| Definition | Pasteurella multocida subsp. multocida str. Pm70, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002663 |
| Length | 2,257,487 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 15603404
Identifier: 15603404
GI number: 15603404
Start: 1739179
End: 1740744
Strand: Direct
Name: 15603404
Synonym: PM1539
Alternate gene names: NA
Gene position: 1739179-1740744 (Clockwise)
Preceding gene: 15603403
Following gene: 15603405
Centisome position: 77.04
GC content: 30.33
Gene sequence:
>1566_bases ATGTCGGAACATAACAAAACATTTAATAATGAAGTAATGCCGTTGTGGAATCAAATTCTAGAAACAGTCAAAAATATTGA TGTTAAAGGTTTAGAAACATCATCAAGAGATAAAATTGCAAGACTAAAAAAAGTTGTGGCATATATTTCATCAATGATTG ATTCAATTGATCCTGATTTCGTACCACTTTCTATATTGGCAAATATAAAATCTCCCTTGAGTTCTATTCAGAATAATTTA AATTATTATTTAAATAGTGAAGACATAACTTACATAAATTCTATAAACAATGACTATTTAGATACTTTACTTAAAGATTT GATGCCTTTTGTGTTTTATAAAGGTACTGCAAGTAAGTCCTTACAAAATGCATTGAGTGAATATGCAAAAACGGTGTCTG AACATTCATTATCTTATCTAGATGAACTTAAATCTTGTATTCAGGAAGGAAAAGAAATCAAAGAAGATATACAAAAAATT CTAGATGACTTATCAGTAAAAGAGAAAAGAATAGATGCTTATCATGAGTCTCTTTTTAAAGAAGATGGATTCGAAGATGA ACTTAATAAATTGGCAACTGAACTTACAGATAAATCCAGTCAAGTGGAGGAATTATATAATGATATTTTCAAAAAAGAAG GAATTAAGGAAAGAATAACTCTCTACTTAGCAGATGCTGATACAGATAAAAAATCTATTTCATCGTTAAAAAAGAGCTCA TCCGAAATGATTGATGAGCTTAAAGAATTTCATACAGTTATTTTGGGTGAAGAAAATGAAGAAGGTGAAAGAGAAGGGGG ATTAAAAAATGAAATTAATATACGTAGAAAAGAATTAGATGATTTCAAAATTATGCAGCAAGAACGTTATAAAGAACTTA ATAATCAAATTGAGAGCTTATTACCTGGTGCGACATCCGCAGGATTAGCGAAAGCTTATAGTGAGATGAAGAAAAGTTTT AGTCGTGCTGTTATAACTTACGGTTGCTTATTCTATGTTTCATTGGCTTTCTTATTAGCTATCATTTGTGCGGTATATTA TATTCCAGTTTATTTTGGCTTTCCTGAATTATCGTTAGGCTATGTCATATCGAATTTACCAAAACTAACAGCTTTGGCTG TGGATGGTACTACTGAAGCAGTCAATTTGACAGGAAATATTGCAATGAATACTAGTGAACCATCCGTCAGTTCTCAAATT TTTATTATATTAAAGAGTTTAGTCTTTAAATTGTCATTTATTTTGCCGGCTCTATGGCTTGTGCTTTTTGTCTCTAAAAG ACGAAATGAAGCACGACGTTTAGAGCAAGAATATGCACATAAAGAAGCATTAGCAAAATCCTATGATAGCTATAAGCAAC AAATAGAAAAACTCAAACAAGAAGATCAGGATAAACTTCTTTCTATGCTAATGGAGAATATGCTTAAAGCGATAGCATTA AATCCAGCAGAAACATTAGATAAAAATCATAAAGATCCGATGCCAATAGAAGAGGTGATGAATAGAAAAGAAATTTGGAA TATTTTGGATAAGTTTAAAGATTTGGTAACGCCTAAGAAATCATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAGCATTAGAGAACATCAGAGACGCTTTATTACCAAAATTGCTTTCTGGAGAATTACATATTTAAATATAATTTTTACC ATCGCCAAGGAAATTAGTAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GTATTATTGTCTAATCAGACAAATAACACCATTATTTGCCTGACAATTTAAGGCAAAAAATAAGATTTTGATATTTTTAA GAGGAAAGGAATGGTAACAC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 521; Mature: 520
Protein sequence:
>521_residues MSEHNKTFNNEVMPLWNQILETVKNIDVKGLETSSRDKIARLKKVVAYISSMIDSIDPDFVPLSILANIKSPLSSIQNNL NYYLNSEDITYINSINNDYLDTLLKDLMPFVFYKGTASKSLQNALSEYAKTVSEHSLSYLDELKSCIQEGKEIKEDIQKI LDDLSVKEKRIDAYHESLFKEDGFEDELNKLATELTDKSSQVEELYNDIFKKEGIKERITLYLADADTDKKSISSLKKSS SEMIDELKEFHTVILGEENEEGEREGGLKNEINIRRKELDDFKIMQQERYKELNNQIESLLPGATSAGLAKAYSEMKKSF SRAVITYGCLFYVSLAFLLAIICAVYYIPVYFGFPELSLGYVISNLPKLTALAVDGTTEAVNLTGNIAMNTSEPSVSSQI FIILKSLVFKLSFILPALWLVLFVSKRRNEARRLEQEYAHKEALAKSYDSYKQQIEKLKQEDQDKLLSMLMENMLKAIAL NPAETLDKNHKDPMPIEEVMNRKEIWNILDKFKDLVTPKKS
Sequences:
>Translated_521_residues MSEHNKTFNNEVMPLWNQILETVKNIDVKGLETSSRDKIARLKKVVAYISSMIDSIDPDFVPLSILANIKSPLSSIQNNL NYYLNSEDITYINSINNDYLDTLLKDLMPFVFYKGTASKSLQNALSEYAKTVSEHSLSYLDELKSCIQEGKEIKEDIQKI LDDLSVKEKRIDAYHESLFKEDGFEDELNKLATELTDKSSQVEELYNDIFKKEGIKERITLYLADADTDKKSISSLKKSS SEMIDELKEFHTVILGEENEEGEREGGLKNEINIRRKELDDFKIMQQERYKELNNQIESLLPGATSAGLAKAYSEMKKSF SRAVITYGCLFYVSLAFLLAIICAVYYIPVYFGFPELSLGYVISNLPKLTALAVDGTTEAVNLTGNIAMNTSEPSVSSQI FIILKSLVFKLSFILPALWLVLFVSKRRNEARRLEQEYAHKEALAKSYDSYKQQIEKLKQEDQDKLLSMLMENMLKAIAL NPAETLDKNHKDPMPIEEVMNRKEIWNILDKFKDLVTPKKS >Mature_520_residues SEHNKTFNNEVMPLWNQILETVKNIDVKGLETSSRDKIARLKKVVAYISSMIDSIDPDFVPLSILANIKSPLSSIQNNLN YYLNSEDITYINSINNDYLDTLLKDLMPFVFYKGTASKSLQNALSEYAKTVSEHSLSYLDELKSCIQEGKEIKEDIQKIL DDLSVKEKRIDAYHESLFKEDGFEDELNKLATELTDKSSQVEELYNDIFKKEGIKERITLYLADADTDKKSISSLKKSSS EMIDELKEFHTVILGEENEEGEREGGLKNEINIRRKELDDFKIMQQERYKELNNQIESLLPGATSAGLAKAYSEMKKSFS RAVITYGCLFYVSLAFLLAIICAVYYIPVYFGFPELSLGYVISNLPKLTALAVDGTTEAVNLTGNIAMNTSEPSVSSQIF IILKSLVFKLSFILPALWLVLFVSKRRNEARRLEQEYAHKEALAKSYDSYKQQIEKLKQEDQDKLLSMLMENMLKAIALN PAETLDKNHKDPMPIEEVMNRKEIWNILDKFKDLVTPKKS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 59558; Mature: 59427
Theoretical pI: Translated: 4.93; Mature: 4.93
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSEHNKTFNNEVMPLWNQILETVKNIDVKGLETSSRDKIARLKKVVAYISSMIDSIDPDF CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC VPLSILANIKSPLSSIQNNLNYYLNSEDITYINSINNDYLDTLLKDLMPFVFYKGTASKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH LQNALSEYAKTVSEHSLSYLDELKSCIQEGKEIKEDIQKILDDLSVKEKRIDAYHESLFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EDGFEDELNKLATELTDKSSQVEELYNDIFKKEGIKERITLYLADADTDKKSISSLKKSS CCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHH SEMIDELKEFHTVILGEENEEGEREGGLKNEINIRRKELDDFKIMQQERYKELNNQIESL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LPGATSAGLAKAYSEMKKSFSRAVITYGCLFYVSLAFLLAIICAVYYIPVYFGFPELSLG CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH YVISNLPKLTALAVDGTTEAVNLTGNIAMNTSEPSVSSQIFIILKSLVFKLSFILPALWL HHHHCCCHHHEEEECCCCCEEEECCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLFVSKRRNEARRLEQEYAHKEALAKSYDSYKQQIEKLKQEDQDKLLSMLMENMLKAIAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NPAETLDKNHKDPMPIEEVMNRKEIWNILDKFKDLVTPKKS CCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure SEHNKTFNNEVMPLWNQILETVKNIDVKGLETSSRDKIARLKKVVAYISSMIDSIDPDF CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC VPLSILANIKSPLSSIQNNLNYYLNSEDITYINSINNDYLDTLLKDLMPFVFYKGTASKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH LQNALSEYAKTVSEHSLSYLDELKSCIQEGKEIKEDIQKILDDLSVKEKRIDAYHESLFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EDGFEDELNKLATELTDKSSQVEELYNDIFKKEGIKERITLYLADADTDKKSISSLKKSS CCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHH SEMIDELKEFHTVILGEENEEGEREGGLKNEINIRRKELDDFKIMQQERYKELNNQIESL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LPGATSAGLAKAYSEMKKSFSRAVITYGCLFYVSLAFLLAIICAVYYIPVYFGFPELSLG CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH YVISNLPKLTALAVDGTTEAVNLTGNIAMNTSEPSVSSQIFIILKSLVFKLSFILPALWL HHHHCCCHHHEEEECCCCCEEEECCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLFVSKRRNEARRLEQEYAHKEALAKSYDSYKQQIEKLKQEDQDKLLSMLMENMLKAIAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NPAETLDKNHKDPMPIEEVMNRKEIWNILDKFKDLVTPKKS CCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA