Definition Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome, complete genome.
Accession NC_007295
Length 897,405

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The map label for this gene is 71894021

Identifier: 71894021

GI number: 71894021

Start: 892390

End: 895008

Strand: Reverse

Name: 71894021

Synonym: MHJ_0673

Alternate gene names: NA

Gene position: 895008-892390 (Counterclockwise)

Preceding gene: 71894022

Following gene: 71894020

Centisome position: 99.73

GC content: 25.47

Gene sequence:

>2619_bases
ATCTGGAGAAATATAATGAAAAACAAAATCACACCTTGTATTTGGTCACTTATTTCAAACACTCACCTTAGAAAAGCCGA
AAGTTTAGAAATTTTAATCCGTGCACTTCTTTTAAATAACGAAGAAATTAATCAAAATTTTAAAAATAAATGATTAAAAA
TTTATAAAAATAAAAATTGAAAACCAATTGGCGATTTAAATGAACACTTAAAATTAGCAGCACAATTAGGAGTGACAAAA
ACAGATATTTTAACTCCTGGACAACAAAAAATTAACATATTAGCCAAATTAGTAAACAGTGGGATTATTAAAATTAGAGA
ATATATCAGCATAATTTTGTTTAATTTAGTTAGTTTTATCAATTATGAATATCGTCATATTTTTAAAATGACGCTTGAAT
TGCTTAAAAAACAGAACAATTCTCCTGTTTCTGTTGATGAAATATTTCAAAATTTTAATTTTGGCGAACCAGTTTGCGCT
GAATTTAACATAAAATTACTCCGTTACAATTTAAAACAAAAAGATCATATTTTTTATATTTTAATTTCAGGAGTTTTTTT
TGAAGTTTTATCATCTCGGGGAAAAAATCAACAATATAACATTAATTTTTTTAAAATAAAACTTTATGATCACTGATATT
CAAGGATTGATGAATTAATTAAAAGATGTAATAATCAGCTGGAAAGTTATAATTTTGAAAAAGCAAGTTTGATTAGGTTA
GATTCTGAAAAATGATCAAATTATTTAACCCAAAATTCACAAGCAAATTACGATTATATCGTTGATGTTCTTATGCAAAA
AGAGTCAAATAATCTTGATGAAAAAAATGATAATACTATAAATTTTAAAGCATCAATTAATCATTTAGAAAACCAAGTGC
AGAAAAATTTAGAAAATTCCTTACAAGAAACACAAATAAATCAAGATATTTCAACTACAATTTCAAATAACCCCGAAAAA
GTTGATATTGAATTAGAAGCTATTTTAGAAAATAGTCAAGAAAATAAAGTTGATTTATCAGAATTACCCGCAAATTTTAA
TGATAAGGATCAAGCAGAAAGTCACCAAATTTCTCTTGAAAATGCAGATTTAACTTCCACAAATTCAGTTGAAAAACTTG
AAATTGAAGAAAAAATACAAGAAAAACAGAGCGATATTCGCATAATTTCTAATAATTTAGAACAAAATTGTTGTCCAGAA
CAAAATGTTGTTGAAAAAGAAATTGAAAAAACTTATGAAGACAATATAGAAAAAAACAGTTTTTACAGTAATTTTTACCA
AGATCAATTTGAAAGAGATTTTAATAAAATTTCTGAACCATCTGGAGAAAAAAATCTGCAAGATAACGCACAAAGTGAAA
TATGCGCAGCTGAAAAATGTTGTAATCACATCCAATTAGAAAAAGAAAATCTTGAACATATAGATTCTTCAAAACAAGAA
AAGGTTGTTAAAATCAACAGCAATTATCTTAATAAAGGCGAAAAAAATAATTCTAATACTAATAAAAAAGTTCCTTCACT
TCCGTTATTATACCAAGCAAAACAGGAAATGCAAAGGGAAATTTCAAAATATCCAATTTCAAAATCAGTTAATTCCAAGG
AACATTACTATAATTATTTTATTCATAAAATTAACAAATTATTTAACTTTTCCTTGGAAAACATGTTAAATAAAACTAAT
TTTAAGCAAAATTTTTTTAATATATTAGATTTTCATAAGAAAAATCACGAAATTATATTAAAGCCTAAAAAAACAATAAT
AAAAAGTGGGAAAAACTTGCTCTTAATTTCCCCTTCGGCAAATTTAATTTATTCTAAGATTAAAAATGAATTATGTAAAA
CAGAGATCAGCGAAAAAAACTATGAAATAGTGACTTTTTTTGATGATTATAACCCTGAAAGTTTTATCGGTTATAATGAT
TTTGTTTTAGGTTCTAAGGAAAAATTAAACTTTATCCCTGGTCCTTTTGCAAGAATTTTACACAAGGCTTATTGAAATCC
AGAAAAAAAATATTGCTTAATTCTTGAAAATATCGACAACGATGCCGCAAAAATCACATTAGCTCCTTTAAAACCGCTTT
TTATTCGCGGAGAAAACGGTGAAAGTTTGCTCGGAATTTCGCAGTTTGATCTATCTTTCTATATATTTTCTCATCCTGAG
GAAAAAAATTTTATCCCCGGAAATCTTACAATTATTGGTACAGTAAATTCTAATTTAGATAGGGACTTTGTTGATCTTTA
CCCTGATTTTCTTGAAAATTGAGAGATTAAATATTTAGAAAGAGATAATTTATATTCACATATTACCAAATATCAAATTT
GTGATACAGGATTATCTTGAAAACACTTTTCAGAGAAGTTAAATTCCTTGCTAGAATCAGAAAATTTAAACAATAAATGA
TTTTTACCTAACCAAATTGAAACAAAAATTCTTGAAAATCCCCGGATTTTTGTAGATAAGGTTCTCTTTTCGCTTTGAAA
TTTCACTTCACCCGAGAAAAGAAAGATAATTTTTAGATCAAATTCTTATTCTGTTATGGTTAAGGAATTTTTAGAAACTA
AGGGATCAAAACGCTTAAATATTTTTAAATTCGACTATGAAAAAATTAAAAATATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGAAAGAAAAAAATGGGTTTAATTAAAATTATCCCCATTTTTTTAAAATTTTACTTGAAATTTAGTAAAATTTTATTAGT
TTAAAAACGTTTAAAAATCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAATTTAAATTATTTTTTGCCTAGTTTTGTTTTTTTAGGTGGCGCTTTTTTTGTTTTAGTTAGTTGTGGTTCAACCCATT
TCGGGTTAAATATTTCAAGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 872; Mature: 872

Protein sequence:

>872_residues
MWRNIMKNKITPCIWSLISNTHLRKAESLEILIRALLLNNEEINQNFKNKWLKIYKNKNWKPIGDLNEHLKLAAQLGVTK
TDILTPGQQKINILAKLVNSGIIKIREYISIILFNLVSFINYEYRHIFKMTLELLKKQNNSPVSVDEIFQNFNFGEPVCA
EFNIKLLRYNLKQKDHIFYILISGVFFEVLSSRGKNQQYNINFFKIKLYDHWYSRIDELIKRCNNQLESYNFEKASLIRL
DSEKWSNYLTQNSQANYDYIVDVLMQKESNNLDEKNDNTINFKASINHLENQVQKNLENSLQETQINQDISTTISNNPEK
VDIELEAILENSQENKVDLSELPANFNDKDQAESHQISLENADLTSTNSVEKLEIEEKIQEKQSDIRIISNNLEQNCCPE
QNVVEKEIEKTYEDNIEKNSFYSNFYQDQFERDFNKISEPSGEKNLQDNAQSEICAAEKCCNHIQLEKENLEHIDSSKQE
KVVKINSNYLNKGEKNNSNTNKKVPSLPLLYQAKQEMQREISKYPISKSVNSKEHYYNYFIHKINKLFNFSLENMLNKTN
FKQNFFNILDFHKKNHEIILKPKKTIIKSGKNLLLISPSANLIYSKIKNELCKTEISEKNYEIVTFFDDYNPESFIGYND
FVLGSKEKLNFIPGPFARILHKAYWNPEKKYCLILENIDNDAAKITLAPLKPLFIRGENGESLLGISQFDLSFYIFSHPE
EKNFIPGNLTIIGTVNSNLDRDFVDLYPDFLENWEIKYLERDNLYSHITKYQICDTGLSWKHFSEKLNSLLESENLNNKW
FLPNQIETKILENPRIFVDKVLFSLWNFTSPEKRKIIFRSNSYSVMVKEFLETKGSKRLNIFKFDYEKIKNI

Sequences:

>Translated_872_residues
MWRNIMKNKITPCIWSLISNTHLRKAESLEILIRALLLNNEEINQNFKNK*LKIYKNKN*KPIGDLNEHLKLAAQLGVTK
TDILTPGQQKINILAKLVNSGIIKIREYISIILFNLVSFINYEYRHIFKMTLELLKKQNNSPVSVDEIFQNFNFGEPVCA
EFNIKLLRYNLKQKDHIFYILISGVFFEVLSSRGKNQQYNINFFKIKLYDH*YSRIDELIKRCNNQLESYNFEKASLIRL
DSEK*SNYLTQNSQANYDYIVDVLMQKESNNLDEKNDNTINFKASINHLENQVQKNLENSLQETQINQDISTTISNNPEK
VDIELEAILENSQENKVDLSELPANFNDKDQAESHQISLENADLTSTNSVEKLEIEEKIQEKQSDIRIISNNLEQNCCPE
QNVVEKEIEKTYEDNIEKNSFYSNFYQDQFERDFNKISEPSGEKNLQDNAQSEICAAEKCCNHIQLEKENLEHIDSSKQE
KVVKINSNYLNKGEKNNSNTNKKVPSLPLLYQAKQEMQREISKYPISKSVNSKEHYYNYFIHKINKLFNFSLENMLNKTN
FKQNFFNILDFHKKNHEIILKPKKTIIKSGKNLLLISPSANLIYSKIKNELCKTEISEKNYEIVTFFDDYNPESFIGYND
FVLGSKEKLNFIPGPFARILHKAY*NPEKKYCLILENIDNDAAKITLAPLKPLFIRGENGESLLGISQFDLSFYIFSHPE
EKNFIPGNLTIIGTVNSNLDRDFVDLYPDFLEN*EIKYLERDNLYSHITKYQICDTGLS*KHFSEKLNSLLESENLNNK*
FLPNQIETKILENPRIFVDKVLFSL*NFTSPEKRKIIFRSNSYSVMVKEFLETKGSKRLNIFKFDYEKIKNI
>Mature_872_residues
MWRNIMKNKITPCIWSLISNTHLRKAESLEILIRALLLNNEEINQNFKNK*LKIYKNKN*KPIGDLNEHLKLAAQLGVTK
TDILTPGQQKINILAKLVNSGIIKIREYISIILFNLVSFINYEYRHIFKMTLELLKKQNNSPVSVDEIFQNFNFGEPVCA
EFNIKLLRYNLKQKDHIFYILISGVFFEVLSSRGKNQQYNINFFKIKLYDH*YSRIDELIKRCNNQLESYNFEKASLIRL
DSEK*SNYLTQNSQANYDYIVDVLMQKESNNLDEKNDNTINFKASINHLENQVQKNLENSLQETQINQDISTTISNNPEK
VDIELEAILENSQENKVDLSELPANFNDKDQAESHQISLENADLTSTNSVEKLEIEEKIQEKQSDIRIISNNLEQNCCPE
QNVVEKEIEKTYEDNIEKNSFYSNFYQDQFERDFNKISEPSGEKNLQDNAQSEICAAEKCCNHIQLEKENLEHIDSSKQE
KVVKINSNYLNKGEKNNSNTNKKVPSLPLLYQAKQEMQREISKYPISKSVNSKEHYYNYFIHKINKLFNFSLENMLNKTN
FKQNFFNILDFHKKNHEIILKPKKTIIKSGKNLLLISPSANLIYSKIKNELCKTEISEKNYEIVTFFDDYNPESFIGYND
FVLGSKEKLNFIPGPFARILHKAY*NPEKKYCLILENIDNDAAKITLAPLKPLFIRGENGESLLGISQFDLSFYIFSHPE
EKNFIPGNLTIIGTVNSNLDRDFVDLYPDFLEN*EIKYLERDNLYSHITKYQICDTGLS*KHFSEKLNSLLESENLNNK*
FLPNQIETKILENPRIFVDKVLFSL*NFTSPEKRKIIFRSNSYSVMVKEFLETKGSKRLNIFKFDYEKIKNI

Specific function: Unknown

COG id: COG1401

COG function: function code V; GTPase subunit of restriction endonuclease

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 100804; Mature: 100804

Theoretical pI: Translated: 6.87; Mature: 6.87

Prosite motif: PS01164 COPPER_AMINE_OXID_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
0.8 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
0.8 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MWRNIMKNKITPCIWSLISNTHLRKAESLEILIRALLLNNEEINQNFKNKLKIYKNKNKP
CCHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEEECCCCC
IGDLNEHLKLAAQLGVTKTDILTPGQQKINILAKLVNSGIIKIREYISIILFNLVSFINY
CCHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EYRHIFKMTLELLKKQNNSPVSVDEIFQNFNFGEPVCAEFNIKLLRYNLKQKDHIFYILI
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEHH
SGVFFEVLSSRGKNQQYNINFFKIKLYDHYSRIDELIKRCNNQLESYNFEKASLIRLDSE
HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCC
KSNYLTQNSQANYDYIVDVLMQKESNNLDEKNDNTINFKASINHLENQVQKNLENSLQET
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QINQDISTTISNNPEKVDIELEAILENSQENKVDLSELPANFNDKDQAESHQISLENADL
HCCCCHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCC
TSTNSVEKLEIEEKIQEKQSDIRIISNNLEQNCCPEQNVVEKEIEKTYEDNIEKNSFYSN
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
FYQDQFERDFNKISEPSGEKNLQDNAQSEICAAEKCCNHIQLEKENLEHIDSSKQEKVVK
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECHHHHHHCCCCCCCEEEE
INSNYLNKGEKNNSNTNKKVPSLPLLYQAKQEMQREISKYPISKSVNSKEHYYNYFIHKI
ECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
NKLFNFSLENMLNKTNFKQNFFNILDFHKKNHEIILKPKKTIIKSGKNLLLISPSANLIY
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SKIKNELCKTEISEKNYEIVTFFDDYNPESFIGYNDFVLGSKEKLNFIPGPFARILHKAY
HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHC
NPEKKYCLILENIDNDAAKITLAPLKPLFIRGENGESLLGISQFDLSFYIFSHPEEKNFI
CCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEECCCEEEEECCCCCCEEEEEEECEEEEEEECCCCCCCC
PGNLTIIGTVNSNLDRDFVDLYPDFLENEIKYLERDNLYSHITKYQICDTGLSKHFSEKL
CCCEEEEEECCCCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NSLLESENLNNKFLPNQIETKILENPRIFVDKVLFSLNFTSPEKRKIIFRSNSYSVMVKE
HHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHH
FLETKGSKRLNIFKFDYEKIKNI
HHHCCCCCEEEEEEECHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MWRNIMKNKITPCIWSLISNTHLRKAESLEILIRALLLNNEEINQNFKNKLKIYKNKNKP
CCHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEEECCCCC
IGDLNEHLKLAAQLGVTKTDILTPGQQKINILAKLVNSGIIKIREYISIILFNLVSFINY
CCHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EYRHIFKMTLELLKKQNNSPVSVDEIFQNFNFGEPVCAEFNIKLLRYNLKQKDHIFYILI
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SGVFFEVLSSRGKNQQYNINFFKIKLYDHYSRIDELIKRCNNQLESYNFEKASLIRLDSE
HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCC
KSNYLTQNSQANYDYIVDVLMQKESNNLDEKNDNTINFKASINHLENQVQKNLENSLQET
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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TSTNSVEKLEIEEKIQEKQSDIRIISNNLEQNCCPEQNVVEKEIEKTYEDNIEKNSFYSN
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FLETKGSKRLNIFKFDYEKIKNI
HHHCCCCCEEEEEEECHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA