| Definition | Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_000909 |
| Length | 1,664,970 |
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The map label for this gene is 15669474
Identifier: 15669474
GI number: 15669474
Start: 1232581
End: 1234368
Strand: Reverse
Name: 15669474
Synonym: MJ1286
Alternate gene names: NA
Gene position: 1234368-1232581 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15669475
Following gene: 15669473
Centisome position: 74.14
GC content: 30.37
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases AGAATAGCTGAGTTCATTGGAATTTCAGAAAAAGAGATTATTAATGAACTTCATAGTAGAGCAGAATTTTTGAGGAATTT ATGTAAAACAAAACCAAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases TAAATGGAATTGGACTATTTACTTGCAACAGCCATGTTTTTAATTGTATGTGTCTATGTTATATCTGAAACCGTTAATTT ACATAGTGTTTATGATATTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 595; Mature: 595
Protein sequence:
>595_residues MKNLLKRYVSIKNIIKVIELDFFANLKLRYYKLAMKLFKIEDEKFDEILLKAGMNAVSSTYLPVVFLTSIILGLIIFIIF LIVFNIFYAIFGLIGGIFIVILIGVLYPYVLAEEKAKSIDENLPYAFAFISALSSANIPVVEIFTSLSKEDIYGGMSKEA KEIVKDTKVFNYDIITTFLRRARITPSKKLSSVYYNIVASLIVGAEMKNIFHEIYERLMEDRKLELFEAIEKVEILSEFY VIACGMIPLFVVMTVPVASSISAILQTASLFGDPKLLPLTFYLWVPIASIIFMGLVYGILPKDFKLNVSLLDVLKEFDEP EIEGIKMKFKWKPVHFITLFFWMLSIISFMLFFIRKSIFKFHGTDFLMFGILFLILPFILTSYWHFIIENQKERYYPIFL NDLTMAVRSGMDIIRAMQVCARTNYGPLTKIVKKMAIQMSWGRPVNEVFADLERTEKSLIAKRIASILKECAVSGGDVKD ILTSVTVHAYKLSEMKREISARQFIYVVVIYLSFFLYIGTSYIMVHSLLPTLLKNIHGLSVEFYKNYLFQGILIYSIFSG ASLGILTERSIIAGIKHILLMLIVGYMLFKFYIGG
Sequences:
>Translated_595_residues MKNLLKRYVSIKNIIKVIELDFFANLKLRYYKLAMKLFKIEDEKFDEILLKAGMNAVSSTYLPVVFLTSIILGLIIFIIF LIVFNIFYAIFGLIGGIFIVILIGVLYPYVLAEEKAKSIDENLPYAFAFISALSSANIPVVEIFTSLSKEDIYGGMSKEA KEIVKDTKVFNYDIITTFLRRARITPSKKLSSVYYNIVASLIVGAEMKNIFHEIYERLMEDRKLELFEAIEKVEILSEFY VIACGMIPLFVVMTVPVASSISAILQTASLFGDPKLLPLTFYLWVPIASIIFMGLVYGILPKDFKLNVSLLDVLKEFDEP EIEGIKMKFKWKPVHFITLFFWMLSIISFMLFFIRKSIFKFHGTDFLMFGILFLILPFILTSYWHFIIENQKERYYPIFL NDLTMAVRSGMDIIRAMQVCARTNYGPLTKIVKKMAIQMSWGRPVNEVFADLERTEKSLIAKRIASILKECAVSGGDVKD ILTSVTVHAYKLSEMKREISARQFIYVVVIYLSFFLYIGTSYIMVHSLLPTLLKNIHGLSVEFYKNYLFQGILIYSIFSG ASLGILTERSIIAGIKHILLMLIVGYMLFKFYIGG >Mature_595_residues MKNLLKRYVSIKNIIKVIELDFFANLKLRYYKLAMKLFKIEDEKFDEILLKAGMNAVSSTYLPVVFLTSIILGLIIFIIF LIVFNIFYAIFGLIGGIFIVILIGVLYPYVLAEEKAKSIDENLPYAFAFISALSSANIPVVEIFTSLSKEDIYGGMSKEA KEIVKDTKVFNYDIITTFLRRARITPSKKLSSVYYNIVASLIVGAEMKNIFHEIYERLMEDRKLELFEAIEKVEILSEFY VIACGMIPLFVVMTVPVASSISAILQTASLFGDPKLLPLTFYLWVPIASIIFMGLVYGILPKDFKLNVSLLDVLKEFDEP EIEGIKMKFKWKPVHFITLFFWMLSIISFMLFFIRKSIFKFHGTDFLMFGILFLILPFILTSYWHFIIENQKERYYPIFL NDLTMAVRSGMDIIRAMQVCARTNYGPLTKIVKKMAIQMSWGRPVNEVFADLERTEKSLIAKRIASILKECAVSGGDVKD ILTSVTVHAYKLSEMKREISARQFIYVVVIYLSFFLYIGTSYIMVHSLLPTLLKNIHGLSVEFYKNYLFQGILIYSIFSG ASLGILTERSIIAGIKHILLMLIVGYMLFKFYIGG
Specific function: Unknown
COG id: COG2064
COG function: function code NU; Flp pilus assembly protein TadC
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential)
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To M.jannaschii flaJ
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): Y1286_METJA (Q58682)
Other databases:
- EMBL: L77117 - PIR: E64460 - RefSeq: NP_248284.1 - GeneID: 1452186 - GenomeReviews: L77117_GR - KEGG: mja:MJ_1286 - NMPDR: fig|243232.1.peg.1321 - TIGR: MJ1286 - OMA: ASILKEC - ProtClustDB: CLSK2517713 - BioCyc: MJAN243232:MJ_1286-MONOMER - InterPro: IPR018076
Pfam domain/function: PF00482 GSPII_F
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 68278; Mature: 68278
Theoretical pI: Translated: 9.51; Mature: 9.51
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
HASH(0xd080a0c)-; HASH(0xd6970c8)-; HASH(0xe25dc58)-; HASH(0xe656ef8)-; HASH(0xe8239bc)-; HASH(0xe7081a8)-; HASH(0xdea6f14)-; HASH(0xdb8ccd0)-; HASH(0xe4fced4)-;
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 3.7 %Met (Translated Protein) 4.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 3.7 %Met (Mature Protein) 4.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKNLLKRYVSIKNIIKVIELDFFANLKLRYYKLAMKLFKIEDEKFDEILLKAGMNAVSST CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCHHHHHH YLPVVFLTSIILGLIIFIIFLIVFNIFYAIFGLIGGIFIVILIGVLYPYVLAEEKAKSID HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ENLPYAFAFISALSSANIPVVEIFTSLSKEDIYGGMSKEAKEIVKDTKVFNYDIITTFLR CCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RARITPSKKLSSVYYNIVASLIVGAEMKNIFHEIYERLMEDRKLELFEAIEKVEILSEFY HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH VIACGMIPLFVVMTVPVASSISAILQTASLFGDPKLLPLTFYLWVPIASIIFMGLVYGIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PKDFKLNVSLLDVLKEFDEPEIEGIKMKFKWKPVHFITLFFWMLSIISFMLFFIRKSIFK CCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FHGTDFLMFGILFLILPFILTSYWHFIIENQKERYYPIFLNDLTMAVRSGMDIIRAMQVC HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ARTNYGPLTKIVKKMAIQMSWGRPVNEVFADLERTEKSLIAKRIASILKECAVSGGDVKD HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH ILTSVTVHAYKLSEMKREISARQFIYVVVIYLSFFLYIGTSYIMVHSLLPTLLKNIHGLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH VEFYKNYLFQGILIYSIFSGASLGILTERSIIAGIKHILLMLIVGYMLFKFYIGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH >Mature Secondary Structure MKNLLKRYVSIKNIIKVIELDFFANLKLRYYKLAMKLFKIEDEKFDEILLKAGMNAVSST CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCHHHHHH YLPVVFLTSIILGLIIFIIFLIVFNIFYAIFGLIGGIFIVILIGVLYPYVLAEEKAKSID HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ENLPYAFAFISALSSANIPVVEIFTSLSKEDIYGGMSKEAKEIVKDTKVFNYDIITTFLR CCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RARITPSKKLSSVYYNIVASLIVGAEMKNIFHEIYERLMEDRKLELFEAIEKVEILSEFY HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH VIACGMIPLFVVMTVPVASSISAILQTASLFGDPKLLPLTFYLWVPIASIIFMGLVYGIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PKDFKLNVSLLDVLKEFDEPEIEGIKMKFKWKPVHFITLFFWMLSIISFMLFFIRKSIFK CCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FHGTDFLMFGILFLILPFILTSYWHFIIENQKERYYPIFLNDLTMAVRSGMDIIRAMQVC HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ARTNYGPLTKIVKKMAIQMSWGRPVNEVFADLERTEKSLIAKRIASILKECAVSGGDVKD HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH ILTSVTVHAYKLSEMKREISARQFIYVVVIYLSFFLYIGTSYIMVHSLLPTLLKNIHGLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH VEFYKNYLFQGILIYSIFSGASLGILTERSIIAGIKHILLMLIVGYMLFKFYIGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087