| Definition | Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_000907 |
| Length | 1,830,138 |
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The map label for this gene is mukB [H]
Identifier: 16273285
GI number: 16273285
Start: 1465837
End: 1470369
Strand: Direct
Name: mukB [H]
Synonym: HI1374
Alternate gene names: 16273285
Gene position: 1465837-1470369 (Clockwise)
Preceding gene: 16273284
Following gene: 16273286
Centisome position: 80.09
GC content: 39.93
Gene sequence:
>4533_bases ATGTCTGATGTTTTTGAATTAGAAAATGAAATCGAATTAGAGAGCGATGAAGTCATTCTGGAAAATGAAAACGTCGAAGA AATCGTTGATGCACCTATACCTTTTAGCATGACGACAAATAATGGTATAGAGCGTGGTAAATTTCGTTCTTTAACCTTAA TTAACTGGAATGGTTTTTTTGCCCGTACTTTTGATTTAGACGAGTTAGTTACCACGCTTTCTGGTGGTAACGGTGCGGGG AAATCAACCACAATGGCTGGATTTGTGACCGCATTAATTCCCGATTTAACCCTTTTACATTTCCGTAATACAACAGAGGC TGGTTCTACAGGCGGTTCTCGCGATAAAGGTTTACATGGTAAATTGCGTCCAGGTGTTTGTTACGCAGTATTAGATACCA TTAATTCACGTCATCAACGTATTCTTGTTGGTGTGCGTCTGCAACAAATTGCAGGTCGTGATAAAAAGGTTGATTTAAAA ACGTTCTCAATTCAAGGTGTTGAATTATCTCAAAATCCAACCGCACTTTTCACTGAAACAGTGGGCGAACATCAAGCACG CGTCCTTAATTTAAACGAACTCAAAGATAAAATTGAAAATATCGGTGCGCAATTTAAACAATATCATTCCATTACCGATT ATCACGGCATGATGTTCGATCTCGGTATTATTCCGAAACGTTTACGTTCAGCATCAGACCGAAGCAAATTCTATAAACTT ATCGAAGCGTCTTTATACGGTGGTATTTCCAGTGCAATCACACGTTCTTTACGTGACTATTTATTGCCAGAAAATTTAGG TGTACGTAAAGCTTTCCAAGATATGGAAAGTGCATTGCGTGAGAACCGTATGACTTTAGAAGCGATTAAGGTCACGCAAT CAGATCGTGATTTATTCAAACATTTAATTACTGAAACCACCAACTATGTTGCTTCGGATTATATGCGTAATGCGAATGAA CGCCGTGGCAATATTGAGGCTGCATTAGAATCTCGTCGTGAGTGGTATAAAGCAAAAGCAGAGCAGAATTTATCTCAACA TCGTTTAGTTGATTTAAGTCGAGAAGTGGCTGAATTGGCAGAAAGTGAACGTACTTTAGAAGTTGATCACCAAAGTGCGG TTGATCATCTTAATTTAGTGTTAAATGCTTTACGTCATCAAGAAAAAATCACGCGCTATCAAGAAGATATTGCAGAACTT ACCGAGCGTTTAGAAGAACAAAAAATGGTGGTTGAAGATGCGAATGATGCGTTAGAAGAAAGCCAAGCCCAATTTGAGCA AACTGAAATTGAAATTGACGCTGTACGATCCCAATTAGCTGACTATCAACAAGCATTAGATGCCCAACAAACTCGCGCAC TTCAATATCAACAAGCCATTGCAGCCCTTGAAAAAGCGAAAACATTATGCGGTTTAGCGGATTTAAGTGTTAAAAATGTA GAAGATTATCACGCAGAATTTGATGCGCATGCAGAAAGTTTGACTGAAACCGTACTTGAGCTTGAGCACAAAATGTCTAT TTCTGAAGCAGCGAAATCTCAGTTCGATAAAGCGTACCAATTGGTATGCAAAATTGCGGGTGAAATGCCTCGTTCTACGG CGTGGGAAAGTGCTAAAGAATTATTACGTGAATATCCAAGCCAAAAATTGCAGGCACAACAAACGCCACAACTTCGCACA AAATTACATGAACTTGAGCAACGTTATGCACAACAACAAAGTGCGGTCAAATTACTTAATGATTTTAATCAACGTGCTAA TTTAAGTTTACAAACGGCAGAAGAATTAGAGGATTATCACGCCGAGCAAGAAGCGTTAATTGAAGACATTTCAGCAAGAC TTTCAGAACAAGTGGAAAACCGTTCTACGCTTCGTCAAAAACGTGAAAATTTAACCGCACTTTATGATGAAAATGCGCGT AAAGCACCAGCATGGCTGACGGCTCAAGCTGCATTGGAACGTCTAGAACAACAAAGTGGCGAGAGGTTTGAACATAGCCA AGATGTGATGAATTTTATGCAATCACAACTTGTGAAAGAACGTGAACTCACGATGCAGCGTGATCAACTTGAACAAAAAC GTTTGCATTTAGATGAACAAATTTCTCGTTTAAGTCAGCCAGATGGTTCAGAAGATCCACGCTTAAATATGCTGGCAGAA CGTTTTGGTGGAGTACTGCTTTCAGAGCTTTACGATGATGTAACAATTGAAGATGCACCTTATTTCTCCGCACTTTACGG GCCTTCGCGTCATGCTATTGTTGTGCGTGATCTCAATGCTGTGCGTGAACAACTTGCGCAATTAGAAGATTGCCCCGATG ATTTGTATTTAATTGAAGGCGATCCTACCGCATTTGACGACAGCGTATTATCCGCACAAGAACTTGAGCTAGGTGTTGTC GTGCAAGTTTCAGATCGTGAATTACGCTATTCAAGATTCCCTGAAATCCCATTATTTGGGTGTGCAGCACGTGAAAAACG TTTAGAAGAATTACAAATTGAACGTGATGAAGTGGCAGAACAACATGCCCAAATTGCGTTTGATGTACAAAAATGCCAAC GTTTACACGAACATTTCAGCCAATTTGTTGGGTTGCATTTGGCGTTGGCGTTCCAGCCAAATCCAGAAGCGTTAATGTCT GAAATTAATCGCGAACGCAATGAAATTGATCGTGAATTAAACCAATTTAATAGCGGCGAACAACAATTACGCATTCAATT AGATAATGCAAAAGAAAGACTGCAGTTACTCAATAAGTTAATTCCACAACTCAATGTATTAGCTGATGAAGATTTAATTG ATCGTATTGAAGAATGTCGTGAGCAATTAGATATTGCAGAGCAAGATGAATATTTTATTCGTCAGCATGGCGTAACGTTG TCACAATTAGAGCCGATTGCAAATAGTTTACAAAGTGATCCAGAAAATTACGAAGGCTTAAAAAATGAATTAACTCAAGC GATTGAGCGTCAAAAACAAGTTCAACAACGTGTATTTGCGTTAGCTGATGTTGTACAACGTAAACCGCATTTTGGTTATG AAGATGCAGGGCAGGCTGAAACTTCTGAACTCAATGAAAAACTTCGCCAACGTTTAGAACAAATGCAAGCACAGCGAGAT ACGCAACGTGAGCAAGTTCGTCAAAAACAAAGTCAATTTGCTGAATATAATCGCGTATTGATTCAGTTACAAAGTTCTTA CGATAGTAAATATCAGCTCTTAAATGAGTTGATTGGTGAAATTAGCGATCTTGGCGTGAGAGCTGATGATGGTGCTGAAG AACGTGCACGTATCCGTCGTGATGAATTACATCAACAACTTTCAACGAGCCGTCAGCGTCGGTCTTATGTAGAAAAACAA CTCACATTAATTGAAAGTGAAGCTGACAACTTAAATCGTCTTATCCGTAAAACTGAACGTGATTATAAAACTCAACGTGA ATTAGTTGTGGCGGCTAAAGTGAGTTGGTGTGTGGTTTTACGCTTATCACGTAACTCTGATATGGAAAAACGCCTTAATC GCCGAGAGCTCGCTTATTTATCTGCAGATGAGTTACGTTCAATGTCGGATAAAGCATTAGGTGCGTTGCGTACAGCAGTG GCGGATAATGAATATTTACGTGATAGCCTAAGAGTGTCTGAAGATAGTCGCAAACCTGAAAATAAAGTGCGGTTCTTTAT TGCGGTGTATCAGCACCTACGTGAACGTATTCGCCAAGATATTATTAAAACGGATGATCCAATTGATGCCATTGAACAAA TGGAAATTGAGCTTTCTCGTTTAACGGCTGAATTAACTGGCCGTGAGAAAAAATTGGCGATCAGTTCTGAAAGTGTTGCA AATATTATGCGTAAAACGATTCAGCGTGAACAAAATCGCATTCGTATGCTCAACCAAGGTTTACAAAACATTGCGTTTGG TCAGGTGAAATCTGTTCGTTTGGTAGTGAATATTCGTGATACCCATGCCATGTTGTTGGACGCACTTTCTGGTCAGCAAG ATGAATATCAAGATTTATTCAACGACAACCGCATCACCTTCTCTGAAGCTATGGCGAAGCTCTATCAACGCATCAATCCA CATATTGATATGGGGCAACGCACAGCGCAAACAATTGGTGAAGAATTGTTAGATTACCGTAATTATCTTGAGCTTGAAGT GGAAGTATTCCGTGGTGCTGATGGTTGGTTACGTGCAGAAAGTGGCGCGCTTTCTACGGGTGAAGCTATTGGTACAGGTA TGTCAATTCTCTTAATGGTTGTTCAAAGTTGGGAAGAAGAAAGCCGTCGAATTCGTGGTAAAGATATTGTGCCTTGTCGC TTGTTGTTCTTAGATGAAGCGGCGCGTTTAGACGGTAAATCTATTTCTACCTTATTCGAACTTTGCGAACGTTTAGATAT GCAGTTACTTATCGCTGCGCCAGAAAATATTAGCCCGGAAAAAGGTACAACCTATAAACTCGTACGTAAAATCGCAGGCA ACCAAGAGTACGTACACGTTGTTGGTTTACGCGGATTCGGTGCGACAGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CACCTGATTCCTTAGCGTTGGAAAAACAAGCGCAATTAATGGAAAACGATACGAAAAGTGCGGATGAAATTGACGAAGAA TTTGACGGAGAACAAGAATA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAATAGAAGGGAAGTGCGGTTGAAAACTTCGGTGTTTTTGACCGCACTTAAGCCTTTAAGGAAGGAATAATGAAAATCT TTACATCAAAAAAAGGACAA
Product: cell division protein MukB
Products: NA
Alternate protein names: Structural maintenance of chromosome-related protein [H]
Number of amino acids: Translated: 1510; Mature: 1509
Protein sequence:
>1510_residues MSDVFELENEIELESDEVILENENVEEIVDAPIPFSMTTNNGIERGKFRSLTLINWNGFFARTFDLDELVTTLSGGNGAG KSTTMAGFVTALIPDLTLLHFRNTTEAGSTGGSRDKGLHGKLRPGVCYAVLDTINSRHQRILVGVRLQQIAGRDKKVDLK TFSIQGVELSQNPTALFTETVGEHQARVLNLNELKDKIENIGAQFKQYHSITDYHGMMFDLGIIPKRLRSASDRSKFYKL IEASLYGGISSAITRSLRDYLLPENLGVRKAFQDMESALRENRMTLEAIKVTQSDRDLFKHLITETTNYVASDYMRNANE RRGNIEAALESRREWYKAKAEQNLSQHRLVDLSREVAELAESERTLEVDHQSAVDHLNLVLNALRHQEKITRYQEDIAEL TERLEEQKMVVEDANDALEESQAQFEQTEIEIDAVRSQLADYQQALDAQQTRALQYQQAIAALEKAKTLCGLADLSVKNV EDYHAEFDAHAESLTETVLELEHKMSISEAAKSQFDKAYQLVCKIAGEMPRSTAWESAKELLREYPSQKLQAQQTPQLRT KLHELEQRYAQQQSAVKLLNDFNQRANLSLQTAEELEDYHAEQEALIEDISARLSEQVENRSTLRQKRENLTALYDENAR KAPAWLTAQAALERLEQQSGERFEHSQDVMNFMQSQLVKERELTMQRDQLEQKRLHLDEQISRLSQPDGSEDPRLNMLAE RFGGVLLSELYDDVTIEDAPYFSALYGPSRHAIVVRDLNAVREQLAQLEDCPDDLYLIEGDPTAFDDSVLSAQELELGVV VQVSDRELRYSRFPEIPLFGCAAREKRLEELQIERDEVAEQHAQIAFDVQKCQRLHEHFSQFVGLHLALAFQPNPEALMS EINRERNEIDRELNQFNSGEQQLRIQLDNAKERLQLLNKLIPQLNVLADEDLIDRIEECREQLDIAEQDEYFIRQHGVTL SQLEPIANSLQSDPENYEGLKNELTQAIERQKQVQQRVFALADVVQRKPHFGYEDAGQAETSELNEKLRQRLEQMQAQRD TQREQVRQKQSQFAEYNRVLIQLQSSYDSKYQLLNELIGEISDLGVRADDGAEERARIRRDELHQQLSTSRQRRSYVEKQ LTLIESEADNLNRLIRKTERDYKTQRELVVAAKVSWCVVLRLSRNSDMEKRLNRRELAYLSADELRSMSDKALGALRTAV ADNEYLRDSLRVSEDSRKPENKVRFFIAVYQHLRERIRQDIIKTDDPIDAIEQMEIELSRLTAELTGREKKLAISSESVA NIMRKTIQREQNRIRMLNQGLQNIAFGQVKSVRLVVNIRDTHAMLLDALSGQQDEYQDLFNDNRITFSEAMAKLYQRINP HIDMGQRTAQTIGEELLDYRNYLELEVEVFRGADGWLRAESGALSTGEAIGTGMSILLMVVQSWEEESRRIRGKDIVPCR LLFLDEAARLDGKSISTLFELCERLDMQLLIAAPENISPEKGTTYKLVRKIAGNQEYVHVVGLRGFGATE
Sequences:
>Translated_1510_residues MSDVFELENEIELESDEVILENENVEEIVDAPIPFSMTTNNGIERGKFRSLTLINWNGFFARTFDLDELVTTLSGGNGAG KSTTMAGFVTALIPDLTLLHFRNTTEAGSTGGSRDKGLHGKLRPGVCYAVLDTINSRHQRILVGVRLQQIAGRDKKVDLK TFSIQGVELSQNPTALFTETVGEHQARVLNLNELKDKIENIGAQFKQYHSITDYHGMMFDLGIIPKRLRSASDRSKFYKL IEASLYGGISSAITRSLRDYLLPENLGVRKAFQDMESALRENRMTLEAIKVTQSDRDLFKHLITETTNYVASDYMRNANE RRGNIEAALESRREWYKAKAEQNLSQHRLVDLSREVAELAESERTLEVDHQSAVDHLNLVLNALRHQEKITRYQEDIAEL TERLEEQKMVVEDANDALEESQAQFEQTEIEIDAVRSQLADYQQALDAQQTRALQYQQAIAALEKAKTLCGLADLSVKNV EDYHAEFDAHAESLTETVLELEHKMSISEAAKSQFDKAYQLVCKIAGEMPRSTAWESAKELLREYPSQKLQAQQTPQLRT KLHELEQRYAQQQSAVKLLNDFNQRANLSLQTAEELEDYHAEQEALIEDISARLSEQVENRSTLRQKRENLTALYDENAR KAPAWLTAQAALERLEQQSGERFEHSQDVMNFMQSQLVKERELTMQRDQLEQKRLHLDEQISRLSQPDGSEDPRLNMLAE RFGGVLLSELYDDVTIEDAPYFSALYGPSRHAIVVRDLNAVREQLAQLEDCPDDLYLIEGDPTAFDDSVLSAQELELGVV VQVSDRELRYSRFPEIPLFGCAAREKRLEELQIERDEVAEQHAQIAFDVQKCQRLHEHFSQFVGLHLALAFQPNPEALMS EINRERNEIDRELNQFNSGEQQLRIQLDNAKERLQLLNKLIPQLNVLADEDLIDRIEECREQLDIAEQDEYFIRQHGVTL SQLEPIANSLQSDPENYEGLKNELTQAIERQKQVQQRVFALADVVQRKPHFGYEDAGQAETSELNEKLRQRLEQMQAQRD TQREQVRQKQSQFAEYNRVLIQLQSSYDSKYQLLNELIGEISDLGVRADDGAEERARIRRDELHQQLSTSRQRRSYVEKQ LTLIESEADNLNRLIRKTERDYKTQRELVVAAKVSWCVVLRLSRNSDMEKRLNRRELAYLSADELRSMSDKALGALRTAV ADNEYLRDSLRVSEDSRKPENKVRFFIAVYQHLRERIRQDIIKTDDPIDAIEQMEIELSRLTAELTGREKKLAISSESVA NIMRKTIQREQNRIRMLNQGLQNIAFGQVKSVRLVVNIRDTHAMLLDALSGQQDEYQDLFNDNRITFSEAMAKLYQRINP HIDMGQRTAQTIGEELLDYRNYLELEVEVFRGADGWLRAESGALSTGEAIGTGMSILLMVVQSWEEESRRIRGKDIVPCR LLFLDEAARLDGKSISTLFELCERLDMQLLIAAPENISPEKGTTYKLVRKIAGNQEYVHVVGLRGFGATE >Mature_1509_residues SDVFELENEIELESDEVILENENVEEIVDAPIPFSMTTNNGIERGKFRSLTLINWNGFFARTFDLDELVTTLSGGNGAGK STTMAGFVTALIPDLTLLHFRNTTEAGSTGGSRDKGLHGKLRPGVCYAVLDTINSRHQRILVGVRLQQIAGRDKKVDLKT FSIQGVELSQNPTALFTETVGEHQARVLNLNELKDKIENIGAQFKQYHSITDYHGMMFDLGIIPKRLRSASDRSKFYKLI EASLYGGISSAITRSLRDYLLPENLGVRKAFQDMESALRENRMTLEAIKVTQSDRDLFKHLITETTNYVASDYMRNANER RGNIEAALESRREWYKAKAEQNLSQHRLVDLSREVAELAESERTLEVDHQSAVDHLNLVLNALRHQEKITRYQEDIAELT ERLEEQKMVVEDANDALEESQAQFEQTEIEIDAVRSQLADYQQALDAQQTRALQYQQAIAALEKAKTLCGLADLSVKNVE DYHAEFDAHAESLTETVLELEHKMSISEAAKSQFDKAYQLVCKIAGEMPRSTAWESAKELLREYPSQKLQAQQTPQLRTK LHELEQRYAQQQSAVKLLNDFNQRANLSLQTAEELEDYHAEQEALIEDISARLSEQVENRSTLRQKRENLTALYDENARK APAWLTAQAALERLEQQSGERFEHSQDVMNFMQSQLVKERELTMQRDQLEQKRLHLDEQISRLSQPDGSEDPRLNMLAER FGGVLLSELYDDVTIEDAPYFSALYGPSRHAIVVRDLNAVREQLAQLEDCPDDLYLIEGDPTAFDDSVLSAQELELGVVV QVSDRELRYSRFPEIPLFGCAAREKRLEELQIERDEVAEQHAQIAFDVQKCQRLHEHFSQFVGLHLALAFQPNPEALMSE INRERNEIDRELNQFNSGEQQLRIQLDNAKERLQLLNKLIPQLNVLADEDLIDRIEECREQLDIAEQDEYFIRQHGVTLS QLEPIANSLQSDPENYEGLKNELTQAIERQKQVQQRVFALADVVQRKPHFGYEDAGQAETSELNEKLRQRLEQMQAQRDT QREQVRQKQSQFAEYNRVLIQLQSSYDSKYQLLNELIGEISDLGVRADDGAEERARIRRDELHQQLSTSRQRRSYVEKQL TLIESEADNLNRLIRKTERDYKTQRELVVAAKVSWCVVLRLSRNSDMEKRLNRRELAYLSADELRSMSDKALGALRTAVA DNEYLRDSLRVSEDSRKPENKVRFFIAVYQHLRERIRQDIIKTDDPIDAIEQMEIELSRLTAELTGREKKLAISSESVAN IMRKTIQREQNRIRMLNQGLQNIAFGQVKSVRLVVNIRDTHAMLLDALSGQQDEYQDLFNDNRITFSEAMAKLYQRINPH IDMGQRTAQTIGEELLDYRNYLELEVEVFRGADGWLRAESGALSTGEAIGTGMSILLMVVQSWEEESRRIRGKDIVPCRL LFLDEAARLDGKSISTLFELCERLDMQLLIAAPENISPEKGTTYKLVRKIAGNQEYVHVVGLRGFGATE
Specific function: Plays a central role in chromosome condensation, segregation and cell cycle progression. Functions as a homodimer, which is essential for chromosome partition. Involved in negative DNA supercoiling in vivo, and by this means organize and compact chromosom
COG id: COG3096
COG function: function code D; Uncharacterized protein involved in chromosome partitioning
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm, nucleoid. Note=Restricted to the nucleoid region (By similarity) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the SMC family. MukB subfamily [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787154, Length=1468, Percent_Identity=65.2588555858311, Blast_Score=1915, Evalue=0.0,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR012090 - InterPro: IPR007406 [H]
Pfam domain/function: PF04310 MukB [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 173288; Mature: 173157
Theoretical pI: Translated: 4.79; Mature: 4.79
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSDVFELENEIELESDEVILENENVEEIVDAPIPFSMTTNNGIERGKFRSLTLINWNGFF CCCHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCE ARTFDLDELVTTLSGGNGAGKSTTMAGFVTALIPDLTLLHFRNTTEAGSTGGSRDKGLHG EEECCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC KLRPGVCYAVLDTINSRHQRILVGVRLQQIAGRDKKVDLKTFSIQGVELSQNPTALFTET CCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECEEECCCCCHHHHHH VGEHQARVLNLNELKDKIENIGAQFKQYHSITDYHGMMFDLGIIPKRLRSASDRSKFYKL HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH IEASLYGGISSAITRSLRDYLLPENLGVRKAFQDMESALRENRMTLEAIKVTQSDRDLFK HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHH HLITETTNYVASDYMRNANERRGNIEAALESRREWYKAKAEQNLSQHRLVDLSREVAELA HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ESERTLEVDHQSAVDHLNLVLNALRHQEKITRYQEDIAELTERLEEQKMVVEDANDALEE HCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SQAQFEQTEIEIDAVRSQLADYQQALDAQQTRALQYQQAIAALEKAKTLCGLADLSVKNV 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA