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The map label for this gene is 88608516

Identifier: 88608516

GI number: 88608516

Start: 470369

End: 471850

Strand: Reverse

Name: 88608516

Synonym: NSE_0541

Alternate gene names: NA

Gene position: 471850-470369 (Counterclockwise)

Preceding gene: 88608566

Following gene: 88608106

Centisome position: 54.93

GC content: 37.45

Gene sequence:

>1482_bases
TTGAAATCGTTTCCCGGACTGAAGTGCTCTTTCTCTTTGGAAAACCGGTTTAGTAAATTCTCTTTCCCTGCTACTATTTT
AAAGGATCCTTCTGTGGTACCTGGTTCTGTGAGTAGTCTCTTTTTTATTTCTGCGGCTTCTGTTTTTTTCTGTACCTTTG
TATTTTTTTTCTTTAAGCTGAACGCCTTTGAGAAAGTCGGCACCGCGTTAATTTTAGTTGCTTGTCTTTTTACATTTTTT
CAGAACAACTTATTCTATATTTTACTCGGCCTTGAGATTCTTTCGCTGATATACTCGACATTAATTGCTTCGCAGGGTAA
CGTAAAAGGAGCCATTACATATGCAGCATGCAGTTTTGCCGTAGCTACTGCTATGGCTGCGCTCATACCTCACGACCTTT
CTTTTACGGCGGATAACATTAATTTTTTACATCTTCATGATTTGAGGGAAAAGTTATTTGGAGGTTTACTGTTTCTCTAT
GCAGGTGTATTTATCATGGCCCCAGTGATAAAAAGTGAGTATGTAAGTGCTAGATCACTCTTTATTCCGTTTCTTAGCAT
CTTCACATATGCATTACCGCTGGCTTTAATCGGGAAAATTGGTATTGGCGACAGCGAATTTTTATTCGTCTTAAGTTTTT
TCACGTTGCTATATGCATTTTATCGGATGGCGATTGAGAAAAAGCTGCTAGATGCACTCATAGCAAACCAAATAGGGCAG
GTGGGTTTAACAGGTATCATTCTGCACTGCTCTATAAGTGATGTATATCATTATATTTTTGCATCCGCTGTTTATCAGCT
GGTGGTGTATTTTGTTTGTTCACTCCTTTTGAGGTTAGGTGTAGACACATTTACAAAAGTGACAAAATTTAGCTTTCTTT
CGCTGATTCCTTTATTTGTATCTCTTATTGTAATTTTCGCGGGTTTTATTTTTTTCCGGAGCCCTGGTCTTCTTTTTTTG
CAGTCCTTTGGATATGGAGCAAAAATAACAGTCTTTTTTTTACAAGCTCTTTTCACTTCTATGATACCAGTAAGGTTGTT
ATATTGCTGCTATGCTACCAGTGGAAGGATCAACAACAAAACTTTCGATATTTCTTTAGGTGAAAGGTTCTGTATTGCGT
GTATTTGTATTTATGTGTTTCTTTCTTTCACCACTTGGCTTCATAATCTTGTTGAGTTTTTTCTAATGCTAGCAGTATTT
CTGGGTACTGCCGTCCTATATTTCCTTTTCTCAGGTACGATACGTATGCTCCTTTTAGAATTAAATGCACTACTACGGTC
AAGTTCACTGGTACTTAACCGACTTACTTCAAAAATGGAAAAGCATTTGTTTTTTCTTTGGAACTCGGCTATTCGAGGAC
TGTGCACTTTATTTGGATCAGTGATCCCAACGACCTGTAGTTGTTTAGACTCCTTGTCGCTTAGTATTGTGATTTTTTTA
ATGAGCATCGTTGTTGTATTGTTTCTCTTTGCAGGGGTTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGATATTTTCGCCGGAACCGTGGTTGTATCGAATGGTGCTGAAATTTTTCGAAAAGAAGCTGCTTATCATTCTGCAACT
TACCAGGGCAAAGCAGAGGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTCTTATGTTTGATTCACTTTCTAAAAAAATTGGTGGTGCACTGGATGGAATAAAGAATAGAGGGGTGATTACCGAAAA
GGAGTTTGACGATTTTGTTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 493; Mature: 493

Protein sequence:

>493_residues
MKSFPGLKCSFSLENRFSKFSFPATILKDPSVVPGSVSSLFFISAASVFFCTFVFFFFKLNAFEKVGTALILVACLFTFF
QNNLFYILLGLEILSLIYSTLIASQGNVKGAITYAACSFAVATAMAALIPHDLSFTADNINFLHLHDLREKLFGGLLFLY
AGVFIMAPVIKSEYVSARSLFIPFLSIFTYALPLALIGKIGIGDSEFLFVLSFFTLLYAFYRMAIEKKLLDALIANQIGQ
VGLTGIILHCSISDVYHYIFASAVYQLVVYFVCSLLLRLGVDTFTKVTKFSFLSLIPLFVSLIVIFAGFIFFRSPGLLFL
QSFGYGAKITVFFLQALFTSMIPVRLLYCCYATSGRINNKTFDISLGERFCIACICIYVFLSFTTWLHNLVEFFLMLAVF
LGTAVLYFLFSGTIRMLLLELNALLRSSSLVLNRLTSKMEKHLFFLWNSAIRGLCTLFGSVIPTTCSCLDSLSLSIVIFL
MSIVVVLFLFAGV

Sequences:

>Translated_493_residues
MKSFPGLKCSFSLENRFSKFSFPATILKDPSVVPGSVSSLFFISAASVFFCTFVFFFFKLNAFEKVGTALILVACLFTFF
QNNLFYILLGLEILSLIYSTLIASQGNVKGAITYAACSFAVATAMAALIPHDLSFTADNINFLHLHDLREKLFGGLLFLY
AGVFIMAPVIKSEYVSARSLFIPFLSIFTYALPLALIGKIGIGDSEFLFVLSFFTLLYAFYRMAIEKKLLDALIANQIGQ
VGLTGIILHCSISDVYHYIFASAVYQLVVYFVCSLLLRLGVDTFTKVTKFSFLSLIPLFVSLIVIFAGFIFFRSPGLLFL
QSFGYGAKITVFFLQALFTSMIPVRLLYCCYATSGRINNKTFDISLGERFCIACICIYVFLSFTTWLHNLVEFFLMLAVF
LGTAVLYFLFSGTIRMLLLELNALLRSSSLVLNRLTSKMEKHLFFLWNSAIRGLCTLFGSVIPTTCSCLDSLSLSIVIFL
MSIVVVLFLFAGV
>Mature_493_residues
MKSFPGLKCSFSLENRFSKFSFPATILKDPSVVPGSVSSLFFISAASVFFCTFVFFFFKLNAFEKVGTALILVACLFTFF
QNNLFYILLGLEILSLIYSTLIASQGNVKGAITYAACSFAVATAMAALIPHDLSFTADNINFLHLHDLREKLFGGLLFLY
AGVFIMAPVIKSEYVSARSLFIPFLSIFTYALPLALIGKIGIGDSEFLFVLSFFTLLYAFYRMAIEKKLLDALIANQIGQ
VGLTGIILHCSISDVYHYIFASAVYQLVVYFVCSLLLRLGVDTFTKVTKFSFLSLIPLFVSLIVIFAGFIFFRSPGLLFL
QSFGYGAKITVFFLQALFTSMIPVRLLYCCYATSGRINNKTFDISLGERFCIACICIYVFLSFTTWLHNLVEFFLMLAVF
LGTAVLYFLFSGTIRMLLLELNALLRSSSLVLNRLTSKMEKHLFFLWNSAIRGLCTLFGSVIPTTCSCLDSLSLSIVIFL
MSIVVVLFLFAGV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 54969; Mature: 54969

Theoretical pI: Translated: 8.71; Mature: 8.71

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.8 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
2.8 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKSFPGLKCSFSLENRFSKFSFPATILKDPSVVPGSVSSLFFISAASVFFCTFVFFFFKL
CCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NAFEKVGTALILVACLFTFFQNNLFYILLGLEILSLIYSTLIASQGNVKGAITYAACSFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
VATAMAALIPHDLSFTADNINFLHLHDLREKLFGGLLFLYAGVFIMAPVIKSEYVSARSL
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIPFLSIFTYALPLALIGKIGIGDSEFLFVLSFFTLLYAFYRMAIEKKLLDALIANQIGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VGLTGIILHCSISDVYHYIFASAVYQLVVYFVCSLLLRLGVDTFTKVTKFSFLSLIPLFV
CCHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLIVIFAGFIFFRSPGLLFLQSFGYGAKITVFFLQALFTSMIPVRLLYCCYATSGRINNK
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
TFDISLGERFCIACICIYVFLSFTTWLHNLVEFFLMLAVFLGTAVLYFLFSGTIRMLLLE
EEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNALLRSSSLVLNRLTSKMEKHLFFLWNSAIRGLCTLFGSVIPTTCSCLDSLSLSIVIFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MSIVVVLFLFAGV
HHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKSFPGLKCSFSLENRFSKFSFPATILKDPSVVPGSVSSLFFISAASVFFCTFVFFFFKL
CCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NAFEKVGTALILVACLFTFFQNNLFYILLGLEILSLIYSTLIASQGNVKGAITYAACSFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
VATAMAALIPHDLSFTADNINFLHLHDLREKLFGGLLFLYAGVFIMAPVIKSEYVSARSL
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIPFLSIFTYALPLALIGKIGIGDSEFLFVLSFFTLLYAFYRMAIEKKLLDALIANQIGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VGLTGIILHCSISDVYHYIFASAVYQLVVYFVCSLLLRLGVDTFTKVTKFSFLSLIPLFV
CCHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLIVIFAGFIFFRSPGLLFLQSFGYGAKITVFFLQALFTSMIPVRLLYCCYATSGRINNK
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
TFDISLGERFCIACICIYVFLSFTTWLHNLVEFFLMLAVFLGTAVLYFLFSGTIRMLLLE
EEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNALLRSSSLVLNRLTSKMEKHLFFLWNSAIRGLCTLFGSVIPTTCSCLDSLSLSIVIFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MSIVVVLFLFAGV
HHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA