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The map label for this gene is cef

Identifier: 89898054

GI number: 89898054

Start: 291653

End: 293680

Strand: Direct

Name: cef

Synonym: CF0247

Alternate gene names: NA

Gene position: 291653-293680 (Clockwise)

Preceding gene: 89898053

Following gene: 89898057

Centisome position: 25.01

GC content: 34.91

Gene sequence:

>2028_bases
ATGAGAAAAGCTTGTTATAATTTTGAAAAGGCTCTGGAGCATTTAGAGAAATTAAAAAAGATTTCTTATGGCTCTCCGGC
ATCTTTTATAAATAGCGCCAAAATTAATGAATTGTTTTCAAACGATCATTACGTTGGTGAAATGAAACAAGCTCTTAAGA
ATATAGAAGATTATCTTAAGAAGGCTGGTTCCTTACCTAAGAGCGAAGCTAATAAGGCTTTGCAAGAATCAAATTTTCTA
ATCGCTGGAGTGCAGAATGTATTTTCTTTTCTAGAAAGTAGGGAGAGAGAATTATACCAGAGCTTAGCTAACGATTATTC
TGAAATAAGTAAGGTTTACAATAAGACGCAGGCAAATCTTAGTCGAAAGATTATTAAGGAGGAAGAAGAAGAGGAGCTAG
TAGAACGAGAATTAGAAGAAATGTGCGAAGAAGAGCGTTTCTTAAATAACCTCGTAGAAGTCAAACGTGACCGTTCTTAT
GAGCTTTTCTATATGTCTGATGAGGAAAATAAGCGTTTTTATACAGACACGCTTATTCAGATTATTTGCAAACAAGGAAA
GGTTCATGAGACAGCTCATGAAGGCGATCCCTTAACAAAAACAATTGTGTGGAATAGCGAAGAACTTCATAACATAGCAT
CTTCGTTAGTATTTGCTAACGACATGCCGATACGTCTATTTTATCAGAAAGCTTTGAGCGATTTGGAAACAGAGTCCACA
AAAAAGATCCACAATGCTGTTATGGGGTTATTTTTTTCTAGATATGATGCAACGGTCGTCTCTAATAACCCTAAGAAAGA
TAATCTTCGTTATTTTAATGATTTTCTTTATTTCCTTAGGGATGCTTGGAAAACCTTGAGCGATCATACTCATGATCAGA
CGCATTACCGGCATTCCTTCACACTCATATCTGCTTTAAGTTCGGGAATTTTTGAAAGCAAACTCGCATTTACAGAGGCA
GCTCGGTATCTGTATTTTCATATACATACGAAATTACATCCTGAAGGAGAGAAAAAACCTTTGTCTTCAGGACACTATGT
TTCTGAGATTTATGAGGAGCTATATCGGTTTCTTTCTAAATATCCCAACGGGCCACTGTTTAAAGCTATAGATAGAATGC
TAGATCCTCATTCTTCAGTATTTGACCCTATTATTCTAGGAATGTTTCCTGGATTAGAAGGTACTTTGAAGCTAGGAGAT
AAATCAATAAATGTAATAAGATCCCCGAGCCCTATAACGCAAAGTTCTATACTGTATGCTAATTGTAATGAGGAATTTAT
AGGCTTTCTTAATGCTAAAGCAAATCTCGGAGATACGACTCTAGTTTTAAACATACAAAATCGTTTATCGAGGAAAGATC
GAGCAAGAAGTCGTGTTTTAGAAGAGATCCTGGACGGTATTGATAGGGCACATGTATTTTCATTCCCAGAGCCAGAAGAT
TTGCTGAACGGCATAGAAAAGATGCATGGTGAGCAGGAAACCTTTTTGGGATTCTTTTCTGTATTCAAAGAAGAATTTAA
TAAATCAGGATCTTCATCTCTATTTTCAGTTCCCGATGTGTCGATAGGGAAAATTCATGCATTTATAGATGATAGTCTTT
CAGTTTTGAAAGAAACATTTTTTTCTAAGAAAAAGATCCTATTTAAAAACGATAAACTATTGCTTCTACACATTATTTCT
TATTTAATCGTATTTAAGCTTATAGAAATTATAGACCCAAATAATCTCATAGTTATGTCCAAAGATGGCTTGGACTATGC
ATCGGTATTCATTTCAGGGTTTTCGTTCTTTGCTGACGATGAGTTTTGGGATGAGCATAGATTAAAGTTGCTTATGGTGA
AAGTTTTGGCTCCAACCTTAGTGGCTAGAGACAGGTTAGTATTTGCAAATTACATTGAATTGATGAGTAAGTTTCTAAAT
TGTCTGAGAAAAAATAGACAAAATCTATCTAACCTTAAACCTATCTTTAATTACGATTTAGAAAAGTGGAATTTCTCGGG
TTATCTAAATGAAATTACTGAAGCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTATTTCAAAATTAATTGATGGTTAAATGATTTTTGTAATAAAGTAATATAACGATCGCAAAATAATAATCTAATTTTT
TGATTCCTTTATGGGGAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CATAAGCATAGTTTGTAAATATTGCTAAGGCAATTAACGGAAATAGCATTACAGGCAGAGTTGGCAAAACACTGCTATTA
GATAGAACTATTCCGGCTTT

Product: calcium binding EF-hand protein precursor

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 675; Mature: 675

Protein sequence:

>675_residues
MRKACYNFEKALEHLEKLKKISYGSPASFINSAKINELFSNDHYVGEMKQALKNIEDYLKKAGSLPKSEANKALQESNFL
IAGVQNVFSFLESRERELYQSLANDYSEISKVYNKTQANLSRKIIKEEEEEELVERELEEMCEEERFLNNLVEVKRDRSY
ELFYMSDEENKRFYTDTLIQIICKQGKVHETAHEGDPLTKTIVWNSEELHNIASSLVFANDMPIRLFYQKALSDLETEST
KKIHNAVMGLFFSRYDATVVSNNPKKDNLRYFNDFLYFLRDAWKTLSDHTHDQTHYRHSFTLISALSSGIFESKLAFTEA
ARYLYFHIHTKLHPEGEKKPLSSGHYVSEIYEELYRFLSKYPNGPLFKAIDRMLDPHSSVFDPIILGMFPGLEGTLKLGD
KSINVIRSPSPITQSSILYANCNEEFIGFLNAKANLGDTTLVLNIQNRLSRKDRARSRVLEEILDGIDRAHVFSFPEPED
LLNGIEKMHGEQETFLGFFSVFKEEFNKSGSSSLFSVPDVSIGKIHAFIDDSLSVLKETFFSKKKILFKNDKLLLLHIIS
YLIVFKLIEIIDPNNLIVMSKDGLDYASVFISGFSFFADDEFWDEHRLKLLMVKVLAPTLVARDRLVFANYIELMSKFLN
CLRKNRQNLSNLKPIFNYDLEKWNFSGYLNEITEA

Sequences:

>Translated_675_residues
MRKACYNFEKALEHLEKLKKISYGSPASFINSAKINELFSNDHYVGEMKQALKNIEDYLKKAGSLPKSEANKALQESNFL
IAGVQNVFSFLESRERELYQSLANDYSEISKVYNKTQANLSRKIIKEEEEEELVERELEEMCEEERFLNNLVEVKRDRSY
ELFYMSDEENKRFYTDTLIQIICKQGKVHETAHEGDPLTKTIVWNSEELHNIASSLVFANDMPIRLFYQKALSDLETEST
KKIHNAVMGLFFSRYDATVVSNNPKKDNLRYFNDFLYFLRDAWKTLSDHTHDQTHYRHSFTLISALSSGIFESKLAFTEA
ARYLYFHIHTKLHPEGEKKPLSSGHYVSEIYEELYRFLSKYPNGPLFKAIDRMLDPHSSVFDPIILGMFPGLEGTLKLGD
KSINVIRSPSPITQSSILYANCNEEFIGFLNAKANLGDTTLVLNIQNRLSRKDRARSRVLEEILDGIDRAHVFSFPEPED
LLNGIEKMHGEQETFLGFFSVFKEEFNKSGSSSLFSVPDVSIGKIHAFIDDSLSVLKETFFSKKKILFKNDKLLLLHIIS
YLIVFKLIEIIDPNNLIVMSKDGLDYASVFISGFSFFADDEFWDEHRLKLLMVKVLAPTLVARDRLVFANYIELMSKFLN
CLRKNRQNLSNLKPIFNYDLEKWNFSGYLNEITEA
>Mature_675_residues
MRKACYNFEKALEHLEKLKKISYGSPASFINSAKINELFSNDHYVGEMKQALKNIEDYLKKAGSLPKSEANKALQESNFL
IAGVQNVFSFLESRERELYQSLANDYSEISKVYNKTQANLSRKIIKEEEEEELVERELEEMCEEERFLNNLVEVKRDRSY
ELFYMSDEENKRFYTDTLIQIICKQGKVHETAHEGDPLTKTIVWNSEELHNIASSLVFANDMPIRLFYQKALSDLETEST
KKIHNAVMGLFFSRYDATVVSNNPKKDNLRYFNDFLYFLRDAWKTLSDHTHDQTHYRHSFTLISALSSGIFESKLAFTEA
ARYLYFHIHTKLHPEGEKKPLSSGHYVSEIYEELYRFLSKYPNGPLFKAIDRMLDPHSSVFDPIILGMFPGLEGTLKLGD
KSINVIRSPSPITQSSILYANCNEEFIGFLNAKANLGDTTLVLNIQNRLSRKDRARSRVLEEILDGIDRAHVFSFPEPED
LLNGIEKMHGEQETFLGFFSVFKEEFNKSGSSSLFSVPDVSIGKIHAFIDDSLSVLKETFFSKKKILFKNDKLLLLHIIS
YLIVFKLIEIIDPNNLIVMSKDGLDYASVFISGFSFFADDEFWDEHRLKLLMVKVLAPTLVARDRLVFANYIELMSKFLN
CLRKNRQNLSNLKPIFNYDLEKWNFSGYLNEITEA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 78149; Mature: 78149

Theoretical pI: Translated: 6.20; Mature: 6.20

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRKACYNFEKALEHLEKLKKISYGSPASFINSAKINELFSNDHYVGEMKQALKNIEDYLK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KAGSLPKSEANKALQESNFLIAGVQNVFSFLESRERELYQSLANDYSEISKVYNKTQANL
HHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SRKIIKEEEEEELVERELEEMCEEERFLNNLVEVKRDRSYELFYMSDEENKRFYTDTLIQ
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHH
IICKQGKVHETAHEGDPLTKTIVWNSEELHNIASSLVFANDMPIRLFYQKALSDLETEST
HHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKIHNAVMGLFFSRYDATVVSNNPKKDNLRYFNDFLYFLRDAWKTLSDHTHDQTHYRHSF
HHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
TLISALSSGIFESKLAFTEAARYLYFHIHTKLHPEGEKKPLSSGHYVSEIYEELYRFLSK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
YPNGPLFKAIDRMLDPHSSVFDPIILGMFPGLEGTLKLGDKSINVIRSPSPITQSSILYA
CCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCCCCCCEEEE
NCNEEFIGFLNAKANLGDTTLVLNIQNRLSRKDRARSRVLEEILDGIDRAHVFSFPEPED
CCCHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHH
LLNGIEKMHGEQETFLGFFSVFKEEFNKSGSSSLFSVPDVSIGKIHAFIDDSLSVLKETF
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSKKKILFKNDKLLLLHIISYLIVFKLIEIIDPNNLIVMSKDGLDYASVFISGFSFFADD
HHCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCC
EFWDEHRLKLLMVKVLAPTLVARDRLVFANYIELMSKFLNCLRKNRQNLSNLKPIFNYDL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCC
EKWNFSGYLNEITEA
CCCCHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MRKACYNFEKALEHLEKLKKISYGSPASFINSAKINELFSNDHYVGEMKQALKNIEDYLK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KAGSLPKSEANKALQESNFLIAGVQNVFSFLESRERELYQSLANDYSEISKVYNKTQANL
HHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SRKIIKEEEEEELVERELEEMCEEERFLNNLVEVKRDRSYELFYMSDEENKRFYTDTLIQ
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHH
IICKQGKVHETAHEGDPLTKTIVWNSEELHNIASSLVFANDMPIRLFYQKALSDLETEST
HHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKIHNAVMGLFFSRYDATVVSNNPKKDNLRYFNDFLYFLRDAWKTLSDHTHDQTHYRHSF
HHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
TLISALSSGIFESKLAFTEAARYLYFHIHTKLHPEGEKKPLSSGHYVSEIYEELYRFLSK
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YPNGPLFKAIDRMLDPHSSVFDPIILGMFPGLEGTLKLGDKSINVIRSPSPITQSSILYA
CCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCCCCCCEEEE
NCNEEFIGFLNAKANLGDTTLVLNIQNRLSRKDRARSRVLEEILDGIDRAHVFSFPEPED
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LLNGIEKMHGEQETFLGFFSVFKEEFNKSGSSSLFSVPDVSIGKIHAFIDDSLSVLKETF
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSKKKILFKNDKLLLLHIISYLIVFKLIEIIDPNNLIVMSKDGLDYASVFISGFSFFADD
HHCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCC
EFWDEHRLKLLMVKVLAPTLVARDRLVFANYIELMSKFLNCLRKNRQNLSNLKPIFNYDL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCC
EKWNFSGYLNEITEA
CCCCHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA