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The map label for this gene is thiP

Identifier: 16272954

GI number: 16272954

Start: 1083776

End: 1085392

Strand: Direct

Name: thiP

Synonym: HI1020

Alternate gene names: 16272954

Gene position: 1083776-1085392 (Clockwise)

Preceding gene: 16272953

Following gene: 16272955

Centisome position: 59.22

GC content: 37.29

Gene sequence:

>1617_bases
ATGTTTTCGTTATTTCATCATCCACAACTTCGCCCTCGTCATTATGCGGGCGGGGTTGTTGTTATTAGTTTCATTATTCT
TTTTTATGGTGGTGCCTTAAGTTCGATCTTTGCATTGGGCGGTGAATTGCAATGGCGAGCTTGGTTTACTGATGATTATC
TACAGCATTTGATTCTTTTCAGTTTTGGGCAAGCCTTACTGTCTACCGTTTTATCTATTTTCTTTGGTTTACTTCTCGCT
AGGGCATTATTTTATAAGCCATTTTTGGGAAAAAAGTGGTTGTTAAAATTAATGTCGCTAACTTTTGTCTTACCTGCTTT
AGTGGTAATTTTTGGTTTGATCGGCATTTATGGTTCAAGTGGTTGGTTAGCTTGGCTTGCTAACCTTTTTGGAATGTCGT
GGCAGGGACATATTTACGGACTTTCGGGAATTTTAATTGCCCACCTTTTTTTCAATATTCCACTGGCAGCACAGCTTTTC
TTACAAAGTTTGCAAAGTATCCCTTATCAGCAACGTCAGCTTGCAGCCCAGCTTAATTTGCAAGGTTGGCAATTTGTTAA
ATTGGTGGAGTGGCCGGTTTTTCGTCAGCAATGTTTGCCTACATTCAGCTTAATTTTTATGCTGTGCTTTACCAGTTTTA
CTGTTGTTCTTACATTAGGTGGTGGGCCTCAATATACAACATTAGAAACAGCAATCTACCAAGCGATTTTATTTGAATTT
GATCTGCCGAAAGCGGCACTTTTTGCTATGTTGCAATTTGTATTTTGCTTGATTTTATTTAGTTTGACATCGCGTTTTTC
GCTTTCTAATCAAAATGGCTTGAGCAATAGTAATATTTGGTTTGAGAAACCTAAAAGTGCGGTCAAAATTTTCCATATTT
TGGTTTTACTTGTTTTTGTCTTTTTCCTTTTTTCGCCAGTATTGAATATTCTTATTAGCGCATTGAGTTCATCAAATTTA
CTCACAGTTTGGCATAATTCCCAGCTCTGGCGTGCCTTAGGCTATTCACTTTCTATCGCGCCCTTGTCCGCATTACTTGC
ATTAACGATGGCAATTGCCTTATTGCTTTTATCACGCCGTTTAGAATGGTTGCATTATCAAAAAATCTCACAATTTATTA
TTAATGCTGGAATGGTAATTTTAGCCATCCCGATTTTAGTGCTTGCGATGGGGTTGTTTTTATTATTACAAGATCGTGAT
TTTTCCAATATTGATTTGTTTATCATCGTTGTATTTTGTAATGCCTTAAGTGCAATGCCTTTTGTTTTACGTATTTTAAG
CGCACCTTTTCATAACAATATGCGTTATTACGAAAATTTGTGTAATAGTCTGGGAATTGTGGGTTGGCAACGTTTTTATC
TGATTGAATGGAAAACTTTGCGCGCACCGCTGCGTTATGCTTTTGCTTTAGGTTTAGCGTTATCTCTCGGCGATTTTACG
GCGATTGCGTTATTTGGCAATCAAGAGTTTACTTCTCTACCGCATTTGTTATATCAGCAGCTAGGGAATTATCGTAATCA
AGATGCAGCTGTAACCGCAGGGATTTTATTATTGCTTTGTGGCATATTGTTTGCCTTTATTCACACATATAGGGATGCCG
ATGATTTATCTAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTCAACAAAAAACTCAAACGTCAATTAATCCAATGGTGAATACTGAGCAGTTAAAAAATTGGATCAGCACTTGGCAAAC
TACATTAACAAAATAATTTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTGATTTTGAATGATAAAACCTTACCGATGTGCTTTAATTTGAGCGTAAATGCTGGAGAACGTGTTGCAATTATTGGCG
AGAGTGGCGCGGGGAAAAGT

Product: thiamine transporter membrane protein

Products: ADP; phosphate; thiamine [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 538; Mature: 538

Protein sequence:

>538_residues
MFSLFHHPQLRPRHYAGGVVVISFIILFYGGALSSIFALGGELQWRAWFTDDYLQHLILFSFGQALLSTVLSIFFGLLLA
RALFYKPFLGKKWLLKLMSLTFVLPALVVIFGLIGIYGSSGWLAWLANLFGMSWQGHIYGLSGILIAHLFFNIPLAAQLF
LQSLQSIPYQQRQLAAQLNLQGWQFVKLVEWPVFRQQCLPTFSLIFMLCFTSFTVVLTLGGGPQYTTLETAIYQAILFEF
DLPKAALFAMLQFVFCLILFSLTSRFSLSNQNGLSNSNIWFEKPKSAVKIFHILVLLVFVFFLFSPVLNILISALSSSNL
LTVWHNSQLWRALGYSLSIAPLSALLALTMAIALLLLSRRLEWLHYQKISQFIINAGMVILAIPILVLAMGLFLLLQDRD
FSNIDLFIIVVFCNALSAMPFVLRILSAPFHNNMRYYENLCNSLGIVGWQRFYLIEWKTLRAPLRYAFALGLALSLGDFT
AIALFGNQEFTSLPHLLYQQLGNYRNQDAAVTAGILLLLCGILFAFIHTYRDADDLSK

Sequences:

>Translated_538_residues
MFSLFHHPQLRPRHYAGGVVVISFIILFYGGALSSIFALGGELQWRAWFTDDYLQHLILFSFGQALLSTVLSIFFGLLLA
RALFYKPFLGKKWLLKLMSLTFVLPALVVIFGLIGIYGSSGWLAWLANLFGMSWQGHIYGLSGILIAHLFFNIPLAAQLF
LQSLQSIPYQQRQLAAQLNLQGWQFVKLVEWPVFRQQCLPTFSLIFMLCFTSFTVVLTLGGGPQYTTLETAIYQAILFEF
DLPKAALFAMLQFVFCLILFSLTSRFSLSNQNGLSNSNIWFEKPKSAVKIFHILVLLVFVFFLFSPVLNILISALSSSNL
LTVWHNSQLWRALGYSLSIAPLSALLALTMAIALLLLSRRLEWLHYQKISQFIINAGMVILAIPILVLAMGLFLLLQDRD
FSNIDLFIIVVFCNALSAMPFVLRILSAPFHNNMRYYENLCNSLGIVGWQRFYLIEWKTLRAPLRYAFALGLALSLGDFT
AIALFGNQEFTSLPHLLYQQLGNYRNQDAAVTAGILLLLCGILFAFIHTYRDADDLSK
>Mature_538_residues
MFSLFHHPQLRPRHYAGGVVVISFIILFYGGALSSIFALGGELQWRAWFTDDYLQHLILFSFGQALLSTVLSIFFGLLLA
RALFYKPFLGKKWLLKLMSLTFVLPALVVIFGLIGIYGSSGWLAWLANLFGMSWQGHIYGLSGILIAHLFFNIPLAAQLF
LQSLQSIPYQQRQLAAQLNLQGWQFVKLVEWPVFRQQCLPTFSLIFMLCFTSFTVVLTLGGGPQYTTLETAIYQAILFEF
DLPKAALFAMLQFVFCLILFSLTSRFSLSNQNGLSNSNIWFEKPKSAVKIFHILVLLVFVFFLFSPVLNILISALSSSNL
LTVWHNSQLWRALGYSLSIAPLSALLALTMAIALLLLSRRLEWLHYQKISQFIINAGMVILAIPILVLAMGLFLLLQDRD
FSNIDLFIIVVFCNALSAMPFVLRILSAPFHNNMRYYENLCNSLGIVGWQRFYLIEWKTLRAPLRYAFALGLALSLGDFT
AIALFGNQEFTSLPHLLYQQLGNYRNQDAAVTAGILLLLCGILFAFIHTYRDADDLSK

Specific function: Part of the ABC transporter complex thiBPQ involved in thiamine import. Probably responsible for the translocation of the substrate across the membrane

COG id: COG1178

COG function: function code P; ABC-type Fe3+ transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 ABC transmembrane type-1 domains

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786254, Length=472, Percent_Identity=43.6440677966102, Blast_Score=365, Evalue=1e-102,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): THIP_HAEIN (P44985)

Other databases:

- EMBL:   L42023
- PIR:   D64164
- RefSeq:   NP_439180.1
- ProteinModelPortal:   P44985
- GeneID:   950718
- GenomeReviews:   L42023_GR
- KEGG:   hin:HI1020
- NMPDR:   fig|71421.1.peg.982
- TIGR:   HI_1020
- HOGENOM:   HBG296626
- OMA:   HDSYLWH
- ProtClustDB:   PRK09433
- BioCyc:   HINF71421:HI_1020-MONOMER
- InterPro:   IPR000515
- InterPro:   IPR005947
- TIGRFAMs:   TIGR01253

Pfam domain/function: PF00528 BPD_transp_1

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 60852; Mature: 60852

Theoretical pI: Translated: 9.44; Mature: 9.44

Prosite motif: PS50928 ABC_TM1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

HASH(0xd679264)-; HASH(0xc323908)-; HASH(0xdc74960)-; HASH(0xddf74ec)-; HASH(0xdc3733c)-; HASH(0xd920f3c)-; HASH(0xdb9e164)-; HASH(0xc349708)-; HASH(0xddf0c24)-; HASH(0xc1acad0)-; HASH(0xc63b8ac)-; HASH(0xd2bd428)-;

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFSLFHHPQLRPRHYAGGVVVISFIILFYGGALSSIFALGGELQWRAWFTDDYLQHLILF
CCCCCCCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHH
SFGQALLSTVLSIFFGLLLARALFYKPFLGKKWLLKLMSLTFVLPALVVIFGLIGIYGSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GWLAWLANLFGMSWQGHIYGLSGILIAHLFFNIPLAAQLFLQSLQSIPYQQRQLAAQLNL
HHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCC
QGWQFVKLVEWPVFRQQCLPTFSLIFMLCFTSFTVVLTLGGGPQYTTLETAIYQAILFEF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC
DLPKAALFAMLQFVFCLILFSLTSRFSLSNQNGLSNSNIWFEKPKSAVKIFHILVLLVFV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHH
FFLFSPVLNILISALSSSNLLTVWHNSQLWRALGYSLSIAPLSALLALTMAIALLLLSRR
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEWLHYQKISQFIINAGMVILAIPILVLAMGLFLLLQDRDFSNIDLFIIVVFCNALSAMP
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
FVLRILSAPFHNNMRYYENLCNSLGIVGWQRFYLIEWKTLRAPLRYAFALGLALSLGDFT
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCE
AIALFGNQEFTSLPHLLYQQLGNYRNQDAAVTAGILLLLCGILFAFIHTYRDADDLSK
EEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCH
>Mature Secondary Structure
MFSLFHHPQLRPRHYAGGVVVISFIILFYGGALSSIFALGGELQWRAWFTDDYLQHLILF
CCCCCCCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHH
SFGQALLSTVLSIFFGLLLARALFYKPFLGKKWLLKLMSLTFVLPALVVIFGLIGIYGSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GWLAWLANLFGMSWQGHIYGLSGILIAHLFFNIPLAAQLFLQSLQSIPYQQRQLAAQLNL
HHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCC
QGWQFVKLVEWPVFRQQCLPTFSLIFMLCFTSFTVVLTLGGGPQYTTLETAIYQAILFEF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC
DLPKAALFAMLQFVFCLILFSLTSRFSLSNQNGLSNSNIWFEKPKSAVKIFHILVLLVFV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHH
FFLFSPVLNILISALSSSNLLTVWHNSQLWRALGYSLSIAPLSALLALTMAIALLLLSRR
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEWLHYQKISQFIINAGMVILAIPILVLAMGLFLLLQDRDFSNIDLFIIVVFCNALSAMP
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
FVLRILSAPFHNNMRYYENLCNSLGIVGWQRFYLIEWKTLRAPLRYAFALGLALSLGDFT
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCE
AIALFGNQEFTSLPHLLYQQLGNYRNQDAAVTAGILLLLCGILFAFIHTYRDADDLSK
EEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCH

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: ATP; thiamine [Periplasm]; H2O [C]

Specific reaction: ATP + thiamine [Periplasm] + H2O = ADP + phosphate + thiamine [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800