Definition Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 chromosome, complete genome.
Accession NC_000909
Length 1,664,970

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The map label for this gene is 15669474

Identifier: 15669474

GI number: 15669474

Start: 1232581

End: 1234368

Strand: Reverse

Name: 15669474

Synonym: MJ1286

Alternate gene names: NA

Gene position: 1234368-1232581 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15669475

Following gene: 15669473

Centisome position: 74.14

GC content: 30.37

Gene sequence:

>1788_bases
TTGAAGAATTTGTTAAAAAGATATGTGAGTATAAAGAATATCATAAAGGTGATTGAATTGGATTTTTTTGCCAATTTAAA
GTTAAGGTATTATAAATTGGCTATGAAACTTTTTAAAATAGAGGATGAGAAATTTGATGAAATTTTATTAAAAGCAGGTA
TGAATGCAGTTTCTTCCACATATCTGCCTGTAGTATTTTTAACATCTATAATATTAGGGTTAATTATCTTCATAATTTTT
TTAATAGTATTTAATATATTCTATGCAATTTTTGGGCTTATTGGAGGGATTTTTATTGTTATTCTTATTGGGGTCTTATA
TCCTTATGTCTTAGCTGAAGAAAAGGCTAAAAGTATAGATGAGAATTTACCTTATGCGTTTGCCTTTATCTCTGCCTTAT
CTTCAGCAAACATTCCTGTAGTGGAGATATTTACTTCTCTATCAAAAGAGGATATTTATGGAGGGATGAGTAAAGAGGCA
AAAGAAATAGTTAAGGATACGAAGGTATTCAATTATGACATTATAACAACATTTTTAAGAAGAGCAAGGATAACACCAAG
TAAAAAGCTGTCTTCAGTTTATTATAATATAGTAGCCTCTTTAATAGTTGGGGCTGAGATGAAAAACATTTTTCATGAAA
TATATGAACGATTGATGGAAGATAGAAAGTTGGAATTATTTGAAGCTATTGAAAAAGTTGAGATACTGTCTGAGTTTTAT
GTAATAGCATGTGGTATGATTCCTCTTTTTGTTGTTATGACAGTTCCTGTAGCTTCATCCATTAGTGCAATTTTACAAAC
CGCATCACTTTTTGGAGACCCAAAGCTACTTCCACTGACCTTTTATTTATGGGTTCCAATAGCATCAATAATTTTTATGG
GATTGGTTTATGGAATACTACCAAAAGACTTCAAATTAAATGTTTCTTTATTAGATGTTTTAAAAGAATTTGATGAACCA
GAGATAGAAGGCATAAAAATGAAATTTAAATGGAAACCAGTTCATTTTATTACTTTGTTTTTTTGGATGCTTTCTATAAT
TTCTTTTATGTTGTTTTTCATTAGAAAATCAATTTTTAAGTTCCATGGAACTGATTTCTTAATGTTTGGAATTTTGTTTC
TTATACTTCCTTTTATTTTAACAAGCTATTGGCATTTTATTATTGAAAATCAAAAGGAGAGATACTACCCTATATTTTTA
AATGATTTAACCATGGCTGTGAGAAGTGGTATGGATATAATTAGAGCGATGCAGGTCTGTGCAAGAACGAACTATGGGCC
TTTAACAAAAATTGTTAAAAAAATGGCTATTCAGATGTCTTGGGGAAGGCCTGTGAATGAAGTATTTGCCGATTTAGAAA
GAACAGAAAAATCTTTAATTGCAAAAAGAATCGCCTCAATATTAAAAGAATGTGCCGTCTCTGGTGGGGATGTAAAGGAT
ATCTTAACCTCAGTTACGGTTCATGCATACAAGTTAAGTGAAATGAAAAGGGAGATAAGTGCAAGGCAGTTTATATATGT
GGTTGTCATCTATCTCTCATTTTTCCTGTACATTGGGACATCGTACATTATGGTTCATTCCCTCCTGCCAACATTATTAA
AAAATATTCATGGTTTGAGTGTTGAATTTTATAAAAACTATTTATTCCAAGGAATTTTGATATATTCCATATTCTCTGGA
GCTTCTTTAGGAATACTTACTGAGAGGTCGATTATTGCTGGAATAAAGCATATATTACTAATGTTGATTGTTGGATATAT
GCTGTTTAAATTTTACATTGGGGGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGAATAGCTGAGTTCATTGGAATTTCAGAAAAAGAGATTATTAATGAACTTCATAGTAGAGCAGAATTTTTGAGGAATTT
ATGTAAAACAAAACCAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAATGGAATTGGACTATTTACTTGCAACAGCCATGTTTTTAATTGTATGTGTCTATGTTATATCTGAAACCGTTAATTT
ACATAGTGTTTATGATATTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 595; Mature: 595

Protein sequence:

>595_residues
MKNLLKRYVSIKNIIKVIELDFFANLKLRYYKLAMKLFKIEDEKFDEILLKAGMNAVSSTYLPVVFLTSIILGLIIFIIF
LIVFNIFYAIFGLIGGIFIVILIGVLYPYVLAEEKAKSIDENLPYAFAFISALSSANIPVVEIFTSLSKEDIYGGMSKEA
KEIVKDTKVFNYDIITTFLRRARITPSKKLSSVYYNIVASLIVGAEMKNIFHEIYERLMEDRKLELFEAIEKVEILSEFY
VIACGMIPLFVVMTVPVASSISAILQTASLFGDPKLLPLTFYLWVPIASIIFMGLVYGILPKDFKLNVSLLDVLKEFDEP
EIEGIKMKFKWKPVHFITLFFWMLSIISFMLFFIRKSIFKFHGTDFLMFGILFLILPFILTSYWHFIIENQKERYYPIFL
NDLTMAVRSGMDIIRAMQVCARTNYGPLTKIVKKMAIQMSWGRPVNEVFADLERTEKSLIAKRIASILKECAVSGGDVKD
ILTSVTVHAYKLSEMKREISARQFIYVVVIYLSFFLYIGTSYIMVHSLLPTLLKNIHGLSVEFYKNYLFQGILIYSIFSG
ASLGILTERSIIAGIKHILLMLIVGYMLFKFYIGG

Sequences:

>Translated_595_residues
MKNLLKRYVSIKNIIKVIELDFFANLKLRYYKLAMKLFKIEDEKFDEILLKAGMNAVSSTYLPVVFLTSIILGLIIFIIF
LIVFNIFYAIFGLIGGIFIVILIGVLYPYVLAEEKAKSIDENLPYAFAFISALSSANIPVVEIFTSLSKEDIYGGMSKEA
KEIVKDTKVFNYDIITTFLRRARITPSKKLSSVYYNIVASLIVGAEMKNIFHEIYERLMEDRKLELFEAIEKVEILSEFY
VIACGMIPLFVVMTVPVASSISAILQTASLFGDPKLLPLTFYLWVPIASIIFMGLVYGILPKDFKLNVSLLDVLKEFDEP
EIEGIKMKFKWKPVHFITLFFWMLSIISFMLFFIRKSIFKFHGTDFLMFGILFLILPFILTSYWHFIIENQKERYYPIFL
NDLTMAVRSGMDIIRAMQVCARTNYGPLTKIVKKMAIQMSWGRPVNEVFADLERTEKSLIAKRIASILKECAVSGGDVKD
ILTSVTVHAYKLSEMKREISARQFIYVVVIYLSFFLYIGTSYIMVHSLLPTLLKNIHGLSVEFYKNYLFQGILIYSIFSG
ASLGILTERSIIAGIKHILLMLIVGYMLFKFYIGG
>Mature_595_residues
MKNLLKRYVSIKNIIKVIELDFFANLKLRYYKLAMKLFKIEDEKFDEILLKAGMNAVSSTYLPVVFLTSIILGLIIFIIF
LIVFNIFYAIFGLIGGIFIVILIGVLYPYVLAEEKAKSIDENLPYAFAFISALSSANIPVVEIFTSLSKEDIYGGMSKEA
KEIVKDTKVFNYDIITTFLRRARITPSKKLSSVYYNIVASLIVGAEMKNIFHEIYERLMEDRKLELFEAIEKVEILSEFY
VIACGMIPLFVVMTVPVASSISAILQTASLFGDPKLLPLTFYLWVPIASIIFMGLVYGILPKDFKLNVSLLDVLKEFDEP
EIEGIKMKFKWKPVHFITLFFWMLSIISFMLFFIRKSIFKFHGTDFLMFGILFLILPFILTSYWHFIIENQKERYYPIFL
NDLTMAVRSGMDIIRAMQVCARTNYGPLTKIVKKMAIQMSWGRPVNEVFADLERTEKSLIAKRIASILKECAVSGGDVKD
ILTSVTVHAYKLSEMKREISARQFIYVVVIYLSFFLYIGTSYIMVHSLLPTLLKNIHGLSVEFYKNYLFQGILIYSIFSG
ASLGILTERSIIAGIKHILLMLIVGYMLFKFYIGG

Specific function: Unknown

COG id: COG2064

COG function: function code NU; Flp pilus assembly protein TadC

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential)

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To M.jannaschii flaJ

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): Y1286_METJA (Q58682)

Other databases:

- EMBL:   L77117
- PIR:   E64460
- RefSeq:   NP_248284.1
- GeneID:   1452186
- GenomeReviews:   L77117_GR
- KEGG:   mja:MJ_1286
- NMPDR:   fig|243232.1.peg.1321
- TIGR:   MJ1286
- OMA:   ASILKEC
- ProtClustDB:   CLSK2517713
- BioCyc:   MJAN243232:MJ_1286-MONOMER
- InterPro:   IPR018076

Pfam domain/function: PF00482 GSPII_F

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 68278; Mature: 68278

Theoretical pI: Translated: 9.51; Mature: 9.51

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

HASH(0xd080a0c)-; HASH(0xd6970c8)-; HASH(0xe25dc58)-; HASH(0xe656ef8)-; HASH(0xe8239bc)-; HASH(0xe7081a8)-; HASH(0xdea6f14)-; HASH(0xdb8ccd0)-; HASH(0xe4fced4)-;

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKNLLKRYVSIKNIIKVIELDFFANLKLRYYKLAMKLFKIEDEKFDEILLKAGMNAVSST
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
YLPVVFLTSIILGLIIFIIFLIVFNIFYAIFGLIGGIFIVILIGVLYPYVLAEEKAKSID
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ENLPYAFAFISALSSANIPVVEIFTSLSKEDIYGGMSKEAKEIVKDTKVFNYDIITTFLR
CCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RARITPSKKLSSVYYNIVASLIVGAEMKNIFHEIYERLMEDRKLELFEAIEKVEILSEFY
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIACGMIPLFVVMTVPVASSISAILQTASLFGDPKLLPLTFYLWVPIASIIFMGLVYGIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PKDFKLNVSLLDVLKEFDEPEIEGIKMKFKWKPVHFITLFFWMLSIISFMLFFIRKSIFK
CCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FHGTDFLMFGILFLILPFILTSYWHFIIENQKERYYPIFLNDLTMAVRSGMDIIRAMQVC
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ARTNYGPLTKIVKKMAIQMSWGRPVNEVFADLERTEKSLIAKRIASILKECAVSGGDVKD
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
ILTSVTVHAYKLSEMKREISARQFIYVVVIYLSFFLYIGTSYIMVHSLLPTLLKNIHGLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
VEFYKNYLFQGILIYSIFSGASLGILTERSIIAGIKHILLMLIVGYMLFKFYIGG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
>Mature Secondary Structure
MKNLLKRYVSIKNIIKVIELDFFANLKLRYYKLAMKLFKIEDEKFDEILLKAGMNAVSST
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
YLPVVFLTSIILGLIIFIIFLIVFNIFYAIFGLIGGIFIVILIGVLYPYVLAEEKAKSID
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ENLPYAFAFISALSSANIPVVEIFTSLSKEDIYGGMSKEAKEIVKDTKVFNYDIITTFLR
CCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RARITPSKKLSSVYYNIVASLIVGAEMKNIFHEIYERLMEDRKLELFEAIEKVEILSEFY
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIACGMIPLFVVMTVPVASSISAILQTASLFGDPKLLPLTFYLWVPIASIIFMGLVYGIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PKDFKLNVSLLDVLKEFDEPEIEGIKMKFKWKPVHFITLFFWMLSIISFMLFFIRKSIFK
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FHGTDFLMFGILFLILPFILTSYWHFIIENQKERYYPIFLNDLTMAVRSGMDIIRAMQVC
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ARTNYGPLTKIVKKMAIQMSWGRPVNEVFADLERTEKSLIAKRIASILKECAVSGGDVKD
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
ILTSVTVHAYKLSEMKREISARQFIYVVVIYLSFFLYIGTSYIMVHSLLPTLLKNIHGLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
VEFYKNYLFQGILIYSIFSGASLGILTERSIIAGIKHILLMLIVGYMLFKFYIGG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087