAAAGCGGTGCTGTAAGACCAGATCTACTGGAGTATTTAACTGAATTTACACTTA
ATTTTATACAATCAAAGAAGGAGGCATTCTCAAGAATGAGAGCTTATCAAGTTTTAGGAATTCTAACACCACTCCTTCTA
ATAGCTACAATACTTATAGCTATTGTGATTATTGACTCATTCACAATAGTAACTTTACCGACAAATACCGTAGGTTTACC
ACAATTCCCAAACATCATTAGTCAATTTATTTTATCTCCGGTGATACTTGCTGAAATGTTCATATTCATTTTAATGTCAA
CTTTTGCCATAGGATTACTGGTAACTAAAGCACTATATGGCACTGTACAATACATGATAATGCCAGCAATTGGATTAACC
CTAGCAGTGCTCTCAATACACTTCTTCAGCGTAATAGAACCGATAATCTTGAAATTCTTCTCGATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGGGAGATTGAAAACAGATTACTACTAATAAGAGGGCTTGCCGAAAAGGGAGTTTATGACTATGACACATTAGCAAGAGA
GTTAGTCAAGTATTATACAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACGTTTATATTTTCTCTTTTCCTATTTTTTACTAATGCAAGATAGTTTAGGATTACTTGCAATAACTCTAGTGATCGTTT
TGCTATTTTCTATTTTAATT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Type II Secretion System F Domain; Flp Pilus Assembly Protein

Number of amino acids: Translated: 662; Mature: 662

Protein sequence:

>662_residues
MVIRVTERRVKLASIISYDFLFLVLLSGLLNLIITIFRERLLYVLSSFFQYIVSNPSVALGDALGFIFVLQALLLGLFIG
GIVILSISFTINLTRIRSEYEEGVPLSTILRSRIITSSRLGIIANWISERSKRYINASADLESPTEVGVRYVAYFLVSLL
VVIPVSLALSIALLSPLPFLLIFFPLTFIFYPEQKYKSRAREIRDDIQDEIPFFVTLITIINASGTTIYEGMRKILQFPI
FKAMKKEALLIIRDIEFFGKSPLDALEHRSRLTLNRDYSWFLAGYSSIIRSGGDIEAYLFQKAREFLNWLQFRWRFYSER
TSFLGELIVILFLIFPMFLIALAFFTSGAVISFLLIIPILFGTILYTITANNRPRYMDSIGLTKLQLLIGFIAALLTAGV
IEIFLDEIYYAIGLGLLSFSLASTIFMYNQIREINDVENSLPQFLRDITEFRKIGYDLSRAIKTLAEEKRYRREFNRVLN
EITKQDSMGIPITRAKINTRSWLGKFSLTTVQILIESGAVRPDLLEYLTEFTLNFIQSKKEAFSRMRAYQVLGILTPLLL
IATILIAIVIIDSFTIVTLPTNTVGLPQFPNIISQFILSPVILAEMFIFILMSTFAIGLLVTKALYGTVQYMIMPAIGLT
LAVLSIHFFSVIEPIILKFFSI

Sequences:

>Translated_662_residues
MVIRVTERRVKLASIISYDFLFLVLLSGLLNLIITIFRERLLYVLSSFFQYIVSNPSVALGDALGFIFVLQALLLGLFIG
GIVILSISFTINLTRIRSEYEEGVPLSTILRSRIITSSRLGIIANWISERSKRYINASADLESPTEVGVRYVAYFLVSLL
VVIPVSLALSIALLSPLPFLLIFFPLTFIFYPEQKYKSRAREIRDDIQDEIPFFVTLITIINASGTTIYEGMRKILQFPI
FKAMKKEALLIIRDIEFFGKSPLDALEHRSRLTLNRDYSWFLAGYSSIIRSGGDIEAYLFQKAREFLNWLQFRWRFYSER
TSFLGELIVILFLIFPMFLIALAFFTSGAVISFLLIIPILFGTILYTITANNRPRYMDSIGLTKLQLLIGFIAALLTAGV
IEIFLDEIYYAIGLGLLSFSLASTIFMYNQIREINDVENSLPQFLRDITEFRKIGYDLSRAIKTLAEEKRYRREFNRVLN
EITKQDSMGIPITRAKINTRSWLGKFSLTTVQILIESGAVRPDLLEYLTEFTLNFIQSKKEAFSRMRAYQVLGILTPLLL
IATILIAIVIIDSFTIVTLPTNTVGLPQFPNIISQFILSPVILAEMFIFILMSTFAIGLLVTKALYGTVQYMIMPAIGLT
LAVLSIHFFSVIEPIILKFFSI
>Mature_662_residues
MVIRVTERRVKLASIISYDFLFLVLLSGLLNLIITIFRERLLYVLSSFFQYIVSNPSVALGDALGFIFVLQALLLGLFIG
GIVILSISFTINLTRIRSEYEEGVPLSTILRSRIITSSRLGIIANWISERSKRYINASADLESPTEVGVRYVAYFLVSLL
VVIPVSLALSIALLSPLPFLLIFFPLTFIFYPEQKYKSRAREIRDDIQDEIPFFVTLITIINASGTTIYEGMRKILQFPI
FKAMKKEALLIIRDIEFFGKSPLDALEHRSRLTLNRDYSWFLAGYSSIIRSGGDIEAYLFQKAREFLNWLQFRWRFYSER
TSFLGELIVILFLIFPMFLIALAFFTSGAVISFLLIIPILFGTILYTITANNRPRYMDSIGLTKLQLLIGFIAALLTAGV
IEIFLDEIYYAIGLGLLSFSLASTIFMYNQIREINDVENSLPQFLRDITEFRKIGYDLSRAIKTLAEEKRYRREFNRVLN
EITKQDSMGIPITRAKINTRSWLGKFSLTTVQILIESGAVRPDLLEYLTEFTLNFIQSKKEAFSRMRAYQVLGILTPLLL
IATILIAIVIIDSFTIVTLPTNTVGLPQFPNIISQFILSPVILAEMFIFILMSTFAIGLLVTKALYGTVQYMIMPAIGLT
LAVLSIHFFSVIEPIILKFFSI

Specific function: Unknown

COG id: COG2064

COG function: function code NU; Flp pilus assembly protein TadC

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 75406; Mature: 75406

Theoretical pI: Translated: 9.72; Mature: 9.72

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVIRVTERRVKLASIISYDFLFLVLLSGLLNLIITIFRERLLYVLSSFFQYIVSNPSVAL
CEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
GDALGFIFVLQALLLGLFIGGIVILSISFTINLTRIRSEYEEGVPLSTILRSRIITSSRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
GIIANWISERSKRYINASADLESPTEVGVRYVAYFLVSLLVVIPVSLALSIALLSPLPFL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIFFPLTFIFYPEQKYKSRAREIRDDIQDEIPFFVTLITIINASGTTIYEGMRKILQFPI
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
FKAMKKEALLIIRDIEFFGKSPLDALEHRSRLTLNRDYSWFLAGYSSIIRSGGDIEAYLF
HHHHHHHHHHHHEEHHHHCCCCHHHHHHHHCCEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
QKAREFLNWLQFRWRFYSERTSFLGELIVILFLIFPMFLIALAFFTSGAVISFLLIIPIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGTILYTITANNRPRYMDSIGLTKLQLLIGFIAALLTAGVIEIFLDEIYYAIGLGLLSFS
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LASTIFMYNQIREINDVENSLPQFLRDITEFRKIGYDLSRAIKTLAEEKRYRREFNRVLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EITKQDSMGIPITRAKINTRSWLGKFSLTTVQILIESGAVRPDLLEYLTEFTLNFIQSKK
HHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EAFSRMRAYQVLGILTPLLLIATILIAIVIIDSFTIVTLPTNTVGLPQFPNIISQFILSP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
VILAEMFIFILMSTFAIGLLVTKALYGTVQYMIMPAIGLTLAVLSIHFFSVIEPIILKFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SI
CC
>Mature Secondary Structure
MVIRVTERRVKLASIISYDFLFLVLLSGLLNLIITIFRERLLYVLSSFFQYIVSNPSVAL
CEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
GDALGFIFVLQALLLGLFIGGIVILSISFTINLTRIRSEYEEGVPLSTILRSRIITSSRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
GIIANWISERSKRYINASADLESPTEVGVRYVAYFLVSLLVVIPVSLALSIALLSPLPFL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIFFPLTFIFYPEQKYKSRAREIRDDIQDEIPFFVTLITIINASGTTIYEGMRKILQFPI
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
FKAMKKEALLIIRDIEFFGKSPLDALEHRSRLTLNRDYSWFLAGYSSIIRSGGDIEAYLF
HHHHHHHHHHHHEEHHHHCCCCHHHHHHHHCCEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
QKAREFLNWLQFRWRFYSERTSFLGELIVILFLIFPMFLIALAFFTSGAVISFLLIIPIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGTILYTITANNRPRYMDSIGLTKLQLLIGFIAALLTAGVIEIFLDEIYYAIGLGLLSFS
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LASTIFMYNQIREINDVENSLPQFLRDITEFRKIGYDLSRAIKTLAEEKRYRREFNRVLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EITKQDSMGIPITRAKINTRSWLGKFSLTTVQILIESGAVRPDLLEYLTEFTLNFIQSKK
HHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EAFSRMRAYQVLGILTPLLLIATILIAIVIIDSFTIVTLPTNTVGLPQFPNIISQFILSP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
VILAEMFIFILMSTFAIGLLVTKALYGTVQYMIMPAIGLTLAVLSIHFFSVIEPIILKFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SI
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA