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The map label for this gene is 88608640

Identifier: 88608640

GI number: 88608640

Start: 409574

End: 415339

Strand: Direct

Name: 88608640

Synonym: NSE_0496

Alternate gene names: NA

Gene position: 409574-415339 (Clockwise)

Preceding gene: 88608574

Following gene: 88608126

Centisome position: 47.68

GC content: 42.33

Gene sequence:

>5766_bases
ATGCAGGGTCTATACAATAAACTTTTAGATGCTATTAGTTGTGGCAACTACTCTCTTTTCTCTCAACTCACTAAGCGTGT
CGATTTTGATTATTCAGGGAGTCCCTATAACGGAGTTTCAGCTTTTAATGCGGTGGTTTCTGCTATTTGCATAGAAACTC
CAAAAGATGAGAGAGACATTGCTGATTTGCTTCCTGTGCAGACAAAAGAATCGTCCACTGCGATTGCAGGTTTGAGGGCA
AGAATAACTGGTAGAGAGGAGATTTTTGCAGATTTATGCAAACACCTTCGTGTAAATAGTTTAATAAATTTGGCGGATTT
TGGAACTGGTCTCACACCGGTGCAAGTTGCCTTAGCTGCTAATAACACCACTCTAATAAATCGATTGTTTGCGAACGGTG
CCCTGAGAAGTGCTAGGTGTGAGATTGATAGGGTTTCCGGTTGTACTTTGTTCATGAAAGCGCTTAGTTGTGCAAGTGGT
ACGGCCTCTGTGGAAATGTTGAAAGCGGTTGCTCGTGGTACGGCCAACATTCGACAGTTGACTACAACAGGTAAGACAGA
TAGGCAGATAGTAAATGACCTATGTAACTATTTTCGCTCTCTTGCGTCGAATTATGAAGAAGCACTGGCAGTTTTAATGT
CTTCAGACGGCGATGGGAAGAACTTATATCATAGGGCACTTGAAAAAAATGATCCTGAAGCTTTGCAGTGGTTAAACAAG
CTGTTCCTATCAGAAAAACCCATCATTGAAGAGGCAGAGGAACTTTTGAATAATCTTAGTCTATCAAGTAAGTACAAAAC
GCAGATTTTACAAAGTGTTCGCTATTCGAATGATAAGTTTACCCGCATAAGGAAAGCGATAGGTGCAGCGGATGTGATAT
TTAATATGCCGTGTGGGGAGCTCACTCCAACGGAGTTTATAGTGAGTAATATACCTTCCCAGGACGCTGGAGAGTTTGCT
AGAAATGCAATGATTGGAAACAGTGATGGGAGTGGTTACATGTCTCTTGCGGAAATAGTTGACGGTGGGACGGATCCAGC
TGACTTGATTAAGCTTGCTGATGCAATGGTTCGTTGTGCTCCAGAAAACGTCTGTGCAAGGTTTTTTGCTGGTCACTCTG
GTTCCGTTCTTTTGAAAAAACTTTGTGATTTTTATGAAAAACGCGATGGTTCTATCAATGAAAAGGCATTTATTGATTTC
TTGATAAAAATCGCTTTCCCTAGCTGCCTAGAATTTGTTACGGAAGGTAGGATCAATGTTGAGGATATCCTACATGGAGT
GGTTGAAACTCGTGATCCCAATAGGATTGCTGGTATTGCTGCTCTTGCTTCACCGAAATCTTGGGAGCACGAGAATAAGG
CAGGATGTAATCCGTTGGAGCTTGCTATTGCAAATGAGGATCCTGATTGTTTTGCTGCGATTCTTCAAAGCTTAGAAGGT
GCATTGGTAGCTGCAAGCACTCAGGAAGAGCTCAGTGCACACCGAGAATGTATAGATAGGCTTCTTGCAGGAGTTGGTAA
GACATCTGGAAAGGCGGCTTTGCACTTTGTTGTTGACAAAGCCCCACAACTGATAGGTATGATTCTTAACTTATCTTCTG
ATGGTGAAGCTTTATTGCGTGTTAAGGATGCAAGAGGCCTCTTACCAGTTCACCATAATGCAAACATAAACGCTTTTTAC
CAGCCTCTATACGAGAAGAAATTTTGCAAGCCAATTACAGAGGCAACGGCGAATCAAATTAACGATCTAAAGGAAAGCGT
TGTACTTCATAAAAAAATCGCCGATGGGGATAAATCTGTCCTGCAAACGCTATTTTTACAAGATGAATCCAACGTGTACA
AATGCATAGATACCGCTGAGGGTACGAAGAGCATTCTTGAAGTGGCTGCTGAAAGTGGTAGACCGGATTTGGTGAAGTTT
ATTCTTCTAGAACATAAAAAATTACAGGAAAAAAGTAAAAATAAATGTAAGGACGTTGAGGCTGAACTTGAACAACTGAC
AGCCTTCCAGACTCCTGAAGTGCAAGAAAAGATCGGTGATCTGGAAGCTGAGAGGACGCTTCAAGAAGGGATGCAGCGTG
CTAGATCCGATGCGATGTGTAGGCATGCTAACGAAACGTTGTTAAGGGTGCTTAGTACCCAAAACCCGCAAGATTGGCAT
CAAGAAGTAATGGATGCTGCGGATTTGCGTGAAGAGACGCTTGTTGCAACACTTTTGGATAGTGGTGCAAACCCGCTAGT
TACAGCTGTACAAAGTGGTAACAATCCGGTTGCACAGAAAATATTGTCAGAAGCCAAAGAGTGTGCAAATGATGATCTAA
AGGATAGTCTTATCAAAAATCAAGATGTTACTGGTCTTTTAAAGTGTGGCTTTGGATCATCTAGCTTATATGATGCTACT
TATACTCCGCTCAGGGATCCTGGAAAGGATAAGGCAGAGTTTGAGCCTTCAGTAGCGGCCGTTGCACTTATACGTGAGGA
AATGAATACTCTTAGGAAACAGGTTACTTCAAAGTTTTCTGGTAAGGGTGTTTTGCTTACGTATGCACACGCTATCTCCA
TGGATACACCTGAAGCAGAGAATATAAAAGATAAATTGAATGGCTTTGAAGATGGAGATAAAGGGCTTCTTTCAGTGTGC
AGCCCAGATGGGCATAACATAGGTACCCTCATTGCTGCCTTTGGTGGCATTGCACAATGGCAGGCCTACGCAAATAAGTA
TAGCAAGCTAAAGTCTGCAGATAGTGGTGGTGTTTCTCCAGCGGTAAACGTGTCTGCTGATATAGGTACTCCCTTGCAGG
TTGCGCTTTTGGCGAAGCACTTTGCAAACAATGGTCCGGAAAAGAGAAGGAGATCACTCCTCCTTGATTATTTGCTACAG
CACCACTTAGATGATGTTTTTATTCCAAACGTAAATGGGGAAAATCTTTTGCACACGGCTGTCAAATGTAGCGATATGGA
GGTATTAGACTTGATGTTGACGCATGCTATCTATACAAGTACCACCACCTTTTCCGCCTTGAATCAACGGAACGGAGCTG
GTAGGACTGTTCTAGAGCTTGCCGTTTACATGGATAATGCTTCAGCGCTTAAAATAATAGTTGAGAGTGTGTTGGCACGC
CATGGAGCGGGTGCTGCGAGCGCTTTACTTCTTGAATCGCGCCTCTTACACACTGCTGTTGCAACAAATAATGATGCGAT
GCTTAAGCTGATTGCGAGTGTGCAAAAAATGCTTAATGTAATTACTGCTCCAGACCAGCAGCTCTTGTTGGAGAATCAGA
AAGATCAACAAGGTAGGGATCCGTTTGTTCTTGCTGTCGAAATGGGAAACCTTTCTGCTATGAAAACGATGCATAGGGCT
GGACTGCAAATGAATGCAGAGAGTGTTAAGGAAGCAATTGCAGGGCTTCCAGCCAGCTTTGATAAAGGTAAGTTGGATGG
ATTGATTAAACTTCTCAAGTTAGATAGAGCTGAGTCAGCTGCGCTCCTAGCTGAACGTGAGAAGCGTTTAAGAAAAACTC
TTCCTCCAACACCGCCCTTGGCGGTGGAGCCCCAAAGCAGTGAAGTAAGAGGGGAATTTATAGATCAGGTGCGCTGTATT
GCAGAAAGTGAGTCTGAGCTATTCAAAAGGCAGTCTTTTCATGCGCACAACAGTCTTTTTTCACAATTTCAACAAGAGTA
CAACAAGCGCGCTACATCTTTAAAAGAAGATATTACTAATGACAGGATAGATATTGCTCTTGCTAACATGCGTTTGCATC
CAGATCTTGTCGATTCTGCCGATAACAGGGGTGAGATTATAGAGGCAGTACTAGCATCCAACAACTTAGAATTGGCTAAG
GTTGTTGTGCAAAGTTCAAATAAGTTCATAAAGAACTCTAGTGGTGATAACTTGCTTAATTGTATTATAAAGCATGCTAG
CGATGGAAGTTTAAAAGAATTAGTTGCTGAGTGTATAAATACTGGTTATAGCCTCGCTGAGGTTTCAAGGGATGGGATAA
GCGCCTTTCAACTACTGGAAGAAAGAGATCCGGCTTTTGCAGCGGAATTAAGAAGTGCTCATGAGAAAGAAAGTGCTAAA
ATCACCAGTCTAATGAATTGTTTGGAGGATGTTCTACAGTCCGCAAATACGGGTGCGAAGTCACGTGCATCTTCCGTATT
GCTAGGAGAAATGAATTCTTTTCCTAAAGGCTATAATTTCCCTGTTTTTTCGCAGATATTTTCGCAAATACTTAGTGACA
ATACTCATGGTGAGCACTCTTTGGTTACAAAGCGTCTTGGTCTGCTCTGCTATCTTTTCAAGGGAGTTTCATACTTTGGA
GAAAAAAGCCCAGAGAACGGGGATACAGTTCTGCATATGCTATTTAAGGTGCTTAAAAGCAATCCTGGAGCTATTGTTGA
AGTACGTGAAGCTCTTGAGGCTATTATCGCAAACAAAAATTTTTATCCTGAGTTGCTTTTGGAAAAAAACTACTATGGTT
TTTCGGCATTGGATGTTTTAGCAGGTGTAAAAGGGTCATGGCACCTTTTAGATGTCATTAGGAGAACTTTTCCAAATTTT
GATGATAAAATTAGCCTTGCGAAGATGTTGATGTTTTCTGTACTTGAAGCAGACTTAGACGAAACTAGAGAATTTTTAGA
ACGGCATCAAGGTTCTCTCTTAGATATTAATTCTGAAGATAACGATGGTGTTTCTAGTCTTGAGTGTGCCATTTTAAGGA
ACGATGTTCCTATGTGCAAGCTTCTCCTTGAATATGGAGCAGAAATAAATACGGTTGATCTTCATGGACGTAATTTCCTT
GATAAGATACTCGATCGTTCTTTCGAGACGGGCGTTCAGCCTAGTCCCGAGATGGTGTCCCTACTTGTAAGTAGAGGTGT
AGATTTGATGCACAGTAGTGGTGATTTAACTACTTTAGAACGATTCGAGAAGTTTGAACAGAAAAAAGATGTGCTCCGTA
CTCGTTTAGCTGTCCTGATGGATAAGCCTAACCTCTGTCAAAGCGATTATACGGAATTGCGCATTTTGATGAATGCACAG
TTGCACCAAGACTACTGTAGGATTCTCCGCGATGCTGTACTTGAGCGTGAGCGACTTAATGAAGAAGTGAGCAAACGGGC
TGCGAATGCGTTATATGTTGCAAGCGGTTTTAACTTTGTCGAAAGCATAAGGCCAATTGTAAGTGCTCCATTCAGATTAC
CGAAGGATAAAAGTTCCGCAAGTCTTATTGGAGGCGTGGTGTGTATCAAGGTTGATGAGAACGCTTCTATTGATATTGAT
GAACTTTTTTCTTCTGTGAAGCCCTATGGAGTACGGTGTAGTGATTTATCGTTCAATGGGGGTAGGGATGTCGTTAAGGT
GGAAAGAAAAGCAAATGGTTTAACGAACTATATCCCCAAAAGTGGGTGTGTCATTGTCTCGGTTGATGCGAAGGTAAAGG
GAAATTCTGAGAAGGTTGAGATATTCATTAGCAGTGATGGTTCTGTCTCTTTTGGTTCCAAAAAAAATTCTGCTAAATTG
ACTTCTCTTTTCAAGGAGGGCAAGATTGATTTCACTTCTTCAGGCGTATATGTTGATGGTACACCACTTGAGAAGGCATT
CGGTTCAGCGCCTAAAAAGGCTGTAGTGCATGAACAACTTCAGGGGGTAGCAAGAAGTTTGAGGGAGGCCGGTGCTTCAG
GTGCAGAGAATGTTCATGCTTCCCATAGGCACGTACCGACCGGTGGGGCATCGCGCGTTACAGAGCGCGGAGGTGATATA
ACGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCTTGAATTTACTGTTCCCTTCTGGACGGGGACTTGGTGGGCTGATTTTGATGTGTTGTTTTGTCGTGTTCAGGGGATT
TTTTTGCTTTATAGTGAGCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAACCATTGTGTACTGGCTGGCTCTGTGCACATCTTGGTTACCAGGAACGGAGTTTATTAATATTTTGGATGAGTGAACT
GTAGAAAGTTTTCTTTTTAT

Product: ankyrin repeat-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: Ankyrin Repeat-Containing Protein

Number of amino acids: Translated: 1921; Mature: 1921

Protein sequence:

>1921_residues
MQGLYNKLLDAISCGNYSLFSQLTKRVDFDYSGSPYNGVSAFNAVVSAICIETPKDERDIADLLPVQTKESSTAIAGLRA
RITGREEIFADLCKHLRVNSLINLADFGTGLTPVQVALAANNTTLINRLFANGALRSARCEIDRVSGCTLFMKALSCASG
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LFLSEKPIIEEAEELLNNLSLSSKYKTQILQSVRYSNDKFTRIRKAIGAADVIFNMPCGELTPTEFIVSNIPSQDAGEFA
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T

Sequences:

>Translated_1921_residues
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T
>Mature_1921_residues
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TSLFKEGKIDFTSSGVYVDGTPLEKAFGSAPKKAVVHEQLQGVARSLREAGASGAENVHASHRHVPTGGASRVTERGGDI
T

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 210149; Mature: 210149

Theoretical pI: Translated: 5.64; Mature: 5.64

Prosite motif: PS50088 ANK_REPEAT ; PS50297 ANK_REP_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQGLYNKLLDAISCGNYSLFSQLTKRVDFDYSGSPYNGVSAFNAVVSAICIETPKDERDI
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NNTTLINRLFANGALRSARCEIDRVSGCTLFMKALSCASGTASVEMLKAVARGTANIRQL
CCHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
TTTGKTDRQIVNDLCNYFRSLASNYEEALAVLMSSDGDGKNLYHRALEKNDPEALQWLNK
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
LFLSEKPIIEEAEELLNNLSLSSKYKTQILQSVRYSNDKFTRIRKAIGAADVIFNMPCGE
HHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCC
LTPTEFIVSNIPSQDAGEFARNAMIGNSDGSGYMSLAEIVDGGTDPADLIKLADAMVRCA
CCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC
PENVCARFFAGHSGSVLLKKLCDFYEKRDGSINEKAFIDFLIKIAFPSCLEFVTEGRINV
CHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
EDILHGVVETRDPNRIAGIAALASPKSWEHENKAGCNPLELAIANEDPDCFAAILQSLEG
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCC
ALVAASTQEELSAHRECIDRLLAGVGKTSGKAALHFVVDKAPQLIGMILNLSSDGEALLR
CEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEE
VKDARGLLPVHHNANINAFYQPLYEKKFCKPITEATANQINDLKESVVLHKKIADGDKSV
EECCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
LQTLFLQDESNVYKCIDTAEGTKSILEVAAESGRPDLVKFILLEHKKLQEKSKNKCKDVE
HHHHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AELEQLTAFQTPEVQEKIGDLEAERTLQEGMQRARSDAMCRHANETLLRVLSTQNPQDWH
HHHHHHHHCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
QEVMDAADLREETLVATLLDSGANPLVTAVQSGNNPVAQKILSEAKECANDDLKDSLIKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCC
QDVTGLLKCGFGSSSLYDATYTPLRDPGKDKAEFEPSVAAVALIREEMNTLRKQVTSKFS
CCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GKGVLLTYAHAISMDTPEAENIKDKLNGFEDGDKGLLSVCSPDGHNIGTLIAAFGGIAQW
CCCEEEEEEHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHCCHHHH
QAYANKYSKLKSADSGGVSPAVNVSADIGTPLQVALLAKHFANNGPEKRRRSLLLDYLLQ
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
HHLDDVFIPNVNGENLLHTAVKCSDMEVLDLMLTHAIYTSTTTFSALNQRNGAGRTVLEL
HCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
AVYMDNASALKIIVESVLARHGAGAASALLLESRLLHTAVATNNDAMLKLIASVQKMLNV
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ITAPDQQLLLENQKDQQGRDPFVLAVEMGNLSAMKTMHRAGLQMNAESVKEAIAGLPASF
HCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCC
DKGKLDGLIKLLKLDRAESAALLAEREKRLRKTLPPTPPLAVEPQSSEVRGEFIDQVRCI
CCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH
AESESELFKRQSFHAHNSLFSQFQQEYNKRATSLKEDITNDRIDIALANMRLHPDLVDSA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCEECCHHHCCC
DNRGEIIEAVLASNNLELAKVVVQSSNKFIKNSSGDNLLNCIIKHASDGSLKELVAECIN
CCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
TGYSLAEVSRDGISAFQLLEERDPAFAAELRSAHEKESAKITSLMNCLEDVLQSANTGAK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
SRASSVLLGEMNSFPKGYNFPVFSQIFSQILSDNTHGEHSLVTKRLGLLCYLFKGVSYFG
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
EKSPENGDTVLHMLFKVLKSNPGAIVEVREALEAIIANKNFYPELLLEKNYYGFSALDVL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHEECCCCCHHHHHHH
AGVKGSWHLLDVIRRTFPNFDDKISLAKMLMFSVLEADLDETREFLERHQGSLLDINSED
HCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCC
NDGVSSLECAILRNDVPMCKLLLEYGAEINTVDLHGRNFLDKILDRSFETGVQPSPEMVS
CCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
LLVSRGVDLMHSSGDLTTLERFEKFEQKKDVLRTRLAVLMDKPNLCQSDYTELRILMNAQ
HHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LHQDYCRILRDAVLERERLNEEVSKRAANALYVASGFNFVESIRPIVSAPFRLPKDKSSA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCH
SLIGGVVCIKVDENASIDIDELFSSVKPYGVRCSDLSFNGGRDVVKVERKANGLTNYIPK
HHCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCCCCCCEEEHHHHCCHHHCCCC
SGCVIVSVDAKVKGNSEKVEIFISSDGSVSFGSKKNSAKLTSLFKEGKIDFTSSGVYVDG
CCCEEEEECCEECCCCCEEEEEEECCCCEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEECCCEEECC
TPLEKAFGSAPKKAVVHEQLQGVARSLREAGASGAENVHASHRHVPTGGASRVTERGGDI
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T
C
>Mature Secondary Structure
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