| Definition | Sulfolobus solfataricus P2 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002754 |
| Length | 2,992,245 |
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The map label for this gene is 15898397
Identifier: 15898397
GI number: 15898397
Start: 1428130
End: 1430016
Strand: Direct
Name: 15898397
Synonym: SSO1581
Alternate gene names: NA
Gene position: 1428130-1430016 (Clockwise)
Preceding gene: 15898390
Following gene: 15898398
Centisome position: 47.73
GC content: 34.02
Gene sequence:
>1887_bases ATGGAATATGAGACTATACTCAAGTTGTTCTCTCTTGTTTACATTATTATAATGATGACAATTGATTTTTGGATATTTGG TTTGATTTTAAGAAGAGAATACGTAAGGGTTAAGGGTTTGTTAATAATTCTTTCGATAGTATTGATGATGGGTTTGGAAA GTTTAGCGTTAGCTCAGCTTAATGTATTACTTTTCATATCTGGAATGCTTCTAGTATTGATACCTCTGTTTATATCATTC CTAATAAAGGACCATAGTATTAACGTTAATAGAAATTGGAAATATGGGTTATTATTATCATCGGTTATAGTTTTCGATGA GTTAGCAATGGGTTATCTTTATGGTAATTACTTCACTCCCTTACCTAATCCTTTACTTACCGCGATTAATAATCCAGCCT ATGGTGCCATGATGTTAGGTGATGCGATTTTCTTCCTCTATATATTGAGGAGAAGAAGCATTATGGAGTTCGCTATAACC ACATTTGCCATTTCCATGGCTTTCATGCCCTCCCTTTATTTGATGGATAGAATGCTTGAGTTCATAATGTCAATTTTGAC CTCACTTTTTATGATAGTAAACATCGTGTTGTTATACTTAACAGAAATGAGAATGTTAACATTTCAAGGACAATTAGTTG CGATCTCTCTATCCTTGTTCAATCTCCTAATGATGCTCGGTTTAACCTTTTTTGCTTCACTTAGCAACTTATATTTCCTT ACCCTATCTATGATTGCGTCAATGGTTTGGTACTTCTTTTTGATATTTTACAATGTTCCTGCTAAGAAAATCTCACCTAA ACCTTTCCTCTTCCTTGTATTAGTAAACTTAACAGAATTGGCAATGGGTTTTGGAGAGAGTGTATTAGGGTTTAATCTGA CTAACTCACTCTTCGTTAATACGATGAACTGCGAGATGATGATAGGTTCACATATGATGAGATCGCCTTTCAATAATCCG TTTTGGTGGTTATTCCCAATTAATCCTTTAACAATGATTACTATGACAATAATGAAGTACAATTTACTTGGTAAACTAGT GATGGTACCATTCATGACTATAATGACAACTACCATGGCCCCATTTTACGTAATAATGATGGGCGCTGAGATGAGTTATT TAGTTTATGAGAGGTTTAAGAAAGTTAAGACAAGATATTTAAAGGCGTGGACTTTAGGTATTCTAACCGGGATACCAATA TTCGTAGTTTTGATCCCTTACTATACAAACTATTATATTTTCGGAATGAGTGGTATGATATTTCCCGTGACTTTAGCACC TTTCGTAATTTCCCTAGTCGTTATTGCATTATTTTCAACATTATTTGGCAGGGGTGTTTATTGTAACCTTGTTTGTATGT CCGCTCACATGTGGTCTAATGTGTTCTATGAACAATTTTCAGCTAAGAAAAACAGTAAGTTTTGGGACTACTTGAGGTGG ATTTTTCTCGTGCCATTGATCATCGCATTTTACCTTTTCGTGATGATGGGTTTAGGGAAAATTAAGCTTCCTATTGATCC CTTAGACTTTTACGGTATGTTTACGTTAAACTACATATGGTGGTTCTTTTACTTTTTAACTCCAATTTTTGGAATATATT CATGTGCTAGGCAAGGCTGGTGTGGTTTCGGCACTTTCAATGGAATATTTAACAAGGTGTTGTTTAAGATTAGGGCCAAA GACGTTAATACTTGCAAAGAATGCGTTAGTAAGGAATGTGATACTTCTTGCCCAGTTAAGATACCTATTAGTAACGATAT TTTGAAAAAAGGTTATTCTAATAGGATAAGTTGTATTGTATGTGCTAGGTGTGTCGATGCTTGTGACAATGTTGAAATTG TTAATGTTGTAACTATTCTGAAAAATAGAGAAAGTAAAAGTTTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTGATGCTAAATTGCTTAAAAGTGAAAAATAGTACTATAATATTATTTTTCCAATGTTATTTCAAGTAAAACTTAAATTT TTGAAACTTGAATAGACCAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTAGTAATTAGAATATCTTATATGTCACAACAGAATACGGAATTGGAAGGAATAGGAAAATTAAGGAGCGGCTCCCTCT TTATGATACTTGCCGTGTTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 628; Mature: 628
Protein sequence:
>628_residues MEYETILKLFSLVYIIIMMTIDFWIFGLILRREYVRVKGLLIILSIVLMMGLESLALAQLNVLLFISGMLLVLIPLFISF LIKDHSINVNRNWKYGLLLSSVIVFDELAMGYLYGNYFTPLPNPLLTAINNPAYGAMMLGDAIFFLYILRRRSIMEFAIT TFAISMAFMPSLYLMDRMLEFIMSILTSLFMIVNIVLLYLTEMRMLTFQGQLVAISLSLFNLLMMLGLTFFASLSNLYFL TLSMIASMVWYFFLIFYNVPAKKISPKPFLFLVLVNLTELAMGFGESVLGFNLTNSLFVNTMNCEMMIGSHMMRSPFNNP FWWLFPINPLTMITMTIMKYNLLGKLVMVPFMTIMTTTMAPFYVIMMGAEMSYLVYERFKKVKTRYLKAWTLGILTGIPI FVVLIPYYTNYYIFGMSGMIFPVTLAPFVISLVVIALFSTLFGRGVYCNLVCMSAHMWSNVFYEQFSAKKNSKFWDYLRW IFLVPLIIAFYLFVMMGLGKIKLPIDPLDFYGMFTLNYIWWFFYFLTPIFGIYSCARQGWCGFGTFNGIFNKVLFKIRAK DVNTCKECVSKECDTSCPVKIPISNDILKKGYSNRISCIVCARCVDACDNVEIVNVVTILKNRESKSF
Sequences:
>Translated_628_residues MEYETILKLFSLVYIIIMMTIDFWIFGLILRREYVRVKGLLIILSIVLMMGLESLALAQLNVLLFISGMLLVLIPLFISF LIKDHSINVNRNWKYGLLLSSVIVFDELAMGYLYGNYFTPLPNPLLTAINNPAYGAMMLGDAIFFLYILRRRSIMEFAIT TFAISMAFMPSLYLMDRMLEFIMSILTSLFMIVNIVLLYLTEMRMLTFQGQLVAISLSLFNLLMMLGLTFFASLSNLYFL TLSMIASMVWYFFLIFYNVPAKKISPKPFLFLVLVNLTELAMGFGESVLGFNLTNSLFVNTMNCEMMIGSHMMRSPFNNP FWWLFPINPLTMITMTIMKYNLLGKLVMVPFMTIMTTTMAPFYVIMMGAEMSYLVYERFKKVKTRYLKAWTLGILTGIPI FVVLIPYYTNYYIFGMSGMIFPVTLAPFVISLVVIALFSTLFGRGVYCNLVCMSAHMWSNVFYEQFSAKKNSKFWDYLRW IFLVPLIIAFYLFVMMGLGKIKLPIDPLDFYGMFTLNYIWWFFYFLTPIFGIYSCARQGWCGFGTFNGIFNKVLFKIRAK DVNTCKECVSKECDTSCPVKIPISNDILKKGYSNRISCIVCARCVDACDNVEIVNVVTILKNRESKSF >Mature_628_residues MEYETILKLFSLVYIIIMMTIDFWIFGLILRREYVRVKGLLIILSIVLMMGLESLALAQLNVLLFISGMLLVLIPLFISF LIKDHSINVNRNWKYGLLLSSVIVFDELAMGYLYGNYFTPLPNPLLTAINNPAYGAMMLGDAIFFLYILRRRSIMEFAIT TFAISMAFMPSLYLMDRMLEFIMSILTSLFMIVNIVLLYLTEMRMLTFQGQLVAISLSLFNLLMMLGLTFFASLSNLYFL TLSMIASMVWYFFLIFYNVPAKKISPKPFLFLVLVNLTELAMGFGESVLGFNLTNSLFVNTMNCEMMIGSHMMRSPFNNP FWWLFPINPLTMITMTIMKYNLLGKLVMVPFMTIMTTTMAPFYVIMMGAEMSYLVYERFKKVKTRYLKAWTLGILTGIPI FVVLIPYYTNYYIFGMSGMIFPVTLAPFVISLVVIALFSTLFGRGVYCNLVCMSAHMWSNVFYEQFSAKKNSKFWDYLRW IFLVPLIIAFYLFVMMGLGKIKLPIDPLDFYGMFTLNYIWWFFYFLTPIFGIYSCARQGWCGFGTFNGIFNKVLFKIRAK DVNTCKECVSKECDTSCPVKIPISNDILKKGYSNRISCIVCARCVDACDNVEIVNVVTILKNRESKSF
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 72519; Mature: 72519
Theoretical pI: Translated: 9.21; Mature: 9.21
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.1 %Cys (Translated Protein) 7.2 %Met (Translated Protein) 9.2 %Cys+Met (Translated Protein) 2.1 %Cys (Mature Protein) 7.2 %Met (Mature Protein) 9.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEYETILKLFSLVYIIIMMTIDFWIFGLILRREYVRVKGLLIILSIVLMMGLESLALAQL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHH NVLLFISGMLLVLIPLFISFLIKDHSINVNRNWKYGLLLSSVIVFDELAMGYLYGNYFTP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC LPNPLLTAINNPAYGAMMLGDAIFFLYILRRRSIMEFAITTFAISMAFMPSLYLMDRMLE CCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIMSILTSLFMIVNIVLLYLTEMRMLTFQGQLVAISLSLFNLLMMLGLTFFASLSNLYFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLSMIASMVWYFFLIFYNVPAKKISPKPFLFLVLVNLTELAMGFGESVLGFNLTNSLFVN HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHEEE TMNCEMMIGSHMMRSPFNNPFWWLFPINPLTMITMTIMKYNLLGKLVMVPFMTIMTTTMA ECCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PFYVIMMGAEMSYLVYERFKKVKTRYLKAWTLGILTGIPIFVVLIPYYTNYYIFGMSGMI HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCHH FPVTLAPFVISLVVIALFSTLFGRGVYCNLVCMSAHMWSNVFYEQFSAKKNSKFWDYLRW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH IFLVPLIIAFYLFVMMGLGKIKLPIDPLDFYGMFTLNYIWWFFYFLTPIFGIYSCARQGW HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC CGFGTFNGIFNKVLFKIRAKDVNTCKECVSKECDTSCPVKIPISNDILKKGYSNRISCIV CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCHHHHHCCCCCCHHHHH CARCVDACDNVEIVNVVTILKNRESKSF HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MEYETILKLFSLVYIIIMMTIDFWIFGLILRREYVRVKGLLIILSIVLMMGLESLALAQL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHH NVLLFISGMLLVLIPLFISFLIKDHSINVNRNWKYGLLLSSVIVFDELAMGYLYGNYFTP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC LPNPLLTAINNPAYGAMMLGDAIFFLYILRRRSIMEFAITTFAISMAFMPSLYLMDRMLE CCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIMSILTSLFMIVNIVLLYLTEMRMLTFQGQLVAISLSLFNLLMMLGLTFFASLSNLYFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLSMIASMVWYFFLIFYNVPAKKISPKPFLFLVLVNLTELAMGFGESVLGFNLTNSLFVN HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHEEE TMNCEMMIGSHMMRSPFNNPFWWLFPINPLTMITMTIMKYNLLGKLVMVPFMTIMTTTMA ECCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PFYVIMMGAEMSYLVYERFKKVKTRYLKAWTLGILTGIPIFVVLIPYYTNYYIFGMSGMI HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCHH FPVTLAPFVISLVVIALFSTLFGRGVYCNLVCMSAHMWSNVFYEQFSAKKNSKFWDYLRW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH IFLVPLIIAFYLFVMMGLGKIKLPIDPLDFYGMFTLNYIWWFFYFLTPIFGIYSCARQGW HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC CGFGTFNGIFNKVLFKIRAKDVNTCKECVSKECDTSCPVKIPISNDILKKGYSNRISCIV CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCHHHHHCCCCCCHHHHH CARCVDACDNVEIVNVVTILKNRESKSF HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA