Definition Chlamydia muridarum Nigg, complete genome.
Accession NC_002620
Length 1,072,950

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The map label for this gene is Not Available

Identifier: 15835123

GI number: 15835123

Start: 610558

End: 613314

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: TC0505

Alternate gene names: NA

Gene position: 610558-613314 (Clockwise)

Preceding gene: 15835122

Following gene: 15835124

Centisome position: 56.9

GC content: 37.47

Gene sequence:

>2757_bases
TTGCGAGCCTTACGTTTTTTGCTCAGTTTACGTCGTGGGGAAGAGAAGCGAGCTTTGTTGTTTCTCTTATTGGGGCTTGT
TTGGAGCGTTGCTTGTTACGGTTCGCTAGCTCTAGGTGAGAGCTTATTTTTAGAAGAAATAGGGACTAAGAAGTTGCCAT
TTGCCTATTTAGGAGCTTCCTTTTTCCTATGCTTTATTTCTTGTGTGGTCCTCTATAGTCTTTCCCGGAAAAGGGCGTCT
CCAAAAGCTCTTTTTCTTTCTTTTATATCTTGCGTACTCGTTTGCAATCTTTATCTCTTCTGGCATCTTGCTATACATAG
AGGAGTTTCTGGCACCCCAATTTTTCTTTATAGAATTTTGATATGGGGATTGACGATTCTATGTTATGCAAATTTTTGGG
GATTTGTAGATCAATTTTTTAATATTCAGGATGCAAAACGTCATTTTTGCATCTTTAATGCCATAACATTTTGCGGAGAC
TTTCTAGGAGCTCGTATTGTTAATCAGATTCAGCATCTTGGAGCAGAACTCATTCTTCTCTCATTTATTGCTGTAATTGT
CTTCACTTTCCCTTTAGTACACTACATTTCATCTTCACTCAAAGAGCTTTCTGAAGATCATGATCTTTTCCTAGATACCG
GTTATCCCCCATCTGCGAAACAAGCTTTTAAGCTATGTTTGAAAGATAAATACACCTTTTATTTGGTTAGCTTTTACTTT
CTTTTGCAATTGCTCGTTGTATTTACTGAATTCAACTATTTAAAAATTTTCGATGCTCAATTTGGAAATGCTAAAAATTT
TGAGTTAACAGAGAATTTTACGAAATACTCGTCCTGGATTTCTCTGGGAAATATGTTCTTTGCCTTATTTGCTTATAGCC
GAGTAATCACAAGGTTTGGAATCAACAACATCATTCTCTTTGCTCCAATCTGTTTCTTTAGCTTATTTGTCTGCTGGTCA
ATTAAAACTTCTGTCCTTATAGCGACAATGGGGATGATTGCTAGGGAAGGACTCGCCTACGCTTTAGATGACAATAATCT
ACAATTGTTGATCTACGGAATTCCTAATAAGATCCGAAACCAAGTACGCATTGCAATAGAATCCTTTGTTGAACCTGCAG
GTATGTTTATCTGTGCCTTACTTTGTTTGTTTATACCCCACCAATACATACTATGTATTATCATCTCTGCAGTTTGTATT
CTTTTGGCACTGCTTCTACGGACTCGTTATTCCGGAGCCATTCTTAGAAATCTTTCTTTAGAATCCTTACATCTCAGACG
TTCTATATCCGAATGGTTTACAGAGATGAACGACACTGAAAAACGCCAAGCAGAAATTCTGCTGTTAACTCATCTAAAAA
ATCCTCAAGAACGCCATCAAATGTTTGCGTTCCAACATCTTCTAAATCTTAAAAATCGAGCTGTTCTTCCCAATCTACTT
CTTCATATGAATAAATTAGGTTTATCAGGGAAACTTAGAACCCTAAACATGTTAAAAAATAGTGTTTGGGCAAAAGATTT
TCTTACTTTAGAACTTCTAAAACGATGGAGCAGCCTTCCTCAACATCCAGCTATCGCCACTGCCATTCACCTTTATTTTG
TAGAACACGACTTACTCAGCGTCTCTGATGTTGCAGATGATCTTTATGATCAATCTGGGGATCGCCTGTTCGCAGCTATT
CTTACCGTAAGAAAGCACAAACCTTGTGGAGAATATCAGGCCCTTGCTCAAAGACGCCTCACAGAAATTCTTCAATCTGA
AGATCCAGAGTTAATTATTAAAGGACTTTCTATCTTATCCTTGGAACGCAAACCTTCGAATTTCCTTACTATCCTTCCAT
TCCTGACCCATTCAAATGAACGAGTTTTCCTACAAGCTTGTTTGGCTTTAGAAAGCTGTGCAGATAAACAATATAGTCAA
TATGGATCCGATATTCTGACTGCGCTTCAAAAAACCAAGGATCTACAGGCCTCCATAGCCCTACTTAATGCTTTATCCCC
TCTGTTAAACGCTCCTTTAATTCAGGAATTTATTACTATCACAGTCCGGCTCAAAAATATTTTACGGAAGCAAGCGGAAG
TAATTTTAGCTTCTCTATCTAAAGAATGTGTCCCAATCCTAATTGAAATCATCTCCAATCCCTCTTTACATAATAACTGC
CGTATTATGGCAGCAAAAGCACTAAGCCGCATAGATAATCGCCAACTCAAACGTCTGGCTTTGAAAATTTTAAAATCCAA
GGCTGCTAAAGCTTTGTTCTATGATTATCATAAAAACTTCATACAAAAACGCTATCCTCACTACGATCTCCATCTCCTTA
TCGAAACTTTAGAAGCCAATTATCATGCTGAAGTAAATTTTATGCTGACTTTCTTAGCAATCATTGGCTCAACAGATTAT
GCAGACGTTTTAATTAGGTCTTTAACAGGGAAAAATTTAAAGGCTCGCGCCCAGGCATTAGAATCCTTAGAAAAGGATTG
CGAAAGCCACTTATTTACTCTCGTTACCCCTTTCGTATATCGAGATACCCATGCTTTTAATGAAAAATATTACATGAAAA
AAGGGGTTGAACCTTTAGCTATAGAAGAGCTTCTTAACTGGATTGAAACAACTCCTTTTCATCTTAGTAAGCTTGCAGCT
TTGCAGCTAAAAGAAGAGCTCTCTCTTTGCGATGCAGAGTTCTCCTCTGCTTTACAGAACTTTTCGAAGAAACAAAAAAC
CTCTATACTACCCCGAGAATATATAACAATCACTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATATAAACTAGTATTTTGAATTAGAATTAATTTTTAAACTCCTTGAAATTAAGAATTAATTCTATTAACATGTTACTTTT
TTTATAAAGGAAGACGAGCG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTTAATCCCCTAAGAGGAACTTCCTTGAACCTTATAGACAAAGCCTTTCTCCTGAAAAAAACTATCTTATTCGCTTCTT
TGGACATGGATGTACTGCTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Lipoprotein

Number of amino acids: Translated: 918; Mature: 918

Protein sequence:

>918_residues
MRALRFLLSLRRGEEKRALLFLLLGLVWSVACYGSLALGESLFLEEIGTKKLPFAYLGASFFLCFISCVVLYSLSRKRAS
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FLGARIVNQIQHLGAELILLSFIAVIVFTFPLVHYISSSLKELSEDHDLFLDTGYPPSAKQAFKLCLKDKYTFYLVSFYF
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LTVRKHKPCGEYQALAQRRLTEILQSEDPELIIKGLSILSLERKPSNFLTILPFLTHSNERVFLQACLALESCADKQYSQ
YGSDILTALQKTKDLQASIALLNALSPLLNAPLIQEFITITVRLKNILRKQAEVILASLSKECVPILIEIISNPSLHNNC
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ADVLIRSLTGKNLKARAQALESLEKDCESHLFTLVTPFVYRDTHAFNEKYYMKKGVEPLAIEELLNWIETTPFHLSKLAA
LQLKEELSLCDAEFSSALQNFSKKQKTSILPREYITIT

Sequences:

>Translated_918_residues
MRALRFLLSLRRGEEKRALLFLLLGLVWSVACYGSLALGESLFLEEIGTKKLPFAYLGASFFLCFISCVVLYSLSRKRAS
PKALFLSFISCVLVCNLYLFWHLAIHRGVSGTPIFLYRILIWGLTILCYANFWGFVDQFFNIQDAKRHFCIFNAITFCGD
FLGARIVNQIQHLGAELILLSFIAVIVFTFPLVHYISSSLKELSEDHDLFLDTGYPPSAKQAFKLCLKDKYTFYLVSFYF
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IKTSVLIATMGMIAREGLAYALDDNNLQLLIYGIPNKIRNQVRIAIESFVEPAGMFICALLCLFIPHQYILCIIISAVCI
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LHMNKLGLSGKLRTLNMLKNSVWAKDFLTLELLKRWSSLPQHPAIATAIHLYFVEHDLLSVSDVADDLYDQSGDRLFAAI
LTVRKHKPCGEYQALAQRRLTEILQSEDPELIIKGLSILSLERKPSNFLTILPFLTHSNERVFLQACLALESCADKQYSQ
YGSDILTALQKTKDLQASIALLNALSPLLNAPLIQEFITITVRLKNILRKQAEVILASLSKECVPILIEIISNPSLHNNC
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LQLKEELSLCDAEFSSALQNFSKKQKTSILPREYITIT
>Mature_918_residues
MRALRFLLSLRRGEEKRALLFLLLGLVWSVACYGSLALGESLFLEEIGTKKLPFAYLGASFFLCFISCVVLYSLSRKRAS
PKALFLSFISCVLVCNLYLFWHLAIHRGVSGTPIFLYRILIWGLTILCYANFWGFVDQFFNIQDAKRHFCIFNAITFCGD
FLGARIVNQIQHLGAELILLSFIAVIVFTFPLVHYISSSLKELSEDHDLFLDTGYPPSAKQAFKLCLKDKYTFYLVSFYF
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YGSDILTALQKTKDLQASIALLNALSPLLNAPLIQEFITITVRLKNILRKQAEVILASLSKECVPILIEIISNPSLHNNC
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LQLKEELSLCDAEFSSALQNFSKKQKTSILPREYITIT

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 105046; Mature: 105046

Theoretical pI: Translated: 8.84; Mature: 8.84

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.4 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
2.4 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRALRFLLSLRRGEEKRALLFLLLGLVWSVACYGSLALGESLFLEEIGTKKLPFAYLGAS
CHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH
FFLCFISCVVLYSLSRKRASPKALFLSFISCVLVCNLYLFWHLAIHRGVSGTPIFLYRIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCEEEEEEECCHHHHH
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HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCH
ESLHLRRSISEWFTEMNDTEKRQAEILLLTHLKNPQERHQMFAFQHLLNLKNRAVLPNLL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
LHMNKLGLSGKLRTLNMLKNSVWAKDFLTLELLKRWSSLPQHPAIATAIHLYFVEHDLLS
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHE
LERKPSNFLTILPFLTHSNERVFLQACLALESCADKQYSQYGSDILTALQKTKDLQASIA
ECCCCCCCEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HCHHHHCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSKKQKTSILPREYITIT
HHHHHHHCCCCCCCEEEC
>Mature Secondary Structure
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CHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH
FFLCFISCVVLYSLSRKRASPKALFLSFISCVLVCNLYLFWHLAIHRGVSGTPIFLYRIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
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SFIAVIVFTFPLVHYISSSLKELSEDHDLFLDTGYPPSAKQAFKLCLKDKYTFYLVSFYF
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RDTHAFNEKYYMKKGVEPLAIEELLNWIETTPFHLSKLAALQLKEELSLCDAEFSSALQN
HCHHHHCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSKKQKTSILPREYITIT
HHHHHHHCCCCCCCEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA