| Definition | Geobacter metallireducens GS-15 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007517 |
| Length | 3,997,420 |
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The map label for this gene is 78222706
Identifier: 78222706
GI number: 78222706
Start: 1689347
End: 1690594
Strand: Direct
Name: 78222706
Synonym: Gmet_1494
Alternate gene names: NA
Gene position: 1689347-1690594 (Clockwise)
Preceding gene: 78222705
Following gene: 78222707
Centisome position: 42.26
GC content: 41.59
Gene sequence:
>1248_bases GTGTTCACAAATGTCAGCTTTATTGTCACAGGCACGAGCTCTGCAACCATACTTATATTATGTTTGTTTATTCGTGCAAT TATTAGTTATAAATCTAAAACTGTAAATAAATTCGATGCACGATTGTTAATAATATTGATTGGCTGGTTGTTTGCATCAG CTAGTCTTGCTTTTCTGATTAACCAATCAACCAAATGGGATCTGATTACTGTCACTTTGCAAACTGCAATATTTTATATT TTGCCTTTAGCAGTCTCAACCCTTTCAGCTAAAGAACGAAAATTGCTGGCAAACATTACTATTTTGTTAGCTGTGTTGTT TGCTCTAATCCACCTCGGCATATTATGGACAAAAAATGGAAAGCTGGTTGCAAAATACTATTTCCTGCCAAAGGGGATGA ATGATGCTTACGGAGTATCCGAAAACATAGCCACCAGTTCTGGGATGTTCTATGTACCTAGGGCGTCAGCGTTGATAATG ATAACAACTGCATTTCTGGCGGGCAGAATTTTGCTTAAATCATACAAAAATGTTTTCGGATTATTCTTGCTGCTGTCATC TTTGGTTATTTGTCTCATATGTTCAATATCGTTTGCGCAACGGTCTTTCGTGTTGATATTGCCTTTAGTTATGCTGATCT ATGCGGGACTTTCCTTTAAGAGAAGGGGGGGCATAGCCACTGTATTTGTCATGATCATACTGGTTGGTGGTGGATATGCA GTTATCAGGAATGCGTCAGCAAAGTCGAATTTTACTGCAGTGATGGAAAAGCGGCTTGCAGAAGCTGCCAAAGTGGGAAG TCTGGACCCAAGGAATGCAAGGATTGCTGCAAACCGCGATGCTCTCGAATCTATTGTAGAATCACCCTTATGGGGGATCG GCTCAATCGTTTCGAGCACAAGAAGCCAGGATGCGCATAGTATCCTGCGGGTAGGCTTTATGGGGGGACTACCGGCAATT CTTATGGTTTTGGTTTGGATATCTACTCAATTCTTAAGGTTTGCCAAATTGTTGAAAAAATGTGGTGAACCAAATCTGGG GCTTTGTCTGTCTGCATTCTGCGCAGTAATGTGCGCCTGCTTGATGATGCTGCTGAACACGGTTCCATACCTGTTTTATT CAATGAATCTGGTCCCGTTCGGCATTTTCGTCGGGCTGTTCATAAGTGAGTACACAGATATGGCAAACAGCAGAATGAGG AATGATAGTGTCAAAGAACCTTTTGATACATACGTTTCGCCGGCCTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AACGTTTTTTGTCATATTTATCGGCATAGTGACATTATTTAAACCTATTGTCGGAATTATATCTTTATTGTTATTGGAAT GTTCATTTGTTCTGCCGTCT
Downstream 100 bases:
>100_bases TGACGGCGCCTTTATCAGGGTTAAAAATCTCAATACGGCTATTGCTGAAATAACTGCTGGACATTGCCACGAGGTAGTCC TTGTGTCAGTGCGTCACTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 415; Mature: 415
Protein sequence:
>415_residues MFTNVSFIVTGTSSATILILCLFIRAIISYKSKTVNKFDARLLIILIGWLFASASLAFLINQSTKWDLITVTLQTAIFYI LPLAVSTLSAKERKLLANITILLAVLFALIHLGILWTKNGKLVAKYYFLPKGMNDAYGVSENIATSSGMFYVPRASALIM ITTAFLAGRILLKSYKNVFGLFLLLSSLVICLICSISFAQRSFVLILPLVMLIYAGLSFKRRGGIATVFVMIILVGGGYA VIRNASAKSNFTAVMEKRLAEAAKVGSLDPRNARIAANRDALESIVESPLWGIGSIVSSTRSQDAHSILRVGFMGGLPAI LMVLVWISTQFLRFAKLLKKCGEPNLGLCLSAFCAVMCACLMMLLNTVPYLFYSMNLVPFGIFVGLFISEYTDMANSRMR NDSVKEPFDTYVSPA
Sequences:
>Translated_415_residues MFTNVSFIVTGTSSATILILCLFIRAIISYKSKTVNKFDARLLIILIGWLFASASLAFLINQSTKWDLITVTLQTAIFYI LPLAVSTLSAKERKLLANITILLAVLFALIHLGILWTKNGKLVAKYYFLPKGMNDAYGVSENIATSSGMFYVPRASALIM ITTAFLAGRILLKSYKNVFGLFLLLSSLVICLICSISFAQRSFVLILPLVMLIYAGLSFKRRGGIATVFVMIILVGGGYA VIRNASAKSNFTAVMEKRLAEAAKVGSLDPRNARIAANRDALESIVESPLWGIGSIVSSTRSQDAHSILRVGFMGGLPAI LMVLVWISTQFLRFAKLLKKCGEPNLGLCLSAFCAVMCACLMMLLNTVPYLFYSMNLVPFGIFVGLFISEYTDMANSRMR NDSVKEPFDTYVSPA >Mature_415_residues MFTNVSFIVTGTSSATILILCLFIRAIISYKSKTVNKFDARLLIILIGWLFASASLAFLINQSTKWDLITVTLQTAIFYI LPLAVSTLSAKERKLLANITILLAVLFALIHLGILWTKNGKLVAKYYFLPKGMNDAYGVSENIATSSGMFYVPRASALIM ITTAFLAGRILLKSYKNVFGLFLLLSSLVICLICSISFAQRSFVLILPLVMLIYAGLSFKRRGGIATVFVMIILVGGGYA VIRNASAKSNFTAVMEKRLAEAAKVGSLDPRNARIAANRDALESIVESPLWGIGSIVSSTRSQDAHSILRVGFMGGLPAI LMVLVWISTQFLRFAKLLKKCGEPNLGLCLSAFCAVMCACLMMLLNTVPYLFYSMNLVPFGIFVGLFISEYTDMANSRMR NDSVKEPFDTYVSPA
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 45481; Mature: 45481
Theoretical pI: Translated: 10.19; Mature: 10.19
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.9 %Cys (Translated Protein) 3.6 %Met (Translated Protein) 5.5 %Cys+Met (Translated Protein) 1.9 %Cys (Mature Protein) 3.6 %Met (Mature Protein) 5.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFTNVSFIVTGTSSATILILCLFIRAIISYKSKTVNKFDARLLIILIGWLFASASLAFLI CCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE NQSTKWDLITVTLQTAIFYILPLAVSTLSAKERKLLANITILLAVLFALIHLGILWTKNG CCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC KLVAKYYFLPKGMNDAYGVSENIATSSGMFYVPRASALIMITTAFLAGRILLKSYKNVFG CEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFLLLSSLVICLICSISFAQRSFVLILPLVMLIYAGLSFKRRGGIATVFVMIILVGGGYA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCE VIRNASAKSNFTAVMEKRLAEAAKVGSLDPRNARIAANRDALESIVESPLWGIGSIVSST EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH RSQDAHSILRVGFMGGLPAILMVLVWISTQFLRFAKLLKKCGEPNLGLCLSAFCAVMCAC CCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LMMLLNTVPYLFYSMNLVPFGIFVGLFISEYTDMANSRMRNDSVKEPFDTYVSPA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MFTNVSFIVTGTSSATILILCLFIRAIISYKSKTVNKFDARLLIILIGWLFASASLAFLI CCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE NQSTKWDLITVTLQTAIFYILPLAVSTLSAKERKLLANITILLAVLFALIHLGILWTKNG CCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC KLVAKYYFLPKGMNDAYGVSENIATSSGMFYVPRASALIMITTAFLAGRILLKSYKNVFG CEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFLLLSSLVICLICSISFAQRSFVLILPLVMLIYAGLSFKRRGGIATVFVMIILVGGGYA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCE VIRNASAKSNFTAVMEKRLAEAAKVGSLDPRNARIAANRDALESIVESPLWGIGSIVSST EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH RSQDAHSILRVGFMGGLPAILMVLVWISTQFLRFAKLLKKCGEPNLGLCLSAFCAVMCAC CCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LMMLLNTVPYLFYSMNLVPFGIFVGLFISEYTDMANSRMRNDSVKEPFDTYVSPA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA