| Definition | Chlamydophila abortus S26/3, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004552 |
| Length | 1,144,377 |
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The map label for this gene is 62184664
Identifier: 62184664
GI number: 62184664
Start: 26660
End: 29317
Strand: Direct
Name: 62184664
Synonym: CAB017
Alternate gene names: NA
Gene position: 26660-29317 (Clockwise)
Preceding gene: 62184662
Following gene: 62184665
Centisome position: 2.33
GC content: 38.98
Gene sequence:
>2658_bases ATGTTAATTTTATTAAAAATAAAAGTTAACAAGACTGTTTTCCGTATGGATATCATCAATAGTTACTCTGTTTCAGCAAA TTATAAAAAATTACCGATACTACCTTGCTCAGATTCAATACAAAAACGCCACCAGTTATTAGAAAGTGTTTTTCATTACG AAAAGACTGAGTTTGAACGTTATGTAGTGCAGAGATTGATCTGTATTTTAGATCAAAAAGCTGATGAAAAGTACCGGCAG TTAATAGATAAACTGCATAAGTTTGAAATAGAAGACCGGGTGATCCCTAAGGAAAATCGAGTTTCAGCTGTTCATCGTAA GCCTTTATCAGATTTACACGCCCCGATTGCCGTTGTAGCTACGACTTCTGCTGTAGGTAGTAGTGACAGCTTACCTACAG AAGACCCTTTCTATAATGCGACTAAACAACAGTGGGCCCACAACTTATTAGGAGAAATCAAAAATGTAGTGGATAAGATC GTGGGAGCCGTAGTGAGACTGGCTGGTAAGCCAACCTTACTTCCAAGAGATGGGAGTGTGCGCTCTTCAATCGAAAAGGT GGAAAAAGAACCAGAGAAACCCTCACAAGAGGAGTTAGATAAAGCAGCGCTTTTGAAAATCCAAACAGAGGTTCAACGTT TATTTGATCTTGGTACGAATTTAACAAACGCAGATTTTGAATCTCTATACCGCTTGTCGAAGCAGATTTTCGATACGGTT CAAACATCCACTCTTTTTATGGGTGGCCAGAAAACAGATTTTATCAATGAGCTCTCAGCAGAATATGGCAATGCAGATCA ATTAGCTCAAGTTTTTGCGGATGGTCGTATTGAGGGATTAAAAGATGTTCTCAATGTAGTTAAAAGGAAGTTAACAGAAG AAGAATACAGCATTTTCTCAGAAGTAGAAAAAGCATTAGCGAGTTTGCAAACCTCAGTACACACCTACGACCAAGAAAAA TTTGATCTTATCGATCAAATCGGAGACGAATTAGCAGATACAATTAATGCATCTGCCTTATCGAGAAATGATAAAATCGA TTTATGTGCACAGATCTCCTATTTATATAAAGATCAAGTATCTGCTGTAGATTCTTTTAATGTTGTTGTTGATGCAACTA TTTTCGTCAACAGTCACCAAGAGGCTATTTTCGATCAGATATCTAATTTAGTATCCTCCTTGATGGGGGTATTTGCTCCT ATCAACTTAGGACAAGTGACTACGGAGATCAGTAGTGCGGCCATAGCCGGAGCATTACAAGCTGTCCGTGCAATCAATTC TAGGTTCAATGATCTAACAGATGCACAACAAAAATTAGTCAATGATGCTTTTAAAACACTAACAACGTTCAAAGCTCCTA GTTATATAGGGGCGATATGGGCCTATTTTGTTGCTTCGACTGTATTAGCTACTAATACAACAGCTTCAATGGAGAATATT GGTGCTGTCATAAGAGAAGCGGCAAAAGAGATGGGGAGCTCAAAACTTGATATAGCCTCCTCTATTAAGACTACAATGGA GAACATTGTATCAGCAAATGGGCAGTTTAAACCGGGGAATACTGATAACGGGCAAGAAGAAACTTATACAATTTATTCAC AACAAAACGGCTCTGGAGTAAAAATCAATGCCCAGCTTTTAAATCGTGGAAACGTAGGATTTTTACCTAAAATAACGGTT GCAGCCAACGCGCATGCAGAAAGTACAGCTAGAGCTTATTTCGCATTTAAAGGACTAGCTGGAGTACAAATAGCACAACT CCAATCTAAGATAGATGAATCCCGAGGGCAACTTAAGGATTATCAAGCTTTAAAGGCAGAGCTCTATAAGGATCAATTAT ATGCACAATCTAATGAGCTGCAAGCGATGGCATTACCTTCAGCTGTGGCTTCGGTATTAATCGATCGTTATATGCCTAAG GAAGTGGGTTTTTTAAATGGTATTTACGATCAGCTGTACTATAGCAACCTCGGATCGTCAGTTGGAAATGCAATGATAGA CGTTATTTCCGAGTATGTGAACGCGGCTACATATTTCAATTTTGCCAGTTATGTGGGTCAGCAACCTGCTGTAGGACAGA AAGGTAAAGATGTATTTCCTGGAACTGCGGATAGCGCGAGAAATAAATTAGAAACAGAACGAAAAAAAGCAGCTGCCTAT CTTAAAAGTACGCAAGATGCAAAAATAGTATTGGAAGAGCAGGTAAAAAGAGTCACTGAAGATTCCAAAATTTCGAATGA GCAACGTACACGCATCATCGATTCTTTAAATAACTACAGAGATAATTTGAATGTGATATCAGGATCTTTAGTCTTGTTAC AAAACTATTTAGCTCCTTTAGGTGTGAGTGAAGGTGAAGTTGCTGGAACGTTTCAAGTTACCGGTGGAGAAGAACAATGG CAGGCACGACTGGAGATTTTAGAAGATGCGTTAGTATCTGGGTTATCAGGTAATGCTATCAGTGGGGGGATGTTCCCATT ACAAGCTACTATACAATCAGATCAGCAGTCTTATGCCGACATGGGACAGAACTACCAGCTAGAGTTACAAATGCACCTAA CGTCTATGCAGCAAGAATGGACCGTTGTCGCGACATCTTTACAGGTGTTAAATCAGATGTATCTGAGTTTGGCAAGAAGT TTGATGGGCAATTTATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAACTTTTTTTCTATTAAATTTTTTATTTTTCTTATAGTCCTGTTATTTTTGTTTTTAAGAAAAACGATTTATTTTTGAT TAATTATAAAAATAGTTTTC
Downstream 100 bases:
>100_bases GATTTTTCTTATAGGCAACCAGGGTTTGGCATGATTTTCGCTCCTTATTTTCTTGTGAAAGGAAGAAATAGAAGGGAGGG AGTTATGACCACGCCACAGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 885; Mature: 885
Protein sequence:
>885_residues MLILLKIKVNKTVFRMDIINSYSVSANYKKLPILPCSDSIQKRHQLLESVFHYEKTEFERYVVQRLICILDQKADEKYRQ LIDKLHKFEIEDRVIPKENRVSAVHRKPLSDLHAPIAVVATTSAVGSSDSLPTEDPFYNATKQQWAHNLLGEIKNVVDKI VGAVVRLAGKPTLLPRDGSVRSSIEKVEKEPEKPSQEELDKAALLKIQTEVQRLFDLGTNLTNADFESLYRLSKQIFDTV QTSTLFMGGQKTDFINELSAEYGNADQLAQVFADGRIEGLKDVLNVVKRKLTEEEYSIFSEVEKALASLQTSVHTYDQEK FDLIDQIGDELADTINASALSRNDKIDLCAQISYLYKDQVSAVDSFNVVVDATIFVNSHQEAIFDQISNLVSSLMGVFAP INLGQVTTEISSAAIAGALQAVRAINSRFNDLTDAQQKLVNDAFKTLTTFKAPSYIGAIWAYFVASTVLATNTTASMENI GAVIREAAKEMGSSKLDIASSIKTTMENIVSANGQFKPGNTDNGQEETYTIYSQQNGSGVKINAQLLNRGNVGFLPKITV AANAHAESTARAYFAFKGLAGVQIAQLQSKIDESRGQLKDYQALKAELYKDQLYAQSNELQAMALPSAVASVLIDRYMPK EVGFLNGIYDQLYYSNLGSSVGNAMIDVISEYVNAATYFNFASYVGQQPAVGQKGKDVFPGTADSARNKLETERKKAAAY LKSTQDAKIVLEEQVKRVTEDSKISNEQRTRIIDSLNNYRDNLNVISGSLVLLQNYLAPLGVSEGEVAGTFQVTGGEEQW QARLEILEDALVSGLSGNAISGGMFPLQATIQSDQQSYADMGQNYQLELQMHLTSMQQEWTVVATSLQVLNQMYLSLARS LMGNL
Sequences:
>Translated_885_residues MLILLKIKVNKTVFRMDIINSYSVSANYKKLPILPCSDSIQKRHQLLESVFHYEKTEFERYVVQRLICILDQKADEKYRQ LIDKLHKFEIEDRVIPKENRVSAVHRKPLSDLHAPIAVVATTSAVGSSDSLPTEDPFYNATKQQWAHNLLGEIKNVVDKI VGAVVRLAGKPTLLPRDGSVRSSIEKVEKEPEKPSQEELDKAALLKIQTEVQRLFDLGTNLTNADFESLYRLSKQIFDTV QTSTLFMGGQKTDFINELSAEYGNADQLAQVFADGRIEGLKDVLNVVKRKLTEEEYSIFSEVEKALASLQTSVHTYDQEK FDLIDQIGDELADTINASALSRNDKIDLCAQISYLYKDQVSAVDSFNVVVDATIFVNSHQEAIFDQISNLVSSLMGVFAP INLGQVTTEISSAAIAGALQAVRAINSRFNDLTDAQQKLVNDAFKTLTTFKAPSYIGAIWAYFVASTVLATNTTASMENI GAVIREAAKEMGSSKLDIASSIKTTMENIVSANGQFKPGNTDNGQEETYTIYSQQNGSGVKINAQLLNRGNVGFLPKITV AANAHAESTARAYFAFKGLAGVQIAQLQSKIDESRGQLKDYQALKAELYKDQLYAQSNELQAMALPSAVASVLIDRYMPK EVGFLNGIYDQLYYSNLGSSVGNAMIDVISEYVNAATYFNFASYVGQQPAVGQKGKDVFPGTADSARNKLETERKKAAAY LKSTQDAKIVLEEQVKRVTEDSKISNEQRTRIIDSLNNYRDNLNVISGSLVLLQNYLAPLGVSEGEVAGTFQVTGGEEQW QARLEILEDALVSGLSGNAISGGMFPLQATIQSDQQSYADMGQNYQLELQMHLTSMQQEWTVVATSLQVLNQMYLSLARS LMGNL >Mature_885_residues MLILLKIKVNKTVFRMDIINSYSVSANYKKLPILPCSDSIQKRHQLLESVFHYEKTEFERYVVQRLICILDQKADEKYRQ LIDKLHKFEIEDRVIPKENRVSAVHRKPLSDLHAPIAVVATTSAVGSSDSLPTEDPFYNATKQQWAHNLLGEIKNVVDKI VGAVVRLAGKPTLLPRDGSVRSSIEKVEKEPEKPSQEELDKAALLKIQTEVQRLFDLGTNLTNADFESLYRLSKQIFDTV QTSTLFMGGQKTDFINELSAEYGNADQLAQVFADGRIEGLKDVLNVVKRKLTEEEYSIFSEVEKALASLQTSVHTYDQEK FDLIDQIGDELADTINASALSRNDKIDLCAQISYLYKDQVSAVDSFNVVVDATIFVNSHQEAIFDQISNLVSSLMGVFAP INLGQVTTEISSAAIAGALQAVRAINSRFNDLTDAQQKLVNDAFKTLTTFKAPSYIGAIWAYFVASTVLATNTTASMENI GAVIREAAKEMGSSKLDIASSIKTTMENIVSANGQFKPGNTDNGQEETYTIYSQQNGSGVKINAQLLNRGNVGFLPKITV AANAHAESTARAYFAFKGLAGVQIAQLQSKIDESRGQLKDYQALKAELYKDQLYAQSNELQAMALPSAVASVLIDRYMPK EVGFLNGIYDQLYYSNLGSSVGNAMIDVISEYVNAATYFNFASYVGQQPAVGQKGKDVFPGTADSARNKLETERKKAAAY LKSTQDAKIVLEEQVKRVTEDSKISNEQRTRIIDSLNNYRDNLNVISGSLVLLQNYLAPLGVSEGEVAGTFQVTGGEEQW QARLEILEDALVSGLSGNAISGGMFPLQATIQSDQQSYADMGQNYQLELQMHLTSMQQEWTVVATSLQVLNQMYLSLARS LMGNL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 97757; Mature: 97757
Theoretical pI: Translated: 4.98; Mature: 4.98
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLILLKIKVNKTVFRMDIINSYSVSANYKKLPILPCSDSIQKRHQLLESVFHYEKTEFER CEEEEEEEECCEEEEEEHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YVVQRLICILDQKADEKYRQLIDKLHKFEIEDRVIPKENRVSAVHRKPLSDLHAPIAVVA HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHCCCEEEEE TTSAVGSSDSLPTEDPFYNATKQQWAHNLLGEIKNVVDKIVGAVVRLAGKPTLLPRDGSV ECHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH RSSIEKVEKEPEKPSQEELDKAALLKIQTEVQRLFDLGTNLTNADFESLYRLSKQIFDTV HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH QTSTLFMGGQKTDFINELSAEYGNADQLAQVFADGRIEGLKDVLNVVKRKLTEEEYSIFS HHHHHEECCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EVEKALASLQTSVHTYDQEKFDLIDQIGDELADTINASALSRNDKIDLCAQISYLYKDQV HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH SAVDSFNVVVDATIFVNSHQEAIFDQISNLVSSLMGVFAPINLGQVTTEISSAAIAGALQ HHHHCCCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH AVRAINSRFNDLTDAQQKLVNDAFKTLTTFKAPSYIGAIWAYFVASTVLATNTTASMENI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH GAVIREAAKEMGSSKLDIASSIKTTMENIVSANGQFKPGNTDNGQEETYTIYSQQNGSGV HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCE KINAQLLNRGNVGFLPKITVAANAHAESTARAYFAFKGLAGVQIAQLQSKIDESRGQLKD EEEHEEECCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YQALKAELYKDQLYAQSNELQAMALPSAVASVLIDRYMPKEVGFLNGIYDQLYYSNLGSS HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VGNAMIDVISEYVNAATYFNFASYVGQQPAVGQKGKDVFPGTADSARNKLETERKKAAAY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LKSTQDAKIVLEEQVKRVTEDSKISNEQRTRIIDSLNNYRDNLNVISGSLVLLQNYLAPL HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCC GVSEGEVAGTFQVTGGEEQWQARLEILEDALVSGLSGNAISGGMFPLQATIQSDQQSYAD CCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH MGQNYQLELQMHLTSMQQEWTVVATSLQVLNQMYLSLARSLMGNL CCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MLILLKIKVNKTVFRMDIINSYSVSANYKKLPILPCSDSIQKRHQLLESVFHYEKTEFER CEEEEEEEECCEEEEEEHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YVVQRLICILDQKADEKYRQLIDKLHKFEIEDRVIPKENRVSAVHRKPLSDLHAPIAVVA HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHCCCEEEEE TTSAVGSSDSLPTEDPFYNATKQQWAHNLLGEIKNVVDKIVGAVVRLAGKPTLLPRDGSV ECHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH RSSIEKVEKEPEKPSQEELDKAALLKIQTEVQRLFDLGTNLTNADFESLYRLSKQIFDTV HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH QTSTLFMGGQKTDFINELSAEYGNADQLAQVFADGRIEGLKDVLNVVKRKLTEEEYSIFS HHHHHEECCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EVEKALASLQTSVHTYDQEKFDLIDQIGDELADTINASALSRNDKIDLCAQISYLYKDQV HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH SAVDSFNVVVDATIFVNSHQEAIFDQISNLVSSLMGVFAPINLGQVTTEISSAAIAGALQ HHHHCCCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH AVRAINSRFNDLTDAQQKLVNDAFKTLTTFKAPSYIGAIWAYFVASTVLATNTTASMENI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH GAVIREAAKEMGSSKLDIASSIKTTMENIVSANGQFKPGNTDNGQEETYTIYSQQNGSGV HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCE KINAQLLNRGNVGFLPKITVAANAHAESTARAYFAFKGLAGVQIAQLQSKIDESRGQLKD EEEHEEECCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YQALKAELYKDQLYAQSNELQAMALPSAVASVLIDRYMPKEVGFLNGIYDQLYYSNLGSS HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VGNAMIDVISEYVNAATYFNFASYVGQQPAVGQKGKDVFPGTADSARNKLETERKKAAAY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LKSTQDAKIVLEEQVKRVTEDSKISNEQRTRIIDSLNNYRDNLNVISGSLVLLQNYLAPL HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCC GVSEGEVAGTFQVTGGEEQWQARLEILEDALVSGLSGNAISGGMFPLQATIQSDQQSYAD CCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH MGQNYQLELQMHLTSMQQEWTVVATSLQVLNQMYLSLARSLMGNL CCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA