| Definition | Borrelia burgdorferi B31 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_001318 |
| Length | 910,724 |
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The map label for this gene is atpI
Identifier: 15594437
GI number: 15594437
Start: 87377
End: 89203
Strand: Reverse
Name: atpI
Synonym: BB0091
Alternate gene names: 15594437
Gene position: 89203-87377 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15594438
Following gene: 15594436
Centisome position: 9.79
GC content: 28.31
Gene sequence:
>1827_bases ATGATTGTAAAAATGAAAAAAGTGTTGCTTTTAACTTTATCAAAATATAAAAAAGAGTCATTAGAGATTTTAAGAGATTT TGGAGCAGTTCATATTAATTCTTGCAATAAGAATTCAGATTCTTTAAAAAAAAGCATTGATGATAGACGAATTTTAATGC AAGCTTTTTCCCTGCTTAAAGAAGATGGAGGTGTTAAAGCTTTAAAATCTTCTAATGGAAATTTTTTAGATATTGCAAAA AGCATAGTCAATTTGGGCAATGAAATTAAAGAATTTCAAGATATTAAACGATCTTTATTACATGAAAGGAATTTGATTTC TGTTTGGGGAAATTTTTCTTTAGAGAATATTGACGAATTAAAAGAGTCTAACATTTATATTCAATTTTTTAAAATCCAAA AGAGTGAATATAAAAATTTATTAAGAGACCCTAATGTCAATGTGCTTTTGATTAAAAACGTAAAAAACACTTCTTATTTT GTGAGTGTTGGTGAATTTGAGCAAAAAATTGAAATTGCTGATGAGTTTAAATTTAATTTTGATCTTGATTATATTAATAA TAAATTAAAGGTTGTTGATGAGATTTTAGATCAAAAATTGACACAAATTTCTCTTTTTAATAAATATATTGATATTTTAA GAGATGAGATAAAAAATTACGATCAAATCGTAGAGTTTGAGCAAGTTTTAGCTGATATGCAAACTGATTTKGAAGATTTT TCGTATATTACAGGATTTGTTCCAGCTGAAAGTCAAGAATCTCTTAAAAACGCAGTTTTAAAAGCAGGTTTTGCAGCTCA ATTTGCAGATCCTGAAGAAAATGATATTATTCCAACTTATATAAAAAGAAAAGGAATTGCCAATTTAGCTGCACCCATTT TTAATATTTTAGAGACAATTCCTGGGTACAAAGAAAGGGATATAAGTTTTATCTTTATGTTATTTTTCTTTGTGTTTTTT GGTATGATAATAGGTGATGCTGCTTATGGAGTGATATTTTTTTTGATAGGAATTTTGCTTAGTTTGAGTTTTCTTCTTAA AGGCAAGCCCTTAACGCCATTTCATGGGTTAATATTTTATCTTAGTGTATCATCGATACTTTATGGTGCTATGACTGGGA CTTGGTTTGGTAGTCCTTTAATTCTTGAAATGTTTCCTATTTTAAATTCATTTAAAGTTAGTTATTTGACAGAGAAAAAT AGTGTACAAAATATTATCTTTATCTGTTTTTCAATAGGGGTTTTGCAAATTTCATTGGCGCATGTTTGGAATTTTTTCAG ACAAGTAAAAGAAAAGCCCCATATTCATTCAATTGCACAGATTGGTTGGCTTATGTGTATAGTTGGACTTTATTATCTTG TTTTGAATTTAATACTAAGTCAATCTAGATTTCCCATGTATAATGTTGTTTATAATGTAATATATTTTGGCGTTGCACTT GTATTTGTTTTTGGCAAGCAAGATGGTTCAAATTTTTTCAAGTGTATATTGAAAAGTTTTGGGGGTATTATAGAGCAGTT TTTAACCACTGTGTCGGGGTTTGCAGATATAATATCTTATATTAGACTTTTTGCAGTTGGGCTTGCGGGGCTTTCAATAT CAGCAAGTTTTAATACTATGTCAATACCTTTGTTAAAATCTTCTAATATTGGTCTTATAGTAGCTGGAATTATTGTTATA CTTTTTGGGCATGTTTTAAATATAATGTTATCTTTGCTTTCAGTAATTGTTCATGGGGTAAGGCTTAATATGCTTGAATT TTCAAACCATTTGGGGCAAGAATGGAGTGGATGTGCTTATAGGCCTTTTAAAAAAATGAAAAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAAAAAAAATTAATATATATCTTGGAGATCAGCAAACCGCGGCTGTTGTAAGAGGTAAGATTGCTAAATCTAGTTTGATA AAAAAAAATAGGAACAGCTT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAAAAAGGAGTATTTATGGATATAGGTTTAATAGGGGTTAATTCAGCTTTAACAATCTCAGCAATAGGTTCTGCGTTGG GCATGGGGGCGGCAGGTAGT
Product: V-type ATP synthase subunit I
Products: ADP; phosphate; H+
Alternate protein names: V-ATPase subunit I
Number of amino acids: Translated: 608; Mature: 608
Protein sequence:
>608_residues MIVKMKKVLLLTLSKYKKESLEILRDFGAVHINSCNKNSDSLKKSIDDRRILMQAFSLLKEDGGVKALKSSNGNFLDIAK SIVNLGNEIKEFQDIKRSLLHERNLISVWGNFSLENIDELKESNIYIQFFKIQKSEYKNLLRDPNVNVLLIKNVKNTSYF VSVGEFEQKIEIADEFKFNFDLDYINNKLKVVDEILDQKLTQISLFNKYIDILRDEIKNYDQIVEFEQVLADMQTDXEDF SYITGFVPAESQESLKNAVLKAGFAAQFADPEENDIIPTYIKRKGIANLAAPIFNILETIPGYKERDISFIFMLFFFVFF GMIIGDAAYGVIFFLIGILLSLSFLLKGKPLTPFHGLIFYLSVSSILYGAMTGTWFGSPLILEMFPILNSFKVSYLTEKN SVQNIIFICFSIGVLQISLAHVWNFFRQVKEKPHIHSIAQIGWLMCIVGLYYLVLNLILSQSRFPMYNVVYNVIYFGVAL VFVFGKQDGSNFFKCILKSFGGIIEQFLTTVSGFADIISYIRLFAVGLAGLSISASFNTMSIPLLKSSNIGLIVAGIIVI LFGHVLNIMLSLLSVIVHGVRLNMLEFSNHLGQEWSGCAYRPFKKMKK
Sequences:
>Translated_608_residues MIVKMKKVLLLTLSKYKKESLEILRDFGAVHINSCNKNSDSLKKSIDDRRILMQAFSLLKEDGGVKALKSSNGNFLDIAK SIVNLGNEIKEFQDIKRSLLHERNLISVWGNFSLENIDELKESNIYIQFFKIQKSEYKNLLRDPNVNVLLIKNVKNTSYF VSVGEFEQKIEIADEFKFNFDLDYINNKLKVVDEILDQKLTQISLFNKYIDILRDEIKNYDQIVEFEQVLADMQTDXEDF SYITGFVPAESQESLKNAVLKAGFAAQFADPEENDIIPTYIKRKGIANLAAPIFNILETIPGYKERDISFIFMLFFFVFF GMIIGDAAYGVIFFLIGILLSLSFLLKGKPLTPFHGLIFYLSVSSILYGAMTGTWFGSPLILEMFPILNSFKVSYLTEKN SVQNIIFICFSIGVLQISLAHVWNFFRQVKEKPHIHSIAQIGWLMCIVGLYYLVLNLILSQSRFPMYNVVYNVIYFGVAL VFVFGKQDGSNFFKCILKSFGGIIEQFLTTVSGFADIISYIRLFAVGLAGLSISASFNTMSIPLLKSSNIGLIVAGIIVI LFGHVLNIMLSLLSVIVHGVRLNMLEFSNHLGQEWSGCAYRPFKKMKK >Mature_608_residues MIVKMKKVLLLTLSKYKKESLEILRDFGAVHINSCNKNSDSLKKSIDDRRILMQAFSLLKEDGGVKALKSSNGNFLDIAK SIVNLGNEIKEFQDIKRSLLHERNLISVWGNFSLENIDELKESNIYIQFFKIQKSEYKNLLRDPNVNVLLIKNVKNTSYF VSVGEFEQKIEIADEFKFNFDLDYINNKLKVVDEILDQKLTQISLFNKYIDILRDEIKNYDQIVEFEQVLADMQTDXEDF SYITGFVPAESQESLKNAVLKAGFAAQFADPEENDIIPTYIKRKGIANLAAPIFNILETIPGYKERDISFIFMLFFFVFF GMIIGDAAYGVIFFLIGILLSLSFLLKGKPLTPFHGLIFYLSVSSILYGAMTGTWFGSPLILEMFPILNSFKVSYLTEKN SVQNIIFICFSIGVLQISLAHVWNFFRQVKEKPHIHSIAQIGWLMCIVGLYYLVLNLILSQSRFPMYNVVYNVIYFGVAL VFVFGKQDGSNFFKCILKSFGGIIEQFLTTVSGFADIISYIRLFAVGLAGLSISASFNTMSIPLLKSSNIGLIVAGIIVI LFGHVLNIMLSLLSVIVHGVRLNMLEFSNHLGQEWSGCAYRPFKKMKK
Specific function: Produces ATP from ADP in the presence of a proton gradient across the membrane
COG id: COG1269
COG function: function code C; Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential)
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the V-ATPase 116 kDa subunit family
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): VATI_BORBU (O51118)
Other databases:
- EMBL: AE000783 - PIR: C70111 - RefSeq: NP_212225.1 - EnsemblBacteria: EBBORT00000008706 - GeneID: 1194927 - GenomeReviews: AE000783_GR - KEGG: bbu:BB0091 - NMPDR: fig|224326.1.peg.475 - TIGR: BB_0091 - GeneTree: EBGT00050000007378 - HOGENOM: HBG354204 - OMA: YIRLFAV - ProtClustDB: PRK05771 - BioCyc: BBUR224326:BB_0091-MONOMER - BRENDA: 3.6.3.14 - InterPro: IPR002490 - PANTHER: PTHR11629
Pfam domain/function: PF01496 V_ATPase_I
EC number: 3.6.3.14
Molecular weight: Translated: 69070; Mature: 69070
Theoretical pI: Translated: 8.57; Mature: 8.57
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
HASH(0xba6e918)-; HASH(0xb2e4890)-; HASH(0xc2f95ac)-; HASH(0xbe796a4)-; HASH(0xbe98c34)-; HASH(0xb8a6d28)-; HASH(0xbbe3bd0)-; HASH(0xbc24b10)-; HASH(0xbe8a0c8)-;
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIVKMKKVLLLTLSKYKKESLEILRDFGAVHINSCNKNSDSLKKSIDDRRILMQAFSLLK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EDGGVKALKSSNGNFLDIAKSIVNLGNEIKEFQDIKRSLLHERNLISVWGNFSLENIDEL CCCCCEEHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHH KESNIYIQFFKIQKSEYKNLLRDPNVNVLLIKNVKNTSYFVSVGEFEQKIEIADEFKFNF HHCCEEEEEEEECHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHEEEC DLDYINNKLKVVDEILDQKLTQISLFNKYIDILRDEIKNYDQIVEFEQVLADMQTDXEDF CHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH SYITGFVPAESQESLKNAVLKAGFAAQFADPEENDIIPTYIKRKGIANLAAPIFNILETI HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC PGYKERDISFIFMLFFFVFFGMIIGDAAYGVIFFLIGILLSLSFLLKGKPLTPFHGLIFY CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH LSVSSILYGAMTGTWFGSPLILEMFPILNSFKVSYLTEKNSVQNIIFICFSIGVLQISLA HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HVWNFFRQVKEKPHIHSIAQIGWLMCIVGLYYLVLNLILSQSRFPMYNVVYNVIYFGVAL HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH VFVFGKQDGSNFFKCILKSFGGIIEQFLTTVSGFADIISYIRLFAVGLAGLSISASFNTM HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCEE SIPLLKSSNIGLIVAGIIVILFGHVLNIMLSLLSVIVHGVRLNMLEFSNHLGQEWSGCAY EEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC RPFKKMKK CHHHHHCH >Mature Secondary Structure MIVKMKKVLLLTLSKYKKESLEILRDFGAVHINSCNKNSDSLKKSIDDRRILMQAFSLLK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EDGGVKALKSSNGNFLDIAKSIVNLGNEIKEFQDIKRSLLHERNLISVWGNFSLENIDEL CCCCCEEHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHH KESNIYIQFFKIQKSEYKNLLRDPNVNVLLIKNVKNTSYFVSVGEFEQKIEIADEFKFNF HHCCEEEEEEEECHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHEEEC DLDYINNKLKVVDEILDQKLTQISLFNKYIDILRDEIKNYDQIVEFEQVLADMQTDXEDF CHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH SYITGFVPAESQESLKNAVLKAGFAAQFADPEENDIIPTYIKRKGIANLAAPIFNILETI HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC PGYKERDISFIFMLFFFVFFGMIIGDAAYGVIFFLIGILLSLSFLLKGKPLTPFHGLIFY CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH LSVSSILYGAMTGTWFGSPLILEMFPILNSFKVSYLTEKNSVQNIIFICFSIGVLQISLA HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HVWNFFRQVKEKPHIHSIAQIGWLMCIVGLYYLVLNLILSQSRFPMYNVVYNVIYFGVAL HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH VFVFGKQDGSNFFKCILKSFGGIIEQFLTTVSGFADIISYIRLFAVGLAGLSISASFNTM HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCEE SIPLLKSSNIGLIVAGIIVILFGHVLNIMLSLLSVIVHGVRLNMLEFSNHLGQEWSGCAY EEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC RPFKKMKK CHHHHHCH
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: ATP; H2O; H+
Specific reaction: ATP + H2O + H+(in) = ADP + phosphate + H+(out)
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9403685