| Definition | Vibrio fischeri ES114 chromosome I, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006840 |
| Length | 2,897,536 |
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The map label for this gene is 59711462
Identifier: 59711462
GI number: 59711462
Start: 940744
End: 942639
Strand: Direct
Name: 59711462
Synonym: VF_0855
Alternate gene names: NA
Gene position: 940744-942639 (Clockwise)
Preceding gene: 59711461
Following gene: 59711463
Centisome position: 32.47
GC content: 39.72
Gene sequence:
>1896_bases GTGACGGGAGGGGAGTTAGAGAACGATCCTTTCTTGTTATTTCGAGATTATTTATCAGGGTTAACTCAAAGCTCTGGTAA TGTTCAAGTAGAGAATGGCTATCTGATTGCCAAGCACGATGATAAAGAATATGTCGTGATCACCGCTGATCTATCAGGAT CATCATACCAACTCTCTTTGCAGCAGCAATTACCTCAACTATTGTCACTTGAAAGCAAAGTATCAAAGACATTTTCGGTT GATATTCAACATACAGGTGTGATCTTTTATGCAGCCCATGGGACAGAAAGCGCCAAAGGGGAGATCAGCACAATCGGCCT TGGATCCCTTATCGGAATTATTGTCCTTGTCTTTTTAGTTTATCGCAGCACATTACCTTTGGCTCTAGCATTACTGTCAA TATCAACGGGTCTTGCTTGTGCCTATGTACTGACGATTGCTTTATTTGGTTCCATTCATTTGTTTAGTTTGGTTTTTGGT GCCAGCTTAATTGGGGTTTCTATTGATTATGCATTTCACTTTTTAACCGACCGACTTCATGCGGGCAAAAAATGGAATTC AGTGGTGGGTATTCAGCAACTGTTTCCAGCCATTACCTTGGGGCTAATTACCAGTTTAATTGGTTATTTAGGGATGCTTA TTGCGCCTTTTCCCGGGTTACAGCAATTATCCTTATTCTCCGCCATTGGTTTAACGGCAGCCTATTTTACAGTGGTATGC TGGTATCCAATATTGGCAAGTAAACCAAATCAATATAACAAAGTACCGATGCAACGAGCCTTGAGTCAGTGGCTCTTGGT GTGGCAACAACCGCTTATTCGATTAGTTTTACCATTGAGCTTATTGATTGCTGCAAGTTTTGGTGTCTATATGGCGAAAT ATGATGATGATATTCGTCAACTTCAAGCTTTGCCACATGCACTGCAGCAGCAAGAGAGAGAGATAAAAGCGATTACCGGT GTCAGTGGCTCTCAGCAACTATTGCTTGTACGAGACAGCTCTGAAGAAGGGTTACTGCAAAAGTTAGAAACCATATCGAC TAAACTGGATAAACGTAATGATTTCGGTGGTTATCAATCCATAAGCCGTTATGTACCGTCACAAAAAAGACAACAAGAAA ATTACCAATTAGTTAAACACCTGTATCAGCAACAATCTGAGTATTATCAAAGTGTCATACAGCAAAAAACAGCGCTGGAT TTTTCACAGCAATATCAGCCTCTGACTATAGATGGTTTCTTAGCGTCACCAATATCAGACACAGTGGGTTTTTTATGGTT AGGCAAAATTGATGATGTATTTGCCTCGGTGATCGCGTTTAACCAAGAAGTGAACAGTACGGAACTGCAAGCATTTGCAG CGGATAATCACATTACTTATTTAAATAAAGCAGAAGAGATTTCTCGTTTATTTGCAGATTATCGACATCGTATTACCGAG CTATTGTTGTTTGCTTATGCCGCTATTTTCTTACTGCTGTTACCTCGCTATAAAATGAAACAAGCGTTTTTAATAGTATT GCCACCATTTATAGCAGGTTGCGCCGGTTTAGCTGTAACCGTTTTAACTGGCGTACCGTTGAATTTGTTTAACTTACTAG CCTTGATGTTGATTTTAGGGATCGGAATAGACTACACCTTGTTTTTTGCAGAGCAGAATAAGCAAAGTGATGATTCACAT AAAGAAAGCACGCTATTAGCGATATCTTTATCTGCGTTAACAACGATTTTGTCATTTGGTTTATTGGCTTTGAGTGAAAC CCAAGCGATTCATAGCTTTGGTATTACGGTTCTTACAGGGATTATCGTGGCTTGGTTACTGGCTCCGTTAAGCCAACAAA ATAAAGAGAGTAAAGGGTATATTAATACGCTTTCGGAGAAAAAAGATGCATCATAA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases GGCCATAAAAGTCCGCCACCTTATAGCGCTTGTTCTATCCTTTCTTTTGATGGGATGTGCAGCAAAACCGGTAAAGCAAC CCAACCAAGTAGAAGTATCA
Product: transporter
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 631; Mature: 630
Protein sequence:
>631_residues MTGGELENDPFLLFRDYLSGLTQSSGNVQVENGYLIAKHDDKEYVVITADLSGSSYQLSLQQQLPQLLSLESKVSKTFSV DIQHTGVIFYAAHGTESAKGEISTIGLGSLIGIIVLVFLVYRSTLPLALALLSISTGLACAYVLTIALFGSIHLFSLVFG ASLIGVSIDYAFHFLTDRLHAGKKWNSVVGIQQLFPAITLGLITSLIGYLGMLIAPFPGLQQLSLFSAIGLTAAYFTVVC WYPILASKPNQYNKVPMQRALSQWLLVWQQPLIRLVLPLSLLIAASFGVYMAKYDDDIRQLQALPHALQQQEREIKAITG VSGSQQLLLVRDSSEEGLLQKLETISTKLDKRNDFGGYQSISRYVPSQKRQQENYQLVKHLYQQQSEYYQSVIQQKTALD FSQQYQPLTIDGFLASPISDTVGFLWLGKIDDVFASVIAFNQEVNSTELQAFAADNHITYLNKAEEISRLFADYRHRITE LLLFAYAAIFLLLLPRYKMKQAFLIVLPPFIAGCAGLAVTVLTGVPLNLFNLLALMLILGIGIDYTLFFAEQNKQSDDSH KESTLLAISLSALTTILSFGLLALSETQAIHSFGITVLTGIIVAWLLAPLSQQNKESKGYINTLSEKKDAS
Sequences:
>Translated_631_residues MTGGELENDPFLLFRDYLSGLTQSSGNVQVENGYLIAKHDDKEYVVITADLSGSSYQLSLQQQLPQLLSLESKVSKTFSV DIQHTGVIFYAAHGTESAKGEISTIGLGSLIGIIVLVFLVYRSTLPLALALLSISTGLACAYVLTIALFGSIHLFSLVFG ASLIGVSIDYAFHFLTDRLHAGKKWNSVVGIQQLFPAITLGLITSLIGYLGMLIAPFPGLQQLSLFSAIGLTAAYFTVVC WYPILASKPNQYNKVPMQRALSQWLLVWQQPLIRLVLPLSLLIAASFGVYMAKYDDDIRQLQALPHALQQQEREIKAITG VSGSQQLLLVRDSSEEGLLQKLETISTKLDKRNDFGGYQSISRYVPSQKRQQENYQLVKHLYQQQSEYYQSVIQQKTALD FSQQYQPLTIDGFLASPISDTVGFLWLGKIDDVFASVIAFNQEVNSTELQAFAADNHITYLNKAEEISRLFADYRHRITE LLLFAYAAIFLLLLPRYKMKQAFLIVLPPFIAGCAGLAVTVLTGVPLNLFNLLALMLILGIGIDYTLFFAEQNKQSDDSH KESTLLAISLSALTTILSFGLLALSETQAIHSFGITVLTGIIVAWLLAPLSQQNKESKGYINTLSEKKDAS >Mature_630_residues TGGELENDPFLLFRDYLSGLTQSSGNVQVENGYLIAKHDDKEYVVITADLSGSSYQLSLQQQLPQLLSLESKVSKTFSVD IQHTGVIFYAAHGTESAKGEISTIGLGSLIGIIVLVFLVYRSTLPLALALLSISTGLACAYVLTIALFGSIHLFSLVFGA SLIGVSIDYAFHFLTDRLHAGKKWNSVVGIQQLFPAITLGLITSLIGYLGMLIAPFPGLQQLSLFSAIGLTAAYFTVVCW YPILASKPNQYNKVPMQRALSQWLLVWQQPLIRLVLPLSLLIAASFGVYMAKYDDDIRQLQALPHALQQQEREIKAITGV SGSQQLLLVRDSSEEGLLQKLETISTKLDKRNDFGGYQSISRYVPSQKRQQENYQLVKHLYQQQSEYYQSVIQQKTALDF SQQYQPLTIDGFLASPISDTVGFLWLGKIDDVFASVIAFNQEVNSTELQAFAADNHITYLNKAEEISRLFADYRHRITEL LLFAYAAIFLLLLPRYKMKQAFLIVLPPFIAGCAGLAVTVLTGVPLNLFNLLALMLILGIGIDYTLFFAEQNKQSDDSHK ESTLLAISLSALTTILSFGLLALSETQAIHSFGITVLTGIIVAWLLAPLSQQNKESKGYINTLSEKKDAS
Specific function: Unknown
COG id: COG4258
COG function: function code R; Predicted exporter
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 69699; Mature: 69567
Theoretical pI: Translated: 6.38; Mature: 6.38
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.0 %Met (Translated Protein) 1.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 0.8 %Met (Mature Protein) 1.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTGGELENDPFLLFRDYLSGLTQSSGNVQVENGYLIAKHDDKEYVVITADLSGSSYQLSL CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCEEEEH QQQLPQLLSLESKVSKTFSVDIQHTGVIFYAAHGTESAKGEISTIGLGSLIGIIVLVFLV HHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHH YRSTLPLALALLSISTGLACAYVLTIALFGSIHLFSLVFGASLIGVSIDYAFHFLTDRLH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AGKKWNSVVGIQQLFPAITLGLITSLIGYLGMLIAPFPGLQQLSLFSAIGLTAAYFTVVC CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WYPILASKPNQYNKVPMQRALSQWLLVWQQPLIRLVLPLSLLIAASFGVYMAKYDDDIRQ HHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQALPHALQQQEREIKAITGVSGSQQLLLVRDSSEEGLLQKLETISTKLDKRNDFGGYQS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH ISRYVPSQKRQQENYQLVKHLYQQQSEYYQSVIQQKTALDFSQQYQPLTIDGFLASPISD HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCEEECCHHCCCHHH TVGFLWLGKIDDVFASVIAFNQEVNSTELQAFAADNHITYLNKAEEISRLFADYRHRITE HHHHHEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLLFAYAAIFLLLLPRYKMKQAFLIVLPPFIAGCAGLAVTVLTGVPLNLFNLLALMLILG HHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH IGIDYTLFFAEQNKQSDDSHKESTLLAISLSALTTILSFGLLALSETQAIHSFGITVLTG CCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIVAWLLAPLSQQNKESKGYINTLSEKKDAS HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure TGGELENDPFLLFRDYLSGLTQSSGNVQVENGYLIAKHDDKEYVVITADLSGSSYQLSL CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCEEEEH QQQLPQLLSLESKVSKTFSVDIQHTGVIFYAAHGTESAKGEISTIGLGSLIGIIVLVFLV HHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHH YRSTLPLALALLSISTGLACAYVLTIALFGSIHLFSLVFGASLIGVSIDYAFHFLTDRLH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AGKKWNSVVGIQQLFPAITLGLITSLIGYLGMLIAPFPGLQQLSLFSAIGLTAAYFTVVC CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WYPILASKPNQYNKVPMQRALSQWLLVWQQPLIRLVLPLSLLIAASFGVYMAKYDDDIRQ HHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQALPHALQQQEREIKAITGVSGSQQLLLVRDSSEEGLLQKLETISTKLDKRNDFGGYQS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH ISRYVPSQKRQQENYQLVKHLYQQQSEYYQSVIQQKTALDFSQQYQPLTIDGFLASPISD HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCEEECCHHCCCHHH TVGFLWLGKIDDVFASVIAFNQEVNSTELQAFAADNHITYLNKAEEISRLFADYRHRITE HHHHHEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLLFAYAAIFLLLLPRYKMKQAFLIVLPPFIAGCAGLAVTVLTGVPLNLFNLLALMLILG HHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH IGIDYTLFFAEQNKQSDDSHKESTLLAISLSALTTILSFGLLALSETQAIHSFGITVLTG CCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIVAWLLAPLSQQNKESKGYINTLSEKKDAS HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA