Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yqiA

Identifier: 15673616

GI number: 15673616

Start: 1680931

End: 1682361

Strand: Reverse

Name: yqiA

Synonym: L80679

Alternate gene names: 15673616

Gene position: 1682361-1680931 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15673617

Following gene: 15673614

Centisome position: 71.12

GC content: 39.76

Gene sequence:

>1431_bases
ATGGGAGAAAATACTGTTCCTCAAAAATCTAGTGATAATGCGGGTTCAATAGTGGCTTTAATGGTGGCCCTATTGGTAGC
AATCTTTGCTTTTCAGCTCAATGCTTCAATGCTCTCGCCTGCTTTGGTTACCATGCAGACCCAATTACACACGACAGCTT
CGTCTATAGCACTAACACAAACCATCTTTTTTACAGCTGCGGCCTTATTTGCTCTATTTTTGCCTCGTTTGGCGGATTTG
ATTGGACGAAAAAAAGTTCTAATTGGAATGCTTACTTTGACAATGATTGGTTGTCTTATCTCAGGATTTGCTACAAATGT
GGGGATTTTGATGATTGGTCGTATTTTACAAGGTGCTGCTGGCCCTGTGGTTCCGCTTTGTTTAATTATTCTGCATGTGA
AAGTGCGTGATGAGAAGAGATATGCAAAATTAATGGCCATACTCACTTCAATCAATGGTGGAATTGCTGGGGTTGATGCA
TTAGCAGGTGGTTGGCTAGTAAGTCATGGTGGATTTCGTTCTGTATTTTTTGTTATGGGAATTACTGCGGCACTTGCTAT
TCTTTTAGTAAGTTTTGGAACGCAAGAGTCAACTGCAAAAGATACACCAAAAATGGATTGGAGCGGAGTCATTCTTTTAG
TAGTGGCAATGGGTGCGCTCTTGAGCGCGGTGAATGCCTTGCAAGGAAGTTTTGGAAATCTTGGACTTCCTAATTGGCTT
TTAGCTTCACTCTTGGCTCTTTTAGGTTTGATTTGTTTTGTTGGATTTTGGCAAGTTGAAAAACGAGTGAATCATCCAAT
GGTTCCTATTCATTATTTGAAACAAAGAAGAACTTGGGGGTTATTAATTACAACTCTCCTAACGATGACTGGTGTCTTTG
CAATTATGAATGGTATTATTCCAGCTTTGGGTCAAGATGGTAAGTTTGGTTTGGGACTTGGGGCAGATATGGTTTCTCTT
GTTACCCTTACTCCTTATGCGCTTGCTGGCTTATTCTTTGGACCTGTTTCAGGATTCTTGGCTGCACGCTTTGGCTTTAC
AAAAGTCCTTCGGGTTGGACTTTTAACGACGATTATCGGTATTGGTTTGGCCGTTGTTGGAGTGCTACAACCTTCAATCT
GGCTTTTATTGTTGGTATCTACCTTCATTGGGATTACCTATGCTGGAATAACAAATATTATGTTAAATGGTCTGGGAATC
GTGCTTTCACCAGAGGATAATCCAGGTTATCTTCCGGGCTTAAATGCAGGAATGTTTAATTTAGGAGCTGGTATCAGTTT
CATTATTTTGTACGCAGTGCCAACGCTTTTACATACCAGTGTTGGTGGAAGTAGTTCTGGTTATATTTCTGGAATTGTCA
CAGGATTGATTCTTGTTATTATTGCTTTCTTTACTTCATTTTTAATTCCAGATTCTAAAAATGTAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAACTTCGCAAAAAGTAAAATTTATAATATAATAGATAGCTGGGGCTCTTTTAGGTTTGTAAAACTAAAAAGAGTTTATC
CTCTAAAAAAAGGAGAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGAGTTACTTATAAAAAACTCTGTCGGAATTCCGTCAGAGTTTTTTATTCGGGTAAATTATCAAAGTATTCAGGAAAAG
CTTGTAAAACTGCCATTTCT

Product: multidrug transporter

Products: Proton [Cytoplasm]; drug [Periplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 476; Mature: 475

Protein sequence:

>476_residues
MGENTVPQKSSDNAGSIVALMVALLVAIFAFQLNASMLSPALVTMQTQLHTTASSIALTQTIFFTAAALFALFLPRLADL
IGRKKVLIGMLTLTMIGCLISGFATNVGILMIGRILQGAAGPVVPLCLIILHVKVRDEKRYAKLMAILTSINGGIAGVDA
LAGGWLVSHGGFRSVFFVMGITAALAILLVSFGTQESTAKDTPKMDWSGVILLVVAMGALLSAVNALQGSFGNLGLPNWL
LASLLALLGLICFVGFWQVEKRVNHPMVPIHYLKQRRTWGLLITTLLTMTGVFAIMNGIIPALGQDGKFGLGLGADMVSL
VTLTPYALAGLFFGPVSGFLAARFGFTKVLRVGLLTTIIGIGLAVVGVLQPSIWLLLLVSTFIGITYAGITNIMLNGLGI
VLSPEDNPGYLPGLNAGMFNLGAGISFIILYAVPTLLHTSVGGSSSGYISGIVTGLILVIIAFFTSFLIPDSKNVK

Sequences:

>Translated_476_residues
MGENTVPQKSSDNAGSIVALMVALLVAIFAFQLNASMLSPALVTMQTQLHTTASSIALTQTIFFTAAALFALFLPRLADL
IGRKKVLIGMLTLTMIGCLISGFATNVGILMIGRILQGAAGPVVPLCLIILHVKVRDEKRYAKLMAILTSINGGIAGVDA
LAGGWLVSHGGFRSVFFVMGITAALAILLVSFGTQESTAKDTPKMDWSGVILLVVAMGALLSAVNALQGSFGNLGLPNWL
LASLLALLGLICFVGFWQVEKRVNHPMVPIHYLKQRRTWGLLITTLLTMTGVFAIMNGIIPALGQDGKFGLGLGADMVSL
VTLTPYALAGLFFGPVSGFLAARFGFTKVLRVGLLTTIIGIGLAVVGVLQPSIWLLLLVSTFIGITYAGITNIMLNGLGI
VLSPEDNPGYLPGLNAGMFNLGAGISFIILYAVPTLLHTSVGGSSSGYISGIVTGLILVIIAFFTSFLIPDSKNVK
>Mature_475_residues
GENTVPQKSSDNAGSIVALMVALLVAIFAFQLNASMLSPALVTMQTQLHTTASSIALTQTIFFTAAALFALFLPRLADLI
GRKKVLIGMLTLTMIGCLISGFATNVGILMIGRILQGAAGPVVPLCLIILHVKVRDEKRYAKLMAILTSINGGIAGVDAL
AGGWLVSHGGFRSVFFVMGITAALAILLVSFGTQESTAKDTPKMDWSGVILLVVAMGALLSAVNALQGSFGNLGLPNWLL
ASLLALLGLICFVGFWQVEKRVNHPMVPIHYLKQRRTWGLLITTLLTMTGVFAIMNGIIPALGQDGKFGLGLGADMVSLV
TLTPYALAGLFFGPVSGFLAARFGFTKVLRVGLLTTIIGIGLAVVGVLQPSIWLLLLVSTFIGITYAGITNIMLNGLGIV
LSPEDNPGYLPGLNAGMFNLGAGISFIILYAVPTLLHTSVGGSSSGYISGIVTGLILVIIAFFTSFLIPDSKNVK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. EmrB family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004638
- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196
- InterPro:   IPR005829
- InterPro:   IPR001411 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49922; Mature: 49791

Theoretical pI: Translated: 10.13; Mature: 10.13

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGENTVPQKSSDNAGSIVALMVALLVAIFAFQLNASMLSPALVTMQTQLHTTASSIALTQ
CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIFFTAAALFALFLPRLADLIGRKKVLIGMLTLTMIGCLISGFATNVGILMIGRILQGAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GPVVPLCLIILHVKVRDEKRYAKLMAILTSINGGIAGVDALAGGWLVSHGGFRSVFFVMG
CCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHEECCCHHHHHHHHH
ITAALAILLVSFGTQESTAKDTPKMDWSGVILLVVAMGALLSAVNALQGSFGNLGLPNWL
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH
LASLLALLGLICFVGFWQVEKRVNHPMVPIHYLKQRRTWGLLITTLLTMTGVFAIMNGII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PALGQDGKFGLGLGADMVSLVTLTPYALAGLFFGPVSGFLAARFGFTKVLRVGLLTTIIG
HHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGLAVVGVLQPSIWLLLLVSTFIGITYAGITNIMLNGLGIVLSPEDNPGYLPGLNAGMFN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHH
LGAGISFIILYAVPTLLHTSVGGSSSGYISGIVTGLILVIIAFFTSFLIPDSKNVK
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
GENTVPQKSSDNAGSIVALMVALLVAIFAFQLNASMLSPALVTMQTQLHTTASSIALTQ
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIFFTAAALFALFLPRLADLIGRKKVLIGMLTLTMIGCLISGFATNVGILMIGRILQGAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GPVVPLCLIILHVKVRDEKRYAKLMAILTSINGGIAGVDALAGGWLVSHGGFRSVFFVMG
CCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHEECCCHHHHHHHHH
ITAALAILLVSFGTQESTAKDTPKMDWSGVILLVVAMGALLSAVNALQGSFGNLGLPNWL
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH
LASLLALLGLICFVGFWQVEKRVNHPMVPIHYLKQRRTWGLLITTLLTMTGVFAIMNGII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PALGQDGKFGLGLGADMVSLVTLTPYALAGLFFGPVSGFLAARFGFTKVLRVGLLTTIIG
HHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGLAVVGVLQPSIWLLLLVSTFIGITYAGITNIMLNGLGIVLSPEDNPGYLPGLNAGMFN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHH
LGAGISFIILYAVPTLLHTSVGGSSSGYISGIVTGLILVIIAFFTSFLIPDSKNVK
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; drug [Cytoplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + drug [Cytoplasm] = Proton [Cytoplasm] + drug [Periplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]