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The map label for this gene is 75909668

Identifier: 75909668

GI number: 75909668

Start: 4292627

End: 4295002

Strand: Direct

Name: 75909668

Synonym: Ava_3462

Alternate gene names: NA

Gene position: 4292627-4295002 (Clockwise)

Preceding gene: 75909666

Following gene: 75909672

Centisome position: 67.43

GC content: 41.84

Gene sequence:

>2376_bases
ATGGACGCTGAAGCAGCATTAGCATGGTTAGACACCATAATTCCTGCTCAGACCGGGGAACGGTTGAGCGATTTGCAAAA
AGTTATTGTTGTGCAGGTTTGGTTGGGTAGGAAATATTTGGATATTGCCCGTGCTTATGGTTGTACGGAAGGACACGCTA
AGGATGCTGGCTCACATTTATGGAAACTGCTTTCTCAAGTACTGCGGCAGAGGATTACCAAGAGTAATTGTCGCGCTACC
TTGGAACGGGTGCTGAGAAAAACTACGGCTATATCTGGTCTAATTGATTACCCAAAAGTAACCCAACAACCTACACCTAA
GTTAGAGGATAGCAATTTTTTGGGTAGGGAGGGAGCGATCGCTCACCTGAATACTCTGGTAAATCAAGGCTCGAAGGTGA
TTGTTATCCAAGGTGAGGGGGGTTTAGGGAAAACTACTCTCGCTCAACAATATCTGCAAACTCAGGGTTTTGAGTTGGTT
TTAGAACTGCTGATGGCGAAGGAAACCCAAAATATCACGCCGGCGGAACGGGTAGTGGAGGAATGGCTAAAACAAGATTT
TGGGGAAGAACCAGGGGTGGAGTTTGGGGTGACTTTAGGACGACTCAAGCGCCAACTGCACAATCGACGGATTGGGGTGT
TAATTGATAATCTGGAACCTGCATTAGATCAACAAGGTGGGTTGATTCCCCTTCACGGCAATTATGTAGAATTGTTGCGG
GTTTTGGCTGATGTTCGGGTGCAGTCGGTAACGTTGATTACTAGCCGCGATCGCCTGTGCGAACCTGGGTTAAATGTCCA
TCATTATCGGCTTCCTGGTTTGGATCAAAGCGCATGGCAAAAGTTTTTTAGTAGCTGTGGATTAACTATCAACTTGCCTA
CATTGCAACAGATACATCGTACATATGGCGGTAATGCCAAAGCAATGGGGATTCTCTGCGGGGCGATCCTGGAGGATTTC
GGCGGTGATATGGCACTTTATTGGCAAGAACATCATGGTGATCCTTTAGCCGCAACTGACTTAAAGAATTTAGCGGTGAG
TCAAATTAATCGTTTGCAAGCCCTTGATCCCCAAGCCTACCGCCTGCTTTGCCGTTTGGGATGTTATCGTTACCAAGATA
TACCCAGTATCCCCTCTCCAGGAGTATTTTGTTTACTTTGGGATGTCCCTGCATCTGAACATCGTCAACTTATTGCTTCC
CTGAGAAATCGCTCTTTAGTGGAGTGTCATCAAGGAAAATATTGGCTACATCCAGTAATTCGTGCCGAGGCGATCGCTCG
TTTACGCACTAGTGATGAGTGGGAAATAACCAATCACAAAGTTGCTGAATTTTGGACGGCTAGTGTTTCCAGAATCACCA
TATTTCAAGATGCTTTGCAAGCTCTAGAAGCATATTATCACTATATAGAAATTAATGAATTTGAGTCGGCAGGCAAGGTA
ATTCTCAAGAGTCGTAATAATCAATGGCAACAGTTTTTACCTTTGGGAAGTACGCTGTATCGGATGGGATTAATTCAGCC
GATCATGACTGCTATTAATCAAGTCGTCAAGAATATTGGACATGACCAAGACTTAAGTGAACTATATAATATCTTGGGTG
ATTTATATTGGATTACAGGTGATATTATTCAGGCGATCGCCTGTCAAGAAAAAACTATCGATTTGACAACACAAGCGCTG
AAATCACTCGTACCGCAACCAGGGAATAAACATAAAGTCTATTATTTGAGGATGTTAGAGGTAGATTCTCTCTTAAGTAT
TGGTCTTTATAAAATAGATTTGTGGGAACTAGAAGAGGCTGCCAAATTATTTCAACAAGTAATTTACCTAGCCCAAAATA
CAGACCATCATCGCTGGGCAGAAAAAGCGTCTGTATGTTTAGCCTTAGTCAATTCATACTTAGGCTTATATGATGCCGCT
TATTTATTAGCAGATGTAGCTTACCAAAATATTAAAAACGAAGAAATTCTAGAAACAGGAAGATTCGCTTACTTCATGCA
AATCTTGGGTCAAACTTATGTGAACTTAGGAGAATTTACCAAAGCAAAGGAAATGTTTCATCAAGCATTGACCTTTGCGG
AAGAAAGCCATTATATGCAGGTAAAAGCAAAAACCCTGAATGGATTAGCAGAAATTCATCGCCAACAAGCAGATTATCCA
TTAGCCCTTGCATATCATACAGAAGCAATTGAACTTTTAGAGAAAATTGGTGCTAAATGTGACCTAGCCGAAACCTATTT
TCAATTAGGTTTAACTTATCAAAAAATGGCAAAATCCGATGCCAGCCAAAAGTATTTTGCTCAAGCAACACATTTATTTA
CAGAAATCAAAGCCCCCAATCAAGTTGCCAAAATTTCCATAACTGCCAGTTTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGGGTGTAAGGGTTTTATACCCCTATATCCTTACACCCAGTCTCAACAGACAACCTTGGTGCGTAAGTTCTAATTTAACT
ACCCTCGTCGTTGCATAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACCACCACTTCCCCTAAACCCGCCTTGCAAGCTAAAGTCCACGTCCTGGCTGGCAATCTGCGAAACCTAATGCTTCTGTG
TCCAGAAAACTAGCGATCGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 791; Mature: 791

Protein sequence:

>791_residues
MDAEAALAWLDTIIPAQTGERLSDLQKVIVVQVWLGRKYLDIARAYGCTEGHAKDAGSHLWKLLSQVLRQRITKSNCRAT
LERVLRKTTAISGLIDYPKVTQQPTPKLEDSNFLGREGAIAHLNTLVNQGSKVIVIQGEGGLGKTTLAQQYLQTQGFELV
LELLMAKETQNITPAERVVEEWLKQDFGEEPGVEFGVTLGRLKRQLHNRRIGVLIDNLEPALDQQGGLIPLHGNYVELLR
VLADVRVQSVTLITSRDRLCEPGLNVHHYRLPGLDQSAWQKFFSSCGLTINLPTLQQIHRTYGGNAKAMGILCGAILEDF
GGDMALYWQEHHGDPLAATDLKNLAVSQINRLQALDPQAYRLLCRLGCYRYQDIPSIPSPGVFCLLWDVPASEHRQLIAS
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YLLADVAYQNIKNEEILETGRFAYFMQILGQTYVNLGEFTKAKEMFHQALTFAEESHYMQVKAKTLNGLAEIHRQQADYP
LALAYHTEAIELLEKIGAKCDLAETYFQLGLTYQKMAKSDASQKYFAQATHLFTEIKAPNQVAKISITASF

Sequences:

>Translated_791_residues
MDAEAALAWLDTIIPAQTGERLSDLQKVIVVQVWLGRKYLDIARAYGCTEGHAKDAGSHLWKLLSQVLRQRITKSNCRAT
LERVLRKTTAISGLIDYPKVTQQPTPKLEDSNFLGREGAIAHLNTLVNQGSKVIVIQGEGGLGKTTLAQQYLQTQGFELV
LELLMAKETQNITPAERVVEEWLKQDFGEEPGVEFGVTLGRLKRQLHNRRIGVLIDNLEPALDQQGGLIPLHGNYVELLR
VLADVRVQSVTLITSRDRLCEPGLNVHHYRLPGLDQSAWQKFFSSCGLTINLPTLQQIHRTYGGNAKAMGILCGAILEDF
GGDMALYWQEHHGDPLAATDLKNLAVSQINRLQALDPQAYRLLCRLGCYRYQDIPSIPSPGVFCLLWDVPASEHRQLIAS
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KSLVPQPGNKHKVYYLRMLEVDSLLSIGLYKIDLWELEEAAKLFQQVIYLAQNTDHHRWAEKASVCLALVNSYLGLYDAA
YLLADVAYQNIKNEEILETGRFAYFMQILGQTYVNLGEFTKAKEMFHQALTFAEESHYMQVKAKTLNGLAEIHRQQADYP
LALAYHTEAIELLEKIGAKCDLAETYFQLGLTYQKMAKSDASQKYFAQATHLFTEIKAPNQVAKISITASF
>Mature_791_residues
MDAEAALAWLDTIIPAQTGERLSDLQKVIVVQVWLGRKYLDIARAYGCTEGHAKDAGSHLWKLLSQVLRQRITKSNCRAT
LERVLRKTTAISGLIDYPKVTQQPTPKLEDSNFLGREGAIAHLNTLVNQGSKVIVIQGEGGLGKTTLAQQYLQTQGFELV
LELLMAKETQNITPAERVVEEWLKQDFGEEPGVEFGVTLGRLKRQLHNRRIGVLIDNLEPALDQQGGLIPLHGNYVELLR
VLADVRVQSVTLITSRDRLCEPGLNVHHYRLPGLDQSAWQKFFSSCGLTINLPTLQQIHRTYGGNAKAMGILCGAILEDF
GGDMALYWQEHHGDPLAATDLKNLAVSQINRLQALDPQAYRLLCRLGCYRYQDIPSIPSPGVFCLLWDVPASEHRQLIAS
LRNRSLVECHQGKYWLHPVIRAEAIARLRTSDEWEITNHKVAEFWTASVSRITIFQDALQALEAYYHYIEINEFESAGKV
ILKSRNNQWQQFLPLGSTLYRMGLIQPIMTAINQVVKNIGHDQDLSELYNILGDLYWITGDIIQAIACQEKTIDLTTQAL
KSLVPQPGNKHKVYYLRMLEVDSLLSIGLYKIDLWELEEAAKLFQQVIYLAQNTDHHRWAEKASVCLALVNSYLGLYDAA
YLLADVAYQNIKNEEILETGRFAYFMQILGQTYVNLGEFTKAKEMFHQALTFAEESHYMQVKAKTLNGLAEIHRQQADYP
LALAYHTEAIELLEKIGAKCDLAETYFQLGLTYQKMAKSDASQKYFAQATHLFTEIKAPNQVAKISITASF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 15 WD repeats [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000767
- InterPro:   IPR020472
- InterPro:   IPR002182
- InterPro:   IPR015943
- InterPro:   IPR001680
- InterPro:   IPR011046
- InterPro:   IPR019782
- InterPro:   IPR019775
- InterPro:   IPR017986
- InterPro:   IPR019781 [H]

Pfam domain/function: PF00931 NB-ARC; PF00400 WD40 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89356; Mature: 89356

Theoretical pI: Translated: 6.72; Mature: 6.72

Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION L=RR

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDAEAALAWLDTIIPAQTGERLSDLQKVIVVQVWLGRKYLDIARAYGCTEGHAKDAGSHL
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
WKLLSQVLRQRITKSNCRATLERVLRKTTAISGLIDYPKVTQQPTPKLEDSNFLGREGAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHH
AHLNTLVNQGSKVIVIQGEGGLGKTTLAQQYLQTQGFELVLELLMAKETQNITPAERVVE
HHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
EWLKQDFGEEPGVEFGVTLGRLKRQLHNRRIGVLIDNLEPALDQQGGLIPLHGNYVELLR
HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHCCCCEEEECCCHHHHHH
VLADVRVQSVTLITSRDRLCEPGLNVHHYRLPGLDQSAWQKFFSSCGLTINLPTLQQIHR
HHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCEEECHHHHHHHH
TYGGNAKAMGILCGAILEDFGGDMALYWQEHHGDPLAATDLKNLAVSQINRLQALDPQAY
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
RLLCRLGCYRYQDIPSIPSPGVFCLLWDVPASEHRQLIASLRNRSLVECHQGKYWLHPVI
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCEEEHHHH
RAEAIARLRTSDEWEITNHKVAEFWTASVSRITIFQDALQALEAYYHYIEINEFESAGKV
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHCCCCE
ILKSRNNQWQQFLPLGSTLYRMGLIQPIMTAINQVVKNIGHDQDLSELYNILGDLYWITG
EEECCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
DIIQAIACQEKTIDLTTQALKSLVPQPGNKHKVYYLRMLEVDSLLSIGLYKIDLWELEEA
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEECHHHHHHCCCCEEHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
RFAYFMQILGQTYVNLGEFTKAKEMFHQALTFAEESHYMQVKAKTLNGLAEIHRQQADYP
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LALAYHTEAIELLEKIGAKCDLAETYFQLGLTYQKMAKSDASQKYFAQATHLFTEIKAPN
EEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
QVAKISITASF
CEEEEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MDAEAALAWLDTIIPAQTGERLSDLQKVIVVQVWLGRKYLDIARAYGCTEGHAKDAGSHL
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
WKLLSQVLRQRITKSNCRATLERVLRKTTAISGLIDYPKVTQQPTPKLEDSNFLGREGAI
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LALAYHTEAIELLEKIGAKCDLAETYFQLGLTYQKMAKSDASQKYFAQATHLFTEIKAPN
EEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
QVAKISITASF
CEEEEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11759840 [H]