Definition Vibrio fischeri ES114 chromosome I, complete genome.
Accession NC_006840
Length 2,897,536

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The map label for this gene is 59711462

Identifier: 59711462

GI number: 59711462

Start: 940744

End: 942639

Strand: Direct

Name: 59711462

Synonym: VF_0855

Alternate gene names: NA

Gene position: 940744-942639 (Clockwise)

Preceding gene: 59711461

Following gene: 59711463

Centisome position: 32.47

GC content: 39.72

Gene sequence:

>1896_bases
GTGACGGGAGGGGAGTTAGAGAACGATCCTTTCTTGTTATTTCGAGATTATTTATCAGGGTTAACTCAAAGCTCTGGTAA
TGTTCAAGTAGAGAATGGCTATCTGATTGCCAAGCACGATGATAAAGAATATGTCGTGATCACCGCTGATCTATCAGGAT
CATCATACCAACTCTCTTTGCAGCAGCAATTACCTCAACTATTGTCACTTGAAAGCAAAGTATCAAAGACATTTTCGGTT
GATATTCAACATACAGGTGTGATCTTTTATGCAGCCCATGGGACAGAAAGCGCCAAAGGGGAGATCAGCACAATCGGCCT
TGGATCCCTTATCGGAATTATTGTCCTTGTCTTTTTAGTTTATCGCAGCACATTACCTTTGGCTCTAGCATTACTGTCAA
TATCAACGGGTCTTGCTTGTGCCTATGTACTGACGATTGCTTTATTTGGTTCCATTCATTTGTTTAGTTTGGTTTTTGGT
GCCAGCTTAATTGGGGTTTCTATTGATTATGCATTTCACTTTTTAACCGACCGACTTCATGCGGGCAAAAAATGGAATTC
AGTGGTGGGTATTCAGCAACTGTTTCCAGCCATTACCTTGGGGCTAATTACCAGTTTAATTGGTTATTTAGGGATGCTTA
TTGCGCCTTTTCCCGGGTTACAGCAATTATCCTTATTCTCCGCCATTGGTTTAACGGCAGCCTATTTTACAGTGGTATGC
TGGTATCCAATATTGGCAAGTAAACCAAATCAATATAACAAAGTACCGATGCAACGAGCCTTGAGTCAGTGGCTCTTGGT
GTGGCAACAACCGCTTATTCGATTAGTTTTACCATTGAGCTTATTGATTGCTGCAAGTTTTGGTGTCTATATGGCGAAAT
ATGATGATGATATTCGTCAACTTCAAGCTTTGCCACATGCACTGCAGCAGCAAGAGAGAGAGATAAAAGCGATTACCGGT
GTCAGTGGCTCTCAGCAACTATTGCTTGTACGAGACAGCTCTGAAGAAGGGTTACTGCAAAAGTTAGAAACCATATCGAC
TAAACTGGATAAACGTAATGATTTCGGTGGTTATCAATCCATAAGCCGTTATGTACCGTCACAAAAAAGACAACAAGAAA
ATTACCAATTAGTTAAACACCTGTATCAGCAACAATCTGAGTATTATCAAAGTGTCATACAGCAAAAAACAGCGCTGGAT
TTTTCACAGCAATATCAGCCTCTGACTATAGATGGTTTCTTAGCGTCACCAATATCAGACACAGTGGGTTTTTTATGGTT
AGGCAAAATTGATGATGTATTTGCCTCGGTGATCGCGTTTAACCAAGAAGTGAACAGTACGGAACTGCAAGCATTTGCAG
CGGATAATCACATTACTTATTTAAATAAAGCAGAAGAGATTTCTCGTTTATTTGCAGATTATCGACATCGTATTACCGAG
CTATTGTTGTTTGCTTATGCCGCTATTTTCTTACTGCTGTTACCTCGCTATAAAATGAAACAAGCGTTTTTAATAGTATT
GCCACCATTTATAGCAGGTTGCGCCGGTTTAGCTGTAACCGTTTTAACTGGCGTACCGTTGAATTTGTTTAACTTACTAG
CCTTGATGTTGATTTTAGGGATCGGAATAGACTACACCTTGTTTTTTGCAGAGCAGAATAAGCAAAGTGATGATTCACAT
AAAGAAAGCACGCTATTAGCGATATCTTTATCTGCGTTAACAACGATTTTGTCATTTGGTTTATTGGCTTTGAGTGAAAC
CCAAGCGATTCATAGCTTTGGTATTACGGTTCTTACAGGGATTATCGTGGCTTGGTTACTGGCTCCGTTAAGCCAACAAA
ATAAAGAGAGTAAAGGGTATATTAATACGCTTTCGGAGAAAAAAGATGCATCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGAGCAGCAACAAGGCAAAACCCAAACAATTTAGAAACACGCAACCAGAAGCAGCAAGTTCAAAAGGTATTACACGCAC
TATACAATCCTTTTTCAGGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGCCATAAAAGTCCGCCACCTTATAGCGCTTGTTCTATCCTTTCTTTTGATGGGATGTGCAGCAAAACCGGTAAAGCAAC
CCAACCAAGTAGAAGTATCA

Product: transporter

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 631; Mature: 630

Protein sequence:

>631_residues
MTGGELENDPFLLFRDYLSGLTQSSGNVQVENGYLIAKHDDKEYVVITADLSGSSYQLSLQQQLPQLLSLESKVSKTFSV
DIQHTGVIFYAAHGTESAKGEISTIGLGSLIGIIVLVFLVYRSTLPLALALLSISTGLACAYVLTIALFGSIHLFSLVFG
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WYPILASKPNQYNKVPMQRALSQWLLVWQQPLIRLVLPLSLLIAASFGVYMAKYDDDIRQLQALPHALQQQEREIKAITG
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FSQQYQPLTIDGFLASPISDTVGFLWLGKIDDVFASVIAFNQEVNSTELQAFAADNHITYLNKAEEISRLFADYRHRITE
LLLFAYAAIFLLLLPRYKMKQAFLIVLPPFIAGCAGLAVTVLTGVPLNLFNLLALMLILGIGIDYTLFFAEQNKQSDDSH
KESTLLAISLSALTTILSFGLLALSETQAIHSFGITVLTGIIVAWLLAPLSQQNKESKGYINTLSEKKDAS

Sequences:

>Translated_631_residues
MTGGELENDPFLLFRDYLSGLTQSSGNVQVENGYLIAKHDDKEYVVITADLSGSSYQLSLQQQLPQLLSLESKVSKTFSV
DIQHTGVIFYAAHGTESAKGEISTIGLGSLIGIIVLVFLVYRSTLPLALALLSISTGLACAYVLTIALFGSIHLFSLVFG
ASLIGVSIDYAFHFLTDRLHAGKKWNSVVGIQQLFPAITLGLITSLIGYLGMLIAPFPGLQQLSLFSAIGLTAAYFTVVC
WYPILASKPNQYNKVPMQRALSQWLLVWQQPLIRLVLPLSLLIAASFGVYMAKYDDDIRQLQALPHALQQQEREIKAITG
VSGSQQLLLVRDSSEEGLLQKLETISTKLDKRNDFGGYQSISRYVPSQKRQQENYQLVKHLYQQQSEYYQSVIQQKTALD
FSQQYQPLTIDGFLASPISDTVGFLWLGKIDDVFASVIAFNQEVNSTELQAFAADNHITYLNKAEEISRLFADYRHRITE
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KESTLLAISLSALTTILSFGLLALSETQAIHSFGITVLTGIIVAWLLAPLSQQNKESKGYINTLSEKKDAS
>Mature_630_residues
TGGELENDPFLLFRDYLSGLTQSSGNVQVENGYLIAKHDDKEYVVITADLSGSSYQLSLQQQLPQLLSLESKVSKTFSVD
IQHTGVIFYAAHGTESAKGEISTIGLGSLIGIIVLVFLVYRSTLPLALALLSISTGLACAYVLTIALFGSIHLFSLVFGA
SLIGVSIDYAFHFLTDRLHAGKKWNSVVGIQQLFPAITLGLITSLIGYLGMLIAPFPGLQQLSLFSAIGLTAAYFTVVCW
YPILASKPNQYNKVPMQRALSQWLLVWQQPLIRLVLPLSLLIAASFGVYMAKYDDDIRQLQALPHALQQQEREIKAITGV
SGSQQLLLVRDSSEEGLLQKLETISTKLDKRNDFGGYQSISRYVPSQKRQQENYQLVKHLYQQQSEYYQSVIQQKTALDF
SQQYQPLTIDGFLASPISDTVGFLWLGKIDDVFASVIAFNQEVNSTELQAFAADNHITYLNKAEEISRLFADYRHRITEL
LLFAYAAIFLLLLPRYKMKQAFLIVLPPFIAGCAGLAVTVLTGVPLNLFNLLALMLILGIGIDYTLFFAEQNKQSDDSHK
ESTLLAISLSALTTILSFGLLALSETQAIHSFGITVLTGIIVAWLLAPLSQQNKESKGYINTLSEKKDAS

Specific function: Unknown

COG id: COG4258

COG function: function code R; Predicted exporter

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69699; Mature: 69567

Theoretical pI: Translated: 6.38; Mature: 6.38

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.0 %Met     (Translated Protein)
1.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
0.8 %Met     (Mature Protein)
1.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTGGELENDPFLLFRDYLSGLTQSSGNVQVENGYLIAKHDDKEYVVITADLSGSSYQLSL
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCEEEEH
QQQLPQLLSLESKVSKTFSVDIQHTGVIFYAAHGTESAKGEISTIGLGSLIGIIVLVFLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHH
YRSTLPLALALLSISTGLACAYVLTIALFGSIHLFSLVFGASLIGVSIDYAFHFLTDRLH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGKKWNSVVGIQQLFPAITLGLITSLIGYLGMLIAPFPGLQQLSLFSAIGLTAAYFTVVC
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WYPILASKPNQYNKVPMQRALSQWLLVWQQPLIRLVLPLSLLIAASFGVYMAKYDDDIRQ
HHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQALPHALQQQEREIKAITGVSGSQQLLLVRDSSEEGLLQKLETISTKLDKRNDFGGYQS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
ISRYVPSQKRQQENYQLVKHLYQQQSEYYQSVIQQKTALDFSQQYQPLTIDGFLASPISD
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCEEECCHHCCCHHH
TVGFLWLGKIDDVFASVIAFNQEVNSTELQAFAADNHITYLNKAEEISRLFADYRHRITE
HHHHHEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLFAYAAIFLLLLPRYKMKQAFLIVLPPFIAGCAGLAVTVLTGVPLNLFNLLALMLILG
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
IGIDYTLFFAEQNKQSDDSHKESTLLAISLSALTTILSFGLLALSETQAIHSFGITVLTG
CCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIVAWLLAPLSQQNKESKGYINTLSEKKDAS
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TGGELENDPFLLFRDYLSGLTQSSGNVQVENGYLIAKHDDKEYVVITADLSGSSYQLSL
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCEEEEH
QQQLPQLLSLESKVSKTFSVDIQHTGVIFYAAHGTESAKGEISTIGLGSLIGIIVLVFLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHH
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CCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIVAWLLAPLSQQNKESKGYINTLSEKKDAS
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA