Definition Helicobacter pylori 26695, complete genome.
Accession NC_000915
Length 1,667,867

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is Not Available

Identifier: 15646088

GI number: 15646088

Start: 1551656

End: 1554190

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: HP1479

Alternate gene names: NA

Gene position: 1554190-1551656 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15646089

Following gene: 15646087

Centisome position: 93.18

GC content: 39.33

Gene sequence:

>2535_bases
GTGCTGAATGAAGAGCAAAATTCATTAGAAGAAAAAGGGGGCGAAAATAAAAACGAAAAAGAAACCCCCCTAAAGGGCAT
TCATTCTAAAATCCCCTCTTTGAAGCAGGCTTTGGAGCAGACGATTAGTAAAATCAAAAGCTCTAAAGAGTTTTTTAAAC
AGATTTTACACAATAAAAAAAAGCTTTATATCGCGCTTGGAGCATTGCTTTTGCTCATTGTGCTCATTGTGGCTTTGAGT
TTGTTACTAGGGCATAAAAAAGAAAATAAACAAACTTCTTTACAAACTAATACCATCGCCACCAATAACGAAACGCCTAA
TAACACCAACAACGCTAACAACACAGAAGCCGAAAGGCAAATAGAGAATTTAGACTTATCCGATCTAATCGGCAAGGACT
CCCTCAAACGAAACGATGAAAATCAAGTGGATGCGATCATGAAAAAAGCGAGCCTTTTGTATGAGCAAGGGCAAAAAGAT
GAAGCTTTGCATTTGTTTGACAAAGCCGCTTCTTTTTCGCAAGGGATTGCGAGCCATAATTTAGGGGTGATTAAGTTTAA
GGAAAAGGATTTTAATGGGGCGTTGGATTTGTTTGATTCTAGCATCGCTTCTAAAGAAAATGCGAGCGTGAGCGCGATTG
ATGCGTTAGTGAGCGCTTATCATTTGCAAGATGAAGATTTGTATTATCATTATCTAAAAATTGCGAGAGACACTTTGTAT
AAAGACTATAAAAAGTCTTTTTATTCCTACGCTTACGCGCTCAAATCCTATTACGCCGGGGAGTATTTTGAAGCCCTTTC
GCCCTTAATGCACCCTAATTCCAACGCCTTTTTAAAGCCTAATACGCGCTTAGCGTCTAAATTGTTTTTGATGTTTAAAG
ATGAAACGAACGCTTACGAGCAATTACAAAAAAGCGCAAACGCCCAAGATGAGCTTGCTTTAGGGCTTTTGCAGGCGCGT
TTGGGCCATTACAAGCAGGCTTTGGAGCATTTGCAGCATTATTTGCACAACTACCCTAAAGATTTAAACGCTTTGATGGC
TTTGGAATTGGTGAGTTTGAAAAAAGGCGACACCCTTAAAGCGAGCGAAGCCTTAAAATTAGCCAGCCACACCAAAGAAG
ACACGCTATTAGCCAACTCTTTTTACCCCATCAAGCCCACGATAAACCCTGTTTTTTTAGACAAAGAAAGAGCCAAAGAG
CGTTTTTGGAACACGCAATATTTTGAAGGCAAAAGGGATTTTATCTACCGCTTGCTCTTTTATTACGCTCCTTTTAAGGT
TTTAGACTCTAAAGAAACCTTAGGCGTGATTGAAGAGGGGCTGTTTCTTTTAGACTCTGATGCACAAAAGGATTTAGAGG
GGGCAAGCCTTGCTTTTAAAAGGGGGCGTTTGATGGCGATAGCGGATAAAAACGCGCTTCAAGGGTTGAAAGCGTTAGAA
AACAAGCGCTTAAAAAAAGCCCTTTCTTTTTTTGATTTGTCTTTAAAAAACAGCCCCAATAACGCACTCCTCCATTATAA
TACGGGCTTGATTTATGCGCAATTGGAAAATTACCATAAAGCCTATTTCCATTTTTTAAGGGCTTTCCATTTAAACTCTG
CGGATTATTTGAGCGCGGTTTTTGCAATTTTAGCTTCGCATTTCACCCACGAAGACACCACGGAGTTTTTAAGAGAAATC
ACCGAGAATTTTTATAGTCAGGATTTTTCTAGCCCCACGCAAAAAGCTTTACTCTCTTCGCTCATCGCTTATTTGAATTA
CCGCACCAATTGGGATATGGACTGGCTTAAAAACGCCCCTAAAAAACTCCCTTTTTATTACGCGCTAGAAGCGGCGTTCG
CTAAAGAGAGCAAGGATAAAAAATTGATGGTGCAATCCTTTGGGAATTTAAAAAAAATGCTCCCTAAAGATCTCATCTCT
AATATTTTTTATGAAATCGTTTCGTATTACGATGCGAGTATCCGCCACACTTTAAGCATTTACACCCTTTTAGATTCGCA
TAAAATCAGTTGGGATCAAACCATGCAAGGGCCCATTTTAGGGCGCCATTTCTACACTTACATGGGATTTATGGTCAATG
ATTTAGATCATCAAGAAAGATTACTAGAGCAAAAAATCGCCAGTTTAGAAGAGGGAGAAGCCCCTAACGATTGGTTGGAA
AATTTAGCGCTAGTGAGTTTGTTTCAAGGCCAGTATGAAAAAGCGAGTGCGTTGTATCAAAACTTAATTAGCGGGCTTAA
GGATAATGAGACGCACTTAAAAATCCTAGCGGGTTTGACTTATATCGCGCAGAATAATTACGATAGTGCGGCTTTATGGC
TAGAGCTTGGGAAACTAGACGATCCGAATAATGAAAATATCCGTTACGCTTTAGGGTTGTTGTATCAAAGAAAAGGGGAC
TTGAAATCAGCGCTAAACCATTTTTTAGCCATTAAAACCTCTGATTTTTCTTCGCCTTATTTTGATTTTGAAATTGATGC
GAACCTTTTAAAAGAGCGTTTGGACCAAGAAAAAGAAGGCGAGTTTTTAGAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTAGGCAGGACGATGGTCGCTTTAATGGAAAACCACCAGCAAGCGGATGGGAGCATCCACATTCCTAAGGCATTAGAAA
AATACCTTTAAGGCTAGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGATTTTGAAAAAAGCATTTTAGACCATTTAAACGGAGCGCAAAAAATCGCTGCAAGCCACATTCAAGGGCCATTGCTC
ATTTTAGCGGGAGCTGGGAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 844; Mature: 844

Protein sequence:

>844_residues
MLNEEQNSLEEKGGENKNEKETPLKGIHSKIPSLKQALEQTISKIKSSKEFFKQILHNKKKLYIALGALLLLIVLIVALS
LLLGHKKENKQTSLQTNTIATNNETPNNTNNANNTEAERQIENLDLSDLIGKDSLKRNDENQVDAIMKKASLLYEQGQKD
EALHLFDKAASFSQGIASHNLGVIKFKEKDFNGALDLFDSSIASKENASVSAIDALVSAYHLQDEDLYYHYLKIARDTLY
KDYKKSFYSYAYALKSYYAGEYFEALSPLMHPNSNAFLKPNTRLASKLFLMFKDETNAYEQLQKSANAQDELALGLLQAR
LGHYKQALEHLQHYLHNYPKDLNALMALELVSLKKGDTLKASEALKLASHTKEDTLLANSFYPIKPTINPVFLDKERAKE
RFWNTQYFEGKRDFIYRLLFYYAPFKVLDSKETLGVIEEGLFLLDSDAQKDLEGASLAFKRGRLMAIADKNALQGLKALE
NKRLKKALSFFDLSLKNSPNNALLHYNTGLIYAQLENYHKAYFHFLRAFHLNSADYLSAVFAILASHFTHEDTTEFLREI
TENFYSQDFSSPTQKALLSSLIAYLNYRTNWDMDWLKNAPKKLPFYYALEAAFAKESKDKKLMVQSFGNLKKMLPKDLIS
NIFYEIVSYYDASIRHTLSIYTLLDSHKISWDQTMQGPILGRHFYTYMGFMVNDLDHQERLLEQKIASLEEGEAPNDWLE
NLALVSLFQGQYEKASALYQNLISGLKDNETHLKILAGLTYIAQNNYDSAALWLELGKLDDPNNENIRYALGLLYQRKGD
LKSALNHFLAIKTSDFSSPYFDFEIDANLLKERLDQEKEGEFLE

Sequences:

>Translated_844_residues
MLNEEQNSLEEKGGENKNEKETPLKGIHSKIPSLKQALEQTISKIKSSKEFFKQILHNKKKLYIALGALLLLIVLIVALS
LLLGHKKENKQTSLQTNTIATNNETPNNTNNANNTEAERQIENLDLSDLIGKDSLKRNDENQVDAIMKKASLLYEQGQKD
EALHLFDKAASFSQGIASHNLGVIKFKEKDFNGALDLFDSSIASKENASVSAIDALVSAYHLQDEDLYYHYLKIARDTLY
KDYKKSFYSYAYALKSYYAGEYFEALSPLMHPNSNAFLKPNTRLASKLFLMFKDETNAYEQLQKSANAQDELALGLLQAR
LGHYKQALEHLQHYLHNYPKDLNALMALELVSLKKGDTLKASEALKLASHTKEDTLLANSFYPIKPTINPVFLDKERAKE
RFWNTQYFEGKRDFIYRLLFYYAPFKVLDSKETLGVIEEGLFLLDSDAQKDLEGASLAFKRGRLMAIADKNALQGLKALE
NKRLKKALSFFDLSLKNSPNNALLHYNTGLIYAQLENYHKAYFHFLRAFHLNSADYLSAVFAILASHFTHEDTTEFLREI
TENFYSQDFSSPTQKALLSSLIAYLNYRTNWDMDWLKNAPKKLPFYYALEAAFAKESKDKKLMVQSFGNLKKMLPKDLIS
NIFYEIVSYYDASIRHTLSIYTLLDSHKISWDQTMQGPILGRHFYTYMGFMVNDLDHQERLLEQKIASLEEGEAPNDWLE
NLALVSLFQGQYEKASALYQNLISGLKDNETHLKILAGLTYIAQNNYDSAALWLELGKLDDPNNENIRYALGLLYQRKGD
LKSALNHFLAIKTSDFSSPYFDFEIDANLLKERLDQEKEGEFLE
>Mature_844_residues
MLNEEQNSLEEKGGENKNEKETPLKGIHSKIPSLKQALEQTISKIKSSKEFFKQILHNKKKLYIALGALLLLIVLIVALS
LLLGHKKENKQTSLQTNTIATNNETPNNTNNANNTEAERQIENLDLSDLIGKDSLKRNDENQVDAIMKKASLLYEQGQKD
EALHLFDKAASFSQGIASHNLGVIKFKEKDFNGALDLFDSSIASKENASVSAIDALVSAYHLQDEDLYYHYLKIARDTLY
KDYKKSFYSYAYALKSYYAGEYFEALSPLMHPNSNAFLKPNTRLASKLFLMFKDETNAYEQLQKSANAQDELALGLLQAR
LGHYKQALEHLQHYLHNYPKDLNALMALELVSLKKGDTLKASEALKLASHTKEDTLLANSFYPIKPTINPVFLDKERAKE
RFWNTQYFEGKRDFIYRLLFYYAPFKVLDSKETLGVIEEGLFLLDSDAQKDLEGASLAFKRGRLMAIADKNALQGLKALE
NKRLKKALSFFDLSLKNSPNNALLHYNTGLIYAQLENYHKAYFHFLRAFHLNSADYLSAVFAILASHFTHEDTTEFLREI
TENFYSQDFSSPTQKALLSSLIAYLNYRTNWDMDWLKNAPKKLPFYYALEAAFAKESKDKKLMVQSFGNLKKMLPKDLIS
NIFYEIVSYYDASIRHTLSIYTLLDSHKISWDQTMQGPILGRHFYTYMGFMVNDLDHQERLLEQKIASLEEGEAPNDWLE
NLALVSLFQGQYEKASALYQNLISGLKDNETHLKILAGLTYIAQNNYDSAALWLELGKLDDPNNENIRYALGLLYQRKGD
LKSALNHFLAIKTSDFSSPYFDFEIDANLLKERLDQEKEGEFLE

Specific function: Unknown

COG id: COG0457

COG function: function code R; FOG: TPR repeat

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96655; Mature: 96655

Theoretical pI: Translated: 6.62; Mature: 6.62

Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION L=RR

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
1.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
1.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLNEEQNSLEEKGGENKNEKETPLKGIHSKIPSLKQALEQTISKIKSSKEFFKQILHNKK
CCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
KLYIALGALLLLIVLIVALSLLLGHKKENKQTSLQTNTIATNNETPNNTNNANNTEAERQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCEECEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
IENLDLSDLIGKDSLKRNDENQVDAIMKKASLLYEQGQKDEALHLFDKAASFSQGIASHN
HHCCCHHHHHCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LGVIKFKEKDFNGALDLFDSSIASKENASVSAIDALVSAYHLQDEDLYYHYLKIARDTLY
CCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
KDYKKSFYSYAYALKSYYAGEYFEALSPLMHPNSNAFLKPNTRLASKLFLMFKDETNAYE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCHHHHHHHHHEECCCCCHHH
QLQKSANAQDELALGLLQARLGHYKQALEHLQHYLHNYPKDLNALMALELVSLKKGDTLK
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
ASEALKLASHTKEDTLLANSFYPIKPTINPVFLDKERAKERFWNTQYFEGKRDFIYRLLF
HHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHH
YYAPFKVLDSKETLGVIEEGLFLLDSDAQKDLEGASLAFKRGRLMAIADKNALQGLKALE
HHCCHHHCCCHHHHHHHHHCCEEECCCHHHCCCHHHHHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHH
NKRLKKALSFFDLSLKNSPNNALLHYNTGLIYAQLENYHKAYFHFLRAFHLNSADYLSAV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
FAILASHFTHEDTTEFLREITENFYSQDFSSPTQKALLSSLIAYLNYRTNWDMDWLKNAP
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCC
KKLPFYYALEAAFAKESKDKKLMVQSFGNLKKMLPKDLISNIFYEIVSYYDASIRHTLSI
HHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YTLLDSHKISWDQTMQGPILGRHFYTYMGFMVNDLDHQERLLEQKIASLEEGEAPNDWLE
HHHHHCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
NLALVSLFQGQYEKASALYQNLISGLKDNETHLKILAGLTYIAQNNYDSAALWLELGKLD
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHEEEECCCC
DPNNENIRYALGLLYQRKGDLKSALNHFLAIKTSDFSSPYFDFEIDANLLKERLDQEKEG
CCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHEEEEECCCCCCCEEEEECHHHHHHHHCCCCCC
EFLE
CCCC
>Mature Secondary Structure
MLNEEQNSLEEKGGENKNEKETPLKGIHSKIPSLKQALEQTISKIKSSKEFFKQILHNKK
CCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
KLYIALGALLLLIVLIVALSLLLGHKKENKQTSLQTNTIATNNETPNNTNNANNTEAERQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCEECEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
IENLDLSDLIGKDSLKRNDENQVDAIMKKASLLYEQGQKDEALHLFDKAASFSQGIASHN
HHCCCHHHHHCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LGVIKFKEKDFNGALDLFDSSIASKENASVSAIDALVSAYHLQDEDLYYHYLKIARDTLY
CCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
KDYKKSFYSYAYALKSYYAGEYFEALSPLMHPNSNAFLKPNTRLASKLFLMFKDETNAYE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCHHHHHHHHHEECCCCCHHH
QLQKSANAQDELALGLLQARLGHYKQALEHLQHYLHNYPKDLNALMALELVSLKKGDTLK
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
ASEALKLASHTKEDTLLANSFYPIKPTINPVFLDKERAKERFWNTQYFEGKRDFIYRLLF
HHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHH
YYAPFKVLDSKETLGVIEEGLFLLDSDAQKDLEGASLAFKRGRLMAIADKNALQGLKALE
HHCCHHHCCCHHHHHHHHHCCEEECCCHHHCCCHHHHHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHH
NKRLKKALSFFDLSLKNSPNNALLHYNTGLIYAQLENYHKAYFHFLRAFHLNSADYLSAV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
FAILASHFTHEDTTEFLREITENFYSQDFSSPTQKALLSSLIAYLNYRTNWDMDWLKNAP
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCC
KKLPFYYALEAAFAKESKDKKLMVQSFGNLKKMLPKDLISNIFYEIVSYYDASIRHTLSI
HHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YTLLDSHKISWDQTMQGPILGRHFYTYMGFMVNDLDHQERLLEQKIASLEEGEAPNDWLE
HHHHHCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
NLALVSLFQGQYEKASALYQNLISGLKDNETHLKILAGLTYIAQNNYDSAALWLELGKLD
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHEEEECCCC
DPNNENIRYALGLLYQRKGDLKSALNHFLAIKTSDFSSPYFDFEIDANLLKERLDQEKEG
CCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHEEEEECCCCCCCEEEEECHHHHHHHHCCCCCC
EFLE
CCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA