| Definition | Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_000907 |
| Length | 1,830,138 |
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The map label for this gene is pqqL
Identifier: 16273278
GI number: 16273278
Start: 1456539
End: 1459319
Strand: Reverse
Name: pqqL
Synonym: HI1368
Alternate gene names: 16273278
Gene position: 1459319-1456539 (Counterclockwise)
Preceding gene: 16273279
Following gene: 16273276
Centisome position: 79.74
GC content: 32.79
Gene sequence:
>2781_bases ATGAAAAAAACAACCGCACTTTTTTTACTTATCTTTTCACTAATTGCTTGTCAATCATTGGAACTATCGCCCAATAATAA TTTACCTTTTGATCCAAATATTCAGCACGGTAAACTATCAAATGGTCTGCAATATTTTGTATTAAAAAATACTGAACCCA AAGAACGCGTTTATATTCGATTAGTGATCAATGCTGGATCTATGCACGAAGATGACGATCAAAAAGGCATTGCTCATTTA GTTGAACATATGGCATTTAATGGCTCAAAGAAATATCCAGAAAATCAAATTATTAATGCGTTAGAAAAACTTGGAATGAA GTTTGCACGAGATATTAATGCTTTCACCGATTTTGAAAATACAGTCTATACTTTAAATTTAGATAGCAACAATCAGCAAA AATTAGAATTGGCTTTTGATGTCATCAATGAATGGATGAATAATATTACTTTTTTGCCTAAAGATGTGGATGGCGAACGT GGCGTAGTACAAGAAGAATGGCGGAGACGTTTAAGCCCAATGCTACGTATTGGCAATAAGAAAAGTGCTATTGAAATGGC GGGTTCTCGTTATGTGTTGCGTGATCCTATTGGAGATATGGATATTATTAAAACAATTTCAGCTAAACGCGTCGCTGATT TTTACCACAAATGGTATCGACCAGATAATATGTCAGTAATTATTGTAGGCGATATTGATACAAAACAAGTAGTAAAACTA TTAAAACAAAATCTATCTCAAGAAAACCCAATTACTAAAACAACATTGGAAAAAATTGATTTTAATATTCCTCTTATCAA CAAATGGCGATTAGATTCTATTTCTGAACAAGGCACAACAATTCCGAGTATTGAATTAAGTTTTTTTGAAAATACAATTG AAACCAATACATTAGCGAGTTATAAACAGGAATTAATTCAGCAAATTACCACTCGATTGCTTAACTTACGTTTACAGCAA TGGGAAAAGGAAACAGAAAATGGCGTAGATTCTGCAAATTTTTATCGCACTCATTTAGGTAAAGAAACACTACAAAGCAT TTTTTCTCTCCAGCTTATAGATACACAATATTCAAAAACGATAGATAAATTATTTGCCTTTATTGCCAGTATAAAACAAC AAGGTTTTACTCAAAATGAATTAAGCGGTGAGATTAAACGCTTAACTCAACTCAATGAAAAACAATTAAATATTCGTTCT GGTAGTTTAAAAATTGCCGATGATCTCATTACTTCTGTGGCAAATAAGCAAGTGGTATTGAGCGTAAATGATCGTTATGA ACTCAATAAACGTTTTTTATCTCAAATTACATTAGCTGATTTACAACGCACGTTAAATCAAACCTTAGCATTAAAAGCAA AATTATTATTAATCACTCAACCTTTGCCACAAAAAGCCTTGCCTTTTGATGTTGCAGAAATAGAAACTCGTTGGAACAAT GTAATGGAAATGCAACAACACCAATGGGATGAAAAAAAACAAATCGAAAAATTACCGCACTTAACATTTAACACAGGCTC ACTTTCTCAAGAAAAATACTGGGATCGCGGCGATATTTATGAATTTCGTTTAAGTAATGGAAGTAAATTGATCTACCACT ATAGTGACAAAACTCCAAATCAAGTACATTTTCGTGCTGTTACTCAAGGTGGTTTACGTTCTATCCCAAATAAGGACTAT CACTTATTACGTGCTGCCGTTAGTGTAGTTGATGAAACAGGTGTTGGAGAACTTTCTCTTTCTGCGGTTAATCAAATTTT TTCGCGCGATCCATTGGTGATTGCAACTGTGATTGATGATGATAAACAAGGTTTTACTGGTGTATCTAAACCTAAGGATT TGGAAAATTTACTGACATTGTTCCGCTTAAAATTACGTTCTTCTCCTATATCCGATCTTGCCTTAGAAAAATATCGACGT GAAACCCGTGATTATTTCAAACAGATTGATTTAGAAACACAATTTATGCAAGCCGTTTCAAAACTACGTTTTCCAAATAT TGAAACCGTCTATACTCAAAAACAAGCACAACAATTATCATTTGATAAAAACCAATTAAATAACGCTTATCAACATTATA TTTTAGATAAAACAGATTTTACCTATTTTATTATTGGCGATATTGAACTTAATCAAGTAAAGAAATTGGCAGAACGTTAT TTAGCTTCTATTGAATCAAAAACTCAGATCCGCCATTTTGTCCCGACTATTATTCATACACCAACTCAATCATTTATTAT GAATGGTTTGAAAGAACCGAGAGCTGATGTAGAAATATACCTTACCGCAGATAATACTTGGCGAACAGAACAAAAATATT TATTCAATATTCTTGCGGATATTGTGCAAGAAAAATTACGCTTAATTCTACGTGAAAAAGTTTCTGGTATTTATTCTGTA AATAGTTGGTTTATGCAAGATGTTTATGCACCACAAATTGAGGGGAAAATTGAATTTAGTTGCGACCCTAAGCGCGTGGA GGAACTTACGTATCTTACAAATCAGGTACTAGATGACATTATAAAAAATGGCATTGATGAAAACTTATTACGTAAAAAAC TAGCGGAACAACATACTCAGATTCGACGTGAATTTGATTCTTTAGTTTCAATTGCTTCAATTATTGAAGAAAGTTACTGG CAACAAGATAATCCAGATGCCATTTATACCTATCAACATTTAGATCAGTTAGCGACAAAAGCCACAATAGATGCGTTGGC GCAAAAAGCTCTAAAAAAATCAGGCAGATTTGTCAGCATATTAAAAGCAGCTTCTTATTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TCTTCAATGTATAGGGCTTGTGGGCTTTTGAAACATCCACTAGCCCTACTCTACGCTTATTTTTACTTAGCGTAGAGTTT TCTTTTTTCTAGGTAAAATA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAATAAATTAAATCTCAATAGATATGAAATAGATAAAAAGGGCGGTGATCGCTTAAACGATCACCGTTTGAACTCACTA TTTAAACAGTAAATTATATT
Product: putative zinc protease
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 926; Mature: 926
Protein sequence:
>926_residues MKKTTALFLLIFSLIACQSLELSPNNNLPFDPNIQHGKLSNGLQYFVLKNTEPKERVYIRLVINAGSMHEDDDQKGIAHL VEHMAFNGSKKYPENQIINALEKLGMKFARDINAFTDFENTVYTLNLDSNNQQKLELAFDVINEWMNNITFLPKDVDGER GVVQEEWRRRLSPMLRIGNKKSAIEMAGSRYVLRDPIGDMDIIKTISAKRVADFYHKWYRPDNMSVIIVGDIDTKQVVKL LKQNLSQENPITKTTLEKIDFNIPLINKWRLDSISEQGTTIPSIELSFFENTIETNTLASYKQELIQQITTRLLNLRLQQ WEKETENGVDSANFYRTHLGKETLQSIFSLQLIDTQYSKTIDKLFAFIASIKQQGFTQNELSGEIKRLTQLNEKQLNIRS GSLKIADDLITSVANKQVVLSVNDRYELNKRFLSQITLADLQRTLNQTLALKAKLLLITQPLPQKALPFDVAEIETRWNN VMEMQQHQWDEKKQIEKLPHLTFNTGSLSQEKYWDRGDIYEFRLSNGSKLIYHYSDKTPNQVHFRAVTQGGLRSIPNKDY HLLRAAVSVVDETGVGELSLSAVNQIFSRDPLVIATVIDDDKQGFTGVSKPKDLENLLTLFRLKLRSSPISDLALEKYRR ETRDYFKQIDLETQFMQAVSKLRFPNIETVYTQKQAQQLSFDKNQLNNAYQHYILDKTDFTYFIIGDIELNQVKKLAERY LASIESKTQIRHFVPTIIHTPTQSFIMNGLKEPRADVEIYLTADNTWRTEQKYLFNILADIVQEKLRLILREKVSGIYSV NSWFMQDVYAPQIEGKIEFSCDPKRVEELTYLTNQVLDDIIKNGIDENLLRKKLAEQHTQIRREFDSLVSIASIIEESYW QQDNPDAIYTYQHLDQLATKATIDALAQKALKKSGRFVSILKAASY
Sequences:
>Translated_926_residues MKKTTALFLLIFSLIACQSLELSPNNNLPFDPNIQHGKLSNGLQYFVLKNTEPKERVYIRLVINAGSMHEDDDQKGIAHL VEHMAFNGSKKYPENQIINALEKLGMKFARDINAFTDFENTVYTLNLDSNNQQKLELAFDVINEWMNNITFLPKDVDGER GVVQEEWRRRLSPMLRIGNKKSAIEMAGSRYVLRDPIGDMDIIKTISAKRVADFYHKWYRPDNMSVIIVGDIDTKQVVKL LKQNLSQENPITKTTLEKIDFNIPLINKWRLDSISEQGTTIPSIELSFFENTIETNTLASYKQELIQQITTRLLNLRLQQ WEKETENGVDSANFYRTHLGKETLQSIFSLQLIDTQYSKTIDKLFAFIASIKQQGFTQNELSGEIKRLTQLNEKQLNIRS GSLKIADDLITSVANKQVVLSVNDRYELNKRFLSQITLADLQRTLNQTLALKAKLLLITQPLPQKALPFDVAEIETRWNN VMEMQQHQWDEKKQIEKLPHLTFNTGSLSQEKYWDRGDIYEFRLSNGSKLIYHYSDKTPNQVHFRAVTQGGLRSIPNKDY HLLRAAVSVVDETGVGELSLSAVNQIFSRDPLVIATVIDDDKQGFTGVSKPKDLENLLTLFRLKLRSSPISDLALEKYRR ETRDYFKQIDLETQFMQAVSKLRFPNIETVYTQKQAQQLSFDKNQLNNAYQHYILDKTDFTYFIIGDIELNQVKKLAERY LASIESKTQIRHFVPTIIHTPTQSFIMNGLKEPRADVEIYLTADNTWRTEQKYLFNILADIVQEKLRLILREKVSGIYSV NSWFMQDVYAPQIEGKIEFSCDPKRVEELTYLTNQVLDDIIKNGIDENLLRKKLAEQHTQIRREFDSLVSIASIIEESYW QQDNPDAIYTYQHLDQLATKATIDALAQKALKKSGRFVSILKAASY >Mature_926_residues MKKTTALFLLIFSLIACQSLELSPNNNLPFDPNIQHGKLSNGLQYFVLKNTEPKERVYIRLVINAGSMHEDDDQKGIAHL VEHMAFNGSKKYPENQIINALEKLGMKFARDINAFTDFENTVYTLNLDSNNQQKLELAFDVINEWMNNITFLPKDVDGER GVVQEEWRRRLSPMLRIGNKKSAIEMAGSRYVLRDPIGDMDIIKTISAKRVADFYHKWYRPDNMSVIIVGDIDTKQVVKL LKQNLSQENPITKTTLEKIDFNIPLINKWRLDSISEQGTTIPSIELSFFENTIETNTLASYKQELIQQITTRLLNLRLQQ WEKETENGVDSANFYRTHLGKETLQSIFSLQLIDTQYSKTIDKLFAFIASIKQQGFTQNELSGEIKRLTQLNEKQLNIRS GSLKIADDLITSVANKQVVLSVNDRYELNKRFLSQITLADLQRTLNQTLALKAKLLLITQPLPQKALPFDVAEIETRWNN VMEMQQHQWDEKKQIEKLPHLTFNTGSLSQEKYWDRGDIYEFRLSNGSKLIYHYSDKTPNQVHFRAVTQGGLRSIPNKDY HLLRAAVSVVDETGVGELSLSAVNQIFSRDPLVIATVIDDDKQGFTGVSKPKDLENLLTLFRLKLRSSPISDLALEKYRR ETRDYFKQIDLETQFMQAVSKLRFPNIETVYTQKQAQQLSFDKNQLNNAYQHYILDKTDFTYFIIGDIELNQVKKLAERY LASIESKTQIRHFVPTIIHTPTQSFIMNGLKEPRADVEIYLTADNTWRTEQKYLFNILADIVQEKLRLILREKVSGIYSV NSWFMQDVYAPQIEGKIEFSCDPKRVEELTYLTNQVLDDIIKNGIDENLLRKKLAEQHTQIRREFDSLVSIASIIEESYW QQDNPDAIYTYQHLDQLATKATIDALAQKALKKSGRFVSILKAASY
Specific function: Unknown
COG id: COG0612
COG function: function code R; Predicted Zn-dependent peptidases
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the peptidase M16 family
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787770, Length=907, Percent_Identity=28.0044101433297, Blast_Score=305, Evalue=1e-83, Organism=Escherichia coli, GI1789946, Length=498, Percent_Identity=21.285140562249, Blast_Score=96, Evalue=1e-20, Organism=Caenorhabditis elegans, GI71999683, Length=200, Percent_Identity=24.5, Blast_Score=67, Evalue=6e-11,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): PQQL_HAEIN (P45181)
Other databases:
- EMBL: L42023 - PIR: E64171 - RefSeq: NP_439519.1 - ProteinModelPortal: P45181 - GeneID: 950673 - GenomeReviews: L42023_GR - KEGG: hin:HI1368 - NMPDR: fig|71421.1.peg.1304 - TIGR: HI_1368 - HOGENOM: HBG495118 - OMA: NILADIV - ProtClustDB: CLSK789566 - BioCyc: HINF71421:HI_1368-MONOMER - GO: GO:0006508 - InterPro: IPR011249 - InterPro: IPR011237 - InterPro: IPR011765 - InterPro: IPR001431 - InterPro: IPR007863 - Gene3D: G3DSA:3.30.830.10
Pfam domain/function: PF00675 Peptidase_M16; PF05193 Peptidase_M16_C; SSF63411 Metalloenz_metal-bd
EC number: 3.4.99.- [C]
Molecular weight: Translated: 107026; Mature: 107026
Theoretical pI: Translated: 7.30; Mature: 7.30
Prosite motif: PS00143 INSULINASE; PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN
Important sites: ACT_SITE 82-82
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 1.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKTTALFLLIFSLIACQSLELSPNNNLPFDPNIQHGKLSNGLQYFVLKNTEPKERVYIR CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEE LVINAGSMHEDDDQKGIAHLVEHMAFNGSKKYPENQIINALEKLGMKFARDINAFTDFEN EEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC TVYTLNLDSNNQQKLELAFDVINEWMNNITFLPKDVDGERGVVQEEWRRRLSPMLRIGNK EEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC KSAIEMAGSRYVLRDPIGDMDIIKTISAKRVADFYHKWYRPDNMSVIIVGDIDTKQVVKL HHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHH LKQNLSQENPITKTTLEKIDFNIPLINKWRLDSISEQGTTIPSIELSFFENTIETNTLAS HHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHH YKQELIQQITTRLLNLRLQQWEKETENGVDSANFYRTHLGKETLQSIFSLQLIDTQYSKT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDKLFAFIASIKQQGFTQNELSGEIKRLTQLNEKQLNIRSGSLKIADDLITSVANKQVVL HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEECCCEEHHHHHHHHHCCCEEEE SVNDRYELNKRFLSQITLADLQRTLNQTLALKAKLLLITQPLPQKALPFDVAEIETRWNN EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH VMEMQQHQWDEKKQIEKLPHLTFNTGSLSQEKYWDRGDIYEFRLSNGSKLIYHYSDKTPN HHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCEECCCCCCHHHCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCC QVHFRAVTQGGLRSIPNKDYHLLRAAVSVVDETGVGELSLSAVNQIFSRDPLVIATVIDD EEEEEEECCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEC DKQGFTGVSKPKDLENLLTLFRLKLRSSPISDLALEKYRRETRDYFKQIDLETQFMQAVS CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH KLRFPNIETVYTQKQAQQLSFDKNQLNNAYQHYILDKTDFTYFIIGDIELNQVKKLAERY HHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEECCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHH LASIESKTQIRHFVPTIIHTPTQSFIMNGLKEPRADVEIYLTADNTWRTEQKYLFNILAD HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHH IVQEKLRLILREKVSGIYSVNSWFMQDVYAPQIEGKIEFSCDPKRVEELTYLTNQVLDDI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKNGIDENLLRKKLAEQHTQIRREFDSLVSIASIIEESYWQQDNPDAIYTYQHLDQLATK HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHH ATIDALAQKALKKSGRFVSILKAASY HHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKKTTALFLLIFSLIACQSLELSPNNNLPFDPNIQHGKLSNGLQYFVLKNTEPKERVYIR CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEE LVINAGSMHEDDDQKGIAHLVEHMAFNGSKKYPENQIINALEKLGMKFARDINAFTDFEN EEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC TVYTLNLDSNNQQKLELAFDVINEWMNNITFLPKDVDGERGVVQEEWRRRLSPMLRIGNK EEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC KSAIEMAGSRYVLRDPIGDMDIIKTISAKRVADFYHKWYRPDNMSVIIVGDIDTKQVVKL HHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHH LKQNLSQENPITKTTLEKIDFNIPLINKWRLDSISEQGTTIPSIELSFFENTIETNTLAS HHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHH YKQELIQQITTRLLNLRLQQWEKETENGVDSANFYRTHLGKETLQSIFSLQLIDTQYSKT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDKLFAFIASIKQQGFTQNELSGEIKRLTQLNEKQLNIRSGSLKIADDLITSVANKQVVL HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEECCCEEHHHHHHHHHCCCEEEE SVNDRYELNKRFLSQITLADLQRTLNQTLALKAKLLLITQPLPQKALPFDVAEIETRWNN EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH VMEMQQHQWDEKKQIEKLPHLTFNTGSLSQEKYWDRGDIYEFRLSNGSKLIYHYSDKTPN HHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCEECCCCCCHHHCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCC QVHFRAVTQGGLRSIPNKDYHLLRAAVSVVDETGVGELSLSAVNQIFSRDPLVIATVIDD EEEEEEECCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEC DKQGFTGVSKPKDLENLLTLFRLKLRSSPISDLALEKYRRETRDYFKQIDLETQFMQAVS CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH KLRFPNIETVYTQKQAQQLSFDKNQLNNAYQHYILDKTDFTYFIIGDIELNQVKKLAERY HHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEECCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHH LASIESKTQIRHFVPTIIHTPTQSFIMNGLKEPRADVEIYLTADNTWRTEQKYLFNILAD HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHH IVQEKLRLILREKVSGIYSVNSWFMQDVYAPQIEGKIEFSCDPKRVEELTYLTNQVLDDI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKNGIDENLLRKKLAEQHTQIRREFDSLVSIASIIEESYWQQDNPDAIYTYQHLDQLATK HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHH ATIDALAQKALKKSGRFVSILKAASY HHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: Zn [C]
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: Hydrolase; Acting on peptide bonds (Peptidases); Endopeptidases of unknown catalytic mechanism [C]
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7542800