| Definition | Vibrio fischeri ES114 chromosome I, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006840 |
| Length | 2,897,536 |
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The map label for this gene is 59712262
Identifier: 59712262
GI number: 59712262
Start: 1865581
End: 1867980
Strand: Direct
Name: 59712262
Synonym: VF_1655
Alternate gene names: NA
Gene position: 1865581-1867980 (Clockwise)
Preceding gene: 59712259
Following gene: 59712263
Centisome position: 64.39
GC content: 39.12
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 799; Mature: 798
Protein sequence:
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Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
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Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 92230; Mature: 92099
Theoretical pI: Translated: 9.47; Mature: 9.47
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
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Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTSYFVINIETFSSLMNNIVTHFLLAFALFCSSQASAEWGINTYNPVSISESAQKIAADI CCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH KQLPEQHFFSNNEYRQVKELMSRTLFEQNKQLKTLEDSLVNYRNDATDKNWAKVEQNHRS HHCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH LTSLNVSKEKLLLLSDTKTRDQLTGFGPRGVTQFYSELRITKQNIQYYIHYQLRSFKKLL HHHCCCCHHEEEEEECCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHH SDLAISPVPMISVLFKVLCIMFIFNWWMRNSDRLIHDFKVSKLKSTSNPSLLIRTIWYCS HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH RAHKAIAYLLLITATLRIISTLPSLQHLIFLEIFTWWILGGSIAVSFILEFAFRNSKHNK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC KENIALRLSTIRRYVWGIIVAGVILQISSRTLGQGTIYAWINSFVALFFVLLTIISLKQW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NNTIFSRIDRFETYPISVQWAIRNKDSMFMSIPATACCAAWLIGRTLQHLVLSTLSQYAA HHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FSHALAYLFRIEVAKQTEVSREQSNLVRVKGPLAFDYIAPGSEESELIEDYAKDEIISLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH RYLLTDSPAVCVLSGERGVGTTTVLKRILNKTKNAVPIYINCPYDGYAALLPELAQLLGL HHHHCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCC DAESSEKDILQHLRNSEQCYLIAFDNAQRLVKPKVNGLVELMKLTNLLRRARKSHRVVLS CCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEE IDKSSWRFIDRARGERLLFDLVTFMPKWTEKEIGQLLDSRIVKENNVNTISFDGLVLPRQ ECCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCEECCCC WDEDNLSDEERAKNGFYRILWDYSDGNPTVALRFFRLSLFRDKDTDAILVRLFRAPQSDD CCCCCCCCHHHHCCCEEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC LETMPKPMLAVLRSIVQLEVASPEDLCDCSRLSIAEVISTLRYFQSRGYIEWNDEKARIS HHHCCHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHCHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHH DHWYRHITNVLHRQHLLVK HHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure TSYFVINIETFSSLMNNIVTHFLLAFALFCSSQASAEWGINTYNPVSISESAQKIAADI CCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH KQLPEQHFFSNNEYRQVKELMSRTLFEQNKQLKTLEDSLVNYRNDATDKNWAKVEQNHRS HHCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH LTSLNVSKEKLLLLSDTKTRDQLTGFGPRGVTQFYSELRITKQNIQYYIHYQLRSFKKLL HHHCCCCHHEEEEEECCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHH SDLAISPVPMISVLFKVLCIMFIFNWWMRNSDRLIHDFKVSKLKSTSNPSLLIRTIWYCS HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH RAHKAIAYLLLITATLRIISTLPSLQHLIFLEIFTWWILGGSIAVSFILEFAFRNSKHNK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC KENIALRLSTIRRYVWGIIVAGVILQISSRTLGQGTIYAWINSFVALFFVLLTIISLKQW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NNTIFSRIDRFETYPISVQWAIRNKDSMFMSIPATACCAAWLIGRTLQHLVLSTLSQYAA HHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FSHALAYLFRIEVAKQTEVSREQSNLVRVKGPLAFDYIAPGSEESELIEDYAKDEIISLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH RYLLTDSPAVCVLSGERGVGTTTVLKRILNKTKNAVPIYINCPYDGYAALLPELAQLLGL HHHHCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCC DAESSEKDILQHLRNSEQCYLIAFDNAQRLVKPKVNGLVELMKLTNLLRRARKSHRVVLS CCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEE IDKSSWRFIDRARGERLLFDLVTFMPKWTEKEIGQLLDSRIVKENNVNTISFDGLVLPRQ ECCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCEECCCC WDEDNLSDEERAKNGFYRILWDYSDGNPTVALRFFRLSLFRDKDTDAILVRLFRAPQSDD CCCCCCCCHHHHCCCEEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC LETMPKPMLAVLRSIVQLEVASPEDLCDCSRLSIAEVISTLRYFQSRGYIEWNDEKARIS HHHCCHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHCHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHH DHWYRHITNVLHRQHLLVK HHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA